Metamycoplasma faucium: LQ356_02875
Help
Entry
LQ356_02875 CDS
T10859
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mfau Metamycoplasma faucium
Pathway
mfau03020
RNA polymerase
Brite
Enzymes [BR:
mfau01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
LQ356_02875
Transcription machinery [BR:
mfau03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
LQ356_02875
DNA repair and recombination proteins [BR:
mfau03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
LQ356_02875
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WYM97121
LinkDB
All DBs
Position
complement(594041..598474)
Genome browser
AA seq
1477 aa
AA seq
DB search
MKKSRKYATLDGDKIAKISLALATPNDVESWSHGEVTKPETINYKSYKPERGGLFDEVIF
GPMIDYRCPICGFKYKKINEGTFCTRTELCKQEKVEILPKIARRNHMGHIKLNSPVVHFW
YFKVDHSIIYKLLGLQTGRSTEPVKRIDLENLIYYKSNIVLESGGLKSLPKNTIIDINEA
ANIYKDALEELIQRFEPDTEDYDDIKETLDDLVEKATSKIGQDYGIDFYELNEVIEHYSD
AKIGTGALAIEYLLKNIDLKKEKEIVTEKIKKINKEEEQKFTLSQKSTREKLYKRLQVIN
AFIESKQDPTSMLIYNLPVIPADLRPLIQLDGGRHSTSDINELYRRVIIRNNRLKQWQEK
DAPTLVVQNELRMIQEAVDALIDNQRRSPNPVLSKDNRPFKSISDALTGKKGRFRQNLLG
KRVDYSGRSVIVVGPDLKMHQCGIPREMAAKLFEPWIIKTLIDNEEATTIKQAKKMIEDQ
NPKIWPYVAKSIEGRLVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLVRGKAIKLHPLVCTPFNADFDGD
QMAVHVLVSDQALLEARELMLANKNILGPKDGEPIINPSQDMVLGIYYLTTEEKDALGEG
KVFDSFEHMMRSYEAKKVSLHARVALPLEKVKTFDSNSINSKIIGRPYIISTVGKFIFNN
IFPMSFPFIYSNEVGKYSSIEEYGKSIFKYIVNPGTDIKTYIKEKLPILSGFNKKNIAKT
IRYIFDKYVATTTIEKIANVVDKINDSLLNNDISSETILSDCFELTTYESKKISTEHAKL
IYFYIKEEAEKIKNSQEKSNEIINFEYSASEKAQILDRVWFKYTNMVASILDQIKELGFK
YSTISGISISFADILETNKKNQYISEGDEYISKLRNYYNQGMITDDERYSLSIKKWTEVK
DKIQHELEEIIKANPSNPVITMINSGARGNISNYVQLAGMRGLMANNTKTTKADAKNDRV
VRSTVEVPVKSSFIEGLTAFEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRLVDVAQNIVVR
EENCGSDYGYVAREIVDSKTNQVIVSLKDRIIGRYTNKPIYKKQLNKMGILELIADRNTL
INEKIANAIIAEGYTEVEIRSILGCNTRNGVCKMCFGKDLATNRIVNIGEAVGIIAAQSI
GEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFARLIELIDAHEQPWGRPAVISPYEGKVIKIEED
PENNNHFMIYIENKTSDGYIQSEKVFVNSNKKLRVNVGDYVRIGQKLSEGPIIIKELLEL
TDTITTQNYLLKEIQKIYRTQGISISDKYIEIIIRQMMSKIIITIPGDSKFFAGAIVDIF
DYQEENSNLLSKGMIPAYGEIVIKGAKQVPLLSNSFLSAASYQETSKILVHSAISSRNDD
LLGLKENIIIGKKIPAGTALYPFEANSKYDIKPSIQYFDANYDNENIDSNLPAAQISDEE
FAENLKSVIGEEYNVNENNDVIETDDTNDASEFDDNN
NT seq
4434 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatctagaaaatatgcaactttagatggcgataaaattgctaagatttcatta
gcattagccactcctaacgatgttgaatcatgatcgcatggtgaagttacaaaacctgaa
acaattaactataaaagttataaaccagaacgtggtgggctttttgatgaggtaatattt
ggaccaatgattgattatcgctgtccaatttgtggctttaaatacaaaaaaattaatgaa
ggaactttttgtactagaactgagttatgtaaacaagaaaaagttgaaattttaccaaaa
attgcacgtcgtaaccatatggggcatattaaacttaacagtcctgttgtgcatttttga
tattttaaagttgatcactcaatcatttataaacttttaggtttacaaactggaagaagt
accgaacctgttaaaagaattgaccttgaaaatttaatttattataaaagtaatattgtt
cttgaaagtggcggactaaaatcgttacctaaaaatactattattgatattaacgaagct
gctaatatttataaagatgctttagaagaattaattcaaagatttgaacctgacactgaa
gattatgatgatattaaagaaactttagatgatttagttgaaaaagcaacatcaaaaata
ggtcaagactatggaattgatttttatgaattaaatgaagttattgaacattattcagac
gctaaaattggtaccggtgctttagctattgaatatttattaaaaaatattgaccttaaa
aaagaaaaagaaattgtaactgaaaaaattaagaaaattaataaagaagaagaacaaaaa
tttacattatcacaaaaatctactcgtgaaaagttatacaaacgtttacaagtaattaat
gcttttattgaatcaaaacaagatccaacaagcatgttaatttacaatttgccggtaatt
cctgccgatttaagacctttaattcaattagatggtggaagacattcaacttctgatatt
aatgaattatatcgtcgtgtaattattagaaataaccgtttgaaacaatgacaagaaaaa
