Candidatus Megaera endosymbiont of Mesostigma viride: LF888_06825
Help
Entry
LF888_06825 CDS
T07589
Name
(GenBank) 50S ribosome-binding GTPase
Organism
menm
Candidatus Megaera endosymbiont of Mesostigma viride
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RickCE_cat
MMR_HSR1
Peptidase_C48
AAA_22
RsgA_GTPase
ABC_tran
AAA_29
AAA_16
Dynamin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCM94756
LinkDB
All DBs
Position
pMegNEIS296:61547..66781
Genome browser
AA seq
1744 aa
AA seq
DB search
MKAQRKELRDDYNLWYGADELVSILTRYIPNVEVNLPAVDLNALDKQLGHVQNQGQYFIP
LNVNGISKGFEESRNNHWVGLYVITSEDKLTVKYLDTMGHPINSYLERVIKDKLGIHNIE
QPLQAQGIQFVQQVSEIELEGNTDDCGPFLIYCMTCLANNKSLELGINTLEQSISLGRFL
RESFNRSSDFKEIYQTVSGDIISELEKVVGQLEVLGIESTDTKQENKEHKSVTTKSNFLP
KKQPNILELVGTIINKIKGGYETIVNDHDEVILVIGKTGAGKSTLVNYLTNPEKMEVKLY
KAPNIKYGKGSLVIDILKGSSGLPKPGHTKDSETTIPNKWQDSGSGIVYWDCPGFGDNQG
ADQDIANAFFIKKIFETSNKIKLILAISWEDLENGRANEIKNLTDTLGTLFNDFSIIKDS
LSLIITKIPDSKDSDDVKGELEKLLQAKCFQEESVAKNILEFFLDSDNKISLFNQPTKPG
PVIEVLGLDDQAQILDTVRNTKFINSPQVTIAVAPTSQIKIRELADLIHHEINSVILKLT
EKYLIQHGCTKWNGNLRYSKNDLIDFVQSFKEGSEILENFINSIKLSKSEEIEELSEIEK
AEKIIGEINTIFKYNDISKEHKELKQYIDTFKFFIQVSPDAQNSLATSDFVQNFQMASDV
INQNLDTAEGHLIRILVDEAENLLKKFVEAVKDRLHDELAQAIEQNDPRLVESCQKYVNE
ISNLFSKKLTLETLVFFEEKLKEYGLKANLDELKLHGKVFDILSAESKQHYNSVLDKVVR
PLHILEREYDSAIKDIEIAVHNEFEKYFHQFISSVNQLKSKDLVQLQDLIRQLDGCVVGL
QHQSDAVSFVDVTLKTWPEVDFLIMAKEEAKKINVLNEIGIKIQLINESKLSNYVEQLKG
VKYKLEVIFIKEVESKITNYIDQCISQIKEGCNKLSQSQKSELLDVIAKREIFQGEDFFE
CIGQLGRLIERKFNDLISITEVVEELSALKELGSIVNNLTMIDIFSNKMLRLSEYIVSDE
AIQNFVLGIKGYVETIEKESNNIEDIPPYLKKLNTLFSNVFEFSGLKIAAFVKQMQENLI
LQIGEHPKIQECLTYLEAMKNTEGNVDYQNHLNPLLRLGKEIKDSLDWYNSVKPIHEIII
EKGYLFANDYPAINRDNFIEFLKILQSNGLKLTQEISYHDYKAEQLNNLLNHSWSKPKIT
KSSAEVTIEGECIKASDVVKYISSNIKLVKIKCLNTILFDQDIQAKGVSLVVIAPLWNVM
QSIKVDLSGKDSGPNLSVKARDGIGYKSGGIGSDGCNGLSGSTGGHSGHFYGIGHKFIDL
QRITFDLKGGRGGDGQNGGNGSSGQNGLDATITDFWEGKGIWQPNERDMKTKFDKMYNRI
ELCKGHLGYKGGDGGKGGLGGKVGEAGKVKILNSIGEEWKLEFPYEETRNGKDGISGLSG
IGGKYGNDLKVYYYQNQYTTLRGSEPVLINLHAHNGSSPIEKNFTHHQHFFRVVDLEKSI
VPKMKQEAKLLKDKVDTSDFYYKVQSPVLEKFSGLFGDGCSIKKIGEQEADWGYVKEFNR
YYDDGIETILKLRIEHSGINQDKNVKLLKAKYLLDHDINNISTLVQDLDNIFSEEDIVLV
PYNLYRAHWVGMIFEKVDDNVIIKYIDSENNSIPEKLEKELVARLNDIGYKVEFIQEVLS
YQQTNNCGPEVIENFIWYLTGARLPQEKAVPFHSQLLEEALLFQSNENDVVSLVHLVGTE
IEYI
NT seq
5235 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagcgcaacgtaaagaacttagagatgattataatttatggtatggagcggacgaa
ttagtttcgatactaacacgatatataccgaacgttgaggtaaatttacctgcagtggat
cttaatgctttagacaaacaattaggtcatgttcaaaatcagggtcagtattttattcca
ttgaatgtcaatggaatatcaaaaggttttgaagaaagtaggaataatcattgggttggt
