Methanosphaera sp. ISO3-F5: PXD04_02700
Help
Entry
PXD04_02700 CDS
T09686
Name
(GenBank) Ig-like domain repeat protein
Organism
meis
Methanosphaera sp. ISO3-F5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3_5
CarboxypepD_reg
Tropomyosin
PUMA_CC
Big_1
SlyX
Lebercilin
ATG16
TMF_DNA_bd
Crescentin
DUF4686
IFT57
FPP
CCDC93_CC
Exonuc_VII_L
UPF0242
Golgin_A5
HOOK
CALCOCO1
ACBP4_C
HrpB7
HAP1_N
Taxilin
Myosin_tail_1
DUF724
Sigma70_ner
CT398_CC
DUF4407
MPS2
Nuf2_DHR10-like
DUF3584
Filament
BRE1
DUF1664
Laminin_II
Nup88
FBF1
CEP63
DUF4763
PI3K_P85_iSH2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WQH64719
LinkDB
All DBs
Position
complement(2260689..2268953)
Genome browser
AA seq
2754 aa
AA seq
DB search
MNINSKHIIFFVALIITLISVASAADINDTTLSSDVTTSTTSPDTQQTDTNVITQNNNNH
EIKNTQQTTKNVVQTENSSQTRNTTPTTYNLNNSNFDEYITVAGLNTVINDGDILNFTEN
ISRTSTNYTVDKPININGNGFTLDLNTIYGYNLPSLDPTWIEFNHGASNSNITNLKFHNT
QVFTTTASNITFDNINVTVENQGVGMSTGYFSMRNGVINITVKNSYFYAVNNTGCSAVVI
TLGENCTIDNNTVMGSGKVGNLIYLNMYGAINNANNITKNRANKITNNIISCTDGENICW
GITVTGPRNVIENNTIDITPGQYGITTTWSGSYDNETDPDDTHNVTYYGNKYINNTVNGK
FSTGNYSIIENNTINGASTINGHAHVTNNTFLAGVSLHNNVRFHSNDATGQTITVQKANS
CFKDSIIGTLTLTNKAKYTYDCGGNTIGTITQNLYTNYFKNCSGNCPNCGSTGSKLLSKL
STKQLKTDSNAEIIYQGTVVTSNDLTIYNNGTVEIILEGENARNVLLYGQNPYQSKINEQ
TIDITDIVIYVNSNSFSTGGNQYDMKSFKLNFDNKENINLKVIGAITKKGGLEINGGWKT
VTYENLKIISDYNEDTDRDIALILNGDNITLRNITYTSTSTGAAAMAIFAGYTDNTGVSG
GVLIRGNNIMIENSEFSISQEEFINITEWGLDPEDFPNDFHNYGFFFYKANNITFRNNNF
LFLSMDKDSSIESRKYSPILGGNVTTLSLVDNEVNVRYVPGIKLVTNNSLFENNTITVQH
ADNTIELTGDNNIVRYNTLTSKSGEGDSTVVVTGENNVVEQNPKVEPKTIIVTQDNVEDV
FGGESHTLGADVNPGDTLDFQGLIDKNHSLVINKPVTVVSTTEDAVIRLHTVAGSLMGDD
PGNCFVINKGASGSYVSGLRLENTECWVYNLYNATLYNMTMYVKDARVGSGVGQTSLRFC
NNVTMDSCYIYTENNGGSSSFVWTGCNNCTIINSTVQAEGKVGNLLYVGNPFNTDDKPAD
YVMTNFDNKVINCTVLGGSGGTSNPLQNGGQRTLVQGNKFYSGGSAGVAAFGVTGATATL
VDNEFYRTVSMYLTAGSTAYNNVFYGTGSTTVQANAQVYNNTLNAVTISGADVLFENNTV
KGKLTVNQPTNVKDNNLADVQVGTNGKNSNITNNNVTGTITSGAANVVIDSNNITTTNDN
TVVVTGANNTVTNNILYTRTKAGDETLNVKNDTTVEENIPESGEEFELTDENYLKFFDTN
GNLINTNVTNYSTLTFKGEFNNKVFKFNDIILSLTGEEAVINNGYISTDNGAIVALENVV
FNNTREGIPNSVLLNSDGNLVRNVTVYRTSNSGISREIMVNGDKNSILSNKFDLTIPVEN
IDYSEYPFAMSNASAISVTGSENIINSNTITVRNSTTGTGTISVIDLASRTKSSGNTVNS
NTIVAESTGYLYGINLGSNTDANTINSNNIKLSSDVYTAGIQIGYSPAKDNTINSNTINL
TSPIAYGVLASAYEGEITGTTVNSNKVYISANQGVGIELCGSIPESINDATINSNTIVVD
GNYCIGIAVSGSDIEVNENTITVTGTRNDTDETSYDIIKPTTSGIILYNSENIEALNNVI
TAENGANIILNGTSNSKVTRTTNNKKINTENGANIVLDNSNNNLIDNQIAYTTSEYAVIL
