KEGG   Methanobacterium lacus: Metbo_2315
Entry
Metbo_2315        CDS       T01437                                 
Name
(GenBank) parallel beta-helix repeat
Organism
mel  Methanobacterium lacus
SSDB
Motif
Pfam: Big_5 CopC Beta_helix Phage_tube_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADZ10529
UniProt: F0T622
LinkDB
Position
complement(2352608..2358040)
AA seq 1810 aa
MGLNKKSLFFVMIIFVFLILFTGSVSATDTTAPTVTNVDPASGTSNVPGNKVINVTFSEP
MQHGYDSVELKDSNSNVIPITQSLGSRVLTITPNDYLDHGGYTLILHTGCYKDLAGNNLA
VYTSTFTVESTAPTVIAVDPDDDATGIPGNKQIKVSFSEPMQQGNRLVDLKDSNGNVIPI
TQSLGSRVLTITPNDYLNHGTYTLTLHTGCYNDLANNYLNLWSSNFAVESTAPTVTDIDP
DNGATNIPATKIINVTFSELMQQGNRLVDLKDSNGNVIPITQSLGSRVLTITPNDNLNHG
TYTLTLHSGCYNDLANNYLNVWSSTFTVESTAPTVTDIDPDNGATNIPINKQIKVTFSET
VQSGTGSVQLKDSNNNIVSITKSLANKVLTIIPSNLSPGPYILYLYNGCYKDLANNNLAT
FTSSFTVDNIPPSVISCDPVNNAVNVPLNKTILVTFNEPIIGGNNQIELRDNNGSTISTV
NTINGNVLTITPSTLFSYGKIYTLHLLAGSYKDLAGNLLGDYNYSFAARNLVLNLNTNQT
YSTIQDAVNDASPNDIIQPLSGTYIENILISKTLTIMPVSGSRVIVQALISSSPVFNLTS
NGIIIQGMTIRGSTNNQSAVYINSGASNCIINGNTITNNYVGINNVLSNNTRITNNNITN
YSYMGINMGKDHLYTNNTLIQNNIITTGLSGITYGIHFGDCKNTTIIGNSILWEGSSTTG
VTSLGINAQDSTANINFNRIAGFTYCGLRDQNSTVNYSNNWWGTNNPIYFTNGDSNGDVC
DPNAISNPYPYLKLKISSNKNPTGLNNTCSITADLTHDNNGKNTSNSGSLPDGIPINFTS
TLGTIANPGYTRYGKAVTTFTGSIYGNATINATLDNQIVSTMVNLVKVYNNRTLASYTNI
QSAIDDALSGDTIIVEDGTYNENITLNKKLTLKSDVNSNSIIKGVVTISSNGSNSVLQDL
IVNGHVNLFANNCNIIGNRIIGNGSSGVIASTSINNFIFNNTITANGYDGINSTFSNNTY
SGNEIFGCHSGIYSYYSADTIDGNDLTGNYYGIWTYNAADLIHFNRISGNTYGLRNDLGI
VDATDNWWGNNNDPSTESSNINLVSGSVNSSSWLVLSVNTSSTNSGGKTSVTADLTHDNT
GSDTSSNGHIPDGIPVNFNTNFGTIIGTAYTLKGKSSTILNLGTTQNATVTCNATLDNQN
VSTTSLIITGVAVLNITSTAVDNATGSPLNTTYTIPLNNSVTWLSVLWINRGMFTDEMQI
IIDGVVVQDKYFTNPAYTKWQNSYPTSLFDAIKYVNQHLPFIATTELPTFWNNLTTQYNL
TSEELTFIKNHSQDFTDNITFDIVYSGSPGLKLNVTDSHSNIFNLNFPGNAIKRTSQVIY
VGSQGEGVKSFAIATTDVTADVLQYWWNQYSSYQTGDVKNVAYNTFLTALTVEYLHDQIA
DNITTLLNVTWSRTSPIIVSVAEDPQQIYVTLECDHGMGMTVVGQFEDIYVFNFMTSFYI
SNIEDDVMSNAYNLSFNSVTMDLLYRYNNNKNDLESIEEDGFIIVKSISNDNFLVFDSET
GMVRDIDTVHNFYGGYYFYKQTTNMINYITLIGFKYLYWQISNPWDLGNFQFLWNGTGNV
FISSNGKFLADISADNILEITGPMGSKTVVGTQGALDITDILDANAGLQNLHLILTDTDQ
GFIATSPLYILWAGIDRQDLELPQLFPTPSFTWPPSPFPPLPLPPANFPPTPWDQNSPEI
PIDPNTVFKDFWRDTINPFISIHNYILKSQDLPPNAQIPPGSLYIVIHTPFNDAEGNPYY
YIPWIQPGGA
NT seq 5433 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggattaaataagaaaagtttattttttgtaatgattatttttgtatttttaatatta
tttacaggttcagtatctgcgactgacaccactgctccaacagtgactaatgttgatccg
gctagtggtacatcaaatgttccagggaataaagtaattaacgttactttcagtgagcct
atgcaacatggttatgatagtgttgaattgaaggacagcaatagtaatgttattccaatt
actcagtcgttaggtagtagggttttaacaattacaccgaatgactacttggatcatgga
