Manihot esculenta (cassava): 110626012
Help
Entry
110626012 CDS
T05761
Name
(RefSeq) extensin-2-like
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110626012
NCBI-ProteinID:
XP_043817622
LinkDB
All DBs
Position
11:26999838..27005131
Genome browser
AA seq
1260 aa
AA seq
DB search
MTSSGGGPTRGRLWPQLAFALAVVLVSSCVSSVYGDAYPYSSPPPPPYEYKSPPPPSPSP
PPPYEYKSPPPPSPKPHYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPPP
SPKPHYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPPPSPKPHYEYKSPPPPSPSP
PPPYEYKSPPPPSPKPHYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSPKPHYEYKSPPPPSPSP
PPPYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSPKPHYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSP
SPPPPYEYKSPPPPSPKPHYEYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPP
VHSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKS
PPPPEKSPAPEPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPP
YYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPEKS
PAPEPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPP
PPSPSPPPPYYYKSPPPPKKSPAPVPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPKAYPPPYYY
SSPPPPPKAYPPPYYYTSPPPPKSPAPTPYYYPSPPPPKAHPPPYYYTSPPPPVPYPHPS
PHPHHFVVKVVGKVYCYRCYDWDYPEKSHDKKHLKGAVVEVTCKTGEKEIKAYGKTKING
KYSITVEGFAYGKYGAEACKAKLHKAPEGSPCNIPTNLHWGKKGAKLKVKSKTKYEVVLY
AKPFAYAPKTPYEECEKPKPKPTPAPYYYTSPPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPP
PSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYK
SPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPTKSPAPEPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPP
PYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVK
SPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPIKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPP
PPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYY
HSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPVYIYASPPPPPPTHY
NT seq
3783 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaccagttctggtggcggccccactaggggccgtctatggcctcaattggccttcgca
ttggctgtggttcttgtttcaagctgtgtaagttcagtttatggtgatgcttatccatac
tcttctcctcctcctccaccttatgagtacaagtcaccaccacccccatctccttctcca
ccacctccttatgagtacaaatctccaccaccaccatctcctaaacctcactatgaatac
aagtctcctccaccaccatctccttctccaccacctccttatgagtataaatccccacca
ccaccatctccttctccaccacctccttatgagtataaatctccaccaccaccaccacca
tctcctaaacctcactatgagtacaagtctcctccaccaccatctccttctccaccacct
ccttatgagtataaatccccaccaccacctccttatgagtataaatctccaccaccacca
ccaccatctcctaaacctcactatgagtacaagtctcctccaccaccatctccttctcca
ccacctccttatgagtataagtctccacctccaccatctcctaaacctcactatgagtac
aagtctcctccaccaccatctccatctccaccacctccttatgagtataagtctccacct
cccccatctcctaaacctcactatgagtataagtctcctccaccaccatctccatctcca
ccacctccttatgagtacaagtctccacctccaccatctccttctccaccaccaccttat
gagtacaagtctccacctccgccatctcctaagcctcattatgagtacaagtctcctcca
ccaccctctccatctccaccacctccttatgagtacaaatctccaccaccaccctcacct
tctccaccaccaccttatgagtacaaatctccaccaccaccatctcctaagcctcattat
gaatacaagtcaccaccacctccatctccatcacctcctccaccctattattataaatct
cctccacctccttcaccatcaccaccacctccctactattacaaatctcctcccccacca
gtacattctcctcctccaccttattattataagtcaccaccaccaccttcaccctcacca
ccaccaccatactattacaaatctccaccacctccttcaccttcacccccaccaccttat
tactataaatctccaccaccaccctcaccatctcctccaccaccatattattataaatct
cctccaccacctgaaaaatcaccagctcctgaaccatattactataagtccccaccacca
ccttcaccatctcctccaccaccatactactataagtctccaccacctccttcaccatct
cctccaccaccatactactataagtctccaccacctccttcaccatctcctccaccacca
tactactataagtctccaccacctccttcaccatctcctccaccaccatactactataag
tcgccacctccaccttcaccatctcctccccctccatattactacaagtccccaccacct
ccgtctccatctcccccaccaccatactactataaatctcctccacctcctgaaaaatca
ccagctccagagccatattactacaagtctccaccaccaccttcaccttctcctcctcca
ccatactactacaagtctccaccacctccttcaccatctcctccaccaccatactactat
aagtcaccacctccaccttcaccatctcctccccctccatactactacaagtctccacca
ccaccatcaccatctcccccaccaccatactactataaatctcctccacctcctaaaaaa
tcaccagcaccagtgccatactactacaagtccccaccaccaccttcaccatctcctccc
cctccttattactataagtcaccaccaccacctaaggcctatccccctccatactactac
tcttctccaccaccaccacctaaggcctatcctccaccatactactacacttctccacca
cccccaaaatcaccagcaccaacaccttattattacccttctccaccaccacctaaggct
catcctccgccttactactatacttctccaccaccacctgttccttatcctcacccgtct
ccacatccccatcatttcgtcgtaaaggtggtaggaaaggtctattgctacagatgctat
gactgggattatcctgaaaaatcacatgacaagaagcatctcaaaggtgccgtagtggag
gtaacatgcaagacaggtgaaaaggagatcaaggcttatggtaaaaccaagatcaacggt
aaatacagtatcaccgttgagggctttgcgtatggcaaatatggagccgaggcttgcaag
gctaagctccataaggcacccgaaggctcaccatgcaacataccaactaacctccactgg
ggcaagaagggtgccaagctcaaggtgaagtccaagacaaagtatgaagttgtcctctat
gctaagccatttgcttatgctcctaagactccttatgaagagtgtgagaagcccaagcct
aagcctacacctgctccttactattacacttctccaccaccaccaccatattattacaaa
tcaccaccaccaccatctccatccccaccacctccatactactacaagtctccccctcca
ccatctccatctcctcctccaccttactactataagtcaccacctcccccttctccatca
ccaccacccccatactactataaatctcctcctccaccatcaccatctcctcctccaccc
tactactacaaatctcctccacccccatctccctcaccacctcctccatattactacaaa
tctcctcctccaccatccccatctcctcctccaccctattactacaagtcaccaccaccc
cctacaaagtcacctgcaccagaaccatattactataagtctccaccaccaccatcacca
tctccaccacctccttactattataaatctccaccaccaccatcaccatcacctcctcct
ccatactactataagtccccacctccaccatctccatcacctccacctccctactactac
aaatctcctccaccaccgtctccatctcctcctcccccatactactaccactcaccacca
ccaccagtgaaatctccccctcccccatactactaccactcgccaccacctcctgtgaaa
tcacctcctcctccatactactaccactcaccaccacctcctgtgaaatcacctcctcct
ccatactattaccactcaccacctcctccaataaaatcacctcctcctccatactactac
cactcaccaccaccacccgtgaaatcacctcctcccccatactactaccactcgcctcct
cctccagtgaaatcaccacctcctccatattattaccactcaccacctcctccagtaaaa
tcacctcctcctccatactactaccactcaccaccaccacctgtgaaatcacctcctccc
ccatactactaccactcgcctcctcctccagtgaaatcaccacctcctccatactactat
cattcaccaccaccaccagtgaaatcacctcctcctccatactactatcattcaccacca
ccaccagtgaaatcacctcctcctccatactactaccactcaccaccacctcctgtaaaa
tcacctcctcccccagtttacatttacgcctcaccaccaccaccaccaccaactcactac
tag
DBGET
integrated database retrieval system