TNSSNNNITNNNLNASNINGGDAAISMDENSKDNYLYNNIPVFGVLTDETYSTFFDENST
YKFPEGINILSLGGNLHNKDLIFTNNITFVNAGNYTIYNGTIIVNDVEGSRYDDRFVRFN
NININNTDKPVFIGNLSTDQQRNIEFRGGVFTVTGDNITAFESVHGPKTYTVLDVQYATV
IMDGKDVTAFKMSRDEYTQNDYLDVEKSNITLKSTGKNTAFEVINTNLDILGNNITQTGS
DVFTAYIENAYANGKFFGENNINASGEKVAILILNETQGNNPTIGNNNITATSPNPVPAI
TIITSKNSYVGQGQYTYSSYNYPNTIIINAENGEVPIVNIIGNGYVRNNFIMSNDLYGAE
GVNATTISNITPTRTSINITAPEQAKVFDKITINVTTTNATTTSDGMIILKINDEIVANT
TKTTLSYTYTANNNETLNIVAEYIYKHTGFVSGTANATVTLVNFNDTLTLDANKPFLNEN
LTITGTLIDENNNPICNATITIDINGNKVNVTTDTEGKYNYTTTPIEGNNTITVKFDGNN
SYISREESKTVFVVDLEKYLQVDELNKTIQEQNKTIEELNKSNTDLKDKLQDANKQIDSL
NKNITNLNNQIKDLNNKNKDLQDKLTAANNKINTQEKQIKDLQDQLNKANDKVNTQEKQI
KDLTDKLNNADKTIANQNKTIQDLNNQVSQLNNKIKNLTTKTNTKITVNKIATGKYASTV
TINGTLTDANNKAINNGVVTIKLNTGTIKVVTNSKGIYAYKTTNAKVGTNNVTVTFTATD
KYAASTAKTTFKLNKATPTLKINPISAVKFKDSVKITGSLIGANNKVISNANIILKINKK
SVTVKTAKDGSFTYTTKATAMGTNNITATYNGNGNFNKVSKKVTFKVNKQSLILTVDRVA
SGLKFKDPLVVSGRLVDGNNKAVVNTMVSLKFNGKTYKAKTDKNGYYKVTTRATTMGKNN
VTASYAGNTKYNKATAKTTFTVAKQDIIITFDKVSYNNGKVTISGTFTDRNRHALMNSLA
RITLNGKQGTAKTNNKGTFTYTTKAKQGTYKVTLAYPGNDRYNAYSKTSTVKTA
NT seq
8265 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattaattcaaaacatatcattttttttgttgctttaataattacattaatatca
gtagccagtgctgcagacatcaacgatacaacattatcatctgatgtaacaaccagcaca
acatcacctgatacacaacaaactgatacaaatgtaatcacacaaaacaacaataatcat
gaaataaaaaacacgcaacaaacaacaaaaaatgttgttcaaacagaaaatagtagtcaa
acaagaaatacaacaccaacaacatataacttaaataactcaaacttcgatgaatatata
acagttgctggtttaaacacagtcattaacgatggggatatattaaactttacagaaaac
atatctcgtacatcaaccaattatacagtagataaaccaataaacataaatggaaacggt
tttacactagacttaaacacaatatatggatataatcttccatccttagatccaacatgg
atagaatttaaccatggagcatctaattctaatattacaaacctaaagttccataataca
caagtattcacaacaacagcatccaacataacatttgacaacatcaatgtaacagtagaa
aatcagggtgttggaatgagtacaggatacttctcaatgcgtaatggagtaataaacatt
acagtaaaaaacagttacttttacgcagtaaacaacactggatgtagtgcagtagtaatt
acactcggtgaaaactgtacaatagacaacaacactgtaatgggtagtggcaaagtagga
aacctcatatatctaaatatgtatggagcaatcaacaatgctaacaacattaccaaaaac
agagcaaacaaaataaccaacaacattatttcttgtactgatggagaaaacatttgttgg
ggtatcacagtaactggaccaagaaacgttatcgaaaacaatacaatagatataacacca
ggacaatatggtataacaaccacatggtctggaagctacgataacgaaacagatccagac
gatacacacaatgttacatactatggtaacaaatacatcaataatacagttaatggtaaa
ttctcaacaggaaactacagtataatagaaaacaacacaataaatggtgcaagtacaatc
aatggacatgctcatgtgacaaacaacacattccttgcaggagtttcactacacaacaat
