Manihot esculenta (cassava): 110606479
Help
Entry
110606479 CDS
T05761
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
Pathway
mesc03015
mRNA surveillance pathway
mesc03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
110606479
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110606479
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
mesc03041
]
110606479
Spliceosome [BR:
mesc03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
110606479
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
RRM_MARF1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110606479
NCBI-ProteinID:
XP_021600987
LinkDB
All DBs
Position
18:25557777..25563926
Genome browser
AA seq
474 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQDGESAPPSYGGYGGGSAGGYGGGSGGGGGGGGYGGGASGGGYGGDGGYGGSGG
GRGGHGGRGGGRGYGGNSQNRGGGGGYQGGDRGGRGGGGGGRGGGRGGSGRDGDWLCPNP
SCGNLNFARRVECNKCGTPSPSGANNDRGNGAGGGYNKGGSGGGYGGNRGGRGGNYDGNR
SNNYSDGGRGGSYDNRSGGGSRGASYGGNQGRDNGAYNQIPPPALPSYGSGSGSASGSYP
PPPNSYGGNTNYGMEAVPPPTSYTGGPTSYPPSYGGPVSGYGGDVPADVRTGGRGGQPGG
PRYEGSGGYGGAAAAGAPAKIKQCDENCDDTCDNSRIYISNLPPDVTTEELRELFGGIGQ
VGRIKQKRGYKDQWPWNIKLYTDEKGNNKGDAVLSYEDPSAAHSAGGFYNNYDMRGYKIS
VSMAEKSAPRSQPSYDHGGGRGGYGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHHHSGNRSRPY
NT seq
1425 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgggatgtacggtcaagatggcgaatctgcacctccatcgtacggaggttatggc
ggtggcagcgctggtggttatggtggcggcagtggcggcggcggaggaggaggaggatat
ggaggaggggctagtggcggaggctacggaggtgatggtggttatggcggcagtggaggc
ggccgcggaggtcatggcggtagaggtggcggcagagggtatggtggtaattcgcaaaat
cgcggtggtggtggtggatatcaaggaggagatcgtggaggaagaggcggtggaggtggt
ggcagaggaggtggccgaggtggaagcggaagggacggtgattggctgtgccctaatcca
agctgtggcaatttgaactttgcaagaagagtggagtgtaacaaatgcggcactccttcc
ccttctggtgccaacaatgatcgtggaaatggtgctggaggaggatataacaagggagga
agtggtggaggatatggtggtaatcgagggggtagaggtggtaattacgatggtaataga
agcaacaattacagtgatgggggacgaggtggtagttatgataataggagtggaggtggc
agcagaggggcctcttatggtggtaatcaaggaagagataatggtgcttataaccagata
cctccccctgcactcccgtcttatggtagtggtagtggtagtgctagtggtagctatcca
ccacctcctaactcatatggtggcaatacaaattatggaatggaagcagttcctccccct
acaagctacactggtggacctacatcttatccaccatcttatggtggtcctgtaagtggt
tatggtggtgatgttccagctgatgtgaggactggtgggcgaggtggccaaccaggtggt
cctcggtatgagggaagtggtgggtatggtggggctgctgctgctggtgccccagctaaa
attaagcagtgtgatgaaaactgtgatgatacttgtgacaactctagaatatacatatca
aatttgcccccagatgtgactactgaggaattgagagaactctttggcggcattggacaa
gttggaaggattaagcagaagcgtggctataaagatcaatggccctggaatataaaatta
tacacagatgagaagggaaacaataaaggagatgcagttttgtcttatgaagatccatct
gctgcacattctgctggcggtttttacaacaattatgatatgagaggttataaaatcagt
gtttcaatggcagagaagtcagcaccaaggtctcaaccttcatacgaccatggaggtggt
agaggtggctatggcggaggtgatcggcgccgggatagttacagagatggaggctctggc
ccagataggcaccaccatagtggaaatcgttcacgtccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
