Miscanthus floridulus: 136452806
Help
Entry
136452806 CDS
T10264
Name
(RefSeq) phytochrome a-like
KO
K12120
phytochrome A
Organism
mflo Miscanthus floridulus
Pathway
mflo04712
Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mflo00001
]
09150 Organismal Systems
09159 Environmental adaptation
04712 Circadian rhythm - plant
136452806
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
HATPase_c
PAS_9
PAS_4
HisKA
PAS_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
136452806
NCBI-ProteinID:
XP_066309497
LinkDB
All DBs
Position
5:102219745..102233218
Genome browser
AA seq
1138 aa
AA seq
DB search
MSYSKPSDRTGCCSPSPSKTQERSHARMLSQTTLDSELNAEYEESGNSYDYFKLVKAQRT
TQSEPEQLGHPEKVIAYLQQIQRAKLIQPFGCLLALDEKSFNIIAFSENAPEMLMANSHA
VPTVDDDAPKIKIGTNVQSIFSSRSVAALHKALKFDDVSLLNPIIVQCKTSGKQMYAIVH
RSTGSLVVDLEPVKHTEFPSIATGTTQSYKHATKAISKMQSLPGGSMQILCNTVVKEVFD
LTGYDRVMAYKFHEDDHGEVIAEITKPGLEPYLGLHYPATDVPQAARVLFMKSKVRIICD
CRANSVKIIEAKGLPFDISLSGSTLRAPHSCHLEYMENMNSIASLVMAVVINENREDDDV
KPEEPPKGLKSRRLWGLLVCHHESPRYILFPVRYACEFLAEVFAVHVNNEFLLLEKQIRE
KSILDVQTMLSDMLFHEASPLSIIFGSPNIMDLVKCDGAALLHGDKVWRLGMAPTEPQIH
DIASWLSKVHRDSTGLCTDSLVDAGYSGAASLGDRICGMAMAKIAPNDIVFWFRSHTAAD
IKWGGAKHDPFDQDDNRRMHPRLSFMAFLEVVKMKCLPWNDYEMDAICSLQLILGDRMNG
ATKPTGAAGFDNLQIHDIKLDYGLAELQTVTKEMSRLMETASVPIFAVDANGLVNGWNLK
LVELTGLTVQETVGRNILTLVEQSSFQVVQKMLYLALEGKEEKDVRFEVKTHSSRVDDGP
VILVANACSSRDISGHVIGVFFVAQDMTVHKLAMDKFTRVDGDYKAIIHNPNPLIPPIFG
ADQFGWCFEWNAAMTKLTGFHKDEVLDKMLVGEIFDSSNGSCLLKNHDSVVRLCVIINSA
LAGEQTDKATFGFYNRNGKYIECILSAYGKENTDGIVDGVFCFIHVPSQELQHALHVKQA
SEQTTIRRMKAFSYMRYAINNPLSGLLHTTEALKSTGLNEEQMRHPNVADRCHRQLDKIL
ADIDHDNITDESFCFELEMVEFVLQDVVEGAVSQVLTACQDKHIGVLVNQSEGFMKEKLC
GDGIRLQQILSDILFVSVKFSTVGGSVEISCNLTKNNIGKSLGLELRIKHKGLGVPGEIV
SGTYKDDIKDMSGEGLSLVVSRYLLKLMNGDIHYVRKVGTSTFILTAELASARAVIGQ
NT seq
3417 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttactcaaagcctagtgataggaccggttgttgttctcccagtcctagcaagacc
caggagaggtcgcatgcaaggatgttatcacaaacaacccttgattctgaacttaatgca
gaatatgaagaatcgggtaattcctatgactacttcaagttggttaaagcacagcggacc
acccaaagtgaacctgaacaactagggcatccagagaaggtcatagcgtacttgcagcag
attcagagagccaagttaatccaaccgtttggttgcttgttggcccttgatgagaagagc
ttcaatattattgcattcagtgagaatgcacctgaaatgctgatggcaaacagtcatgca
gtaccaactgttgatgacgatgctccaaagataaagattggcaccaatgttcagtccatt
ttctctagccgtagtgtcgccgccctgcataaggcactcaaatttgatgatgtttcattg
ctgaatcctattatagttcaatgcaagacctcaggcaagcaaatgtatgccattgtccat
aggtctaccggttctctggtggtagatttggagcctgtgaagcatactgaattcccttcc
attgccactgggactacacagtcttacaagcatgctaccaaggcaatctctaagatgcag
tcactgccaggaggaagcatgcagatcctatgcaatactgtggttaaggaagtgtttgac
cttaccgggtatgatagggtcatggcttacaagtttcatgaagatgaccatggtgaggtc
attgcggagatcacaaaacctggtcttgagccttatcttggtctacactatccggccact
