Manihot esculenta (cassava): 110615204
Help
Entry
110615204 CDS
T05761
Name
(RefSeq) piezo-type mechanosensitive ion channel homolog isoform X1
KO
K22128
piezo-type mechanosensitive ion channel component 1/2
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
mesc04131
]
110615204
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
mesc04040
]
110615204
Membrane trafficking [BR:
mesc04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
110615204
Ion channels [BR:
mesc04040
]
Other channels
Mechanosensitive channel (Piezo)
110615204
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Piezo_cap
Piezo_THU9_anchor
THU_Piezo1
Mmc1_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110615204
NCBI-ProteinID:
XP_021612651
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(5892676..5932701)
Genome browser
AA seq
2485 aa
AA seq
DB search
MGNFLVGFVLPLLLLTAALTNWSLISLGDVIAFLLIQYYAPKIGFRFRRRFILLWPIILF
SLFVILSELVYLIVWAIKGNKWSEANAWWAHLTGLMVFQSWKSPPVIYFLVVQLLAVVVA
FVDIYGNRFGLFPWQESCWGHFLTVLEQIGSYFRVASCLLLPAIQLGVGISHPSWLSLPF
FIGSCAGLVDWSLTSNFLGLFRWWRPLQLYASFNIILLYVYQLPIEFPNLFHWIADFIGL
FKISGKAEWPEICSGLSLVLFYIMLSFIRCDLEEMDFIMSMRGSNLTEQLLPLRHSFFIR
QSKSGVTHTNVLLRGAVFRTFSINFFTYGFPVSLFALSYWSFHFASACAFGLLAYVGYIV
YAFPSVFRMHRLNGLLLVFILFWAVSTYIFNVAFPLFNRKLEKDMEIWEMVGLWHYPIPG
FFLLAQFCLGILVALGNLVNNSVFLYLSDEGNRPSNENDSAEVEEGTKVFIVATIAWGLR
KCSRAIMLALIFLIAMKPGFIHAVYMIFFLVYLLSHDISKRLRQCLILLCEAHFALLYIL
QIDLISHALEQTGSTSMEVLLQLGLLKQDSSWDFLEIALLACFCAIHNHGFEMLFSFSAI
VQHTPSAPIGFSILQAGLNKSVLLSVCASQTAKYNHDNHSYESRITSFLGAVGQKFLSMY
RSCGTYIAFLTILFTVYLVIPNYISFGYIFLLLVWIIGRQLVEKTRRRLWFPLKVYAIMV
FVSIYSLSSFPHFEMWLSRFIDLYFYLGYNSKASLLQNVWESLAVLIVMQLYSYERRQSK
YNRSDDPDPLDSGPFGFMKRFLIWHSQKILFVTLFYASLGPISAFGFVYLLGLVICSTLP
KTSRVPSKSFLLYTGFLVTSEYLFQMWGRQVGMFPGQKHSGISLFLGFRAYEPSFRGLES
GLRGKVLVIAACTLQYNVFCWLAQMPNPVPDKGKWEEPCPLFISDESAFMNDSISNDENK
PPSYDSVPSVKGEGVTTASTLTFTSGLTQVPNSNKTVSADGSSTRIFSFGYIWGSTKESH
KWNKKRILALRKERFETQKTILKIYLKFWMENMFNLFGLEINMVALLLASFALLNAISIL
YIALLAACILVNRPIIRKLWPIFVFLFASILILEYFAIWKSMYPFNKHTPSATDLSCHDC
WKSSALHFQYCKNCWLGLTVDDSRMLASYFVVFMLACFKLRADRFSSFSGSSTYRQMMSQ
RKNMFVWKDLSFETKSMWTFLDYLRLFCYCHLLDLVLCLVLVTGTLEYDILHLGYLAFAL
VFFRMRLVMLKKRNKIFRFLRIYNFALIVLSLAYQSPFLGVSKASGKCGTLDYIYEMIGF
YKYDYGFRITARSALVEIIIFVLVSLQSYMFSSSEFDHVSRYLEAEQIGAIVHEQEKKAA
WKTAQLQHIRESEEKKRLRNMQVEKMKSEMLNLQIQLHDINSSANCGGTSPEREGLRRRR
STSLNSKRDSASPEKGEQTLRKQDQIIGEDSSFSFEVKESSVSLNTESLEKEMSPKYSSE
FPICEITEISQESADSLLFDPGKKERGQSKENPLKSAVQLIGDGVSQVQSIGNQAVNNLV
SFLNIEPEDSNTNENFSSENGVYDEMESQNNKHVDLDRSASLQSDMSSDTTSLQIGRIFW
HIWSQMRSNNDIVCYCCFILVFLWNFSLLSMVYLGALFLYALCVNTGPNYIFWVIMLIYT
EVYILLQYLYQIIIQHCGLTIHSGLLRELGFPAHKINSSFVISALPLFFVYLFTLLQSSI
TAKDGEWMPSMESKFCRKSTLHREEALLSYSWSEKAQELLHVTTSMLRLIVRSVFRYWES
LTKGAESPPYFVQMSMDVDLWPEDGIQPERIESGINQLLRIVHDERCKGKNPNLCPFASK
IHVQSIERSEENPNMALVVFEVVYAAPLTSCVSAEWYKSLTPAADVAKEILKAKYDGLVE
