Methanobacterium sp. BAmetb5: CIT02_01570
Help
Entry
CIT02_01570 CDS
T05745
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
meto
Methanobacterium sp. BAmetb5
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
SNF2-rel_dom
ResIII
NOV_C
DEAD
AAA_19
SLFN-g3_helicase
NAT10_TcmA_helicase
AAA_34
AAA
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXV39093
LinkDB
All DBs
Position
complement(334359..337628)
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MLKEGITVSGPFWPEQIEIKKVEKLGENTLIIGSTVQSNQLFENLLDDEDLKKLVIDDFV
IDFSSPASEVFLSLEAQRYRYTSMFDTFLAMNTSKIDPLPFQLDAVYLHALKQPKMRFMI
ADDPGAGKTIMAGLIIKELKLRGLAKKILIVSPGHLASQWQREMKDKFNESFRTVNRSYI
NSYSLENAWDVENQYITSIDFAKQKDIRAMLSGTKWDLVVVDEAHKMSAYMYGKKISKRQ
RYRLGEVLSRTTEHMLFLTATPHQGDPENYRLLLDLLLPGFFADPAMINEARRNGDNPLF
IRRIKEDLRDFDQKPIFTKRYTTTVKFDLNEQEIQLYEDVSRYVRTQFNRALMRGKRVGF
SFALLILQRRMASSIYALLKSLERKKASFEEIIENPKLLKKYQSIDDKDLEDESEEDRWI
LESEWEKKTTVDTITALKAEIKTLDHLIILANSILGERNETKLSKLREVMDSLGEEKILI
FTEAKDTLDYLIEKISSWGYEVNTIHGGMNMDERVKAERVFQDQTQVMVATEAAGEGINL
QFCHLMINYDIPWNPNRLEQRMGRIHRYKQEKDVNIFNFVAENTREGAVLATILDKLNEI
KKSIGSDKVFDVIGDVFQGKDLYNLIAEAVSGERSVVDIQDELDFEVDGEYRERLKKELL
NQGLVDNIDYESIFDLSEMNAELSLVPEYLEEFFKKAFIKANGRYNIRKDGTIQIRTVPL
EIRKNNDQNSFKKNFGIIEKSYTSITFNRDNANNGTELVTFGHPLLEGLIEWVEKSFYEK
MLKGCSFFDPSGEYDGYIWFYEGAVKDGKDEIVGKRLFAIYDDGHEIKKIDPSILWNFEP
VDEPTPLNVQLDRKTPKIQVIGLAKNYLKELKVERERQANVKKKYGIKSLQQLITEIDAD
LTELYIRSDIGEDVDLAIYNKETKKKEYESSLKQLNQEIVQESSLSISLPKFIATINVKS
KTIPTTNDSKINIILNYEIKEGREPLLTPSSSGFNIKSKDKNKIRFIAFKFVKDIESKIT
LTLNEWLKAKRFGENYWLYILVDNGNSYDLYLIQDPKNKLETSKEDFSVKVVPERWQVAN
KVLEINKNY
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaagaaggaataacggtatcaggacctttttggccagaacaaatagagattaaa
aaagttgaaaaattaggagaaaatactcttattattggttctacagtccaatcaaatcag
ctctttgaaaatttgcttgatgatgaggatcttaaaaaactagttatagatgattttgta
atagatttttcatctccagcgagtgaagtctttctatcattagaagcacaaagatacaga
tatacttcaatgtttgacacttttttggccatgaatacttccaaaattgatccacttcct
tttcaattagacgccgtatatcttcatgcgttgaaacaacctaaaatgcggtttatgatt
gcagatgaccctggtgctggtaaaactataatggccgggttaatcatcaaggaattgaaa
cttagaggattagctaaaaaaattttaatcgtatctccgggtcatttagccagtcaatgg
caaagggaaatgaaagataagtttaatgaatcttttagaactgttaataggtcatatatc
aatagttacagtttagaaaatgcttgggatgtcgaaaatcaatatattacttcgattgac
tttgcaaaacaaaaagatatacgtgcaatgttaagtggaacaaaatgggatttggtagtg
gttgatgaagcccataaaatgtctgcatatatgtacggtaaaaaaatttccaaacgacaa
agatatcgtttgggtgaagttctatcaagaactactgaacacatgctatttcttactgca
actcctcaccaaggagatccagaaaattaccgactacttcttgacctacttttaccaggt
