Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis Issoire-Mx1: MMINT_11670
Help
Entry
MMINT_11670 CDS
T02692
Name
(GenBank) putative surface layer protein
Organism
mer
Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis Issoire-Mx1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Insulin_TMD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGN26504
UniProt:
R9T776
LinkDB
All DBs
Position
complement(1146561..1150511)
Genome browser
AA seq
1316 aa
AA seq
DB search
MSENNEVTVSNLTDLKNALGGNIKLAQDITISNESGPLTLINGTILDLNGHTITIPSVGN
ESNKNDTSNSNIDSNSNRLVIADNATVTIKDGKIVYSGTLGDISPIRVGQTKTSVTDANV
QTLNLNNVDIISNGYGVAVFSKGVLNITGGSITADSSAVATNGGNPVENGTTNSADAKIT
LNGGCYTSTTTAAIYFPGGAELNVTGGTFTGKTGFDIRSGTVTIDDNAIINVLGSPDEKK
TDDDGPTPWGMGVAVFDNTAYGKNTDDNDSVTQTPINVTVNSANIYNAAYAYYFTSFGSY
DDLRIEGGSFNTSQQTIPSASHNVSISIPGNGNSFVNLSKGATVTPTKLQADGTDNSQKH
PITIETIGIDNFIFANGTPISIGSGSLSDSKIEYKDNSGNTILFVDNFDLSTFTVFGGSN
NAGETVTSSEITMNGGKAYGIVGGGYGNATVGTSTITIDGGKATYVAGGGWSTDSSTTAV
SLEALKNKTTTTNVTINGGDILYAVGGGRLGYTHVETANLTINGGNFDEIVAGGINGYTK
TANLTVNGTSKITTGLISSGNRGQVSNVTVDIKSLGTEGSANIVVIGALSGFTSTDGGPN
AIFDNITFKITEDINGIDKIFLGGAKWSKGSNPWITSRINSLSDTTITIDAPGYTVSAAD
ISNANDYTNITVQASDYTIGDGKTWTLTESSKLEIIEGSSLTTNGSGKFINEGIIEVNSA
DALKNAINLCSGTIKLMDNINVVNSVDVNVEEGYTTSLLISNNVTLDLNGHTLTLSSAGS
GIYVGAGGYLTIMDSSNSKGSIIYTYSDMSNATIMVNGTSPDYAQLVLEKCNIFVVNTTG
AYDAGYGVFASTYSKVSSDKDVSITAGYSAISGNGTDNGAEITISGGKYTSNASAAIFFP
STTNLTVTGGKFIGKTGFDIRAGTVSISNAEISINQNEPIDSTGASGPSSWGMGVAVIDH
PNYGSVGTTGNKSYSDISVTISKTAVTGAKYDLYVGDLNRGKNGEFLGTDGTFTANHSIE
VEVNGSTVYTVAADDTNAERFTSTIKSSSGGSSGGYPVNPPVTPDTPEEPIIPDSSGNAE
IKVDDKKADELVHETVASGSNTLSIVDKDNVEGTVTSVSISVSDLETISKKIENNNNIDS
ISIATSEGEVIIEKEVLAEILENNSEADTLIIEVNNAENKLTEEQKKVVGDNPVYDITIR
AGNENISSFNGKSITVSIPYELKEGEDQNNLIVYYLKDDGSIEKMNCSYKDNQVSFETNH
LSKFIIVYEAQEPIVPDNPDDKNDDNNSDNTVYYIIAAVIIILIIIALAYYFMKKK
NT seq
3951 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagcgagaataatgaagtaactgtttctaatttgactgacttgaaaaatgccctgggt
ggcaatattaaattggctcaggatattacaatatctaacgaatccggaccattgactctt
ataaatggaacaatccttgatttgaatggtcatacaattacgattccatctgtaggtaat
gaatctaataaaaatgatacatctaattctaatattgattctaattctaatcgattagtc
atcgcagataatgcaacggtgaccattaaagatggtaaaattgtatacagcggaacgtta
ggagatatatcaccaattagggtaggtcaaactaagacatccgtaactgatgcaaacgtg
cagactttgaatctaaacaatgttgacataatcagcaatggatatggtgtagcagtcttt
tccaagggagtactcaatataaccggtggttcaattactgcagacagttcagccgttgct
acaaatggaggcaatcctgtcgaaaatgggaccacaaattctgctgatgcaaaaataact
ttgaatggcggatgctatacttcaacgacaactgccgctatctattttcctggtggagct
gagttaaatgtcactggcggaacattcacaggaaagacaggatttgatattcgatcaggt
actgtaaccattgatgataatgcaataataaacgttctcggcagtcctgatgaaaagaag
actgacgatgatggcccaacaccatggggaatgggtgtagctgtttttgataatactgca
tatggaaagaatacagatgataacgatagcgtaactcaaacaccgattaatgttactgtc
aattcagctaatatctataatgcagcatacgcatattatttcacttcatttggttcatat
gacgatctcaggattgagggcggctcttttaacacatctcaacaaactatacctagcgcg
tctcataatgtatccatatctatccctggaaacggtaatagttttgtaaaccttagtaaa
ggtgctaccgtcacaccaacaaaactacaagctgatggaaccgacaactcccaaaaacat