AIGFPYLIISVIGGGKREIDLYAYIFGADLSVFFLVAIFYQSVIKNKSEFLDVYQLEDQF
PKEFVFLLMVIFFLIVLDRIIYLCSFATGKVIFYIFNLILFTYSVTVYAWHLESFQEHAA
GLALRAIFLAKAVSLALQAIQIRYGIPHKSTLHRQFLTSQVSRINYLGYRLYRALPFLYE
LRCVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDIHASLYLVKCDTVLNRATHKQGEKQTKWTKCCNGIC
LFFILIFVIWAPMLIYSSGNPTNIANPIKDASVQLDIKTAGGRLTLYQTTLCEKLQWDNV
NSDVDLDPDGYLNAYNNNDIQLICCQADASMLWLVPDVVQKRFIQSLEWDLDLDILFIWV
LSRERPKGKEVVKYEKPIDPLDLPTRSDVQKVLNGSTNSFRIYNLYPRYLRVTGSGDVRP
LEQEVSAVSADLIINRANFSWWSFHDINSSDVSGCGGLTGPTAIIMSEETPPQGILGDTI
SKFSIWGLYITFVLAVGRFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLIAICEDIYAARAEGELGV
EEVLYWTLVKIYRSPHMLLEYTKPD
NT seq
7458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaattttcttgtcggatttgttttgccattgctcctcttaacagctgctttgact
aactggagtttgatttctcttggtgatgtaatagccttccttcttattcagtattatgca
ccaaaaataggttttcgatttcggaggcgatttatattattgtggcccattattttgttt
tccctttttgttattcttagtgaactggtatatcttattgtatgggcaattaagggaaac
aaatggagtgaagcaaatgcttggtgggcgcatctaactggtttgatggtgttccagtcc
tggaaatcacctcctgtcatctatttcttggttgtacaactattagcagttgttgttgct
tttgttgatatatatggaaacagatttggtctatttccttggcaagagtcctgctggggt
catttcttaactgttcttgagcagataggttcttattttagggttgcttcctgtttgctg
ttgcctgccattcagctgggcgtggggattagccatccctcgtggctttctctacctttt
tttattggtagctgtgcaggtcttgtggattggtctttgacaagcaattttctaggactt
ttcaggtggtggagacctcttcagctgtacgcaagctttaacattatcctgctttatgtc
tatcagcttcctatagaattccctaatctgtttcactggatagctgatttcattggtctg
ttcaaaatatctggaaaagcggagtggcctgagatttgttctggtctttctcttgtactt
ttttacatcatgttatcctttattaggtgtgatttggaggaaatggattttattatgtcc
atgagaggaagtaacctaacagagcaacttctccccttaaggcattcatttttcattcgt
caatctaaatctggtgtcacgcataccaacgttttattaaggggagcagtttttcggacc
tttagtatcaactttttcacgtatggttttccggtctccttgtttgcactttcctactgg
agttttcattttgctagtgcatgcgcatttgggttacttgcatatgttggctacattgtt
tatgccttcccttcggtattccgcatgcatcggttaaatgggctgcttcttgtattcatt
ctcttttgggctgttagcacatatatcttcaatgtagcttttccactctttaatcggaaa
cttgagaaggatatggaaatctgggagatggttggattgtggcattatcccattcccgga
ttctttctgcttgcacaattttgtcttggtattttggttgctttgggtaaccttgtgaac
aattctgtttttctttacttgtctgatgagggcaatcgaccttcaaatgaaaatgactct
gcagaagtagaagaaggtaccaaggtgtttattgtggcgacgattgcatggggactgcga
aaatgctcccgggctattatgctggcacttattttcctcattgccatgaaacctggtttc
atccatgctgtatatatgatatttttcttggtatatcttttgagccacgacatcagcaaa
aggttacgtcagtgcctgatccttctgtgtgaagctcactttgcactgttgtacattctt
cagattgacttgatctctcatgctttggagcaaacaggatccacgagtatggaagttttg
ctgcagttaggtcttcttaaacaagatagttcttgggatttcttggaaattgccctactt
gcttgtttctgtgccattcacaaccatggttttgagatgttattttcattctcagcaatt
gtgcagcacaccccgagcgctcccattggatttagcatcttgcaagctggtcttaataaa
tcagtcctcttgtcagtgtgtgcctcccagactgccaaatacaaccatgataatcattct
tatgagagtaggataacatcattcctcggtgcagttgggcagaagttcttgtccatgtat
cggtcatgtggaacctacattgcatttctgaccattcttttcacagtatacctggtgatt