ttttttgcagatcctgcaatgatcaatgaagctcggcggaacggtgataatcctcttttt
attaggagaataaaagaagatctcagagattttgatcaaaaacctatttttaccaaaagg
tatacaacaacagttaaattcgatttgaatgaacaggaaattcaattatacgaagatgta
tcaagatatgttcgtacgcaattcaatcgagctttaatgagaggtaagcgagtaggtttt
tcatttgcacttttaattcttcaaagaagaatggcttcgagtatatatgcactattgaag
tctttggaaaggaaaaaagctagttttgaagaaatcattgaaaacccaaaattactcaaa
aaatatcaatccattgatgataaggatttagaagatgaatcagaagaagatcgttggata
ttggaatcagaatgggaaaaaaagaccaccgtagatactatcactgccttaaaagctgaa
ataaaaacgttagaccatcttataatattagcaaattctatcttgggtgaacgaaacgaa
acgaaactttctaaactgagagaagtaatggattctctaggtgaggaaaagatactgatt
tttactgaagctaaagatactctggattatttgattgaaaaaattagctcttgggggtat
gaagtaaataccattcatggtggtatgaatatggatgagcgggttaaagctgaaagggtt
ttccaagatcaaactcaagtcatggtagccacagaagctgcaggtgaaggtattaatctc
caattctgtcatttaatgataaattatgacattccatggaaccctaaccgtttagaacaa
agaatgggaaggattcatcgatacaaacaagaaaaagatgttaatatatttaattttgta
gctgaaaatacccgcgaaggtgcagtattagcaaccattctagataaattaaatgaaata
aaaaaatcgataggctctgataaagtatttgacgtcattggtgatgtatttcaaggaaaa
gatctttataatttaatcgctgaagcggtttcaggcgaaagaagtgtagttgatattcaa
gatgaattagactttgaagttgatggagaatacagggaaaggttaaaaaaagaattatta
aatcaaggtttagtagataatattgattatgaatccatttttgatttaagtgagatgaat
gctgaattaagtctcgtgccagaatatttagaagaattctttaaaaaggcatttataaaa
gctaatggcagatataacattagaaaggatggtacaatccaaatacgaacagtaccgctt
gaaattcgtaaaaataatgatcaaaattcatttaaaaagaactttggcattattgaaaaa
tcttacacaagtataacctttaaccgtgataatgctaataatggaactgaactagttaca
tttggacatccacttttagagggtcttattgaatgggttgaaaaatcattttatgaaaaa
atgctaaaaggttgttctttttttgatccttctggagaatatgatggatatatttggttc
tatgaaggtgccgttaaggatggtaaggatgaaattgtaggtaaaagattgtttgccata
tacgatgatggtcacgaaattaaaaagattgatccatcaatattatggaattttgaacct
gtggatgaaccaacacctttgaatgttcaattagatcgaaaaacacccaaaattcaggtt
attgggttggctaagaactatctaaaagaactcaaagttgaaagagagcgtcaagctaat
gtgaagaagaagtatggaataaaatcactccagcaattaataactgaaatagatgctgat
ttaacagaactttatataagatcagatattggtgaagatgttgatttagcgatatacaat
aaagaaacaaagaaaaaagaatatgaatcttcattaaaacaattgaatcaagagattgtt
caagaaagtagccttagtatatctttacctaagtttattgccactattaatgttaaatcg
aaaactattcccacgactaatgactcgaaaattaatataattttaaattatgaaattaag
gaaggtcgtgaacccttattgactccatcaagctccggctttaatatcaaatcaaaggat
aaaaacaagattagatttatagcttttaaatttgtcaaagatattgaaagtaaaatcacg
ttaacgcttaatgaatggttaaaagcaaaacgattcggagaaaattactggttatacatc
ttagtagataacggtaattcttatgatttgtacttgatccaggacccaaaaaataaatta
gaaacgtcaaaagaagatttttctgttaaggtagttcctgagaggtggcaagtagctaat
aaagttcttgaaataaataaaaattattga
DBGET
integrated database retrieval system