Manihot esculenta (cassava): 110612581
Help
Entry
110612581 CDS
T05761
Name
(RefSeq) pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
LRR_14
LRR_4
LRRNT_2
LRR_LRWD1
LRR_Zer-1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110612581
NCBI-ProteinID:
XP_043812249
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(22288161..22293790)
Genome browser
AA seq
710 aa
AA seq
DB search
MDNLTTASGCFLLFTIFSIIISSFLSFSLALTDSEASFIAHRQLLALQENEELPSQFEYE
VNVKITFANQRLKKAYIALQAWKKAIYSDPFNTTRNWNGANVCNYTGVFCAPSLDDPKLS
VVAGIDLNSADIAGYLPPELGLMTDVALFHINSNRFCGIIPESFCKLKLMHEFDVSNNRF
VGSFPKVVLSWPVLKYLDIRFNNFEGCLPDELFAKDLDALFLNNNRFGCKIPETMGNSTV
STVVFAYNSFTGCVPQSIGNMANLNEIIFLSNNLSGCLTPEIGKLKNLTVFDVSFNQLIG
NLPSTFADLKHIEELNVGNNKLTGSMPENICKLPKLRNLTFSCNYFKEEAQVCLSLPKKD
IVVDDVSNCISNRPHQKSSKECFPIVSKHVDCTKHKCGGGGGGLSTPSVPKPQHTPSTAS
KPSPTPSPPQPTKTPSPPVVEPEMESPTPPQSTSETPSPSVHSPPPPIESPPPPVESPPP
PVQSPPPPVESPPPPVQSPPPPVESPPPPVHSPPPPVESPPPPEHSPPPPVESPPPPVHS
PPPPVESPPPPVESPPPPVHSPPPPVESPPPPVQSPPPPVESPPPPVHSPPPPVESPPPP
VHSPPPPVESPPPPVSSPPPPVESPPPPVSSPPPPVESPPPPVHSPPPPVESPPPPVHSP
PPPVESPPPPVQSPPPPPVESSPPPTTEIVLPPNIGFQYSSPPPPLFPGY
NT seq
2133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataatcttaccacagcctcgggctgttttctcctcttcaccatattctccatcatc
atctcttccttcttgtccttctcccttgccttgactgattctgaagcatctttcatcgct
catcgccagctccttgcgctccaggagaacgaagagcttcccagccaattcgaatatgag
gttaatgttaaaataacctttgcaaaccaaaggttaaagaaagcatatattgccctccag
gcatggaaaaaggctatatattctgatccatttaacacaacccgcaattggaatggtgca
aatgtgtgtaattatactggtgttttctgtgcaccttctcttgatgacccaaaattgagt
gttgttgctggtattgatcttaattcagctgatattgccggctaccttccaccagaattg
gggcttatgacggatgttgcactattccacattaactctaacaggttttgtggaattata
cctgaaagcttttgcaaacttaaacttatgcatgagtttgatgttagcaataatcgattt
gttggttctttcccgaaggttgtcttatcttggcctgtacttaagtatctagacattaga
tttaataatttcgaaggttgtttgcctgatgaactttttgctaaggatcttgatgcgttg
ttcttgaataacaatagattcggatgcaagattcctgaaactatggggaactctactgtt
tctactgttgtgtttgcatataatagtttcacaggctgcgttcctcagagtataggcaat
atggccaatttgaatgagatcattttcctaagcaataatcttagtggttgcttaacaccg
gagattgggaagcttaaaaatttaacggtgtttgatgtaagctttaatcaattgattggg
aacttaccgtctacctttgcagacctgaagcacattgaggaattgaatgtaggaaacaat
aagctaactggatctatgcctgagaacatttgtaagttgccaaagttaaggaatcttaca
ttctcatgtaattatttcaaagaagaggctcaagtatgcttgtcccttccaaagaaggac
attgtagttgatgatgttagcaattgcatatctaatagaccacatcaaaagtcgtcaaag
gaatgtttcccaatagtgagcaagcatgtggattgcaccaagcacaagtgtggtggagga
ggaggtggtctatcaacaccttcagtgccaaagccacagcataccccctctactgcttca
aaaccttcaccaaccccatctcctcctcaacccacaaaaacaccatcacctccggtggta
gaaccagaaatggaatcaccaacaccaccacaatcaacatcagaaacaccatctccgtca
gtccactcaccaccaccacctattgagtcaccaccaccacctgttgagtctccacctccg
ccagtacagtcaccaccacccccggttgagtctccacctccgccagtacagtcaccacca
cccccggttgagtctccacctcctccagtccactcacctccaccacctgttgagtctcca
cctcctccagaacactcaccgccaccacctgttgagtctccacctccgccagtccactca
ccacccccacctgttgagtctccaccaccacccgttgagtctccacctccgccagtccac
tcacccccaccacctgttgagtctccacctccgccagtacaatcaccaccacccccggtt
gagtctccacctcctccagtccactcacctccaccacctgttgagtctccacctccgcca
gtccactcaccaccaccacctgttgagtctccacctccgccagtatcctcaccaccacca
ccggttgagtctccacctccgccagtatcctcaccaccaccacctgttgagtctccacct
cctccagtccactctccaccaccacctgttgagtctccacctcctccagtccactcacca
ccaccacctgttgagtccccacctccacctgtccaatctcctccaccaccaccagttgag
tcctcacctccacctacaaccgaaattgttctaccaccaaacattggtttccaatattca
tccccacctccacctttgttcccaggctattaa
DBGET
integrated database retrieval system
