Methanosarcina sp. MTP4: MSMTP_1730
Help
Entry
MSMTP_1730 CDS
T03850
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
metm
Methanosarcina sp. MTP4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TSP3_bac
DUF5128
NHL
SGL
TEN_NHL
DUF5609
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKB25199
UniProt:
A0A0E3NX71
LinkDB
All DBs
Position
2266184..2272087
Genome browser
AA seq
1967 aa
AA seq
DB search
MAAQFYPAAASSSQESVQEPSYISKGTVAALAMVSQLSVQNQVNTDLDVVGLIGASENKT
DTDGDGLPDSVEAVLGTDFNNTDSDFDRLDDYNESVFYRSDPLEPDSNHDGLSDYFEVMD
VYSLDVDGDGYPNIWDFDNDGDCVEDNIDSSPFALSAARESFNFNLKTNGNPTYVDFQLL
PQNPNNVNIALQKWDWPYDNKSTMQDLDNSEDDVQVIPMLELTMSSVPDQADVKDYGIGI
FSNTAYVPLVQVQGLGANVALAGKMFFPESEPLDSQVNASLIWLVMAKTDSMENGTVISE
NTTLIKYQENFTLTGFSIEESYGSDIGLFYSDEINQTIAANFVMAYSFLRNNQTTVYDMP
SKLAEHNVSVSSTINSSSHRDKALLNVTTRMTPGVLNSLPEDMVLPVISAIESNFAKKDL
SELDSSSYMVGNGLSINLRSEPVITLKTLKTSWYNTTDQKPLVIDSILPVIRDWGQLMNL
DDNSLASMMVLVIAWNIGESTVTRIGNDSTSFVNEVLDVLEVIETGIGGYLLSYSSLIDV
ISIATEGTYRVFFALNYVGEFIQGVLGLVMYTSKIVDKVVDVISTVAKFAEGLGKVLGII
GAITLVVGFVFDIGFAIWGFFKIAMSEGWSSTGTFQGAVYATIMGVYAISLFVIGVILLA
VALIPYVGWIIALVGGIILGVIALTDFILGFFDIGISNLVEKLVGTFHQTYMNTEFSLGL
INSSIDIKDYNENGFDIGDRITFSSFVNGTVLRTSDGTWEDVKESYVIPHYEVKRWMTED
TPYAYWVSPYGSFTNNVSYSEINPESKNTTYEIGAWIEPKLGTINFPLAVLFTADYKIIY
TDRKIEWDFWNGYKYTRLNQTGTIQNELDTLYFDVLPGNVNDFTTWYPLTSQDKDNDGLG
NNVDPYPWAWDGDGDGLSDKFELDIIGSDPGSRDKDGDGLSDRMELIYGTNLTEWDTDND
NLSDYKEINGWDINFNYSGQSFNMTVKSDPLMPDTDKDGVDDQMEYWSSLNPRSKDSNGD
GVVDVPNPKTFTYVNFETKWGKDGVSGYPRFDCPSAVAVDADGYVYVADSGDDSHSVQTF
DSNGGCIRTIIRGSKGSGNGQFGELSDMAIDTANGYIYIADYISGTGGRIQKFDSEGNFL
TSWNTGSGWGPEIAVDEEGYVYANINHCIQKFNSNGTLISNPYFSTYEGVTNVAVDLDGN
VYYTDVYNVYKAYSNWTFITQFYSEGDSTKAFGSPRGLAVDDRGFVYIADQSKNHIQKFD
PTGWFITRWGSYGSGDEEFISPMDIAVDANKNVYVLEAPLVAMYKDTAGNRIQKFSQITD
LPPRNVSEFLDSDGDGLSDMNETRGWDVTFSDRLLGTSTCHVTSEFLANDTDFDGLSDFD
EYSYSSNPRDVDTDGDGLNDYVESVLGTNINHYDTDNDGLDDGTEITFGSDPTKVDTDFD
GLSDLEEYNPDEPFVYFSDPWNNDTDGDGLNDKDEREFNSSARNPDSDGDLMFDGTEKEK
GTDPWDPDSDRDGLQDGYELLYRTNASNNDTDNDGVPDGKEVNNRMNPLNNDTDGDGLSD
FEELANGTDPSNGDTKGNGLNDSEDPYSFAPNVDRIWVAYDPDDDTQQLIENLEKYTNVT
VFRPDEIQNYSGKSNILLVGRPGLENNTAGNISYSILKNKPAILSRMQGSDYARFYVDYD
IWKSSQTVVMLSHPYPSDHYKVLDLFKTLNQTIQYPDVVSDFKADAIEEMGSFIRVELKN
PVKPSIELKSYNGTNVPENFTCELSADEKGVKFLDINVSENVLNESSNNVERALIVIYYT
AEDLDRTGDGDADDPGDIDENTIGFNWFNMSANRWEKLTTDMDWVNDVGINTTNDIIYGR
EYEGYVWANVSHLSMYGLSGTEITQPVHPAPHDGHRRIPIITEEESQDENITLEDVQAAP
ESTENTSRETPVAKETGTLPEIWFYLAAAMIILLTGLGAVYLLRKRT
NT seq
5904 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggctgcccagttctacccggcagccgcatcaagcagccaggaatcagttcaagaacct
tcttacatttcaaaaggtactgttgctgctctggcaatggtatctcaacttagtgttcag
aaccaggtcaacaccgatctggacgtggtcggacttataggcgcttccgagaacaaaaca
gatactgatggcgacggactgcccgattctgttgaagctgttctcggaactgattttaat
aacacagattctgattttgacaggctggacgactacaatgaatcggttttctataggtca
gacccgcttgaaccggattcaaatcatgacgggctatcggattactttgaagtgatggat