ggttacacccttattttacatactggttgttataaagatcttgcaggtaacaatttagct
gtgtatacatcaacttttacggttgaaagcacagcaccaacagtcatagctgtcgatcct
gatgatgatgctacggggataccgggaaataaacaaattaaagtcagtttcagtgagcct
atgcaacagggtaatagacttgttgatttgaaggatagtaacggtaatgttattccaatt
actcaatcattgggaagcagagtgttaacaattactcctaatgactatttaaatcacgga
acatacacattaaccttacatacgggctgttataatgatttagctaataattatctaaat
ttatggtcctcaaattttgcagttgaaagtacagcaccaacagtcacagatatcgatcca
gataacggtgcaacaaatatacctgcaactaaaataatcaatgtcactttcagtgaactt
atgcaacagggtaatagacttgttgatttgaaggatagtaacggtaatgttattccaatt
actcaatcattgggaagcagagtgttaacaattactcctaatgataatttaaatcacgga
acatacacactaacattacatagtggttgctataatgatttagctaataactatctgaat
gtatggtcctcaacctttacagttgaaagcacagcaccaaccgtcacagatatcgatcca
gataacggtgcaacaaatataccaatcaataaacaaatcaaagtaactttcagtgaaaca
gtgcaaagtggtacaggatcagttcaattgaaggatagtaataataatattgtttctatt
actaaatcattggctaataaagttttaactattattccaagtaatctaagtccaggacca
tatattctttatctatataatggatgttacaaggatttagcaaataataatttagcaaca
ttcacctctagttttactgtagataatattccacccagtgtaatcagttgtgatcctgtt
aataatgctgttaatgttcctttaaataaaacaattttagttacttttaatgaacctata
attggtggcaataatcagatagaattaagggacaataatggttctacaatctctacagta
aatacaataaatggaaatgtgttaaccataacaccaagtacattatttagttatgggaag
atttatacattacatttacttgcaggaagttacaaggatttggctgggaacttgttaggg
gattataattacagttttgcagctagaaacttagttttaaatttaaatacaaatcaaact
tattccactattcaagacgccgttaatgatgcttcaccaaatgacattattcaaccacta
agtggaacttatatagaaaatattttaattagcaaaacacttactataatgccggtttct
ggttctagagtaatagttcaagctttaatatcatctagtcctgtttttaatttaactagt
aacggcataattattcaagggatgaccatcaggggatctactaataatcaatcagcagta
tacataaattctggtgcttcaaactgcataatcaatggtaacaccattacaaacaactat
gtgggaataaataatgtattgtcaaacaatactaggataacaaacaacaacatcacaaac
tatagttatatgggaatcaacatgggaaaagatcatttatatacaaataacaccttgatt
caaaacaatattataaccacgggactttcaggaattacctatggaattcactttggagat
tgtaaaaacacaactatcataggtaattctattttatgggaaggtagtagcacaacaggt
gttacaagtctgggtataaatgctcaagattcaactgctaatataaatttcaatcgtata
gctggattcacatattgtggattacgagatcaaaatagtacagtcaattattcaaataat
tggtggggaacaaacaatccaatctatttcactaatggagactccaatggagatgtttgt
gatccaaacgcaatttcaaatccatacccatatttaaaattgaaaatctcatcaaacaaa
aatcctactggcctaaataatacctgttctattactgcagatctgactcatgataacaat
ggtaaaaatacctccaattctggaagtttacccgatggaattcctattaactttacatct
acattaggaactattgcaaaccctggttatacaagatatggtaaagctgtaactacattc
acagggtcaatttatggcaatgctactattaatgcaaccttagacaaccaaatagtatcc
acaatggtcaatttagttaaagtttataacaacagaacattagcaagttacacaaatata
caatccgcaatagatgatgctctaagtggcgatactattatcgtcgaagatggaacttat
aatgaaaatattaccctgaataaaaaattgactcttaaatctgatgttaacagtaattca
attattaaaggagtagtaactattagttccaatggaagtaattctgtgcttcaggattta
