Mesoflavibacter sp. HG96: C7H62_0863
Help
Entry
C7H62_0863 CDS
T06472
Name
(GenBank) Fibronectin type III domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
mesq
Mesoflavibacter sp. HG96
Pathway
mesq02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesq00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
C7H62_0863
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
fn3
InhA-like_MAM
MAM
GBD_T9SS_assoc
Reelin_subrepeat-B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIJ88672
UniProt:
A0A6G7RT43
LinkDB
All DBs
Position
complement(920125..924804)
Genome browser
AA seq
1559 aa
AA seq
DB search
MCLIALFTGYQALSQITSYPYSEDFESGDGGWTADNTNSGTWALGTPASAVINSAASGAN
SWVTNLTGNYNNGESSFVNSPIFDLTSLTNPSIEFSVWWESEFSWDGTVLQSSIDGGATW
QNVGAVGDPNNWYTDGTINGNPGGQQEGWTGRNGSGSNGWVTARHALVGLAGQSSVQFRI
AFGSDGSVQDEGFAFDDVSIFDVTCPEPLNLTATTTGDSTADIFWSLGGSESDWQIWVQP
AGTGLPTTDGTVTSNNNPYPASGLTPSTAYEVYVRANCNANGYSNWVGPVNFTTFNVPPP
APVGVTCSSGSSTFIFTEDFGNDTNYVPTGWTGTTFADSNGNWDITIPSSNSTGTGPDVT
WDGNAGTHLEYEASGNTTNVASAITPAIDLSTAVDGAELSFYMHAYGVDMGTLNVGVSTS
ATGPFTTEYTWIGEYQTSASDPWVPIGINLDAYLGQVIYIEFSYVGTGATWEGDMSIDQV
RVETCGNFCVAPSNITIAGITHDSADISWTPSGSESQWNYVVQPAGTGVPTSGTTVGTTT
LTESGLSPLTDYEVYVQAICGANTSVWAGPISFSTTAQTNFVLDCTNGGPQNLVYCYENN
DTNVFTFTSSDGTTPLNITFNAGQVEQNWDELIVLDSDGITDLNAATPYGNNGDVSGITY
QSTGSSISFQVQSDGSVNCQGNGYTSIDVTVSCATCINPTATFAIVDDCANGDQFLVDVN
ITSLGDATSLSVQDNQGNSPVSVSTTGSVTPLFGPYPFNTDIIFTISNEQDGNCVITSQA
ISLAGCPPDNDNPCDATTAVVNDAFLCEVSTPGTLLEATSSGVPNPSCGGDPDDDVWYQF
TATSDFHLISLANVQGSNTGDIDFALYEGACDALVEIDCTSGFALLSSITPQLVVGNTYF
IRIFSGSSNSETTTFDLCITPYEAPTNVTCDATENLCPGGDDLYTFNTVGVEPGLGQIDC
LFTSPNPTFSVLEIGTSGTIEVQMVQNTAFDAAGNPIGDELDVDFALWGPYAPGDDYCSG
GDYPSDPVTACSYSAAPVESFTINNAIAGEIYIVMITNFEKEPGVIQITQTNLDPNNPDP
NAGTLSADIDVELSSVDVTFIDNDNDDTTPMVAEPCGLDSITIEADSPFADTFEWYINNI
FQPNLTSSSITVSESGPVTVYAYDNQCMGVADATVIVNLYKDPIVNVVPPEEVSIVTCDD
ESGDGVEEFDFSTLSSIILDDVSQDPNDFVVTYHETLSDAQSGTNAITFPYSAVDGTVIY
VRAEDVNAVGSGSGCASTNTSFTLTVLGALPEITDISDFIVCDDSLNDGYETFDLSTKDD
EVLNGQDSSEFSVSYHVSELDAETNSNPITAPFTNTEVSSQTIYVRLENLTASDCYKTSS
FEIIVNPLPETTFGDVVYEVCPNATVPITVTAIPDNYTSSEVSVVWYDQYDTVISGATSL
DLDTVLTAGVYTIEVTFTDTGCSNTAEVLVEELESCVIPQGISPGLKDGKNDTFDLSSFD
VQRLEIYNRYGTLVYSKDNYINEWHGQSNNGDELPVGTYYYIMKYQGSKQKAAWIYINR
NT seq
4680 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcttaatagccttatttacaggttatcaagcattgtctcaaattactagttatccc
tattctgaagattttgaatctggagatggcggatggactgcagacaatacaaattccgga
