Metabacillus elymi: HUW50_06745
Help
Entry
HUW50_06745 CDS
T06752
Name
(GenBank) leucine-rich repeat domain-containing protein
Organism
meku
Metabacillus elymi
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
fn3
LRR_8
LRR_EndoS
LRR_14
FN3_DSCAM-DSCAML_C
LRR_LRWD1
Fn3_PBP1
LRR_R13L1-DRL21
Gram_pos_anchor
LRR_9
LRR_5
fn3_2
DUF6892
LRR_Zer-1
NDNF
LRR_NXF1-5
BppU-like_C
C3orf18_N
DUF5119
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNF27237
UniProt:
A0ABX6RZS4
LinkDB
All DBs
Position
complement(1390662..1394801)
Genome browser
AA seq
1379 aa
AA seq
DB search
MTRRFVSLSLVVTLLFTLITPFLSTAVAANESMTILPAENIESGIKLQWSTISTYQSEEN
FTLLKNTEETSLPLVEVIESSEDQDGNLHRTYQFVDQQVVVGETYKYTVQKTGDSKLQTQ
PIEVTYELVKEALAPFEMNTTSVTDHSIKVSWSEFLEADRYQVVVDGKIIEEVNQAGSYE
LKDLQSGTSYSVSIRAIGDGAILKEALGKITTAQKPEEESVDTTSVIESKEKVSITASEP
SGELVTVPDSALKREIKAALQLKRDEIYVSDMESLTTLDASYSGIKDVTGLEKAINLTKL
ELAGNDIKGAAALQGLTKLNYLDLTSFQGENIEFLTSLTNLKTLILAESLVNNVAPIATL
ASLETLDISYIEVATILPLQQLTNLSTLTIYGELYFTLIDEVQSLEREGLTIDHDDSYKM
YITSIKANEERAIISWEYDDEESVAYYEVKVADKVTMVDPDEVGNQITVETLQQNTEYSV
EIFAYNNKDEQIGKAVSTFKTLSAPVGEKAVFKDAQLEKAIKAEFGLERDIFISDLKGLE
ELYLDSKRIKDLSGIEAATNLRSLSLSGNRISDLTPLASLKNLRDLYVDGNPLVTFTALK
GLTNLESLHLGETGIKDLSILADLQNLTDLSLNGNNLESIETLPALEGLSYLSLYENDLK
DLKGIEKLTQLEYIDVDDNPISSLADIQQLTKLESINLSYTSIEKIDELLKFERLQYVTL
YGTEQLDLSEGSAAQQVIEELIANGVMVDYEGAEEEEWLEVYINTITEDSLSLYWDYYGE
QEIKMYEVYVNGELHSELSGEENFLELDGLKPATVYDLEVKAYNGDGDLVLSSNISEMTW
SEPTGETVPFKDNNLQELIKEQLGLDRDLRVSDLEKLTSLSLIESDIKDLSGLEIASNLY
DFYVFGNAYTLDLSPLKNLSELSYVHIEDADLKNYSILKDLKKVSSLAIVNSNLSDISFL
SGMTNLQDLTLINNSIQDISALSGLRKLNFISLANNKIEDLSPLSGLKENLNYFDVSGNL
IKDLSSLAELENLYYLILDETKISDLTPLLELPSLEYVSLYNIATLDVNDKDNARVFAAL
KDWGVQVNLDVDNSPELNIDEVTEDSISISWDPMLPKGTGTYNVSLYSDDGELVEDVELD
SNETSYQFLNLSPNTNYYIEINVEEDEYYGFLSADVTTLPVEGSVKDVSLYVYKTVDLPE
VDATFDLYGIDEETENIYYFGWSDEQGRLIDVSTDEEMDIVELPVGNYEITFVTADGEEV
TFQFEINGTEDYLVDPILFLLEDSDDNPVTTPGDGQDGGVDPQKPTPDGENPANGNNSSI
GEKPVDSNNIITEPVKVENKNQLPKTATIVYNLLAVGLIVLALGGVILFIQKRKRVTNM
NT seq
4140 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactagacgtttcgtttcattatcactcgttgttacattactatttactctcattacc
ccattcttatcaactgcggttgccgctaatgaaagcatgacaattttaccagcagaaaat
attgagagtggaattaagcttcaatggagtacaatttctacatatcaatcagaagaaaac
tttactctattgaaaaatacagaagaaacttctttgcctttagtagaagtcattgagtca
tcagaagatcaagatgggaatctccatagaacctatcagttcgttgatcaacaagtggta
gtaggtgaaacgtataaatatactgtgcaaaaaactggcgattcaaagcttcaaacacaa
ccaattgaagttacttatgaactagttaaggaagcattagccccattcgaaatgaacacg
acaagtgtaacagaccactcaatcaaggtttcatggtcagagttcctagaagctgatcgt
tatcaagtcgttgttgacggcaagattattgaggaagtcaaccaagctggttcttatgag
ctaaaggatcttcaaagtgggacaagctattctgttagcattagagcaattggtgatggt
gctattttgaaagaggcattaggaaaaattaccactgcacaaaagcctgaagaagaaagt
gtagatactaccagtgttatcgaaagcaaagaaaaggtaagtataacagcttctgaacct
tcaggtgagcttgttacagtacctgattctgctttaaagcgtgaaattaaagcagctcta
caattgaaacgtgatgaaatttatgtatcagatatggaaagcttaacgacgttagatgca
tcttacagtggaattaaagatgtgacaggattagaaaaggcgataaatttaacaaagctt
gaattggcaggaaatgatatcaagggtgccgctgcattacaaggattaacaaagcttaac
taccttgatcttacttctttccaaggagaaaacattgaatttttaacatcattaacaaac
ttaaaaactcttatactcgcagaatcattggtaaataatgtagcaccaatcgcaacgctt