gtttactcccttgatgtcgatggggatggttacccaaacatctgggattttgataatgat
ggcgattgcgttgaagataacatcgattcatccccttttgctctttctgcagccagagaa
agcttcaattttaatcttaaaacaaatggaaatcccacctatgtagacttccagttgctc
ccacaaaatcctaataatgtgaacatagctttgcaaaaatgggactggccgtatgacaat
aaaagtacgatgcaggacctggataattccgaagatgatgtgcaagttatccccatgctt
gaactcacaatgagttctgttcctgatcaagcagatgtgaaggattatgggattggaatc
ttttcgaatactgcgtatgtacctcttgttcaggttcaagggcttggagcaaatgttgcc
ctggccggtaagatgttctttcctgaatctgaaccccttgacagtcaggtaaatgcgagt
cttatctggctggtgatggcaaagaccgattctatggaaaatggaactgtaatatccgaa
aacacaaccctgataaaataccaggaaaacttcacgctcactggatttagtattgaggaa
agttatggcagtgatatcggccttttctacagtgatgaaataaaccagacaattgcagct
aactttgtaatggcatattcgtttttaagaaataatcagaccactgtatatgatatgccc
tctaaacttgccgagcataacgtgagtgtgtcctctacaattaatagctcatctcatcgt
gataaggcattattgaatgttactaccaggatgaccccgggagttttgaattcgcttcca
gaggacatggttcttccagtcatttccgcaattgaaagtaatttcgcaaaaaaagatctg
tcagagcttgattcaagctcttacatggtgggaaatgggctttccattaacctaaggagt
gagcctgtaataacccttaaaaccttgaaaacaagctggtataatactactgatcaaaaa
ccccttgtaatcgattcaattttaccagtcatcagggattgggggcaactaatgaatctg
gatgataattcccttgcatccatgatggttctggtaatagcatggaatataggtgaatca
acagtaacaagaatcgggaacgatagtactagttttgtgaatgaagtcctggatgtgcta
gaggtaattgaaacagggattgggggttatcttttatcgtattcttctttgattgatgta
ataagtatcgctacagaaggtacatatcgagttttttttgcattaaattatgtaggtgaa
tttattcagggcgtattaggccttgtcatgtacacatccaaaattgtagataaagttgtg
gatgttatcagcactgtggctaaatttgcagaaggattggggaaggttcttggtataata
ggtgcgatcacgctggtagtaggattcgtttttgatataggttttgcaatatggggtttc
tttaaaattgcaatgagtgagggatggtcatcaaccggcactttccagggagctgtttat
gctactattatgggtgtatatgcaatcagtctttttgtcattggagtaattttgctggca
gtggcattaattccttatgtgggttggataattgccctggttggagggattatattggga
gttattgcactgaccgactttatactgggattctttgatattggtatttcgaatctggtg
gaaaagttagtaggtacattccatcaaacttacatgaataccgaattttccctcggcctg
attaattcctcgattgacattaaagattacaatgaaaatggattcgacatcggggacagg
ataacatttagtagttttgttaacgggaccgttttaagaacgtctgacggtacatgggaa
gatgttaaagaaagttacgttatccctcattatgaggtcaagaggtggatgactgaagat
acaccatatgcatattgggtttcaccatatggcagttttaccaacaatgtatcatactct
gaaataaaccctgaatccaagaataccacatacgagatcggtgcatggattgaaccaaaa
ttgggtaccattaacttccctctagcagtcctatttacagcggactataaaataatctat
acggacaggaaaattgaatgggatttctggaacggctataaatatacacgcctgaaccaa
acaggaacgatccaaaacgagctagatacactctatttcgatgtacttccaggaaatgtc
aatgatttcacaacatggtatccgttaacgtcacaggataaagataacgacgggcttggt
aataatgtagatccctacccatgggcatgggatggggacggggacgggttaagcgataaa
tttgaactggacatcataggctctgaccctggaagtagggataaggatggggatgggttg
agcgatcgaatggaacttatctatgggacgaacctgacagaatgggatactgataatgat
aatctgtcagattacaaagagatcaatggctgggatatcaatttcaattacagtggtcaa
tcctttaatatgactgttaaatccgatccccttatgccagatactgacaaggacggggta
gatgaccagatggaatactggagctccctcaatccaagatcgaaggattcaaatggcgac
ggtgttgttgatgttccaaatccaaagacttttacctatgttaattttgaaacaaaatgg
ggaaaagacggcgtatccggatatccgcggtttgactgcccatcagcagtagcggttgat
