Manihot esculenta (cassava): 110625900
Help
Entry
110625900 CDS
T05761
Name
(RefSeq) pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
LRR_Zer-1
LRR_ComC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110625900
NCBI-ProteinID:
XP_043817375
LinkDB
All DBs
Position
11:22291007..22293583
Genome browser
AA seq
858 aa
AA seq
DB search
MTRLVRASGCFLLFTLFISFFSSSLFALTNDEASLIARRQLLSLLENEELPYGFEYKVDI
NVTFPNQRLRRAYIALQAWKKAIYSDPFNTTSNWVGANVCSYKGVFCAPALDNRNLSVVA
GIDINGADIAGYLPPEMGLMTDVALFHINSNRICGIVPNSFSRLSLMYEFDISNNRFVGY
FPKVVLAWPNLKYLDIRFNNFEGCLPKQVFLKGLDALFLNNNRFRCNIPETIGNSTVSTV
VFANNNFTGCIPHSIGNMANLNEIIFMGNGLGGCFPPEIGKLKNATVFDVSFNQFAGNLP
SSFADLKNVEELILANNKLIGVMPKNICKLPCLKNLNFSFNFFQGEDEACLQASKKDIVV
DGDSNCMDNRQNQKSLDTCLSILSNPINCSKDKCGGGGGEKPPSPPLVLSPPPLPPVPMQ
SPPQPPTPVQSPPPSVQSSPPPVHSPPPPPPVHSPPPPIPSPPPPVLSPPPPVQSPPPPP
PVQSPPPPVHSPPPPPPVHSPPPPIPSPPPPVLSPPPPVQSPPPPPPVRSPPPPIHSSPP
PPPPPPMHSPPPPVPSPPPPMLSPPPPVQSPPPPPPVQSPPPPVHSPPPPPPVHSPPPPT
PSPPPPVLSPPPPVQSPPPPPPVQSPPPPVHSPPPPPPVHSPPPPVPSPPPPMLSPPPPV
QSPPPPPPVQSPPPPVHSPPPPPPVHSPPPPAPSPPPPVLSPPPPVQSPPPPPPVQSPPP
PVHSPPPPPPVHSPPPPVPSPPPPMLSPPPPVQSPPPPPPVQSPPPPIHSPPPPVQSPPP
PVHSPPPPVHSPPPPLVPSPPPPVHSPPPPPPVYSPPPPTASPPPPLIISPPPADDVVLP
PHIGFRYSSPPPPMFPGY
NT seq
2577 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacccgccttgtcagagcctcaggctgctttctcttattcacgttgttcatctctttc
ttctcatcctccttgtttgccttgaccaatgatgaagcatctcttatcgctcgtcgtcag
cttttgtcactcctcgagaatgaagagcttccctacgggttcgagtacaaggttgatatt
aatgtaacctttccaaaccaaaggttgagaagagcatatattgccctccaggcttggaaa
aaggctatatattcagacccatttaacacaaccagcaattgggttggtgccaatgtgtgt
tcttataagggtgtgttttgcgcaccagctcttgataaccggaatttgagtgtcgttgct
ggtattgatattaatggcgctgatattgctggctaccttccacctgaaatgggacttatg
acagacgttgcattgttccatattaactctaataggatttgtggaattgtcccgaatagc
ttctccaggctctcacttatgtatgagtttgatatcagcaataatcgttttgttggttat
ttccctaaggttgtcttggcttggccaaatctaaagtatcttgacatcagattcaacaat
ttcgaaggttgtttgcctaagcaagtatttttgaagggtcttgatgctttgtttctgaat
aataaccgattcagatgtaacattcctgaaactataggaaattctacagtttctactgtt
gtttttgcaaacaacaatttcacaggttgcattccgcatagcataggcaatatggccaat
ttgaatgagattattttcatgggcaatggccttggaggttgcttcccgccagagattgga
aagcttaagaatgcaacggtatttgatgtcagcttcaatcaatttgcagggaacttgccg
tccagctttgcagacttgaagaacgttgaggaattgatccttgcaaacaataaactaatt
ggagttatgcctaagaatatttgcaaattgccatgcttaaaaaatcttaacttctctttt
aatttcttccagggagaggatgaagcttgcttgcaagcttcaaaaaaggacattgtggtg
gatggtgatagtaattgcatggacaacaggcaaaatcagaagtctttagacacatgtctt
tcaatactgagcaacccgattaattgcagcaaggacaagtgtggtggaggaggaggagaa
aaaccaccatctccaccgttggttctttcccctccacctctcccaccagttccaatgcaa
tctccacctcaaccaccgactccagttcaatctccaccaccttctgtgcaatcttcacct
ccacctgtccactcaccaccaccaccacctccagtgcactccccacctccaccaatcccc
tcacctccaccaccggtgctttctcctcctccaccagtccaatcaccacccccaccaccc
ccagtgcaatccccacctccacctgtccactcaccaccaccaccacctccagtgcactcc
ccacctccaccaatcccctcacctccaccaccggtgctttctcctcctccaccagtccaa
tcaccacccccaccacccccagtgcgatccccacctccacctatccactcatcaccgccg
ccgccgccgccgcctccaatgcactccccacctccaccagtcccctcacctccaccaccg
atgctttctcctcctccaccagttcaatctcctcccccaccacccccagtgcaatcccca
cctccacctgtccactcaccaccaccaccacctccagtgcactccccacctccaccaacc
ccctcacctccaccaccggtgctttctcctcctccaccagtccaatcacctcccccacca
cccccagtgcaatccccacctccacctgtccactcaccaccaccaccacctccagtgcac
tccccacctccaccagtcccctcacctccaccaccgatgctttctcctcctccaccagtt
caatctcctcccccaccacccccagtgcaatccccacctccacctgtccactcaccacca
ccaccacctccagtgcactccccacctccaccagctccctcacctccaccaccggtgctt
tctcctcctccaccagtccaatcacctcccccaccacccccagtgcaatccccacctcca
cctgtccactcaccaccaccaccacctccagtgcactccccacctccaccagtcccctca
cctccaccaccgatgctttctcctcctccaccagtccaatcacctcccccaccaccccca
gtgcaatccccacctccaccaatccactcaccaccaccacctgttcaatctccaccgcca
ccagtacattccccacctccaccagtccactcaccgccaccaccattagtcccttctcca
cctccaccagtccattctcccccacctcccccacctgtctattcaccaccaccaccaact
gcttcccctccacctcctcttattatctccccaccaccagcggatgacgttgttctccca
ccacatattggcttccgctattcatcaccacctccaccaatgtttccaggctactaa
DBGET
integrated database retrieval system