ttatatgtaattacatctgaagataaattaactgtaaagtatttggatacaatggggcat
ccaattaactcttatttagaaagagtaattaaggataaacttgggatacataatatagaa
cagcctttacaagcgcaagggatacaatttgttcagcaagtttcagaaattgagcttgag
ggtaatactgatgattgcggaccttttctaatatactgcatgacttgtctagcaaataat
aaaagtttagaacttggtattaatacactagaacaatcaatttccttagggcgattttta
agagaaagttttaatagatcatctgattttaaggagatatatcaaacagtatcaggagac
ataatatctgaattggagaaagtagttggccaattagaagttttaggtattgaatctact
gatactaagcaagaaaataaagaacataagagtgttacaacaaaaagtaattttttgcct
aaaaaacaacctaatatactagaattagtaggaactataattaataaaattaaaggtggt
tatgagacaatagttaatgaccatgatgaagtaatattggtgattggtaaaacgggagca
ggtaaaagtactttagtaaattatttgactaatcctgaaaaaatggaagtaaagttgtac
aaagcaccgaacattaagtatggaaaaggaagtttagttattgatatattaaaaggtagc
tctgggttacctaaacctggtcatacaaaggattcagaaactacaatacctaataaatgg
caagattctgggtctggaatcgtttattgggattgtccaggctttggagacaatcaagga
gcagatcaagacattgctaatgctttttttataaaaaaaatatttgaaacttcaaataag
ataaaattaatattagctattagttgggaagatcttgaaaatggtagagcaaatgagatt
aaaaatttaactgatactttgggaactttgttcaatgattttagtattattaaggatagt
ctatctttaataattactaagataccagattctaaagatagtgatgacgttaaaggggaa
ttagaaaaattattacaggcaaagtgtttccaagaagaatctgtagctaaaaacatactt
gaattttttttagactcagataataaaatatctttatttaaccaaccaactaaaccgggc
cctgttatagaggtgttaggtttagatgatcaggcacaaatattagatacggttagaaac
acaaagtttattaattctcctcaagtaacaattgcagttgctccaacctcacaaataaag
attagagaattagctgatttaatacatcatgaaattaatagtgtaattttaaaattaact
gaaaagtatcttatacagcatggttgtacaaaatggaatggaaatcttaggtatagtaaa
aatgacctaattgattttgttcaatcatttaaagaaggcagtgaaatattagaaaatttt
attaattcaattaaattatccaaaagcgaagaaatagaagagttaagtgaaatagaaaaa
gcagaaaaaataataggagaaattaataccatctttaaatacaatgatatctctaaggaa
cataaagaattaaaacaatacattgatacatttaagttttttatacaagtttctcctgat
gcacaaaatagtttagcgacaagtgattttgtacagaattttcaaatggctagtgatgtc
atcaatcaaaatttagataccgcagaaggacatctaataagaatacttgttgatgaagca
gaaaacttactgaagaaatttgtagaagctgtaaaagatcggcttcatgatgagttggct
caagctatagagcagaatgatccacgtttagttgaatcttgccaaaaatatgtaaatgag
atttcgaatttatttagtaaaaaactaaccttagagactttagtgttctttgaagaaaaa
ctgaaggaatatggtttaaaagcaaatttagatgagcttaaattgcacggaaaagttttt
gatatactaagtgcagaaagtaagcaacactataacagtgtattagataaagttgtaagg
cctttacatattttagaaagagaatacgacagtgcaataaaagatatagaaatagcagta
cataacgaatttgaaaaatattttcatcaatttattagtagtgttaatcaattaaaaagc
aaggatctagttcagttacaggatttaattagacaattagatgggtgtgttgtgggtttg
caacaccaatccgatgctgtaagttttgtagatgtaactcttaaaacatggcctgaagta
gactttttaattatggctaaagaagaagccaaaaaaataaatgttcttaatgaaatagga
attaaaattcaattaataaatgaaagcaaattaagtaactatgtagagcaattaaaggga
gttaaatataaattagaagtaatttttattaaagaagtagagagtaaaattactaattat