gcggatggatatgtatatgttgccgattcaggagacgattctcacagtgtccagactttc
gattccaatggtggatgcataagaacaatcatacggggctcaaaaggctctggaaatgga
cagtttggagagctatctgatatggctatagatacagctaatggttatatctatattgct
gattatatttctggtactggtggacgtattcagaagttcgattcagaaggtaatttcctc
acatcatggaataccggttccggatggggtccagaaatagcagttgatgaagagggctat
gtctatgctaacataaatcactgcattcaaaaattcaattcaaacgggaccctaatatca
aatccttattttagtacttatgagggtgttactaatgtggcagttgacctggatgggaac
gtatattatacagatgtatacaatgtttacaaggcttattctaattggacattcataaca
caattttatagtgaaggagactcaaccaaagctttcggttcaccccgggggttggcagta
gacgatagaggttttgtctacattgctgatcagagtaaaaaccacattcagaagtttgac
cctactggctggttcatcaccagatgggggagctatggttctggagatgaggaatttata
agcccaatggatatagcagttgatgcaaataaaaatgtatatgtccttgaagcccccctc
gtcgctatgtataaggatactgctggaaaccgcattcagaaattctcccagataactgat
cttcctccccgtaatgtctctgagttccttgattccgatggggatggattgagtgacatg
aacgagaccagaggctgggatgtgacctttagcgacaggttattgggcacttcaacctgc
catgtaacaagcgagtttctggcaaatgatacggatttcgatggactctctgattttgat
gagtacagctattcatcaaatcccagagatgtagataccgatggggatgggctaaatgat
tatgttgagagtgtgcttgggacaaacataaatcattatgataccgataatgacgggctg
gatgatggcactgagatcacttttggaagtgaccctacaaaagtggatacggatttcgat
ggactctcagatcttgaagaatataacccggatgaaccgttcgtttatttctctgaccca
tggaataatgacacggatggagacggattgaatgataaggatgaaagggaatttaattca
agtgcccgtaatccggattctgatggtgacctcatgttcgatgggactgagaaggagaag
ggtacagacccatgggacccggattctgacagggacggtttgcaggacgggtatgaactt
ctatacaggacgaatgcttcgaacaatgataccgataatgatggtgtgcctgatggtaaa
gaagtaaataacaggatgaacccattgaacaatgatactgatggagatgggctgagcgac
tttgaagagcttgcaaatggtacagatccgagcaatggggatacaaagggtaacggatta
aacgattctgaagatccctactcatttgcacccaacgtggacaggatatgggttgcttat
gacccggatgatgacactcagcaacttattgaaaacctagaaaaatataccaatgtaacc
gttttccgtccggatgaaatccaaaactattccggtaaatccaatattctacttgttggg
agacccggactggaaaataatactgccgggaacataagctacagcatcctgaaaaacaaa
ccagctatcctttccagaatgcagggctcagactatgcaaggttctatgttgattacgat
atatggaaatcatcccagaccgttgtcatgctttcccacccatatccttcggaccattac
aaggtactggatctgttcaagacccttaatcagacaatacaatatccagatgtcgtcagt
gatttcaaagccgatgccattgaagagatggggtcattcatccgggtcgaattgaaaaac
cctgtaaagccgtcaatagaattgaaatcatacaatggaacaaatgtcccggagaacttt
acctgtgaattatctgcagatgaaaagggtgtaaaatttctggatatcaatgtcagtgaa
aatgtcctgaacgaaagctccaataatgtcgaacgggctctgatagtcatttattatact
gctgaggaccttgacagaacaggtgatggggatgctgacgatccgggagatatagatgag
aatacaataggctttaactggttcaatatgtctgccaatagatgggagaaactaactacg
gacatggactgggtaaatgatgtcggaataaatactacaaatgatatcatctacggcagg
gaatacgagggatacgtctgggcaaacgtctcacatctgagcatgtatggactttccggt
actgaaataacgcagcctgtgcatcctgcaccccatgacggacaccgcagaatcccgata
atcacggaagaagaaagccaggatgagaatatcacgcttgaagatgttcaggcagccccg
gaaagcacggaaaacacttctagagaaactcctgtggcaaaagaaacaggtacactccct
gaaatatggttctatctggcagcagccatgataatcttactgacggggctgggagctgta
tatctattaagaaagagaacgtga
DBGET
integrated database retrieval system