KEGG   Mycoplasma feriruminatoris: D500_00784
Entry
D500_00784        CDS       T07962                                 
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
mfer  Mycoplasma feriruminatoris
Pathway
mfer03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mfer00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    D500_00784 (rpoC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:mfer03021]
    D500_00784 (rpoC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mfer03400]
    D500_00784 (rpoC)
Enzymes [BR:mfer01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     D500_00784 (rpoC)
Transcription machinery [BR:mfer03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     D500_00784 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mfer03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      D500_00784 (rpoC)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 EF-G-binding_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: UKS54427
LinkDB
Position
complement(909186..912953)
AA seq 1255 aa
MENLNRKKAIKIELANPDTIRSWSHGEVLKPETINYKTLKAEKDGLFDERIFGPTKNYEC
VCGRYKKANPMNKGKVCEKCGVELTESIVRRERMGHIELEEPVTHIWMLKVAPYRIAAIL
DLKAKELEEVVYFVSHIVLEQGNQKHFVEKEVLDLGSSRITKTREKLQLTILDVIDQIND
PNHRDTKKANRLLEELKNTAIPFSIDEATSLISKYTNAKFGIGARAVEYLLEKVDLKKEI
EAIKVQLENSKKTPNERTKLLKRLETFDALKRSNQRPEWMVMRVIPVIPPDIRPIIQLDG
GRFTTSEINDLYRRIIIRNERLKKVKEMGAPSIIVNNEKRMLQEAVDALFDNERKPKPVQ
GKNKRPLKSLTSVLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIAIGPDLKMYQAGLPREMAITLF
KPFVIQWLQDHEYAENVKIAEKMLLQNDPKVWEALEQVIKDRPVLLNRAPTLHRLGIQAF
EPKLVKGKAIRLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPITKEAVAESRALMLGSSAILGPKDGK
AIVTPGQDIILGNYYLTTEEKDAKGQGMIFSSLDEAFMAYNNNQVHLNSLIGIALSALPE
QKFSNKNQRLNSYLLTTVGKLYFNQIFDDNFPWINSNNIWNAKEAVKEFIYDFSQDINTV
ISNVQVQQPIKKKELSLIIERYFESHGARKTAEMLDKMKDLGFSFSTKSGTTISAGDVVA
FTHKYDEFKQADQKVEQITDFYNMGMLTSSEKKRRIIEVWSDVKDKIQNELATVLRKDVK
NPIFVMVDSGARGNVSNFTQLVGMRGLMNDTKGDIKEIPIKSSFREGLTVSEYFVSTHGA
RKGMADIALKTADSGYLTRRLVDVSQEIVVVNEDCEPTKGFEVSAIIDTKHDNVIVPLKD
RLVGRYTFEDIYDDNKNLIVTANTLIDKNIAEKIIMAGISSVIIRSVLTCDNKRGVCQKC
YGLNLATASVVNIGEPVGVIAAQSIGEPGTQLTMRNFHTGGVAGNVDITQGLPRIKELLD
VTTPKGAVAIISEVNGVVSEIEDYNGVFVINIVTENEEVKKYKTEFNSVLRVEEGSSVVA
GQKLTEGAIDLHQLLEFGGIQDVQNYILKEVQKVYRLQGIEISDKYIEIIIKQMLNKVKI
TDSGDSDLLPGEIITIQNYKEVVQDCIVKSIRPPLSKAQIFGIKKAPLESGSWLSSASFQ
DTARVLTRAIIKGKEDKLEGLKENIMLGNLIPAGTGLTGTKEVEELAETYHNNEY
NT seq 3768 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaatttaaatcgtaaaaaagcaataaaaattgaattagctaaccctgatacaatt
cgatcatgatcacatggagaagttttaaaaccagaaactattaactataaaacattaaaa
gctgaaaaagatgggctatttgatgaaagaatttttggtcctactaaaaactatgaatgt
gtttgtggaagatataaaaaagcaaaccctatgaataaaggaaaggtttgtgaaaaatgt
ggtgttgaattaactgaatcaattgttcgtagagaaagaatgggacatattgaattagaa
gaaccagttactcacatttgaatgcttaaagttgctccttatagaattgctgcaatttta
gatttaaaagcaaaagaattagaagaagtagtttactttgtttctcatattgttttagaa
caaggaaatcaaaaacattttgttgaaaaagaagttctagatttaggttcatcaagaatt
actaaaactagagaaaaactacaactaacaattttagatgttattgatcaaattaatgat
ccaaatcatagagatactaaaaaagctaatagattattagaagaattaaaaaacactgct
attccattttcaattgatgaagcaactagtttaattagtaaatatactaatgctaaattt
ggaattggagctagagctgttgaatatttattagaaaaagtagatcttaaaaaagaaatt
