Methanobrevibacter sp. TLL-48-HuF1: K4897_05860
Help
Entry
K4897_05860 CDS
T08254
Name
(GenBank) Ig-like domain repeat protein
KO
K13735
adhesin/invasin
Organism
metv
Methanobrevibacter sp. TLL-48-HuF1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
metv00001
]
09160 Human Diseases
09171 Infectious disease: bacterial
05100 Bacterial invasion of epithelial cells
K4897_05860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Big_3_5
MG4
CarboxypepD_reg
BIg21
Ig_DR_A0283-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URN48828
UniProt:
A0A9E7IK60
LinkDB
All DBs
Position
1253970..1260275
Genome browser
AA seq
2101 aa
AA seq
DB search
MLFLIILSSISLASASDDFNSTNVDDNVIVENNYDTDSIIGDNGDNYVYVNPSANLSIVP
DGSQDKPYASIGEAVNMASDNSTVILMDGIYSSPGDLNIEINKNLVIKSLTGNVTVNGNG
QSTFFNIFESKSLILENINFVNGKTTEYSSYYGVIYNKGFLTLSNVEFKNINSFMGVIYN
EGDLKVYDSKFSNCVGSNYADMIFNLGGCSVVNSKLIISYSNKNPAIYNFHNLFVNNSQT
FGISSNPNFDVDIFKSITMTVINSKVGQLACNNGTLVVKNTTADAGFRAENSVVNISDVY
FRTSGYSGLSSLFNSDATIKSSYFDSSINIGNSNLNITYSVVLGEIYGNGAYANNVSANY
NWWGVNKGPSLKYVKSDTKYWVVMTFECDESPIKVGTNAEFRATLNKYTDGDSMKYLDNP
SLLPQMSVKFESQNGKFDYSSGTLVNGTFSNYLRNNNESSIVYAVINSQRLRLIVGTGLT
DYDWYVSPTGHNGFGDGSHDNPYKTLDHTIAKALNGNTIYLLNGTYTNNWNSNLEIVKNL
TIVGVGNVILSRENDRNIFIVKEWGCLTLKNLNFTVNLKQYSNELILVKGGNLTVLNSNF
YDIRSVGIVSTSNGVQNNGNVYVDNITFKNIVGPLIRGGANITINNISAEKCSNIYTYRG
MEAYNVCFPVWNYISISNSVFRSNTVGIVNLNPTIYSSSSPLGKNIVGDLSKSTVFAYIT
NCSFVENNFIPSDYYASNRIGLGLGRSVYGTCHGEVNNCSFIKNNGRLIGGAVVNNSFFD
SNTVCYVSADLINNSYFYKNDNSGIGNLDSTYSYRGIATANEVYYSVFIGNKAAYGGALA
GTKIVHYSVFLNNSATYGGNDIFVYDGEVDYSSNWWGSNQKPDGNRIFVHIGSLTLDNWV
IMSLDAVTNTHIIAALNKLIDNNGNISGLDKVLPTRDVYFSSDYGIISPLNTSLVNNKAD
AYVVQNETTADFNVYARIDNQLLDLTLRNNNTQLVMDDVVFYGNNNNYEITLINVNGHRI
FNQTLTVVITTPKGEKEYFTLVTDEKGYAKFEVTYPVGVYNISVYYDGNGYFEGCNKSAQ
ITISPSVTYLISYNYTFYGKNVNFYAVLTNGQVGIVNQSITITIIDSKGGTRTAVITTDS
TGRADALLSLDVGKYTIKCEYKGDGWYLPSSSVSYVEIRPVNSTIEVPDVVFYGVGNDYN
ITLRDEHGTLIRGEYINVVITQGNLSDTFTLQTGDDGVARLTINYLPGTYQITASYAGDD
VYGSAKGSGTITVNKVLTVISGFHYSKIPLNGVYTIVLTDMFGHRVTNATIKLNLYKGVL
LKTYTGVTDGNGEVTFRIAQGEGTYLATFDFDGDIWYIDSTGAATIVVDSQTAPGQVSIN
ASDFVQYYGENRYFVISFNDTNAYSLYGKNIAVTISSGDWQQTYNVVTDIYGYGRLQITL
NPGIYNITYQYTNPYYGLFAKNLSTVSVYRMPTTILASDVIMNVGEAKYYVIKLLDSRNA
AVKNMQIMIDINGTNYTATTNNDGVARLLLSLGVGKYLISYHIDNPNYIPSSGSSYILVV
DSNRTSTNIESGDVNGYDNESMNFTVVLSDVLGNPINYATILANISTIDGDFVGSYKGVT
