Manihot esculenta (cassava): 110629921
Help
Entry
110629921 CDS
T05761
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
Pathway
mesc03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110629921
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mesc03019
]
110629921
Messenger RNA biogenesis [BR:
mesc03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
110629921
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Pol_BBD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110629921
NCBI-ProteinID:
XP_021632826
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(4593487..4596191)
Genome browser
AA seq
426 aa
AA seq
DB search
MDSDEGKLFIGGIAWDTTEETLQDHFTHYGDVSQVVIMRDKTTGRPRGFGFVVFSDPSIL
DRVLQDKHTIDGRTVEAKRALSRDEQQTSSRSGNVNAGRGSSGGGSFKTKKIFVGGLPST
LTEDGFRQYFENYGHVTDVVIMFDQHTQRPRGFGFITFDTEDSVDRVLHKVFHELNGKLV
EVKRALPKDANPGGGGHGGGYQGYGASAANANAVDGRMDGNRYMQTQTSAAGYTPYPGYG
APSYGYGATNSGVGYGGYGGYSVGGYGAGNAGFGGPTGAYGMHGALKNSWGGQVPSNYGG
SGYGANAGYGATAPWNASGGGNSVSAPMGQSPGGTSGYGGYGYGYGGSDGPYSGGYGAAV
GRSGNAPNNSSGAGGGEQQGNGDGYPGSGYGDTNGNSGYGTEAWRSDPSQVSGGYDGGHS
RQAPQQ
NT seq
1281 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagacgaggggaagctctttattgggggaatagcatgggacaccacggaggaa
actcttcaagatcacttcacccactacggggatgtttcccaggttgtaataatgcgggac
aagaccactggtcgtcctcgtggctttggtttcgtggttttctccgatccttcaattctc
gatcgcgtgctccaggacaagcacaccatcgatggccgtactgtagaggctaagagggct
ttatcaagagatgaacaacagacctcatctagatctggtaatgtaaatgctggtaggggc
tccagcggcggtggaagttttaagaccaaaaaaatatttgtaggcggtctgccatccacc
ctgacagaagatggcttccgtcaatattttgaaaattatggacatgtcactgatgtggta
ataatgtttgaccagcatactcagaggcctcgaggctttggatttatcacctttgacact
gaagattcagttgatagagtgcttcataaggttttccatgagctaaatggtaaacttgta
gaggtaaaacgagcactcccaaaagatgcaaatccaggtggtgggggccatggtggagga
tatcaaggttatggtgcctctgctgccaatgcaaatgctgttgatggtcgaatggatgga
aacagatatatgcagacccaaacttctgcagctgggtatacgccttatcctggatatggt
gcgccaagttatggttatggtgcaacaaacagtggggtcggttatggtggttatggtggt
tatagtgttggtggatatggagctgggaatgctggattcggtggtccaaccggagcctat
ggaatgcacggcgctctgaaaaatagttggggtggccaagttccttccaattatggtggg
tcaggttatggtgcaaatgcaggttatggggccacagctccatggaatgcatctggtggt
ggaaattctgtctcagctcctatgggtcaatctccaggaggaacttctgggtatggaggt
tatggttatggttatggtggaagtgatggtccttattctggtgggtatggagctgctgtt
gggcgtagtggaaatgccccaaataacagcagtggagctggtgggggagaacaacaaggg
aatggggatggctacccaggtagcggctatggtgacactaatgggaattctggatatgga
actgaagcctggaggtctgatccttcacaagtttctggtggttatgatggtggtcattca
cggcaggcaccacagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