gatgcacctactttagttgttcaaaatgaacttcggatgattcaagaagctgttgatgct
ttaattgataaccaaagaagatcaccaaaccctgttctttctaaagacaatcgtcctttt
aaatcaatttcagacgctttaacaggtaaaaaaggtcgttttcgtcaaaacttattagga
aaacgtgttgactattctggtcgttcagttatagttgttggtcctgatcttaaaatgcat
caatgtggtattccacgtgaaatggctgcaaaactatttgaaccatgaattattaaaaca
ttaattgacaatgaagaagcaacaacaattaaacaagctaaaaaaatgattgaagatcaa
aatccaaaaatttgaccttatgttgctaaatcaattgaaggaaggcttgttttattaaac
cgtgcacctacacttcaccgtttatcaattcaagcttttgaacctgttttagtgcgtgga
aaagcaattaaacttcatccattagtatgtacgccattcaatgctgactttgatggtgac
caaatggctgttcacgttttagtttcagatcaagccttattagaagctagagaactaatg
cttgctaataaaaatatattaggtcctaaagatggtgaacctattattaacccatcacaa
gatatggtattaggtatttattatctaacaacggaagaaaaagacgcattaggcgaagga
aaagtttttgattcttttgagcacatgatgcgttcttatgaagctaaaaaagtttcactt
catgcaagagttgcattgcctcttgaaaaggttaaaacatttgatagtaactcaatcaat
tcaaaaataattggtcgtccatatatcatttcaactgttggtaaatttatatttaataat
atttttccaatgagttttccattcatttattcaaatgaagttggtaaatattcttcaatt
gaagaatatggtaaatcaatatttaaatatattgttaatccaggaacagatattaaaaca
tatattaaagaaaaattaccaattttatctggatttaacaaaaagaatattgctaaaaca
attagatatatttttgataaatatgttgcaacaacaacaattgaaaaaattgcaaatgtt
gttgataaaattaatgattctttattaaacaatgatatttcatcagaaacaattttaagt
gattgttttgaattaacaacatacgaaagcaaaaaaatatcaacagaacatgctaaatta
atttacttttatataaaagaagaagcagaaaagattaaaaatagtcaagaaaaaagcaat
gaaatcattaattttgaatatagcgcttctgaaaaagcacaaatattagatcgtgtttga
tttaaatatacaaacatggttgcatcaattcttgatcaaattaaagaattaggttttaaa
tattcaactatttctggaatatcaatttcttttgctgatattttagaaactaataaaaag
aatcaatatatttctgaaggggatgaatatatttctaaattaagaaattattataatcaa
ggaatgattactgatgatgaaagatattcattatcaattaaaaaatggactgaagtaaaa
gacaagattcaacatgaattagaagaaattattaaagctaatccatcaaaccctgttatt
acaatgataaattctggtgctcgtggaaatatatccaattatgttcaattagctggtatg
cgtggtcttatggctaataataccaaaaccactaaagctgatgctaaaaatgatagagtt
gttagatcaactgttgaagttcctgttaaatcatcatttattgaaggacttactgctttt
gaattctattcttcaacacatggtgctcgtaaaggtctaacagatactgctcttaatact
gcaaaatcaggatatttaacccgtagacttgttgatgttgctcaaaacattgttgttcgt
gaagaaaactgtggttccgactatggctatgttgctcgcgaaatagttgattcaaaaaca
aatcaagttattgtttccttaaaagacagaattattggacgttatactaataagcctatt
tataaaaaacaattaaataaaatggggattttagagttaattgctgatagaaatacttta
attaatgaaaaaattgctaatgctataatcgctgaaggatatactgaagttgaaattaga
tcaattcttggttgcaacactagaaatggtgtatgtaagatgtgctttggtaaagattta
gcaactaatagaattgtaaatattggtgaagcggttggaattattgctgctcaatctatc
ggtgaacccggtacacaacttacaatgcgtactttccatactggaggggttgctggtgtt
gaagatataacaggcggttttgctcgtttaattgaattaattgatgcccatgaacaacca
tgaggtagacctgctgtaatttcaccttatgaaggtaaagttataaaaatcgaagaagat
cctgaaaataataatcattttatgatttatattgaaaataaaacctcagatggatatatt
caaagtgaaaaagtatttgtaaactcaaataaaaaattaagagttaatgttggtgattat
gtaagaatcggtcaaaaactttcagaaggtccaattattattaaagaattattagaatta
actgataccattactactcaaaattatttattaaaagaaatacaaaaaatatatcgtaca
caaggtatttcaattagtgataaatatattgaaattatcattcgtcaaatgatgtcaaaa
attattattactattcctggtgattctaagttttttgcaggagctattgttgatatattt
gactatcaagaagaaaattcaaaccttctttcaaagggaatgatccctgcttatggtgaa
attgttattaaaggtgcaaaacaagtaccacttctatctaattcatttttatcagctgca
tcttatcaagaaacttcaaaaattttagttcattcagcaatttcatcacgtaatgatgat
ttattaggactaaaagaaaatattattattggtaaaaaaattcctgccggaactgcttta
tatccatttgaagcaaattctaagtatgatatcaaaccttcaatacaatactttgatgca
aattatgataatgaaaacattgattcaaatttacctgctgcacaaatttctgatgaagaa
tttgcagaaaatctaaaatcagttattggtgaagaatataatgtcaatgaaaataatgat
gttattgaaactgatgatacaaatgatgcatctgaatttgatgataataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
