Methanosarcina sp. MTP4: MSMTP_2059
Help
Entry
MSMTP_2059 CDS
T03850
Name
(GenBank) High-affnity carbon uptake protein Hat/HatR
Organism
metm
Methanosarcina sp. MTP4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
ANAPC4_WD40
nSTAND1
PD40
eIF2A
Ge1_WD40
Nup160
RMC1_N
NBCH_WD40
PQQ_2
Cytochrom_D1
Bflower_3
AAA_16
CRA_rpt
Gelsolin
RsgA_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKB25528
UniProt:
A0A0E3P042
LinkDB
All DBs
Position
complement(2715682..2719815)
Genome browser
AA seq
1377 aa
AA seq
DB search
MVVPEFQAYVGPRPFEQEDKPIFFGRDREARDLLSLVIAHNLVLVYAQSGAGKTSLINAG
LIPLLEENQFEVFPVARVKGTIFENIGTDEISNIYVFNTLTSWAEGAYDVELLAKMKFVD
FLNGQGRMQDKDGMPLPRVIIFDQFEEIFSSYQGRWKDREVFFDQVSAALKADPLLRVVF
VMREDFIARLDPYAYLLPERLRTRFRMERLRSEAAQLAIKEPLKDTGRFFAEGVAEKLVD
DLLKIRVETIPGETAEVTGEYIEAVQLQVVCQNLWRELPPDEREITFQHLKTYGNVKQEL
YRFYEEAIRAAAAKAGIDEEGLRTLCGEVLITAMETRGMVYRAPESTLGVPNTAIDVLES
MHLIRAEWRAGARWYELTHDRFIEPILSSNKVFNDELAEKKREEKERAEKERLEREWAEK
ERVAEKKRAEKERILRRKIKRIGVYSLIFLLLAGFAAFQWINSEEQAKIANEEKQHAEEQ
TKIAEMQKQRAEEQTIIANEEKQRADEQTIIANEEKQHAEEQAKIAEEQAKIAEEEKQLA
EEQRKKASSAKRRAKEKEREAFALSLNTPAIKFLKFYDTRDIGILIAIESFRISRTSEAE
QLIRYGLSFIPHKVVVLNHNGSINNVVFSPDGRYIATASADNTSRVWDAATGTISVLNHN
GSINNVVFSPDERYIATASADNTSRVWDAATGKSVSVLNHTSSVNNVVLSPDGKYVATIN
SDLKASLWNAFTGEGTDVPNHYNYVYNAVFSPDGKYVMWATVSLDPMGLDPKSLDWKASL
WDASTGEETAVLNHTDLVYNAVFSPDGKYVATMSCPMSLEAMNLDTTNLDYTSLNCTARL
WNASTGEEIAVLYHNGSINNAVFSPDGKYIATVSNGYTAKVWDVSTGNENFTLNHNGWVN
DVVFSPDGKYIATASADNTARVWNVSTGEEILPPLEHNGWVNDVVFSPDGNYIATASDDS
TARIWDADTGKVIYILYHNDLVNNVVFSPDGKYVATASADNTSRIVSTDTSTLNHNDWVN
DVVFSPDGKYVATASADNTSRIWNVSTGKSVLVLDHYGCVNDVNFSSDGKYVATASADNT
ACVWNVSTGEEISVLNHTSPVYKTVFSPDGRYIATASEDNTAGVWDAATGKLVSVLDNSL
GVYDIVFSPDGKYVATASWGYVDNTARVWNASTGKETAVLNNHNSCVNNVVFSPCGKYIA
TASDDSTARIWNASTGEETAVLNHTSPVYKAVFSPDGKYVATASRNYTACLWNADTGKEI
CDPLEHYGSVIDVVFSPDGKCVATASLDYTACVWNVSTGEQISVLEHNCNIVNDVVFSPD
GKYIATTNDYTARLWRICDTEELINESSSRLTRNIPEDIWCKCMGDESYRETFPNLP
NT seq
4134 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtggtacctgaattccaggcttacgtgggccctcgaccttttgaacaggaagataaa
cccatttttttcggaagagaccgtgaagctcgcgatctcctttccctggtcattgcacat
aatctggtcctcgtctatgcccagtcgggtgcaggtaagacttcacttatcaatgcaggg
cttattcctctccttgaggaaaaccagtttgaagttttcccggtggcgcgagttaaaggc
acaatttttgaaaatataggaactgacgagatttcgaacatatatgtctttaatactctc
acaagctgggctgaaggtgcgtatgatgttgagctcctggctaaaatgaaatttgttgat
tttttaaatggacaggggcgtatgcaggataaagatggtatgcctttaccccgcgtaatc
atcttcgatcagttcgaggaaatcttctcttcatatcagggcaggtggaaagatagggag
gttttctttgatcaggtaagtgctgctttgaaagcagatccccttctaagggttgttttt
gtcatgcgggaggatttcatagctcggctagacccttatgcatatcttctgcccgaaagg
ttgcggacgcgttttcgcatggagcgtctgcgcagtgaggctgcccagctggcaatcaaa
gagcctttgaaagacactggccgcttttttgcagaaggcgtggcagaaaagcttgtcgat
gatttgctgaagattcgagttgagacaatcccgggggagaccgctgaggtcacaggagaa
tacatagaggccgtgcaacttcaggtagtatgccagaacctctggcgggagttaccgccg
gatgaaagggaaataacgtttcagcacctgaaaacctatggcaatgtaaaacaggaactt
tacagattttacgaagaggctataagggcagctgcagcgaaggcaggcattgacgaggag
gggctacgcacattatgcggtgaagtgctgataacggcgatggagactcgagggatggtg
taccgcgctccggagtccactttaggtgttcccaatacagccattgatgtgcttgaaagc
atgcaccttatcagagcagagtggcgggcaggtgcgcgctggtatgaactgacacacgac
