Mycoplasma feriruminatoris: D500_00193
Help
Entry
D500_00193 CDS
T07962
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
mfer
Mycoplasma feriruminatoris
Pathway
mfer03420
Nucleotide excision repair
mfer03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mfer00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
D500_00193
03430 Mismatch repair
D500_00193
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mfer03400
]
D500_00193
Enzymes [BR:
mfer01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
D500_00193
DNA repair and recombination proteins [BR:
mfer03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
D500_00193
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
D500_00193
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
Viral_helicase1
AAA_11
AAA_12
AAA_30
PcrA_UvrD_tudor
DEAD
DUF4931_N
CarD_TRCF_RID
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UKS53858
LinkDB
All DBs
Position
216301..218475
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MSVDNLLDLLNPQQLAAVLNIDKPVRIIAGAGSGKTRVITTKIAYLIEKQHIDPSRILAV
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MNAWSQDFEKELTNKKIPFQLIGGIKFRERKVIKDAMAFLKMISIKDKLSCQRVLSLLPK
IGNMTIEKIINFATVNELSIFDLITNENKDLLHTITKNLDELVEVFKKAHELYLDNTNIE
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YVALTRAKEELFLTYVKGDYSYISQSELKPSKFINELDKDLYDFESSFLDDQIHDSNSYT
YTPSRINDTLKQHNLYNVGDQVVHTLFGKGIVTKIINDQLQISFNDSSYGVMMIAANNSA
LSKL
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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ttaagtaagttataa
DBGET
integrated database retrieval system
