KEGG   Methanocaldococcus fervens: Mefer_0539
Entry
Mefer_0539        CDS       T00976                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase domain protein
  KO
K06877  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein
Organism
mfe  Methanocaldococcus fervens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mfe00001]
 09190 Not Included in Pathway or Brite
  09194 Poorly characterized
   99996 General function prediction only
    Mefer_0539
SSDB
Motif
Pfam: DEAD Helicase_C MZB ResIII Cas3-like_C_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACV24360
UniProt: C7P728
LinkDB
Position
508912..511548
AA seq 878 aa
MEDVFKGIGKEIVKIYKIPERKGRFSNFNFKNKEVNGLINALGFKLYTHQVKALKYLYKG
NDVVVTTSTASGKSEIFRLTIFDNFLSNPNDRYLLIYPTRALINNQYEKFSIENELFYKI
TKKRVKAEILTGDVNIKKRREILKDKPNVLFTTPDMLHYQILRNHNSYLWILKNLKLLVV
DELHVYRGVFGTNMVYVFKRLLKLLEKLNNNLQILCLSATLKNPKEFAKLLFNRDFKVVD
KSYNPSPRKYLAILEPRNLDNKQLLKRLIESLINKNIKTLVFFDTRKETEKLMRFLITSN
VFNKLSTYKGTLPKYVREEVEEKFKNGELLGLLTTNALELGIDIGDLDAVINYGIPPDGI
FSLIQRFGRAGRIGREALNIIILRKDGLDYYYREHLNELYEKIRKGIIEYMPVNTKNKFV
AKKHLHYLISELGIVNFNEFNDFEKELIKELEKEGKVKIYKNLITDGVEVKALKKPMYSS
IRTASDESYYLVLDKPWIKIRLLEKNESEILGFINWLKVKGYVVEEVDKDEYFRSLITGM
PYFSRGRLYMVKDMLNFGKFNFIFADELNISWDVEALQKKEEEIDILDIYDKKSYKDVEI
YHGRLRVRKIYSGFIVKGNDVDRYYEELLSLKDKGILDAEIELFKDFFGLNFISVRFKKE
VIRDFETDGMWYVFPESVRDVADEEFFEFLNAIDEDDLAISIYRNKKLSRKELFPIYLGA
TTHYIKNIIKNKVKEHLNVKKDTKDVEELTYKIKKLIDSKDRIAGGLHAIEHNVIKITPI
FTYIDSREVGGYSYERFNKNPFRDRAVIFIYDGNEGGFGLAEILYGYAEKLLNKSLEHLK
NCKCIDGCPLCIYSTKCGTFNEFLDKWQAIKILEKLVK
NT seq 2637 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaagatgtatttaaaggaattggaaaagaaattgtaaagatttacaaaatccctgaa
aggaaagggagattctctaacttcaattttaaaaataaagaggttaatgggctaattaat
gcattgggatttaaactatatactcaccaagttaaagctctaaaatatttatataaaggg
aatgatgtggttgttacaacatcaacagcgagtggaaagagcgagatttttagattaacc
atatttgacaactttttatcaaatcctaatgacagatatctgctaatttacccaacgagg
gctttgataaacaatcaatatgaaaaattttccatagaaaatgagttattttataagata
actaaaaaaagagttaaagctgagatactaactggagatgttaatattaaaaaaagaaga
gaaattttaaaggataagccaaacgtgctatttacaacgccagatatgcttcactatcaa
atattgaggaaccataacagctatttatggattttaaagaatttaaagttattagttgtt
gatgaactccacgtttataggggagtttttggaactaacatggtctatgtttttaagaga
ttgttaaagctgttggaaaaattaaataataatttacagatactctgcctctcagctacg
ttaaaaaatcctaaagagtttgctaagctattattcaacagagattttaaggttgttgac
aaaagctataatccttcaccaagaaagtatttagccatcttagagccaagaaatttagat
aataagcagttattgaaaagactgatagagagcttaataaacaagaatataaaaacactc
gtattctttgatacaaggaaagaaactgaaaaacttatgagatttttgataacatcaaat
gtttttaataaactctcaacttataaaggcactcttccaaagtatgttagggaggaagta
gaggagaagtttaaaaatggagagttattagggttgttaacaacaaacgcattagaatta
ggaattgacattggagatttagacgctgtaataaactatggcattccaccggatggcatt
ttttctttaatacaaaggtttggtagggctgggagaatagggagagaggcgttaaacatc
ataatcttaagaaaggatgggttggattattactatagggagcatttaaatgagctttat
gagaaaattaggaaaggaattattgaatacatgccggtaaatacaaaaaacaagtttgtt
gctaaaaagcatctccactacttaatctctgaattaggaatagttaatttcaatgaattt
aacgattttgagaaagagttaattaaagaattagagaaggaagggaaggttaagatttac
aaaaatttgataacagatggggttgaagtaaaggctttaaaaaagccgatgtattcatca
ataagaactgcgagtgatgagagctattatttggttttagacaaaccatggataaaaatt
aggttgttggagaaaaatgaaagtgagattttagggtttataaattggcttaaagttaag
ggatatgttgttgaagaagttgataaagatgaatattttcgctcattaattaccggaatg
ccatatttctcaagaggaaggctttatatggtaaaagatatgttaaattttggaaaattc
aactttatctttgcagatgaattaaatatatcctgggatgttgaggcattacagaaaaaa
gaggaagagattgatattttagatatttatgataaaaagagctataaagatgtggaaata
tatcatggaagattgagagttaggaaaatttacagtggatttatagttaaaggaaacgat
gtagatagatattacgaggagcttttatctctaaaggataaaggcattttagatgctgag
atagagctttttaaagacttctttggtttaaacttcataagcgttagatttaaaaaagag
gttataagggactttgaaactgatggaatgtggtacgtatttccagagagcgttagggat
gtagctgatgaagaattctttgaatttttaaatgccatagatgaggatgatttggccatt
tcaatatatagaaataaaaaacttagcagaaaagagctgtttccaatctatttaggagct
actactcactatataaaaaatatcataaaaaataaagttaaagaacatttaaatgttaaa
aaagacactaaagacgttgaagagctaacttacaaaataaaaaagcttattgacagcaag
gatagaattgctggaggattgcatgctatagagcataatgtaataaagataactccaatt
ttcacatatatagacagtagagaagttggtggctacagctacgagagatttaacaaaaat
ccatttagagatagggctgttatctttatctacgatggaaatgaaggaggttttggatta
gctgaaatattatatggatatgctgaaaaacttctaaacaaaagcttggaacatttaaaa
aactgcaaatgtatagatggctgtcctctctgcatatattcaacaaaatgtggaacattt
aatgaattcttggataaatggcaggcaataaagattttagaaaaattggttaaatag

DBGET integrated database retrieval system