gtacgtttccactcaaacgatgcaacaggacaaactataactgtacaaaaagccaatagt
tgcttcaaagatagtattattggtacattaacattaaccaataaagcaaaatacacttat
gattgtggtggaaatacaattggaactataacacaaaacttatatacaaattactttaaa
aactgttctggtaattgcccaaattgtggttctacaggcagcaaacttttatctaaactt
tcaaccaaacaattaaaaacagattccaatgctgaaataatttatcaaggaactgtagta
acatctaatgatttgactatttataataatggtactgttgaaatcatattggaaggtgaa
aatgctagaaatgttttattatatggtcaaaatccttatcaatcaaaaattaatgaacaa
acaatagatataacagatattgttatatatgtgaattcaaattcattttcaactggtggg
aaccaatatgatatgaaatcatttaaattaaattttgataataaagaaaatatcaatctt
aaagttattggtgctataaccaaaaaaggtggtttggaaataaatggcggttggaaaact
gtgacctatgaaaatttaaaaatcatatctgattataatgaagatactgatagggatata
gctttaatattaaatggagataatatcacattaagaaacatcacttatacttctacatca
acaggtgcagctgcaatggcaatttttgctgggtatactgataacacaggagtgtctgga
ggagtattaatacgtggtaataatattatgatagaaaattcagaatttagtatcagtcaa
gaagaatttataaatattacagaatggggattagatccagaggatttccctaatgatttc
cataattatggatttttcttttataaagcaaataatataacatttagaaacaataatttc
ctatttttaagtatggataaagatagtagtatagaatcaagaaaatacagtccaatactt
ggaggaaatgtaactactttgtctttagttgataatgaagttaatgttagatatgttcct
ggtataaaactggttacaaacaattcgctctttgaaaacaacacgataacagtacaacat
gcagataacaccattgaacttacaggtgacaacaacattgtacgctacaacactctcaca
tccaaatctggtgaaggtgatagtactgttgtagtaactggagagaacaatgtagttgaa
cagaatcctaaggttgaacctaaaaccattattgtaacacaagataatgttgaagatgta
tttggtggtgaaagtcacacactaggtgctgatgtgaatcctggtgatacacttgatttc
cagggattaattgataaaaatcattcacttgtaattaacaagcctgtaactgttgtttca
actaccgaagatgcagttataagattacacactgttgctggtagtcttatgggtgatgac
cctggtaactgttttgttataaataagggtgcatccggttcttatgtaagtggtttacgc
ttagaaaatactgaatgctgggtatacaacctttacaatgctacactctacaatatgaca
atgtatgtaaaggatgctcgtgttggtagtggtgtaggtcaaacctcacttagattctgt
aataatgtaaccatggacagctgttacatttacactgaaaataatggtggtagttcatca
tttgtatggactggatgtaacaactgtacaataataaactcaacagtacaagctgaagga
aaagttggaaacctattatatgttggtaaccctttcaacactgatgataaaccagcagat
tacgtgatgactaactttgacaataaagttataaactgtacagtattaggtggatctggt
ggaacaagtaatccattacaaaatggtggtcagcgtactttagtacagggaaataaattt
tattctggtggttcagcaggtgttgcagcatttggtgtaactggtgcaactgctacatta
gttgacaatgaattttatagaactgttagtatgtatttaactgcaggttctactgcttat
aataatgtattctatggtactggtagtacaactgtacaagcaaatgctcaagtatacaat
aacacattaaatgctgttaccattagtggtgcagatgttttatttgaaaacaatacagtt
aaaggtaaactcacagttaaccagccaacaaacgttaaagacaacaacttagcagatgta
caagtaggtacaaatggtaaaaactcaaacattacaaataacaatgtaacaggtacaatc
acatctggtgcagcaaatgtagttattgattcaaacaacatcacaacaaccaatgataac
