| Entry |
|
|---|
| Name |
(GenBank) PKD domain containing protein
|
|---|
| Organism |
mesa Methanocaldococcus lauensis SG1
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
I:487429..490485
|
|---|
| AA seq |
1018 aa
MKVNRLLIFIAFLLFLGLNVSMSNGYIILIHNGTMNITNSSGYTNNYNKNIIAYKVNDTI
TFTALAPDSVAEDILNNGLVKWDFGDLTETDYSNSNNIVIHKYSFPFPYPVAWCGYLNNT
GYSKALTYNWLVVGDVKNTKYIFNGSSSNSKQQWNVIYNSSNNTVIIKYYSETPKNYEFY
GLSVDLTPVTVNVSRDDIVAGDSVKFNYSISRNIIFIMWSFGDGTFSFEKSPTHTYTKPG
IYYPRVLLVDDYGRVLVGYLDYGIKVNKPRGGYIYWVMGPSHYNGEAYTYVYNSSGDDND
NRGNAYTDPYKLTYKENDTIRFEMSRAWGYYWKWDFGDGTETDYTYKYLFTPSYHVYKFP
FMWPFFWMSYGAGSWWKSDTLNFIVVGDVGNTRYNFYPSSTYNNPSTYSYTYNKSAHIVN
LYYYSDNPTPKQNMKIKDGYYIDITATANPVEVGVNQNVQFHCNPVFKPIFIMWSFGDGT
ISFKTSPTHRYSKSGIYYPHVFIVDEYGNIEVGIPPPIGVGGYSSYPQIYVSPTIAPTNY
PINITIVEPAYYTRFWHVVYFGDGNYQWILPHYSPYTFTHTYTSEGVYHIDMKVRSVENG
KTVYIIDDRDPIARLYVYPNPASYNTTVFFNSINSYDPDANRNIPEYDYNGNKISEYTIP
PNSPMAKIYGFNLTVYNSSGNVVWNYTSNELKIVSHKFNETGNYTAVLTVWDGMGKTDSV
SVKFSIINKPPVSEFTYYPNLPKVNQTITFDASLSYDPEGKIVKYVWNFGDGNINETNSS
KITHIYTNPGTYNVTLTVYDNLNSSSSITKTVNVFYIKANFTWIPNIIHINQTIYFIDNS
TSTPGNIVKWYWDFGDGTTSNKQNPMHKYIKGGIYEVTLTVTNSYGVKDTISKRIFVIGN
GHYPPVARFTFTVNGLNVTFDASSSYDIDGVITKYIWDFGDGNTNTTTNRIITHIYNKSG
VYTVKLTVVDDENLNSSTVRIISVNKGSGKSIPIPPPIEIIIFITTLLSINYIMGRLK |
|---|
| NT seq |
3057 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaaagtaaatcgtttattaatttttatagcatttttattatttttaggtttaaatgtc
tcaatgtctaatggatatataatactaattcataatggaacaatgaatataacaaacagt
agtggttatacaaataactataataaaaacattattgcatataaagttaatgatactata
acatttacagccttagctccagattctgttgcagaggatatattaaataatggattagta
aaatgggattttggagatttaacagaaactgattatagcaatagtaacaatattgtcata
cataagtatagttttccattcccatatccagttgcatggtgtggatatttaaacaatact
ggttattctaaggctttaacatacaactggctcgttgttggtgatgtaaaaaatactaag
tatatttttaatggtagttcatcaaactcaaaacaacagtggaatgtaatttacaacagt
tcaaacaatactgttataataaaatattactcagaaactcctaaaaattatgaattttat
ggtttaagtgtggatcttaccccagttactgtaaatgttagcagagatgatattgttgct
ggagatagcgttaaatttaactactctataagtagaaatataatatttattatgtggagt
tttggagatggaacattttcctttgaaaaatctcctacacatacctatacaaaacctgga
atttactatccaagagttttattagtagatgactatggaagggttttagttgggtattta
gattatggaattaaagtaaataagccaagaggtggatatatatactgggttatgggtcct
agtcattataatggagaggcatatacttatgtatataatagttcaggagatgataatgac
aatagaggtaatgcatatactgacccatataaattgacatataaagaaaatgatactata
agatttgaaatgtcaagggcgtgggggtattactggaaatgggactttggagatggtaca
gaaactgactatacatataaatatttatttacaccctcatatcatgtatacaaattccca
tttatgtggccattcttctggatgagttatggtgcaggtagttggtggaaatcagataca
ttaaacttcatagtagttggtgatgtaggaaatacaagatataatttttacccatcatca
acatataataatccctcaacatattcatatacctataataaatctgcacatatagttaat
ctatactactattctgataatcctacccctaaacaaaatatgaaaataaaagatggatac
tatattgatataactgctacagctaatccagtagaagttggagtaaatcaaaatgttcaa
tttcactgcaatccagtatttaaaccaatatttattatgtggagttttggagatggaact
atttcgtttaaaacatcacctactcatagatatagtaaatcaggaatttactatcctcat
gtatttattgttgatgaatatggaaacattgaagtaggaattcccccaccaattggtgtt
ggtggctattcttcatacccacaaatttatgtttctcctacaattgctcctacgaattat
ccaataaatattactatagttgaacctgcatattatacaagattttggcatgtagtatat
tttggagatggaaactatcaatggatactacctcactattctccgtatacatttactcat
acctatacatcagaaggtgtatatcatatagatatgaaagtgcgtagtgttgaaaacgga
aaaactgtatatattattgatgatagagatcctatagctagattatacgtctatccaaat
cctgcaagttataatacaactgtattttttaactcaataaatagttatgatccagatgca
aatagaaatattcctgagtatgattataatggaaacaaaataagtgaatatactatacca
ccaaattctcccatggcaaaaatatatggatttaatttaacagtatataactcatctgga
aatgtagtgtggaactatacttcaaatgaattaaaaatagtatctcacaaatttaatgaa
actggaaactacacagcagtattaacagtttgggacggaatgggcaagacagattcagta
agtgttaaatttagcattataaataaacctccagtatctgaatttacttactatccaaat
ctccctaaggttaatcaaactataacttttgatgcatcattatcttacgatccagaagga
aaaatagtaaaatatgtttggaattttggagatggaaatatcaatgaaacaaattcttca
aaaattactcatatctatactaacccaggaacatacaatgtaacacttacagtttatgat
aatctaaattcatcaagttctattacaaaaactgtaaatgtattttacattaaagctaac
tttacatggattcctaatattattcatattaatcaaacaatatacttcatagataactct
acatctactccaggtaatatagttaaatggtattgggattttggagatggaactacatca
aataaacagaatccaatgcataaatatataaagggaggaatctatgaagtaacactaact
gttactaatagttatggagtaaaggatacaatatcaaaaagaatatttgtaataggtaac
gggcattatcctcctgttgcaagatttacttttacagtaaatggcttaaatgtaaccttt
gatgcctcttcatcctatgatattgatggagtaattacaaaatatatctgggattttgga
gatggtaatactaatactactaccaatcgtataattacccacatttataacaaatctgga
gtatatactgttaaattaaccgtagttgatgatgaaaatcttaatagctctacagttaga
ataatttcagtaaataaaggaagtggaaagagcattccaatacccccaccaattgaaata
attatctttataacaaccttacttagtataaactacataatggggagattaaaatga |
|---|
