Mucilaginibacter empetricola: HDF24_23420
Help
Entry
HDF24_23420 CDS
T11619
Symbol
bamA
Name
(GenBank) outer membrane protein assembly factor BamA
Organism
memp Mucilaginibacter empetricola
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
POTRA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XPY84990
LinkDB
All DBs
Position
complement(5310120..5312675)
Genome browser
AA seq
851 aa
AA seq
DB search
MNKFLFAILFSVLSTAAVAQISNQPRFSLSKSALPADSLSYLEPKDYIIGGVTITGTKNL
DKDVLLTISKLNKGDRINLPGEANANVIKNMYSQGLFDDVQLYITKINLDTIYLEIAVVE
RPRLSRMHITGLRKGEIEDVQKKLSDKTGKIVNENLLSTTTAIIKKHFNEKGFLNTTVTI
VQRKDPGDANSVILNIKVDKKQKVMITQVTFEGNSAFSQKKLAKFLKKTRVRKWYNLFGS
KKFKQDKYEEDKQNLITEMQDKGYRDAELLSDTVFKTGENTVGVKIKIFEGHKYFFGNIK
WSGNAKYPADVLNRIFKIKKGDIFSEDELNKRLSGPTPNNDDVSSFYLNDGYLTYQADPV
QTKIYHDTVDLDIRVYEGPQYTINRVILKGNDVTNDKVVMREIRTKPGQKFNKELLIRST
REIGQLGNFDEQKTEPKPTNINPQDGTVDIVYNVVEKPSDQIELSGGFGGGQLVGTLGLT
FNNFSIRNIFHLKDYKPLPKGDGQKLSLRGQSSGRTYQNYSFTFSEPWLGGKKPIYFAFS
AYTQLSSTGQYYAPTNPLYNNLRINGAGITLGRRLNWPDNYFQLNYSLNVDHYDLDNYTG
YLFQNGTSYNIKLTQELSRNSLDAPIYPTTGSNIKLTIQATPPYSLFNDINYKIATPEQR
YHFVEYYKFKYDAQWFTRISGKLVLMSQVRFGFIGEYNTEVGPTPFERFKLGGDGMQSYQ
FLQGSDIVGLRGYQNFTVIPEGTNYNANNNPGSPIYDKFTFELRHPVIQSQSATIFVLAF
AEGGNVWNSFDTFNPFDVRRSAGVGARVFLPIFGLLGLDYGYGFDSIPGIPGANKGQFSF
SISQSLNGGFN
NT seq
2556 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaatttctttttgctattcttttttctgttttgagtacggcggcagtagcccag
atatcgaaccaaccacggttttcgctttcaaaatcggctcttccggctgatagtttgagt
tacctggaacctaaagattatataattggtggtgtaactattaccggcacaaaaaatctg
gacaaggatgtattgcttactatatcaaaactgaataaaggcgaccgtataaacttacca
ggtgaggctaatgccaatgttataaaaaatatgtacagccagggcttgtttgatgatgtg
caattatacatcaccaaaataaacctggatactatttatcttgaaattgcagttgttgag
cgtccgcgtttatcgcgtatgcatataaccggcctgcgtaaaggtgaaattgaagatgta
cagaaaaagttgtcggacaaaaccgggaaaattgtaaatgagaatttactgagtactacc
acagcaattattaaaaagcattttaatgaaaaaggcttcttaaatactactgttactata
gttcagcgtaaagatccgggagatgccaatagcgtaattttgaatattaaggttgataaa
aagcaaaaagtaatgataacgcaggtaacctttgagggtaactcggcgttttcgcaaaag
aaattagccaaatttttgaaaaaaaccagggttagaaagtggtataacctgttcggctca
aaaaaattcaagcaggataagtacgaagaggataaacaaaatctgataaccgaaatgcaa
gacaagggctaccgcgatgcggagcttttaagtgataccgtttttaaaaccggcgaaaat
acagttggtgtaaaaattaaaatatttgagggccataaatatttcttcggtaatatcaaa
tggtcgggcaatgctaagtatccggcagatgtgttaaacaggatatttaaaattaaaaag
ggcgatatatttagtgaggatgaactgaacaaaaggctatcgggcccaacacctaataac
gacgacgtttcgtcattctatttgaacgacggttatttaacttatcaggccgatccggtt
caaaccaaaatttaccatgataccgttgatttggatatcagggtttatgaaggtcctcaa
tataccattaaccgtgttatattaaaaggtaacgatgtaaccaatgataaagtggttatg
cgcgagattagaactaaaccgggtcaaaaattcaacaaagaattattaatacgcagtacc
cgtgaaattggacagttaggtaactttgatgagcaaaaaacagaaccaaagcctaccaat
atcaatcctcaggatggaacagtggatatagtttacaacgtggttgaaaaaccatcggat
cagattgagctatcaggcggttttggcggcggccagctggtaggtacattgggtttaacg
ttcaataacttctctatccgtaacatcttccacttaaaagattacaaaccgctgccaaaa
ggtgatggtcaaaaactgagcttaagaggccaatcaagcggacgtacttatcaaaactac
tcgtttacgttttcagagccatggctgggtggtaaaaaaccaatatattttgcgttttca
gcttatacacagttaagttcaaccgggcagtattatgcgccaactaacccattatacaat
aacctacggataaatggtgcgggtataaccctgggtagacgcttaaactggcctgataac
tacttccagttaaattactcgttaaacgttgaccactatgatttggataattataccggc
tacctgttccaaaatggtacctcatataacattaaattaacacaggagttgtcacgtaat
tcacttgatgcacctatttatccaacaacgggttcaaacattaagttaactatacaggca
acgccaccatactctttgtttaacgacattaactataaaatagcaacccctgaacagaga
taccattttgttgaatattacaaatttaaatacgatgcgcaatggtttacccgtataagt
ggtaaactggtattaatgtcgcaggtaagatttggtttcattggtgagtacaatacagaa
gtaggccctacgccgtttgaaagatttaaactaggtggtgatggtatgcagagctaccag
tttttacaaggtagtgatatagtaggcttaagaggttaccagaactttacggtaatacct
gaaggtactaactacaatgccaacaacaatcctggaagccctatttatgacaagtttacg
ttcgaattaaggcatccggttattcaaagccaatcagcaacaatatttgtgctggctttt
gctgaaggcggaaatgtttggaattcttttgatacctttaatccgtttgacgttaggcgt
tcggcaggtgttggagcgagagtgtttttacctatatttggtttgttagggcttgattat
ggttatggatttgattctataccaggtataccaggtgcaaataaaggacaatttagcttc
tccatatcgcagagccttaacggtggttttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system