acagtagttgtaacaggtgcaaacaacactgtaactaataatatattatataccagaaca
aaagctggtgatgaaacacttaatgttaaaaatgacacaaccgttgaagaaaacattcca
gaatcgggtgaagaatttgaattaactgatgagaattatttaaaattctttgacactaac
ggtaatcttataaatacaaatgttacaaattattcaacattaacattcaaaggagaattt
aataataaagtattcaaatttaacgacataatactatcacttactggtgaggaagctgtt
ataaataatggatacatttcaaccgataatggtgcaattgtagcacttgaaaatgtggta
tttaacaatacccgtgaaggtattcctaacagtgtattattaaattctgatggtaacctt
gttagaaatgtaactgtatacagaacatccaatagtggtatttctcgtgaaattatggtt
aatggagacaaaaacagtatattatccaacaagtttgacttaactattcctgtagaaaat
attgattacagtgaatatccatttgcaatgtctaatgctagtgcaataagtgtaaccggt
tcagaaaacattattaattcaaatactataacagttaggaacagtacaacaggtactggt
actatatctgtgattgaccttgcaagcagaactaaaagtagtggtaacacagttaactca
aacactattgtagctgaaagcacaggatatctttacggtataaatcttggatctaatact
gatgcaaatactattaacagtaataatataaaattaagctctgacgtatatactgcaggt
attcaaataggatactccccagcaaaagataacactattaactctaatactataaatctt
acaagtccaatagcttacggagtacttgcaagtgcatatgaaggagaaataactggtaca
acagtcaattcaaacaaagtatacataagtgctaatcaaggtgttggtattgaattatgt
ggttcaatcccagaatcaattaatgatgcaacaataaacagtaacactatagtagttgat
ggtaattactgtattggtatagcagtatcaggtagtgatattgaggttaatgaaaacact
ataacagtaactggtacaagaaatgatactgatgaaacatcatatgacataatcaaacct
acaacatctggtataatactttacaactcagaaaatattgaagcattaaacaatgttata
actgcagaaaatggtgcaaacattatattaaatggtacaagcaattccaaggttaccaga
acaactaataataaaaagattaacacagaaaatggtgcaaacattgtattagataattca
aacaataaccttatcgataatcagatagcatacactaccagtgaatatgcagtaatatta
accaactcatcaaacaacaacattacaaacaacaaccttaatgcaagtaacattaacggt
ggtgatgctgcaataagtatggatgaaaacagtaaagacaattacctctacaacaatatt
ccagtattcggagtattaactgatgaaacatactcaacattcttcgatgaaaacagcaca
tacaaattcccagaaggaataaatatattatcattaggtggcaacttacacaacaaagat
ttaatcttcacaaacaatataacatttgtaaacgctggaaactatacaatatacaatggt
acaatcatagtaaatgatgttgaaggttcaagatatgatgacagatttgtacgtttcaat
aacattaacataaacaacacagacaaaccagtatttattggaaatctttcaacagatcag
caaagaaatattgaatttagaggtggagtattcacagttaccggtgataatataacagca
tttgaatcagtacatggacctaaaacatacactgtattagatgttcagtacgcaactgtt
atcatggatggtaaagatgtaacagcattcaaaatgagtagagatgaatatacccaaaat
gattatctggatgtggaaaaatccaatattacattaaaatcaacaggtaaaaacacagca
tttgaagtaataaacacaaacctggacatactaggaaacaatataacacagacaggttca
gacgtatttacagcatatatagaaaatgcatatgctaatggtaaattctttggagaaaat
aatattaacgcatccggagaaaaagtagcaatactaatattaaatgaaacccaaggaaac
aacccaacaataggaaacaacaacattacagctacaagtcctaacccagttcctgcaata
