KEGG   Methanosphaera sp. ISO3-F5: PXD04_08070
Entry
PXD04_08070       CDS       T09686                                 
Symbol
cas3
Name
(GenBank) CRISPR-associated helicase Cas3'
  KO
K07012  CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4]
Organism
meis  Methanosphaera sp. ISO3-F5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:meis00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:meis02048]
    PXD04_08070 (cas3)
Enzymes [BR:meis01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     PXD04_08070 (cas3)
Prokaryotic defense system [BR:meis02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Type I signiture cas proteins
    PXD04_08070 (cas3)
SSDB
Motif
Pfam: Cas3-like_C_2 DEAD Helicase_C ResIII HD DUF3069
Other DBs
NCBI-ProteinID: WQH63649
LinkDB
Position
complement(976826..979126)
AA seq 766 aa
MSCYSEEIYSHPNILLTDHLLNVANNSRKIFENMNITDNKLYSDISFFIGLTHDFAKATS
FFQDHLFNRNHSPNAYHGFLSAIFCYYVIKRKGNSNYVNFPVLGYLVVKNHHGNLKNIFD
EHNHFKKNMDNVDVQVNDLLSRNLDSFTAFYSQYDIDVNYFLSNINEVKEDLKKDLFKFK
REDLLDNYLDYILLFSVLIDSDKLDASHTSTYNRIPIDKNVVDKYKIDKKFNSEGINFVR
EEAFQELNSIIDSLDLDNKLYSISLPTGSGKTMNAFSFALKLRDRITNELNFMPRIIYSL
PFLSIIDQNEEVIKDILSDNGFDSQDVFIKHNSMSEIYYKTSDNQELEIDNAEMLIESWY
SEIIITTFYQFFYTIISNKNRSLKKLHNLSNSIVILDEVQSIPPKYWKLVNVLLKYMVER
YNFWIIFMTATQPAIFSESEMIPLVENKEYYFNKFDRVNYKFCLEKQSVIEFNEFILDEI
LSTNKDIMIVVNTIQNSIDIYKYLSNYLEDNILYYLSTNIIPIERKKRISNIKKSENRKI
IVTTQLIEAGVDIDVDIIYRDFAPIDSIVQTAGRCNRNQQKDKGTVNIIRLADDKKEYNK
YIYDSISREVTYELIKDLETISEKDFGTIIDKYYDKILEKISKDSSKDIIKKLSKLEISN
ITNEFKLIEENVEKQDVFIDLNDYSHEIWNKYTEIYSSETSVIEKRYEFKKIKSEFRKYI
ISIDVKKLGTTPIEYNIGHIDRQDIERKYDEQIGFIPLDDEDAFII
NT seq 2301 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcatgttattctgaggagatttattctcatccaaatatattgttaactgatcatctt
ttaaatgtagctaataattctcgtaagatttttgagaatatgaatataactgataataag
ttatattctgatatttctttttttattggcttaactcatgattttgctaaggccactagt
ttttttcaagatcatttatttaacaggaatcattctcctaatgcatatcatggtttttta
tctgccatattctgttattatgttattaaaagaaaaggaaacagtaactatgtgaatttt
ccagttttaggttatttggttgttaaaaatcatcatggtaatttaaagaatatttttgat
gaacataatcattttaagaaaaacatggataatgtggatgtacaagtaaatgatcttttg
agtcgaaatttagattcatttactgcattttactcacaatatgatattgatgttaattat
ttcttatccaatattaatgaggttaaagaagatcttaaaaaagatttatttaaattcaaa
agagaagatttgctagacaattatttggattatattttgttattttctgttttaattgat
tctgataagttagatgcttcacatacaagtacttataatagaatacctattgataagaat
gttgttgacaaatataaaattgataaaaagtttaattcggagggtattaattttgttcgt
gaggaagcttttcaagagttaaatagtataatagattctttagacctggataataaatta
tattctatttcacttcctactggttctggaaaaactatgaatgcattctcctttgccttg
aaattaagagatagaataacaaatgaattgaattttatgccacgtattatttactcgtta
ccttttttaagcattattgatcagaatgaggaagttattaaagatattttatcagataat
ggttttgatagtcaagatgtttttattaagcataattctatgtcagagatttattataaa
acaagtgataatcaggaattagagattgataatgctgagatgttaattgaatcatggtat
tctgagataattatcactactttttatcagtttttttatactattattagtaataagaat
aggtcattgaaaaagttgcataatttaagtaattctattgttattcttgatgaggtacag
tccattcctcccaagtattggaagttagttaatgtgttacttaaatatatggttgaaaga
tataatttctggattatatttatgacagctacacaacctgctattttcagtgagtctgaa
atgattcctttggttgagaataaagaatattattttaataaatttgatagggttaattat
aagttttgtctagaaaagcaaagtgttattgaatttaatgagtttattcttgatgaaata
ttatctaccaataaggatattatgatagttgtaaatactattcaaaattctattgatatt
tacaaatacttatcaaattacttagaggataatatattatattacttatcaactaatatc
attccaattgaaagaaaaaaacgtatatcaaatattaaaaaatctgaaaataggaaaatt
attgtaaccacacaattaattgaagcaggtgtagacatagatgtagatataatatacaga
gattttgcacctatagacagcatagtacaaactgctggtagatgtaacagaaaccaacaa
aaagataaaggaacagtaaacattataagactagccgatgataaaaaagaatacaataaa
tatatctatgattcaatttcaagagaagtaacatatgaactgattaaagacttagaaaca
ataagtgaaaaagattttggaacaataattgacaaatattatgataaaatattagaaaaa
atctcaaaagattcttcaaaagatataattaaaaaattatcaaaactagaaatatccaat
ataacaaatgaattcaagttaattgaagaaaatgttgaaaaacaggacgtgttcatagac
ttaaatgattactcacatgaaatttggaataaatatacagaaatatactcatcagaaaca
tcagtaattgaaaagcgatatgaatttaagaagataaaatcagaatttagaaaatatatt
atatcaattgatgttaaaaaattaggtacaacaccaatagaatataatattggtcatatt
gacagacaggatattgaacgaaaatatgatgaacaaataggtttcataccattagatgat
gaagacgcatttataatatga

DBGET integrated database retrieval system