gctagcctagaaacgttagatattagctacatagaggttgcaacaatattaccgctgcag
cagctaaccaatttatctacattaacaatttacggtgagctttattttactctaattgat
gaggtacaatcacttgagcgcgaaggtctaacgattgaccacgatgattcatataagatg
tacatcacatcaataaaggcgaatgaagagagagcaatcattagctgggaatatgatgat
gaggaatctgtagcttattatgaggtaaaagttgctgataaggtaacaatggtagaccct
gatgaagttgggaaccaaataacagttgagacacttcagcaaaatacagaatactcagta
gagatttttgcttataacaacaaggatgagcaaatcggaaaagctgtttctacgtttaaa
actctttcagctcctgtaggagaaaaagctgtatttaaggatgcacaactagagaaagca
ataaaagctgaatttggtttagaacgtgatatttttattagtgacttaaaaggactagaa
gaactatatctcgacagtaaaagaattaaagatttatcaggtattgaagcagcaactaat
ctcagaagcttaagcttgtctggaaacagaatatctgatttaacaccactcgcttcatta
aaaaacctaagagatctatatgtagatggaaatccgcttgtgactttcactgcattaaaa
gggctaacgaatttagaaagtttacacttaggtgaaacaggaataaaagatctgtctatt
ttagcagatttgcaaaacttaactgatctttctctaaatggaaacaatttagagagcatt
gaaacactgccagcacttgaaggtcttagctacttatcgctttacgaaaatgatttaaaa
gatcttaaaggaattgaaaaattaacacagctggaatatatcgatgtggatgataaccct
attagctcgctcgctgatattcagcagctgacaaagctagagagtattaatttaagttat
acaagcattgaaaagattgatgaattgctgaaatttgagcggcttcaatatgtaacttta
tatggaacagaacaactcgatttatcagaagggtcagccgctcagcaagtaattgaggag
cttatcgcaaatggcgtaatggttgattatgaaggtgctgaagaggaagaatggcttgaa
gtctatattaatacaataacagaagattcactttcactttattgggattattacggtgaa
caagaaattaaaatgtatgaggtatacgtcaatggtgaacttcacagcgagttatcaggt
gaagaaaacttcttagaattagatggtcttaaaccagctactgtgtatgacttagaggtt
aaggcatataacggtgatggagatcttgttcttagttcgaatatctctgaaatgacatgg
tctgagccaacaggtgaaaccgtaccatttaaggataacaatttacaagagcttattaaa
gaacagcttggacttgatcgtgatttaagagtaagtgacttagagaagctaacctcgtta
tctttaattgagtcagatattaaggatctttctggcttagagattgcaagcaacctatat
gatttttatgtatttggaaatgcatatactctagacttatcaccgcttaagaatttatca
gagctaagctatgttcatattgaagatgcagatttaaagaattattcaattttaaaggat
ttaaaaaaggtaagttctttagctatcgtcaatagtaatctatctgatatctccttttta
agtggaatgactaatctgcaagatctgacattaataaataatagtatacaagatatttcc
gctttatcaggattaagaaaacttaactttattagtcttgcaaataataaaatagaggat
ctatcgccactatcaggattgaaggaaaatcttaattatttcgatgtaagtggaaaccta
attaaggatctttcaagccttgcagagttagaaaacctatattatttaattttagatgaa
acgaaaatttcagatttaacacctttacttgaattgccaagcctagaatatgtttcgtta
tacaatattgcaacacttgatgtaaatgataaggataatgccagagtatttgcagctcta
aaggattggggcgttcaagtaaatcttgacgtagataatagtcctgagctaaatatcgat
gaagtaactgaagactctatttcaatttcatgggatccaatgctaccaaaaggtacaggc
acttacaacgtttctctatattcagatgacggagaacttgttgaggacgtagagcttgat
agtaatgaaactagctatcaatttttgaatctctcaccaaatactaattattacattgag
attaatgttgaagaagatgagtattatggctttttatctgcagatgtgacaaccttacct
gtagaaggatcagttaaggatgttagtctgtatgtgtacaaaacagtcgatcttcctgag
gttgatgcgacatttgacctttacggaatcgatgaagaaacagagaatatttattacttt
ggttggtctgatgaacaaggaagattaattgacgtttcaacagatgaagaaatggatata
gtggagctccctgttggaaattacgaaataacgtttgtgacagcggatggagaagaagta
accttccagtttgaaataaacggaacggaagattacctagtagatccaattctctttctg
ttagaagatagtgacgataatccagtaacaacacctggtgatggtcaagatgggggcgtg
gatcctcaaaagccaactcctgacggtgaaaatccagctaatggaaataattcatctatt
ggggaaaaaccagtagattcgaacaacatcattactgaacctgttaaagttgaaaataag
aatcagcttcctaaaacagccactatagtgtataaccttttagcagtgggactcattgtc
ctagctttaggaggagtaatactttttattcagaaaagaaaacgcgtaactaatatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system