Manihot esculenta (cassava): 110627997
Help
Entry
110627997 CDS
T05761
Name
(RefSeq) glutamate receptor 3.7
KO
K05387
glutamate receptor, ionotropic, plant
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
mesc04040
]
110627997
Ion channels [BR:
mesc04040
]
Ligand-gated channels
Glutamate (ionotropic)
110627997
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANF_receptor
Lig_chan
Peripla_BP_6
Lig_chan-Glu_bd
SBP_bac_3
TMEM132_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110627997
NCBI-ProteinID:
XP_021630118
LinkDB
All DBs
Position
12:8548755..8554138
Genome browser
AA seq
911 aa
AA seq
DB search
MMAKSFFSFIFIGVILNGFVSCQRPKFVNIGAVFTFDSVIGRAARPAIEAAVSDINKDTR
ILKGTELRLFMEDAKCNIFLGSIGAFQVLEKHVVAIIGPQSSGIAHMISQIANGLQVPLI
SYAATDPTLSALQFPFFVRTTQSDSYQMAAMADLIDFYGWKEVIGIYVDDDSGRNGIAAL
DDELEKKMAKMYKLRLSVNFDETEIMNLLKQSKLLGPRVYVVFVNPDPKLRIFTIAQKLQ
MMDDNYVWLATDWLSTTLDSISHINQTSFSALQGVVGLRQHIPDSSQKKAFLSRWKLMQQ
NGSASSELNTYGLQAYDTVWAVAYAIDWFLNEFKNITFSSPDKLHDIKTSHLRLGELKVF
SNGSSLLNKILQTNFTGLSGRMQFNNDRNIENGGFDVINIENMSIHTVGYWANISGFSLL
APETRQGDQTNYSRVDQKLQKIIWPGGTLERPRGWVIADNEKPLRIGVPHRVSFVDFVTE
VNKSHKIEGYCIDVFLEARKLVPYDVPYRFEAFGDGRSNPNYNELIRMVEEDVFDAAVGD
IAIITNRTKIVDFSQPYASTGLVIVAPVRNSKSSAWVFLKPFTVEMWCVIAASFVMIAVV
IWILEHRVNDEFRGPPRRQIITMFMFSFSTLFKTNQETTVSPLGRMVMVVWLFLLLVITA
SYTASLTSILTVQQLSSPITDIDSLIATNWPIGYQEGSFVYGYLSESLYIPRSRLISLGS
PGEYEKALRLGPNGGGVAAIIAELPYVEIFLTHQSEFGIIGRPFTRGGWGFAFQRESPLA
VDISTAILKLSETGELQRIRNRWFCKQGCPEDKRQNSDPNQLHLTSFWGLYLLCGIFAIV
ALLAFLLRVVRQFVRYKRRQMQLASPSVISSNTRCSQVIFHFFDFIDEKEEAIKKMFTQH
ENPTSHTSLER
NT seq
2736 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggccaagtcatttttctcgtttattttcataggggtaattctcaatggttttgtt
tcctgccaaaggcctaaatttgtcaatataggtgcagtttttacttttgactcggttatt
ggtagagctgcaaggccagcaatagaggctgcagtatctgatattaataaggacacaaga
attctgaaagggacagagctgaggctgttcatggaagatgcaaagtgcaatatcttcttg
ggttccattggagcttttcaggtacttgagaaacatgtggtagccataattggtccacag
tcctctggtatagctcacatgatttctcaaattgccaatggtctccaagtgccccttatc
tcatatgctgctactgatccaactctatctgctcttcaattccccttttttgtgcgaacc
acacaaagtgattcgtatcagatggctgccatggcagatttaattgatttttatggatgg
aaagaggtcattgggatctatgtggatgatgattctgggaggaatgggatagctgctttg
gatgatgaacttgaaaagaaaatggcaaaaatgtataagttgcggttgtctgtcaatttt
gatgaaactgagatcatgaatttacttaagcaatccaaactgcttggtcctcgtgtttat
gttgtgttcgttaatccagaccccaaattgagaatctttactattgcccaaaaactgcaa
atgatggacgacaattatgtttggcttgcaacagactggctttcaactacattagattcg
atttctcatatcaatcaaacttcatttagtgctcttcaaggggtagttggccttcgtcaa
catattccagattccagccagaaaaaagcttttctgtctcggtggaagttaatgcagcag
aatggttcagcaagttctgagctgaacacctatggacttcaggcctatgatacagtttgg
gcagttgcctatgcaattgactggttcctaaatgaattcaaaaatattacattttcttca
cctgacaagctacatgacatcaaaacatctcatttacgtctgggggaactcaaagtcttt
agtaatggaagcagtctactaaacaaaatattgcagacgaacttcactggtttaagtggt
cgcatgcaatttaataatgacaggaacattgagaatggtggttttgatgtcattaatatt
gagaatatgtctattcatacagttggttattgggctaatatctcaggtttctcactttta
gccccagagactcgccaaggggatcaaactaactattcccgtgtggatcagaagcttcaa
aagattatctggccgggtggaacgcttgaaagaccacgtggttgggtaattgctgacaat
gaaaaaccactgagaattggagtgccgcacagagtcagttttgtggattttgttactgaa
gtaaacaagagccacaaaattgaaggatattgtattgatgtgttccttgaagcaaggaaa
ctagtcccatatgatgtaccttacaggtttgaggcctttggggatggtcggtccaatcca
aattataatgaactcatacggatggtggaagaagatgtatttgatgcagctgttggagac
attgcaattataacaaaccggacaaaaatagtggatttttctcagccttatgcttctacc
ggtcttgtcattgtagctccagtcaggaattcaaaatcaagtgcctgggtatttcttaaa
ccatttacagtggagatgtggtgtgtcatagcagcatcttttgttatgattgcagtggtt
atttggattcttgaacatcgagttaatgatgaattcagaggtcctcctagaaggcagatt
ataacaatgttcatgttcagcttctcaacattattcaagacaaaccaagaaactaccgta
agtccacttggacgcatggtgatggtagtgtggcttttcctattgctggtgataactgca
agctatacagcaagtttgacttcaattcttactgttcagcagctttcatcgcccattact
gatattgacagcttgattgcaactaattggcctattggataccaagaagggtctttcgtc
tatggctatctgtctgaaagtctttatatacctcgttctagacttatttctcttgggtcc
ccgggggaatatgaaaaagcattgagactagggccaaatggtggaggggtagctgcaata
atagctgaacttccatatgtagagatttttcttacacaccaaagtgaatttgggatcatt
gggcgaccatttactaggggcggatggggatttgcttttcaaagagaatctccgcttgct
gttgacatctctactgcaattctaaaactttctgagaccggtgagcttcaaaggatccgc
aacaggtggttctgtaagcagggctgtcctgaagataagagacaaaattctgaccctaac
caacttcatttgacaagtttctggggtctttatcttctatgtggtatcttcgccattgtg
gccctcctagcttttctactaagagtggttcgccaatttgtgcgctataaacggaggcaa
atgcaactggcttctccatccgtaatttcatcaaacactcgctgctctcaagtcattttt
cacttttttgacttcattgatgagaaagaagaagctatcaagaaaatgttcacccagcat
gagaatcccacatcccacacaagcttggaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system