atagtgaatggccatgttaatttatttgcaaacaattgtaatattattgggaataggatt
attggaaatggttcatcgggagttattgcttcaacttccattaataacttcattttcaac
aatactataactgccaatggttatgatggaatcaacagcacatttagtaacaatacctat
tccggcaatgaaatatttgggtgtcatagtggaatttattcgtattattctgctgataca
attgatggtaatgatttgactggtaactactatggtatttggacttacaatgctgcggat
ttaattcattttaatagaatatctggaaacacatatggtcttagaaatgatttaggaatt
gtggatgcgactgataattggtggggtaacaacaatgatccatcaaccgaatctagtaat
attaatcttgtaagtggatcagtaaactcctcttcatggttagttttaagtgtaaatact
tcatctacaaattctggtggaaaaacgagtgtaacagctgatttaactcatgataatact
ggatcagatacatcttcaaatggtcatattcctgatggtattcctgtaaatttcaatacg
aactttggaacaattattggcacggcttatacattgaaagggaaatccagtactatctta
aatttaggtacaacacaaaatgctacagttacatgtaatgcaacccttgataatcagaat
gtatcaacaacaagcttaataatcacaggtgtggcagtactaaatattacaagcacagca
gttgacaatgctacaggatcaccactgaataccacatatactattcccttaaataactct
gtgacatggttgagtgttttatggattaacaggggcatgtttacggatgaaatgcaaata
ataatagatggagtagtagttcaagataaatactttaccaatccagcttatacaaaatgg
caaaatagttatccaacatcactttttgatgctatcaaatatgttaaccagcatttgcca
tttattgccacaactgaattacctacattctggaataacctcacaacacaatataaccta
acaagtgaagaactaaccttcatcaagaatcattcccaagattttacagataatataacg
tttgatatagtttattctggatcacccggattgaaactaaatgtaactgactcacattca
aatatttttaatttgaacttcccgggaaatgctattaaaaggactagtcaagttatatat
gtcggttctcaaggggaaggtgtgaagagttttgctatagcaacaacagatgtgactgct
gatgttttacaatactggtggaatcaatattccagttatcaaactggggatgttaagaat
gttgcttacaatacttttctaacagcattaacagttgaatatcttcacgaccaaatcgca
gacaatattacaactttattgaatgttacttggagtcgtactagccctatcatagtttct
gttgctgaggatccacagcagatttatgtgactttagagtgtgatcatggtatggggatg
acagtagtaggacaatttgaagacatttatgtatttaactttatgacatcgttttatatt
tcaaatattgaagatgatgtaatgagtaatgcatataacttgagttttaattctgtgaca
atggatttactctacagatacaataataataagaatgacttggaaagcattgaagaagac
ggattcattatagtaaagtccatatcaaatgataatttcttggtgtttgactcagaaaca
ggcatggtaagggatatagatactgttcataatttttatggaggttattatttctataag
caaactacaaacatgattaattacattacactaataggatttaaatatttatattggcaa
atatcaaatccgtgggatttggggaacttccaatttctttggaatggaaccggaaacgtt
tttatctctagtaatggtaaatttctagctgatatcagtgctgataatatattggaaatt
acaggacctatgggatcaaaaactgttgtagggacgcaaggagctttggatattacagat
attcttgatgcaaatgcaggtcttcaaaatcttcaccttatacttacagatacggatcaa
ggctttattgcaactagcccattatatatactctgggcaggtatagatagacaagaccta
gaattacctcaactcttccccactccgtcatttacttggcctccatcaccatttcctcca
ttaccattaccaccggccaacttcccaccaaccccatgggatcaaaattctccagaaatt
ccaatagacccaaacacagtttttaaagatttctggagagacacaataaacccatttata
tcaatacacaactatatactaaagtcccaagatttacctcctaacgcacaaatacctcca
ggttcactatatatagtaatacatacccctttcaacgatgcagaaggtaacccctattat
tacattccatggattcagccaggaggagcatga

DBGET integrated database retrieval system