acaataatcacttctaaaaattcatatgtaggacaaggacaatacacatactcatcatac
aactatccaaacacaatcatcataaacgcagaaaacggtgaagtaccaatagtaaacata
ataggaaacggttatgtgagaaacaacttcataatgtcaaatgatttatacggagcagaa
ggagtaaatgcaacaacaatatccaatattacaccaacaagaacaagcataaacatcaca
gcaccagaacaagcaaaagtatttgataaaataacaatcaacgtaacaacaacaaatgca
acaacaacatctgatggtatgataatactaaaaattaatgatgaaatagttgcaaacact
actaaaactacactatcatatacatacacagctaacaataatgaaacattaaatattgta
gcagaatacatttacaaacatacaggatttgtatcaggtactgcaaatgcaacagtaact
cttgtaaactttaatgacacattaacattagatgcaaataaaccattcttaaatgaaaac
ttaaccattacaggaacactcattgatgaaaataataatccaatatgtaatgcaacaatt
acaattgacataaatggtaataaagttaatgttacaacagatactgaaggtaaatataat
tacacaacaacaccaattgaaggaaataacactatcacagtaaaatttgatggaaataat
tcttatatttccagagaagaatcaaaaaccgtgtttgttgtagacttagaaaaatattta
caagtagatgaattaaacaaaacaatacaagaacaaaataaaacaatagaagaattaaat
aaaagcaatactgatttaaaagataaactacaagatgcaaacaaacaaatagactcatta
aacaagaacataaccaacctcaacaatcaaatcaaagacttaaacaataaaaacaaagac
ctacaagacaagttaaccgcagcaaacaacaagataaacacacaggaaaaacaaatcaaa
gacttacaagaccaactaaacaaagcaaacgacaaagtaaacactcaagaaaaacaaatc
aaagacttaaccgataaacttaacaatgcagataaaaccattgcaaaccaaaacaaaaca
atacaagacttaaataaccaagtatcacaactaaacaataaaattaaaaatttaactaca
aaaaccaacacaaaaataacagtcaacaagattgcaacaggaaaatatgcaagtactgta
actatcaacggtacattaactgacgcaaacaacaaagcaataaacaacggtgtagtaaca
attaaactaaacactggaacaataaaagtagtaacaaacagcaagggcatatacgcttat
aaaactaccaacgcaaaagttggaacaaataacgttacagtaacattcacagctacagat
aaatatgctgcaagcactgctaaaacaacattcaaattaaacaaagcaacaccaacactc
aaaatcaaccctatcagtgcagttaaattcaaagattctgttaaaataactggttcacta
ataggtgcaaacaataaagtaataagtaatgcaaatataatacttaaaatcaataaaaaa
tcagtaactgtaaaaactgctaaggatggatcattcacttacacaactaaagcaacagct
atgggtacaaataatataactgcaacatacaatggtaacggtaactttaataaggtaagt
aaaaaagttactttcaaagtaaataaacagagcctcatcttaactgttgacagagttgct
agtggacttaaatttaaggatccactggtagttagtggaagactcgtagatggtaataac
aaagcagtagttaacaccatggtaagcttaaaattcaatggtaaaacatataaggcaaaa
acagacaaaaacggttactacaaagtaacaactcgtgcaaccactatgggtaaaaacaat
gtaacagcatcctatgctggaaacactaaatacaacaaggcaactgctaaaaccacattc
actgtagcaaaacaggacattatcataacctttgataaagtaagttacaacaatggtaaa
gttacaataagtggtacattcactgaccgtaacagacacgcactcatgaacagcctagca
agaatcacattaaacggcaaacaaggaacagcaaaaaccaacaacaaaggaacattcaca
tacaccacaaaagcaaaacagggaacatacaaagtaacactcgcataccctggtaatgac
cgttataatgcttacagtaaaacaagtactgtgaaaacagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system