Methanobacterium paludis: MSWAN_1374
Help
Entry
MSWAN_1374 CDS
T01509
Name
(GenBank) conserved repeat domain protein
Organism
mew
Methanobacterium paludis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
Big_1
DUF7619
Invasin_D3
CarboxypepD_reg
bMG3
Chlam_OMP6
Integrin_A_Ig_3
DUF7507
NPCBM_assoc
bMG10
TED
Big_3_5
NOMO1-like_9th
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEG18389
UniProt:
F6D722
LinkDB
All DBs
Position
1482692..1486564
Genome browser
AA seq
1290 aa
AA seq
DB search
MLLLFSFVFIIAICGTSAAAVTGQNTSVCSNDSVSAASNSSADPVINGTVTINEYGTVRP
LQNATVTVNSMSNRTLGSATTDQNGYYSISFYSTDNQFKVTASYLGCNPVSKTVTVTLNN
TNNISYGTSNLQLTPMNATLVDLGNGAYVYIKSKDSYNFAGIIHVTINGTTYDAYCIDLY
TDISTGDRLLVNGALPGTTGNLSTQVDWGKVNYILSHYSGTTDTEAAAIQCAIWYFTSVQ
YGVYPGNDTSHSGYYQFMTYNKNNYSSATTPYDGYCRGWFGYDKSVYNRAWQIINAAVSM
QYPTNITLTPETTRVSNGQSTTLTATVTDKNGNPLSGITVTFKTSKGTLSTTTGTTNSNG
QVSTILSGLTNSTATVTAGVSGNYGVLLYDNPKDPKQDLVTVKFLPYILSDTSIVNFDVT
ANVQLNQTANSPVNVGDNVTYTVTAKNNGPNTATGIIITDAVPSGLTNVTVTPSAGTSYV
NGVWTIPTLINGATATLTITGNAGTSMAGTTTTNTATRTAQNEYNSQPTTTSASVYTKMA
EVKFSQTSTTPANVGDNVTYVVTVTNEGPDTATNTIITDNVPSGLTNVTVTPSAGTTYVN
GVWTIPSLINGASATLTITGNAGAAMAGTITTNIATKTGETEYDPTTIGEQTTADIYTKE
ADVVLTQTGNYSGSTVTFVVTATNNGPDTATNINITDIIPAGLTNFTVNPSIGTYSNGIW
TIPTLANGAIATLTITGNATPETTTTNTANKTSQTEYDPTPDSTTKSIYTPAVDINVLQY
PWYYDSTAKAYVTSYELYNTPVFIVDVRNSKLYDDATGVIIEYIVGTGFKYIDLDTHGIG
VATFDGNQTITWIIGNMPKNSDVFMTVMCQAIETGNKTTDLTNIAKLKSVNEKDMTSTYN
QANVSIEVPQSADIQVNQTQQNNTQNVTYTITVTNNGPENATGVQITDKLSTGLTFTSAD
THGIGTYDPTTGIWDIGTLNNGTTVTLTLNANITGTGTIKNNAAKTQQTNNDWNLDNNSQ
QNILIISGQYTPTCDIHVLQYPWYYDSTAKAYVTSYELYNTPVFIVDVRNSKLYDDATGV
IIEYIVGTGFKYIDLDTHGIGVATFDGNQTITWIIGNMPKNSDVFMTVMCQAIETGNKTT
DLTNIAKLKSVNEKDMTSTYNQANVSIEVPQSADIQVNQTQQNNTQNVTYTITVTNNGPE
NATGVQITDKLSTGLTFTSADTHGIGTYDPTTGIWDIGTLNNGTTVTLTLNANITGTGTI
KNNAAKTQQTNNDWNLDNNSQQNILITTTT
NT seq
3873 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgcttttattctcgtttgtttttataattgcaatttgtggaacatctgcagcagcc
gtaacaggccaaaatacaagtgtctgttcaaatgattcagtttcagcagcttcaaacagt
agcgctgatcctgtaatcaatggaaccgttactataaatgaatatggtacagtaagacct
ttacaaaacgccacagttactgtaaactcaatgagtaaccgaacccttggaagtgcaacc
actgaccaaaatggatattactcaataagtttttacagcacggataatcagtttaaagtg
acagcgagctatcttggatgcaacccagtcagcaaaaccgtaacagtgaccctgaataat
actaacaatatttcttacggtacatcaaaccttcaattaacccctatgaatgcaaccttg
gtcgacctcggaaacggagcatatgtctatatcaagtcaaaggacagttacaactttgca
gggataatccatgtgactatcaatggtaccacttacgacgcctactgtattgacctgtat
acggatattagtacgggagatcgccttttagttaacggggctctgcctggaaccactgga
aatttatcaacccaggtggactggggcaaagtcaattacatactaagccactacagcggc
acaaccgacactgaagccgcagcaatacaatgtgccatctggtactttacttcagtacag
tacggagtataccctggaaatgatacatcacattcaggatactaccagttcatgacctac
aataaaaataattacagcagtgcaactacaccttacgatggatactgcagaggatggttt
gggtatgataaatctgtttataacagggcctggcagattataaatgctgctgtttccatg
cagtacccaactaacattactttaactcccgaaacaacccgcgtatccaacggacaaagc
acaacattaactgcaacagtaacagacaaaaatggcaaccccctatctgggattactgtc