gatgttcctcaagctgccagggttcttttcatgaagagcaaagtacggataatttgtgat
tgtcgagcaaattctgtgaagataatagaagctaaaggactcccctttgatataagtctg
tctggctcaactcttagagctccacacagttgtcaccttgagtatatggagaacatgaac
tcaattgcatcacttgtcatggctgtagtaataaatgagaatagagaggatgatgatgtc
aagcctgaagaacctccaaaaggactcaagagtaggagactatggggtctccttgtttgc
caccatgagagccctagatatatcctctttccagtgcggtacgcctgtgagttcctggca
gaagtatttgctgtccatgtgaacaatgaatttctattattggagaagcagatacgagag
aaaagcatacttgatgtacagacaatgctctctgatatgttgttccatgaagcatctccc
ctgagcatcatatttgggagtccaaatatcatggaccttgttaaatgtgatggtgctgct
cttttgcatggtgacaaagtgtggcggctaggcatggctccaacggagcctcagatacat
gatatcgcctcatggctatcaaaggttcatagggattccaccggtttgtgtaccgatagc
cttgttgatgctggatattcaggagctgcttcccttggtgacaggatttgtggaatggca
atggctaagattgccccaaatgatattgttttctggtttaggtcacatacagctgctgat
atcaaatggggtggtgcaaagcatgatccatttgaccaggatgacaacagaagaatgcac
cctaggttgtccttcatggcattcctcgaggttgtcaagatgaaatgcctgccgtggaat
gactatgagatggatgctatctgctcattgcagctcatacttggagataggatgaatggt
gcaacaaaaccaactggggcagctggtttcgataacctgcagattcatgatatcaagctt
gattatgggcttgctgaattgcagacagtgacaaaagaaatgtctcgtctgatggaaaca
gcatctgtcccaatatttgcagttgatgcaaatgggttggtcaatggatggaaccttaag
ttagtggagctgacaggattgacagtgcaggagactgtaggaaggaacatacttaccctg
gtagagcaatcatctttccaagttgtacagaaaatgctatacttggctctggaaggcaaa
gaagagaaggatgttcgatttgaagtgaaaacccacagttcaagggtagatgatgggccg
gttatcttggttgcaaatgcttgttctagccgtgacatttctggccatgtaattggggtg
ttctttgtggcccaagatatgactgttcataagctggccatggacaaatttactcgagtt
gacggagactacaaggcaatcattcacaacccgaacccactcattcctcctatatttggt
gctgaccagtttgggtggtgcttcgagtggaatgccgccatgactaagcttactgggttc
cacaaagatgaggtgctcgataagatgcttgttggtgaaatctttgacagtagcaatggc
tcctgtcttttgaagaaccatgattcagttgtacgcctttgcgtcattatcaacagtgca
ctggctggtgaacaaacagataaggctacatttggcttctacaaccgaaatgggaagtac
attgaatgtattttgtcagcttatggaaaagaaaacacagatggcatcgttgatggagta
ttctgcttcatacatgttcctagccaggagctgcaacatgcactacatgtgaagcaagcc
tcggagcagacgaccataagacggatgaaggctttctcctacatgagatatgccatcaac
aatcctctctcaggtttgcttcacaccacagaagcattgaagagcacaggtttgaatgaa
gagcagatgagacaccccaatgttgcagatcgttgtcaccgccagctcgacaagatactt
gctgacattgatcatgataacataactgacgagtcgttttgctttgagctggagatggtt
gaatttgtattgcaagatgtggtagagggtgctgtaagtcaagtattgacagcttgccag
gacaaacacattggagtccttgtaaaccagtcagagggatttatgaaggaaaaactttgt
ggtgatggaattcgactccaacagattctctctgacattctatttgtttcagtgaagttc
tctacagttgggggctctgttgagatttcctgcaacctgaccaagaacaacattggcaaa
agccttggcctagaacttaggatcaaacacaagggattaggtgtccctggggaaatcgtg
tcaggaacttacaaggatgacatcaaagatatgtcaggggagggtttgagccttgtagtt
tcaagataccttttgaagcttatgaatggtgacattcattatgtaaggaaagttggcacg
tcaactttcatcctcacggctgaacttgcttctgctcgtgcagtcattggacaatga
DBGET
integrated database retrieval system