acttgggcattgggtacaccagcttcggcagtaataaatagtgctgcttctggagcaaat
tcttgggttactaatttaacaggtaattacaacaatggcgagagctcatttgtaaatagt
cctatatttgatttaacttcattaactaacccaagtatagaatttagcgtttggtgggaa
tcagagtttagttgggacggtactgttttacaatcatcaatagatggaggagctacttgg
caaaatgtaggagcagttggcgatcctaataattggtatacagacggaaccattaatggt
aatcctggaggacaacaagaaggttggacaggaagaaatggttctggttctaacggatgg
gttacagctagacatgcattagtaggtttagcaggtcaatctagtgtgcaatttagaata
gcttttggatctgatggatctgtacaagacgaaggttttgcttttgatgatgtgtcaatt
tttgacgttacatgtccagaaccattaaaccttaccgcgactacaacaggagatagtact
gcagatatattttggtctttaggaggatcagaatctgattggcaaatttgggtgcaacca
gctggaactggtttaccaactacagatggtactgtaacttctaataataatccttatcca
gcttctggtcttacacctagtacagcctatgaggtatatgtaagagctaattgtaacgca
aatggttacagtaattgggttgggcctgttaattttacaacatttaatgtaccgccacca
gcaccagttggtgtcacttgttctagtggatcttctacgtttatctttacagaagatttt
ggtaatgatactaactacgttccaactggatggacaggaactacctttgcagattctaac
ggaaattgggatattacaattccttcaagtaactcaactggtacaggaccagatgtgact
tgggatggaaatgctggtacacatttagaatatgaagcttctggtaacaccacaaatgtt
gcgtctgctattactcctgctatagatttatctacagctgtagatggtgcagaattatct
ttttacatgcatgcttatggtgtagatatgggaactttaaatgttggtgttagtacatca
gcaactggaccatttactacagaatatacttggattggagaatatcaaacttctgcttca
gatccttgggttccaattggaattaacttagatgcttatttaggtcaggtaatatatata
gaatttagctatgttggtactggagctacttgggaaggagacatgtctatagatcaagta
cgagttgaaacttgtggtaacttttgtgttgcaccaagtaatattacaatagcaggaatt
acacatgattctgcagatatttcttggacaccaagtggatcagaatcacagtggaattac
gttgtacaacctgcaggaactggtgtgccaacatcaggaacaacagttggaacaacaact
ctaacagaatccggtttatcaccactaacagactatgaagtttatgtacaagccatttgt
ggagcaaacacaagtgtttgggctggaccaattagtttttctactacagcacaaacaaac
tttgttttagattgtacaaatggaggaccacaaaaccttgtttattgttacgaaaataat
gatacaaatgtctttacatttactagttctgacggtacaacgcctttaaatattacattt
aatgcaggtcaagtagaacagaattgggatgaattaatcgtattagactcagatggaata
acagacttaaacgctgcaacaccttatggaaacaatggtgatgtaagtggtataacttat
caatctacaggatcttcaatttcttttcaagttcaatcagatggaagtgtaaattgtcaa
ggtaatggttatacatctatagatgttactgtaagttgtgcaacttgtataaatcctaca
gctacttttgcaattgttgatgattgtgcaaatggagatcaatttttagtagatgttaac
ataacttctttaggtgatgctacatcattatcagttcaagataatcaaggaaactcacct
gtaagtgtttcaacaacaggttcagtaactcctttatttggaccttatccttttaataca
gatataatattcacaatttctaacgaacaagatggaaactgtgttattacaagtcaagct
atttctttagcaggttgtcctccagataatgataacccatgtgatgctacaacagcagta