AKDGKVIFSFDLDYGRYIISTYYLGSNSYLGSYGVNYVNVESVGNTTKTVLIAGDSELSG
SSNYYVVLIDENGTYIKGKEIKFAVGNQSYYAITDSEGKAFLDTVLSPGFYDIKATFGGD
DTYKKSSVKTTLVVSGNSTYLFALNCTKNYRNGTQFYVQLLDSYSNPLVNRTIAITINGK
TYNRTTDENGWATMNINLRPGEYEVLCAYYGPTESDNAFAKAIVKVLPTILGDNLVKYYL
NESQFHVKVIDGAGNPIANTNVSMNINGVFYVRKTNDEGIDTLGIKLWAGKYVLTVHNPY
DGLLMSFNVTVLPTVEANDLVKYYRNDSQFYAKFLDGQGNPLANAKVKFNINGVLYTRET
GGDGVAMLNINLNPGEYILTAIHPDGLQVGKKVTVLPTLEGSDLTMNYRDGSQFKARLVD
GTGRALANETVTFNINGVFYNKITDVNGVASLNINLMAGKYIITSVYGSYATSNTILVNK
L
NT seq
6306 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatttttgattatattgtcttcaataagtttagctagtgctagtgatgattttaac
agtactaatgttgatgataatgtaattgttgaaaataactatgatacagactctattatt
ggagataatggggataactatgtttatgtaaatccttctgcaaatttatctatagtgccg
gatggtagtcaggataaaccgtatgcttcaattggtgaagcagttaatatggctagtgat
aattctactgttattcttatggatggaatttatagcagtccaggtgatttaaacattgaa
ataaataaaaatttggtaattaaatcattaacgggcaatgtaacagttaatggtaatgga
caaagtacattttttaatattttcgagtccaaatcattaattttggaaaatattaacttt
gtcaatggaaaaacaactgaatattctagttattatggtgttatttacaataaaggattt
ttaacattgtcaaatgtggaatttaagaatattaattcttttatgggagttatttacaat
gaaggcgacttaaaagtttatgattctaaattttctaattgtgttggttctaattatgcg
gatatgatttttaatttgggaggctgtagtgttgttaatagtaaattgattataagctat
tcaaataagaatcctgcaatttataattttcataatttatttgtgaataattctcaaact
tttggaatttcttcaaaccctaattttgatgttgatatttttaaaagcattaccatgact
gttattaactcaaaagtagggcaattagcatgtaataatggtacattggtagttaaaaat
acaactgctgatgcgggttttagagcagaaaactctgtagttaatataagtgatgtgtac
tttagaacttccggttattcaggtttatcttctctatttaattctgatgcaactattaaa
tcatcatattttgatagcagtattaatattggtaattctaatcttaatataacttattct
gttgtattaggcgaaatttatggtaatggtgcttatgcaaataatgtttcagcaaattat
aattggtggggggtaaataaaggaccttctcttaagtatgttaaatcagacactaaatat
tgggttgtaatgacttttgaatgtgatgagtctccgattaaagtaggtactaatgcggag
tttagggcaactttaaataaatatactgatggggattccatgaaatatttggataatcct
tctttacttcctcaaatgagtgttaaattcgagtctcaaaatggtaaatttgattatagt
agtggaactttagttaatggtacattttctaattatttaagaaacaataatgaaagttca
attgtttatgctgtaattaattctcaaagattaagacttattgtcggtacaggattaact
gattatgattggtatgtttcaccaacaggacacaacgggtttggtgatggaagtcatgat
aatccatataaaactttggatcatacaatagctaaagcattaaatggaaatactatttat
ttgttaaatggtacttatacaaataattggaattcaaatttggaaattgttaaaaattta
actattgttggtgttggtaatgtaattttaagtagagaaaatgaccgtaatatattcata
gttaaagaatggggttgtttgactcttaaaaatttaaattttacagttaatttaaaacag
tattctaatgaattgattcttgttaaaggaggaaatttaacagttttaaattccaatttc