gaagctattaaagttcaacttgaaaattctaaaaaaaccccaaatgaaagaactaaatta
ttaaaacgtttagaaacttttgatgctttaaaacgttctaatcaacgtcctgaatgaatg
gttatgagagtaattccagttattccaccagacattcgtcctattattcaattagatggt
ggacgttttactacttctgaaattaatgatttatatagaagaattattatcagaaatgaa
agattaaaaaaagttaaagaaatgggtgcaccatcaattattgtaaataacgaaaaacgt
atgttacaagaagctgttgatgctttatttgataatgaaagaaaaccaaaaccagttcaa
ggaaaaaataaacgtccattaaaatcattaactagtgttttaaaaggaaaacaaggtaga
tttagacaaaacttattaggaaaacgtgttgattattcagcaagatcagttattgcaatt
ggacctgatctaaaaatgtatcaagcaggtttaccaagagaaatggctattactttattt
aaaccttttgtaattcaatgacttcaagatcatgagtatgcagaaaatgtaaaaattgca
gaaaaaatgttattacaaaacgatccaaaagtttgagaagctttagaacaagttattaaa
gacagaccagtgttattaaaccgtgctcctactttacaccgtttaggaattcaagctttt
gaacctaaattagttaaaggaaaagctattcgtttacacccattagttacaactgcattt
aatgccgattttgatggggatcaaatggctgttcacgttcctattacaaaagaagctgtt
gctgaatctagagctttaatgttaggatcaagtgcaattttaggaccaaaagatggaaaa
gcaattgttactcccggtcaagatatcattttaggaaactactatttaacaactgaagaa
aaagatgctaaaggtcaaggaatgattttttcaagtttagatgaagcatttatggcttat
aacaataaccaagttcatttaaactcattaatcggaattgctttatcagctttaccagaa
caaaaatttagtaataaaaatcaaagattaaattcttatttattaacaactgttggaaaa
ttatatttcaaccaaatttttgatgataatttcccatgaattaactcaaataatatttga
aatgcaaaagaagcagttaaagaatttatttatgatttttcacaagatataaatactgta
attagtaatgttcaagttcaacaaccaattaagaaaaaagaattatctctaattattgaa
agatattttgaatcacatggtgctagaaaaactgctgaaatgctagataaaatgaaagat
ttaggatttagtttttcaacaaaatcaggaactacaatttcagctggagatgttgttgcg
tttactcataaatatgatgaatttaaacaagcagatcaaaaagttgaacaaattactgat
ttttacaatatgggtatgttaacttctagtgaaaagaaacgtagaattattgaagtttga
tctgatgtaaaagataaaattcaaaatgaattagctacagttttacgtaaagatgttaaa
aaccctatctttgtaatggttgattctggagctcgtggtaatgtttcaaactttactcaa
ttagttggtatgcgtggattgatgaacgatactaaaggtgatattaaagaaattcctatt
aaatcatcattccgtgaaggactaacagtttctgaatactttgtttcaactcacggtgct
agaaaaggtatggcagatattgccttaaaaactgcagattcaggatatctaactagaaga
ttagttgacgtttctcaagaaattgttgttgttaatgaagattgtgaaccaactaaagga
tttgaagtatcagcaattattgatacaaaacacgataatgttattgttccattaaaagat
agattagttggaagatatacatttgaagacatttatgatgataataaaaacttaattgtt
acagctaatacattaattgataaaaatattgctgaaaaaattattatggcaggaattagt
tcagtaattattagatcagtattaacttgtgataataaacgtggtgtttgtcaaaaatgt
tatggattaaacttagctacagcatcagttgttaatattggtgaaccagttggagtaatt
gctgctcaatcaattggagaacctggtactcaattaacaatgcgtaacttccatactggg
ggagttgctggtaatgttgatattactcaaggtctacctcgtattaaagaattactagac
gttacaactccaaaaggagcagttgctataatttctgaagttaatggtgtagttagtgaa
attgaagattataatggtgtttttgtaattaatattgttactgaaaatgaagaagttaaa
aaatacaaaactgaatttaactcagtattacgtgttgaagaaggttcaagtgttgttgct
ggtcaaaaattaactgaaggagctattgatttacatcaattattagaatttggtggaatt
caagatgttcaaaactacattttaaaagaagtacaaaaagtttatagactacaaggtatt
gaaatctcagataaatatattgaaatcatcattaaacaaatgttaaataaagtaaaaatt
actgatagtggtgattctgatttattacctggagaaattattactattcaaaactataaa
gaagttgttcaagattgtattgttaaatcaataagaccaccattatcaaaagcacaaatc
tttggtattaaaaaagcacctttagaatctggttcttgattatcttcagcttcattccaa
gatactgctagagtattaactagagcaattattaaaggaaaagaagataaacttgaagga
ttaaaagaaaatattatgttaggtaacttaattccagctggtactggtttaactggaaca
aaagaagttgaagaactagctgaaacttatcataataatgaatattaa

DBGET integrated database retrieval system