gtaaatgatgctttcttatgtgaagtaagtactcctggtacattattagaagcgactagt
tctggtgttcctaacccttcttgtggaggagatccagatgatgatgtttggtatcaattt
actgcaacatcagattttcatttaatttctttagcaaatgtacaaggaagtaatacagga
gatattgactttgctttatatgaaggtgcttgtgatgcgcttgtagaaattgattgtact
tccggattcgctttattatcaagtataacacctcagttagtagtaggaaacacttacttt
ataagaatcttttctgggtcaagtaattctgaaacaacaacatttgatttatgtatcact
ccttatgaagcaccaacaaacgtgacttgtgatgcgactgaaaacttatgtccaggagga
gatgatttatatacttttaataccgtaggtgtagaaccaggtcttggacaaatagattgt
ttatttacttctcctaatcctacatttagtgtgttagaaattggaactagtggaacaatt
gaagtgcaaatggtacagaatactgcttttgatgcagcaggtaatccaattggagacgaa
ttagatgtagattttgctctttggggaccatatgctcctggcgatgattattgtagtggt
ggagattatccatcagatcctgttacagcttgtagttactctgcagctccagttgaaagt
tttacgataaacaatgctatagctggtgaaatttatattgtaatgattacaaactttgaa
aaagaaccaggtgtaattcaaattactcaaactaatttagatcctaataacccagatcca
aatgcaggaactttaagtgcagatattgatgtagaattatctagtgtagatgtaactttt
atcgataacgataatgatgatactacacctatggtagcagagccttgcggtctagattca
ataacaattgaagcagattctccatttgcagatacttttgagtggtatattaataatata
ttccaaccaaatttaacttcatcgtcaattacagtttcagaatctggtcctgtaacagtt
tatgcttatgataaccaatgtatgggtgtagcagatgcgactgtaattgttaacctttac
aaagatccaattgtaaacgtagttccgccagaagaagtttctattgttacttgtgatgac
gagtctggtgatggtgtagaagaatttgattttagtacattatcaagtatcattttagat
gatgtaagtcaagatccaaacgatttcgtggttacgtatcacgagaccttatcagatgcg
caatcaggtactaatgctataacattcccttattctgcagtagatggaactgttatttac
gttagagcagaagacgttaatgcagtaggttctggttcaggttgtgctagtactaacaca
tcttttacgcttactgttttaggtgctttaccagaaattacagatatatctgattttatt
gtttgtgatgatagtttaaatgatggttatgaaacgtttgatctatctacaaaagatgat
gaagtattaaatggacaagactcttcagagtttagtgtttcttatcatgtttcagaatta
gatgctgaaactaatagtaatccaattacagcgccatttactaataccgaagtatctagt
caaactatttatgttagattagaaaatttaacagcatcagactgttataaaacttcaagt
tttgaaattatagtaaatcctctgccagagaccacatttggagatgtagtttacgaggta
tgtccaaacgctacagtaccaattacagtaacagcaatacctgataattacacatcaagt
gaagtaagtgtagtatggtatgatcaatacgatacagtaatttcaggcgctacaagttta
gatttagataccgtattaaccgcaggagtttatacaatagaggttacttttaccgataca
ggatgttcaaacaccgctgaagtattagtagaagagttagagagttgcgttataccacaa
gggatatcaccaggattaaaagatggtaaaaacgacacatttgatttaagtagttttgat
gtacaacgcttagagatctataaccgttacggtactttagtctactcaaaagacaattat
attaatgagtggcatggacaatctaataatggagacgagttaccagtaggaacttattac
tatattatgaaatatcaaggaagcaaacaaaaagcggcttggatttacataaacagataa
DBGET
integrated database retrieval system