tatgatatccgttctgttggtattgtttcaacaagtaatggtgttcaaaataacggtaat
gtatatgtggacaacatcacttttaaaaacattgtaggtccattaattagaggcggagcc
aatattactattaataatatatctgctgaaaaatgcagcaatatttacacttataggggt
atggaagcatacaatgtttgtttccctgtctggaattatatttctatttccaattcagta
tttagaagcaatactgttggcattgttaatttaaatcctactatttattcttcttcatct
ccattaggtaaaaatatagttggggatttatctaaaagtactgtatttgcatacattact
aattgttcttttgtagagaataatttcatacctagtgattattatgcaagtaatcgcata
ggacttggattaggacgcagtgtttatggaacctgtcatggagaagtaaacaattgttct
tttattaaaaataatggtaggttaattggaggggctgttgtaaataattctttctttgat
tccaatactgtttgttatgtaagtgctgatttaatcaataattcttatttctataaaaat
gacaattcaggtataggtaatctggattctacctattcatataggggaatagctactgct
aatgaagtttattattctgtttttattggaaataaagctgcttatggtggtgctcttgca
ggtactaagattgttcattattctgtatttttgaataattctgctacttacggaggtaat
gatatttttgtttatgatggcgaagttgattattcaagtaactggtggggttctaatcaa
aaacctgatggtaataggatttttgtacatatcggatctttaactcttgataattgggta
atcatgtctttagatgctgttacaaacactcatattattgctgctttaaataaattaatt
gataataatggaaatattagtggtttggataaggttcttccaactagagatgtttatttc
tcatcagattatggaataatatctccacttaacacgtctcttgtaaataataaagctgat
gcatatgttgttcaaaatgaaactactgctgactttaatgtttatgcaaggattgataat
caacttttagacttaacacttagaaataataacactcaactggtaatggatgatgtagta
ttttatggaaacaataacaactatgaaattactttaattaatgtaaacggtcatagaatt
ttcaatcagactttaactgttgttattacaactccaaaaggtgaaaaagagtatttcact
ttagtaactgatgaaaaaggatatgccaagtttgaagtaacttatcctgtaggggtatat
aacatatctgtttattatgatggtaatggttattttgaagggtgtaataaatctgctcag
attactattagtccatctgttacttatttgattagttataattacactttttatggtaaa
aatgttaatttttatgcagttttaacaaatgggcaggtaggaattgttaatcaaagtata
acaatcactattattgattctaaaggaggaacaaggacagctgttattactactgattct
actgggcgtgctgatgcactattaagtttggatgttggaaaatatactattaaatgcgag
tataaaggtgacggctggtatctgccaagctcttctgtatcttatgttgaaatccgtccg
gttaattcaacaattgaagtgcctgatgttgttttctatggtgttggaaatgactataac
atcactttaagggatgaacacggtacattaattagaggcgagtatattaatgttgttata
actcagggcaatttgtctgatacttttactttgcaaactggtgatgatggagtagctaga
ttaactattaattatcttccgggtacttatcagataactgccagctatgcaggtgatgat
gtttacggttctgcaaaaggcagtggaactatcacagttaataaggttttaacagttatt
tcaggtttccattatagtaaaattccattaaatggtgtttatactattgttttaactgat
atgtttggtcacagagtaactaatgcaactataaaattaaatctgtacaaaggagtttta
ttaaaaacttatactggtgtaactgatggtaatggagaagtaactttccgtattgctcaa
ggtgaaggtacttatttagctacttttgattttgatggtgatatatggtatattgattca