aggtttatcgaacctatactatcttctaacaaggtttttaatgatgaactggcagagaaa
aaaagggaagagaaggaacgagcagagaaagagcggctggagagagaatgggctgaaaaa
gaacgggtggcagagaaaaagcgggctgaaaaagaaaggatactgcgccgcaaaattaaa
agaattggagtctattcccttatttttcttcttctagctggatttgcagcctttcaatgg
attaactccgaagaacaggcaaaaatagctaatgaagagaaacagcatgctgaagaacag
acaaaaatagccgagatgcagaaacagcgtgctgaagaacagacaataatagctaatgag
gagaaacagcgtgctgatgaacagacaataatagctaatgaggagaaacagcatgctgaa
gaacaggcaaaaatagctgaagaacaagcaaaaatagctgaggaggagaaacagcttgct
gaagaacagagaaaaaaagccagtagtgcgaaacggcgtgctaaagaaaaggagagagaa
gcttttgctttaagtttaaatacaccagccattaagttcctaaaattttatgatactcga
gatataggtattcttattgctatcgaatcatttcgaattagtagaacatcggaggctgaa
cagttaatacgttacgggctatcattcatacctcataaagttgttgttctgaaccataat
ggttcgataaataatgttgtcttcagtcctgatggaagatatatcgcaactgcgagtgct
gacaacacatcacgcgtatgggatgcagctacaggtacaatttctgttctgaaccataat
ggttcgataaataatgttgtcttcagtccagatgaaagatatatcgcaactgcgagtgct
gacaacacatcacgcgtatgggatgcagctacaggtaaatcagtttctgttctgaaccat
actagttcggtgaataatgtcgtattaagtcctgatggaaaatacgtagctacaataaat
tcggacttgaaagcaagtttatggaacgcattcacaggtgaaggaactgatgttccgaac
cattataattatgtttataatgctgtattcagtcctgatggaaaatacgtcatgtgggct
acagtgagtttggacccaatgggtctggacccgaagagtttggactggaaagcaagttta
tgggacgcatctacaggggaagaaactgctgttctgaatcatactgatctggtgtataat
gctgtcttcagtcctgatggaaaatacgtagctacaatgagttgcccaatgagcttggaa
gcaatgaatttggacacaacgaatttggactacacaagtttgaactgcacagcacgtttg
tggaacgcatctacaggggaagaaattgctgttctgtaccataatggttcgataaataat
gctgtattcagtcctgatggaaaatatattgcaacggtgagtaatggctacacagcaaag
gtatgggatgtatctacaggcaatgaaaatttcactctgaaccataatggttgggtaaat
gatgttgtcttcagtcctgatggaaaatatattgctacggcgagtgcagataacacagca
cgcgtatggaatgtatctacaggtgaagaaattcttcctcctttggaacacaatggttgg
gtaaatgatgttgttttcagtcctgatggaaattatattgctacggcgagtgatgactcc
acagcacgcatatgggatgcagatacaggtaaagtaatttatattctatatcataatgat
ttggtaaataatgttgttttcagtcctgatggaaaatatgtcgctacggcaagtgctgac
aatacatcacgcattgtatctacagacacttctactctcaaccataatgattgggtaaat
gatgttgtcttcagtcctgatggaaaatatgtcgctacggcgagtgctgacaacacatca
cgcatatggaatgtatctacaggtaaatcagttcttgttctcgaccattatggttgtgta
aatgatgttaattttagttctgatggaaaatatgtcgctacggcaagtgctgacaacaca
gcatgtgtatggaacgtatctacaggtgaagaaatttctgttctgaaccatactagtcca
gtgtataaaacggtattcagtcctgacggaagatatatcgcaacggcaagtgaggataat
actgctggtgtatgggatgcagctacaggtaaactagtttctgttctggacaatagcctt
ggggtgtatgatattgtcttcagtcctgatggaaaatatgttgctacagcgagttgggga
tatgttgacaatacagcacgcgtatggaatgcatctacaggtaaagaaactgctgttctg
aataatcataatagttgtgtaaataatgttgtcttcagtccttgtggaaaatacatcgct
acagctagtgatgactccacagcacgcatatggaacgcatctacaggtgaagaaactgct
gttctgaaccacactagtccggtgtataaagctgtattcagtcctgatggaaaatatgtc
gctacagcgagtcgtaactatacagcatgcttatggaatgcagatacaggtaaagaaatt
tgtgaccctctggaacattatggttcggtaattgatgttgtcttcagtcctgatggaaaa
tgtgtcgctacagcgagtcttgactatacagcatgcgtatggaatgtatctacaggtgaa
caaatttctgttctggaacataattgtaatatagtaaatgatgttgtcttcagtcctgat
ggaaaatatatcgcaacgacaaatgattacaccgcaagattgtggagaatatgtgataca
gaggagcttataaacgaatccagcagtcgtttaactcggaacataccggaagatatatgg
tgtaagtgtatgggtgatgagtcttatcgcgagacatttccaaatttgccataa
DBGET
integrated database retrieval system