cccaattacatatcattcgggtatattttcctgctccttgtttggataattggaagacaa
cttgttgagaaaacaagaaggcgtctatggtttcctttaaaagtatatgctatcatggtt
tttgtctccatctatagcttgagcagtttcccccactttgagatgtggctgtccaggttt
atagatctctatttttacttaggctacaactcaaaggcttcattattgcaaaatgtttgg
gaatctctggctgtcttgatagtgatgcaactttatagctatgagaggagacaaagcaag
tataacagatcggatgatcctgatccattggattctggaccgtttgggttcatgaaacga
tttcttatttggcacagtcagaaaatcctgtttgtcacattattctatgcttctttgggt
ccaattagtgcttttggttttgtatatttgcttggccttgtaatctgttcaactttacca
aaaacttctcgggtaccatccaaatctttcctgttatatactggatttctagtgacatct
gagtatctatttcagatgtggggtagacaagttggaatgtttcctgggcaaaagcactct
gggatttcccttttcttgggtttccgtgcatatgagcccagttttagggggctagagtca
ggactaagaggaaaagtcctagtaattgctgcttgcactcttcagtacaatgttttctgt
tggttggcgcagatgccaaatcctgttccagataaaggaaaatgggaagagccttgtcca
ttgtttatctcggatgaaagtgcctttatgaatgattctatatccaatgatgaaaataag
ccaccatcatatgatagtgtgccatctgtaaaaggagagggagtcacaactgcaagcaca
ctcactttcacctctggtcttactcaagtgcctaattccaataaaactgttagtgcagat
ggtagtagcaccagaatattttcatttggatatatctggggaagcaccaaggagagtcat
aagtggaataagaagaggattcttgcattgagaaaagaaaggtttgaaacacagaagacc
atcttgaaaatatatttgaagttctggatggagaatatgtttaacctctttggccttgag
ataaacatggttgcattgcttctagccagctttgccttgttgaatgccatctctattcta
tatatagcattgcttgctgcttgtattcttgtaaaccggcccattataagaaagttgtgg
cccatttttgtgttcttgtttgcatccattctcatcctggagtactttgctatctggaag
agcatgtatccttttaataaacataccccaagtgcaactgatctatcttgtcatgactgc
tggaaaagctcagctcttcattttcagtactgcaagaactgttggctgggacttactgtg
gatgattcacgcatgctagccagctattttgtggtcttcatgcttgcttgtttcaaactc
cgtgccgatcgtttttccagtttctcaggttcatcaacatatcgtcaaatgatgtctcaa
cgtaaaaatatgtttgtttggaaggatctctcttttgaaactaaaagcatgtggactttt
ctcgactaccttagacttttttgctattgccatctgttggatcttgtgctttgcttggtt
ttggttactggaacccttgaatatgacattctgcaccttggttatcttgcatttgctctg
gttttctttcggatgagacttgtaatgctgaagaagaggaacaagatattcagattcttg
cgcatatacaactttgctcttattgttctgtctcttgcctatcaatctccttttttgggt
gtgtcaaaagcttctgggaaatgtgggacactagattacatatatgagatgatcgggttt
tataagtatgactatgggtttagaattactgcaagatctgcacttgtcgagattatcata
tttgtattggtatcacttcagtcatatatgttctcctccagcgaatttgatcatgtttca
cgttatcttgaagcagagcaaattggtgccattgtgcatgagcaagagaagaaagcagca
tggaaaactgcacagttgcaacatattcgtgaatctgaggagaagaaacgcctgcgtaat
atgcaagtggagaagatgaaatctgagatgcttaacttgcaaattcagcttcacgacatt
aattcaagtgctaattgtggtggcacttcccctgaaagggaaggcctaagaagaagaagg
agtacttctcttaactctaaaagagattctgctagtcctgagaaaggtgaacaaaccctc
agaaaacaagaccagatcattggagaggattcgtcattctcttttgaagtgaaagaatct
tcagttagtttgaatacagaaagtctagaaaaagaaatgtctcccaagtattcttcagaa
tttcctatttgtgagatcactgagatcagccaggaatcagctgatagcttgctttttgat
cctggaaaaaaggagaggggccagtcaaaggaaaaccctttgaaatctgcagtacagctg
ataggtgatggtgtctctcaggtgcagtctattggaaatcaggcggttaataatcttgtg
agcttcttaaacattgaaccagaagattcaaatacaaatgagaacttctcttctgagaat