atagatcaatgtatttcccaaattaaagaaggctgtaataagttaagtcagtcacaaaag
agtgaacttttagatgtaattgcaaaacgtgaaatattccaaggagaggatttctttgaa
tgtatagggcagttaggacgattgattgaaaggaaatttaatgatttaatttctattact
gaagtagttgaagaattaagtgctttaaaagaattaggatctattgttaataaccttaca
atgatagacatatttagcaataaaatgttaaggttatcagaatatatagttagtgatgag
gcaatacaaaactttgtattaggaataaaaggttatgtagaaaccattgaaaaagaaagc
aataatatagaggatattcctccatatttaaaaaaattaaatacgttattttctaacgta
tttgagtttagtggtttgaaaatagctgcctttgttaaacaaatgcaggaaaaccttatt
ttacagatcggtgaacatccaaagattcaagaatgtttaacttacttggaagcaatgaaa
aatacggagggtaatgtagattatcaaaatcatttaaatcctttattaagattagggaag
gagataaaagatagcctagattggtataatagtgttaagccaattcatgaaattataata
gagaaaggatatttatttgctaatgattacccagcaattaatagagataattttatagag
tttttaaaaatattacaatcaaatgggctaaaattaacgcaggaaattagttatcatgat
tataaagctgaacaattgaataatttactaaatcatagttggagtaagcctaagataact
aagagtagtgcagaagtaactattgaaggtgaatgtataaaagcaagtgatgttgttaaa
tacatctcaagtaatattaaattagtaaaaataaaatgtttaaatacaatactttttgac
caagatatacaagctaaaggagtaagtttagtagtaatagctcctttatggaatgtaatg
caaagtattaaagttgatttaagtggtaaagactcaggacctaacttatctgttaaagca
agagatggtattggttataaatctggtggtataggaagtgatggttgtaatggactatct
ggttctacaggaggtcattctggccatttttatggtataggacataaatttattgattta
caaagaattacttttgatttgaaaggtggtagagggggtgatggacaaaacggaggaaat
ggaagttcaggacaaaatggtttagacgctaccataactgatttttgggaaggtaaaggt
atctggcaacctaatgaaagagatatgaaaactaagtttgataaaatgtataatagaatt
gagttatgtaaggggcatttaggttacaaagggggtgatggtggtaaaggtggactcgga
ggtaaggttggggaagcaggaaaagtaaaaatattaaatagtattggagaagaatggaaa
ctggaatttccttatgaagaaactagaaatggtaaggacgggatttcgggtctatctggt
ataggggggaaatatggtaatgatcttaaagtatactattatcaaaaccaatatactaca
cttagaggatcagaaccagttttgataaatcttcatgcacacaatggttctagtcctata
gaaaaaaactttactcatcatcaacatttctttagggttgttgatttagaaaagagtatt
gtaccaaaaatgaaacaggaagcgaaactgttgaaggataaggttgatacaagcgatttt
tattacaaagttcaaagtcctgttttagaaaagttttcaggactttttggtgatggatgt
agtattaaaaaaattggtgaacaagaagctgactggggatatgttaaagaatttaataga
tattacgatgatggaattgagacaatattaaaattaagaatagaacattctggtattaat
caagataagaatgttaaacttcttaaagctaaatatttgttagatcacgatattaataat
attagtacattagttcaagatttagataatattttttcagaagaagatatagtacttgtt
ccatataatttatatagggctcattgggttggcatgatatttgaaaaggttgatgataat
gtgattataaaatatatagattctgaaaataattcaataccagaaaaattagaaaaagaa
ctggtagcaaggctaaatgatataggttataaagttgagtttatccaagaagttttaagt
taccaacaaaccaataactgtggtcctgaagtgattgagaattttatttggtatttaaca
ggggcacgcttaccacaagagaaagcagttccatttcattctcaattactagaagaagcg
ttattatttcaaagtaatgaaaatgacgtagtatctttggttcacttggttggtactgag
attgaatatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