actggtgctgctactattgttgttgatagtcaaactgcacctggtcaggtttctattaat
gcaagtgattttgtccagtattatggtgaaaataggtattttgtaatttctttcaatgat
actaatgcatatagtttgtatggtaagaatattgctgttacaatttcttccggtgattgg
cagcaaacttacaatgttgttactgacatttatgggtatggccgtttgcagattacttta
aatcctggtatttataatattacttaccaatacactaacccatattatggtttgtttgct
aaaaatttaagtaccgtgtctgtttatcgtatgccgactacaattcttgcatctgatgtt
attatgaatgttggtgaagctaagtattatgtgataaaactacttgatagcaggaatgca
gctgttaaaaatatgcaaatcatgattgatataaatggaacaaactacacagccactaca
aataatgatggtgtagctcgtttactcttaagtcttggtgttggcaagtatctgattagt
tatcatatagataatccaaattatattccatcatccggttcatcttatatattggtggtt
gattctaacaggacttctactaacattgaatctggtgatgttaatggttatgataatgag
tctatgaatttcactgttgttttaagtgatgttttaggtaatcctattaattatgctact
attttagctaatatttctacaattgatggtgattttgtcggatcttacaaaggagtaact
gcaaaagatggtaaggtaatatttagctttgatttagattatggcagatatattatttcc
acttattatttaggcagtaattcctatcttggaagttatggagttaactatgtgaatgtg
gaatctgtaggcaatactactaaaacagttttaattgctggagattctgaattaagtggt
agcagtaattactatgttgttttaattgatgaaaacggaacatatatcaaaggcaaggaa
attaaatttgcagttggtaatcaaagttattatgctattacagattctgaaggtaaggca
tttttggatactgttttatctcctggattctatgatattaaggcaacttttggcggtgac
gatacctataaaaaatcatctgtaaaaactactttggttgtttcaggaaattcaacatat
ctgtttgccttaaactgcactaaaaattatcgtaatggaacacaattttatgtacaatta
ttggattcctattcaaatccattggtaaatcgtacaatagctataactattaatggaaaa
acttataatcgcacaactgatgaaaatggttgggcaactatgaatattaaccttagacct
ggcgaatatgaagttttatgtgcatattatggccctactgaatcagacaatgcatttgca
aaagctattgtgaaagttttaccgacaatattgggggacaatctggttaaatattatctt
aatgagtctcagttccatgttaaagtaattgatggtgcaggtaatccaatagctaatact
aatgtgtcaatgaatattaatggtgtattctatgttcgcaaaactaatgatgagggcata
gatacattaggtattaaattatgggctggaaaatatgttttaacagtacataatccttat
gatggtttattaatgtcatttaatgttacagttctgccaacagtagaagctaacgatttg
gtcaaatattatcgcaatgactctcagttctatgctaaatttttagacggtcagggtaat
ccattagctaatgctaaagttaagtttaacattaatggtgttttatatactcgtgaaact
ggtggggatggtgtagctatgttaaatattaatttaaatcctggggaatatattttaaca
gctattcatcctgacggtcttcaagttggtaaaaaagtaactgttttacctactttggaa
ggtagtgatctgactatgaattatagggatggcagtcagtttaaggctcgtttagttgac
ggtactggtcgtgcattagctaatgagactgtgactttcaacattaatggggtattttat
aacaagattactgatgttaatggtgttgccagcttaaatattaatttgatggctggtaaa
tacattattacatctgtctatggtagttatgctacttctaatactattttagtgaacaaa
ttataa
DBGET
integrated database retrieval system