ggagtatatgatgagatggagagccagaacaataaacacgttgacttggatcgatcagct
tctctgcagtcagacatgagttctgatactacaagtctgcagataggaaggatcttctgg
catatatggtctcaaatgcggtctaataatgacatcgtgtgttattgttgcttcattctt
gtctttctgtggaactttagtttactttctatggtatatcttggagctctcttcttatat
gctttgtgtgtaaacactggtcccaattacatcttctgggttatcatgctgatttacact
gaagtttacattttgcttcagtatctctaccaaattatcattcagcactgcgggttgact
attcattcaggcctacttcgcgagttaggatttcccgcgcataaaatcaactcatccttt
gtcattagtgcattgcctttgttctttgtctatttatttaccctattacagagttctata
actgcaaaagatggtgaatggatgccttccatggaaagtaaattctgtagaaaaagcact
ctgcatcgagaagaggctctcctgagttatagttggagtgagaaggctcaggaactactg
catgtaacaacaagcatgctaagattgatagtcagaagcgtctttaggtactgggaatca
cttacaaagggagcagagtctcctccatattttgtccagatgtctatggatgtggacttg
tggccagaggatggaatacagccagagagaatagagtctggaataaaccagttgcttaga
attgttcatgatgagagatgcaaaggaaagaacccaaatctttgcccttttgctagtaag
attcatgttcagagcattgaaagaagtgaagaaaatccgaacatggccttggttgttttt
gaggtggtatatgccgctccattgacaagctgtgtgtcagcagagtggtacaagtcactt
actccagcagctgatgtagcaaaggagatccttaaagcaaaatatgatgggcttgttgaa
gcaattggatttccataccttattatctctgtcattggaggaggcaaaagagaaattgat
ctgtatgcctatatatttggtgctgatttgagtgtgttcttcttagttgcaatcttctac
caatctgtcataaaaaataaaagtgaatttctagatgtttatcagcttgaagatcagttt
ccaaaagagtttgtatttctcttgatggttatctttttcttgattgtccttgatcgcatt
atttacctctgttcatttgccactggaaaggtgatcttttatatattcaaccttattctc
ttcacctattcagtcacagtgtatgcttggcatttggaatctttccaagaacatgctgca
gggcttgcactccgtgctatatttcttgcaaaagcagtttctctagctctgcaagccata
caaatccgctatggaattcctcataaaagcaccttgcatcgacagtttttgactagtcaa
gtttcacgaattaattatttaggctacagactttaccgagctctgccattcctttatgaa
ttgcggtgcgtgctggactggtcgtgtacaaccacctctttgaccatgtatgactggctg
aagctggaggacattcatgcaagtctctaccttgttaaatgtgatactgtcttgaataga
gctacgcacaaacaaggagagaagcaaacaaagtggaccaaatgttgcaacgggatatgc
ttgttctttatattaatctttgtaatatgggctcctatgctgatctatagcagtggcaac
ccaacaaatatcgcaaaccccattaaagatgcaagtgttcagcttgatatcaagactgca
ggtggaaggttgacgttgtatcaaactactctctgtgaaaaactccaatgggataatgtc
aactctgatgtagatcttgatcccgatggttatttaaatgcatataataataatgatatt
cagctgatatgctgccaagcagatgcaagtatgttgtggcttgttccagatgtggttcaa
aagagatttatccaatcccttgagtgggatctggatctggatattcttttcatttgggta
cttagcagggagaggccgaagggcaaggaagttgtgaaatatgagaaacctattgacccc
ctcgatcttccaacacgatcagatgtccagaaagttcttaatggttcgacaaacagcttt
aggatatacaatctttatcctaggtacttgcgtgttactggctctggtgatgtcagacct
ttagaacaagaggtaagtgcagtcagtgcagatctcattataaatcgggcaaattttagc
tggtggtcatttcatgatatcaattcatcagatgtaagtggctgtggaggcttgacagga
cccacggctatcataatgtcagaggaaactccaccacagggaattcttggtgacacgatc
agcaagttcagcatctggggtctctacataacttttgtgcttgctgtgggccgttttatc
agacttcaatgctcagacttgcgaatgagaataccatatgaaaatctaccttcctgtgac
aggttgatagccatctgtgaggatatatatgcggcaagagcagagggtgagcttggagtg
gaagaggtcctttactggacgcttgtaaagatttacagatcaccacacatgcttctcgag
tacaccaaaccagactag
DBGET
integrated database retrieval system