ccaattacgattgaaacaatcggtattgataattttatctttgccaatggaactccaata
tcaatcggttcaggatcattatctgattctaaaatcgaatataaagataatagtggtaat
actatattatttgttgataatttcgatttatcaactttcactgtgtttggtggatcaaat
aatgctggggagactgtcacttcttcagaaatcacaatgaatggcggaaaggcttatggt
atcgttggtggcggatatggaaacgcaactgttggtacgtcaacaataacaatcgatgga
ggaaaagcaacatatgtagccggtggaggctggtctacagatagctcaacaactgctgtc
agtctagaagctttaaaaaataaaacaacaactaccaatgttaccattaatggtggagat
atcttatatgcagtaggtggcggcagactaggatatacacatgttgaaactgccaactta
acaattaatggtggaaactttgatgaaatcgttgctggcggtattaatggatataccaaa
actgcaaatctcactgttaacgggacttcaaagataaccactggtctgatctcttcagga
aacaggggacaagtatccaatgtaactgttgatatcaaaagtttaggaacagaaggtagt
gctaacatcgttgttattggagcattgtctggattcacaagtactgatggtggaccgaat
gctatatttgataacattactttcaaaataactgaggatattaatggaattgataagata
tttcttggcggagccaaatggtcaaaaggaagcaatccttggatcacatcaagaatcaat
tcattaagtgatactactattacaatagatgcacctggatacacagtatcagctgcagac
atctctaatgcaaatgattatacaaatattactgtacaagcttctgattacaccattggt
gatggtaagacttggacactcactgaatcttctaaacttgaaataattgaaggtagttca
ttaacaactaatggatctggaaagttcatcaatgagggtataatcgaagtaaattctgca
gatgctctaaagaatgcaattaatttatgttctggaacaataaaacttatggacaatatt
aatgttgttaattcagttgatgtaaatgtggaggagggttatacgacttcactacttatc
tcaaataatgtaacattagatctcaatggtcataccttaacactttcatcagcaggttct
ggaatatatgtaggagcaggtggatatctaacaataatggactcgtcaaattctaaaggt
tctatcatctatacatattcagacatgtccaatgctactataatggtaaatggtacttct
ccagattatgcacaattagttcttgaaaagtgcaatatatttgtcgttaataccactggg
gcttatgatgcggggtacggagtattcgcttcaacttattctaaagtatcttcagacaaa
gatgtctcaatcactgctggttactctgcaataagtggaaatggaactgataatggagct
gaaataactatttcaggtggaaaatacacatctaatgcatctgccgcaatattcttccct
tcaacaactaatctgactgtaactggtggaaaattcataggaaaaacaggatttgatatt
agagctggaactgtttcaatttcaaatgctgaaatttcgatcaatcagaatgaacctatc
gattcaacaggtgcatctggtccgtcttcatggggaatgggcgttgcagtaattgatcat
cctaactatggctccgtgggaacaacgggtaataaatcatattcagacatctctgtcaca
attagtaaaacagctgtaactggtgcaaaatatgatttatatgttggggatttaaatagg
ggtaaaaacggagagttcttaggtactgatggaacattcacagctaatcatagcatcgaa
gttgaagtgaatggaagcacggtctataccgtggctgctgatgatacaaatgctgaacgt
ttcacatcaaccattaaatcaagttcaggcggcagcagcggaggataccccgtcaatcca
cctgtaactcctgatacaccggaagaacctatcatacctgacagcagcggaaacgcagaa
attaaggtagatgacaagaaagcagatgaattagttcatgaaacagtcgcatcaggctca
aacacgcttagcatagttgataaagacaatgtagaaggaacagtaacatctgtatcaata
tctgtttcagatttagaaacaatttcaaagaagattgaaaacaataacaacattgattca
atttcaatagcaacttcagaaggagaagtaattattgaaaaagaagttcttgcagaaata
ttagaaaataattcagaagcagacacgttgatcattgaagtaaacaatgcagagaacaaa
ttaacagaagaacaaaagaaagtcgtaggagacaaccctgtatatgacatcacaatcaga
gcaggaaacgagaacatatcaagcttcaacggtaaatcaattactgtatcgataccttat
gaactcaaagagggagaagatcaaaacaacttgattgtttattatctcaaagatgacggt
tcaatcgaaaaaatgaactgttcatataaagacaatcaggtatcgtttgaaacaaatcac
ctttcaaagttcataatcgtctatgaagctcaggaaccaatagttccagacaaccctgat
gacaagaatgatgacaataacagcgacaatactgtttattacataatcgcagcagtaata
attattctcatcatcatcgctttagcatattacttcatgaagaagaagtga
DBGET
integrated database retrieval system