acattcaaaaccagtaaaggaaccctaagcaccaccacaggtacaacaaactctaacggt
caggtttccacaattttatctggattaacaaacagcaccgcaacagttactgcaggggtt
agtggaaattacggagtattattatacgataatccaaaagatcctaaacaagatttagtt
actgttaaatttttaccttacatcctttcagacacttctattgtaaactttgatgtaaca
gccaacgttcaactcaaccaaacagcaaactcacctgtgaacgttggagacaatgtaact
tataccgtaacagctaaaaataacggaccaaacactgctacaggtataattattactgat
gctgtgccatccggattaacaaacgtcactgtaacaccatcagcaggaaccagttatgta
aatggtgtgtggaccataccgacactcataaacggagccaccgcaaccctaacaataacc
ggaaacgctggaacaagcatggcaggaacaaccacaaccaacacagcaaccagaacagca
caaaatgaatacaactcacaaccaaccacaacttcagcaagtgtgtacactaaaatggca
gaagttaaattcagccagacttcaaccacaccagcaaatgttggagataacgtaacttac
gtggttacagtaaccaatgaaggaccagacacagccaccaacacaattataactgataat
gtgccatcaggactgacaaacgtcactgtaacaccatcagcagggaccacatatgtcaat
ggagtttggaccataccctcactaataaacggagcctcagcaaccctaacaataaccgga
aacgctggagcggccatggcaggaacaatcacaaccaacattgccactaaaactggagaa
acagaatacgacccaaccacaattggtgaacaaactactgcagatatttatactaaagaa
gctgacgtggtacttacacaaaccggaaattattcaggtagcaccgtaacgttcgttgta
actgcaaccaacaacggaccagacacagccaccaacataaacataactgatataatacct
gcagggttgacaaactttactgtaaatccaagcattggaacttacagcaacggaatatgg
accataccaacacttgcaaacggagccattgcaaccttaacaataaccggaaatgccaca
cctgagacaaccacaaccaacacagctaacaaaaccagccagacagagtatgaccctaca
cctgacagcaccaccaagagcatatacactcctgctgtggatattaatgtgttgcagtat
ccttggtattatgacagcactgcaaaagcatatgttacaagctatgaactgtataacact
ccagtattcattgtagatgttaggaactctaaactatatgatgatgccacaggcgtaata
atagaatacattgttggaactggtttcaaatacatcgatctcgacacccacggtatagga
gtagccacatttgacggaaaccaaactataacatggatcattggcaacatgccaaaaaat
agtgacgtattcatgaccgtcatgtgccaagctattgaaacaggcaacaaaacaacggat
ttaactaatatagctaaactaaaaagcgtgaatgaaaaagatatgaccagcacatataac
caagctaacgtatccatagaagtgccacaatccgcagacattcaagtaaaccaaacgcaa
caaaacaacactcaaaacgtaacatataccataaccgtaactaacaatggacccgaaaac
gccacaggagtacaaataacagacaaactatctaccggattaacattcacatcagcagac
acacacggaataggaacctacgacccaacaacaggaatatgggacataggaacactcaac
aatggaacaacagtaacattaaccttaaatgccaacataacaggaaccggaaccatcaaa
aacaacgccgcaaaaacacaacaaacaaataacgattggaacttagacaacaactcacaa
caaaacatcctaattatatctggacaatacaccccaacttgtgatattcatgtgttgcag
tatccttggtattatgacagcactgcaaaagcatatgttacaagctatgaactgtataac
actccagtattcattgtagatgttaggaactctaaactatatgatgatgccacaggcgta
ataatagaatacattgttggaactggtttcaaatacatcgatctcgacacccacggtata
ggagtagccacatttgacggaaaccaaactataacatggatcattggcaacatgccaaaa
aatagtgacgtattcatgaccgtcatgtgccaagctattgaaacaggcaacaaaacaacg
gatttaactaatatagctaaactaaaaagcgtgaatgaaaaagatatgaccagcacatat
aaccaagctaacgtatccatagaagtgccacaatccgcagacattcaagtaaaccaaacg
caacaaaacaacactcaaaacgtaacatataccataaccgtaactaacaatggacccgaa
aacgccacaggagtacaaataacagacaaactatctaccggattaacattcacatcagca
gacacacacggaataggaacctacgacccaacaacaggaatatgggacataggaacactc
aacaatggaacaacagtaacattaaccttaaatgccaacataacaggaaccggaaccatc
aaaaacaacgccgcaaaaacacaacaaacaaataacgattggaacttagacaacaactca
caacaaaacatcctaattactacaacaacttaa
DBGET
integrated database retrieval system