Methanosphaera sp. ISO3-F5: PXD04_09405
Help
Entry
PXD04_09405 CDS
T09686
Name
(GenBank) AAA family ATPase
KO
K19171
DNA sulfur modification protein DndD
Organism
meis
Methanosphaera sp. ISO3-F5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
meis00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02048 Prokaryotic defense system [BR:
meis02048
]
PXD04_09405
Prokaryotic defense system [BR:
meis02048
]
DNA phosphothiolation system
Sulfur modification proteins
PXD04_09405
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
AAA_15
AAA_27
AAA_29
SMC_N
DUF3130
Fez1
Exonuc_VII_L
DUF724
Hydro_N_hd
Snapin_Pallidin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WQH63905
LinkDB
All DBs
Position
1266762..1268717
Genome browser
AA seq
651 aa
AA seq
DB search
MILKSISVTNYRPYHGSFTIEFAEGDKNITIIEGSNDKGKTSLLNAFTWCLYGQESYKKE
GKESIWNRTAFNNISIGETLDVIVEIIMKDNENNNIIFKRKQTCQKLSQNDRAIQTPVFK
IFKNDGINDIPIDNPTQYIETHLPYELREYYLFDGEQLVQFFNKDSKSVKKAVFNLSQLN
LLDRSEEHISKFRVKLIENQTNIAPKLAEYQKQKIDLEKLQKNLKSKIEEHNETITYLKN
KNVNLANKIKEFDSNSEELYNKKEELKEEVKNLEENLKNLNISYTKYLTNNINYILANSL
LKDFDNRAKVLEDKGFIPAKYKKEFLEDLLKRNICICGTRLDENSDCYNTLQELINKTDD
VTNISENVNQLLSICRNIKKKYPKNMKDTLRLKQSEIITLENEISYKKTQIQEINVKLES
IPIDMIKENNAKISKNEKEIENLYQEIGKFKDRSKNIPNKINTINIHIAEEESNQEIHNR
ISNQLIFCEKLQEICSQLNYKMKRSIHNKLQKLTSEEFKQIHWKKSYKDVLINDDFEVSF
VMKDGSEKSATDPSSGSQLVLALSFVIALNSLSGFKLPIIIDTPMGRLDSSVREKLAEFL
PEYLNNKQMALFVTDKEYEGLFKEKIDYYVGKKYLLASALDNDDETRVIKC
NT seq
1956 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatattaaagtcaataagtgtaactaattataggccttatcatggttcttttactatt
gaatttgcagaaggagataaaaatattactattattgaggggtctaacgataaaggaaaa
acaagtttattaaatgcttttacctggtgtttatatggtcaagagtcttataaaaaagaa
ggtaaggagtctatttggaatcgtactgcttttaataatataagtattggtgaaacatta
gatgtaattgtagaaattatcatgaaagataatgaaaacaataatataatttttaaaaga
aaacaaacatgtcaaaaattgagtcaaaatgatcgtgcaattcaaacaccagtttttaaa
atttttaaaaatgatggaatcaatgatattccaatagataatccaacacaatacattgaa
acacatcttccttatgaattacgcgaatattatctatttgatggagaacaattagttcaa
ttttttaacaaagattcaaaatctgttaagaaagcagtgtttaatttatcgcaacttaat
ttattagatcgctctgaagaacatattagtaagtttagagttaaattaatagaaaatcaa
accaatattgctccaaaattagctgaataccaaaaacaaaaaatagatttagaaaaactt
caaaaaaatttgaaatctaaaatagaggaacataatgaaacgattacttatttaaagaat
aaaaatgttaatttagctaataaaattaaagaatttgattctaattctgaagaattatat
aataaaaaagaagaattaaaagaagaagttaaaaatttagaagagaatcttaaaaatctc
aacataagttatactaaatatttgactaataatataaattatatacttgcaaattcctta
ttgaaagattttgataatagagctaaagttttagaagacaaaggttttataccggctaaa
tataaaaaagaatttttagaagatttacttaaaagaaatatatgtatttgtggaacacga
ttagatgaaaattctgattgttataacacattacaagaattaattaataaaaccgatgat
gtcacaaatatatctgaaaatgtaaatcaattattatcaatttgtagaaatataaaaaag
aaatatccaaaaaatatgaaagacacattaagattaaaacaaagtgaaataattacatta
gaaaatgaaatatcttataaaaaaacacaaattcaagaaattaatgttaaattagaatca
attcctatagatatgattaaagagaataatgcaaaaattagtaaaaatgaaaaagagata
gaaaatttatatcaagaaattggtaaatttaaagataggtctaaaaatattcctaataaa
attaatacaattaatatacatatagcagaagaagaatctaatcaggagatacacaataga
atatcaaaccaattaatattttgtgaaaaattacaagaaatatgttctcaattgaattat
aaaatgaaacgatcaatacataataaacttcaaaaattaacttcagaagaatttaaacaa
attcattggaaaaaatcttataaagatgtattgataaatgatgattttgaagttagtttt
gttatgaaagatggatctgaaaaatctgctactgatccttcaagtggaagtcaattagtg
ttagcattatcgttcgttattgcgttaaattcattatcgggttttaaattacctattata
attgatactcctatgggtagattagattctagtgttcgcgaaaaactcgcagaattcctt
ccagaatatttaaataacaaacaaatggcattatttgtaacggataaggaatatgaagga
ttatttaaagaaaaaatagattactatgttggtaaaaaatatttattagcatctgcatta
gataatgatgatgaaactagggtgataaaatgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
