Miscanthus floridulus: 136455019
Help
Entry
136455019 CDS
T10264
Name
(RefSeq) phytochrome a-like
KO
K12120
phytochrome A
Organism
mflo Miscanthus floridulus
Pathway
mflo04712
Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mflo00001
]
09150 Organismal Systems
09159 Environmental adaptation
04712 Circadian rhythm - plant
136455019
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
PAS_9
HATPase_c
PAS_4
HisKA
PAS_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
136455019
NCBI-ProteinID:
XP_066311315
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(101321996..101326937)
Genome browser
AA seq
1151 aa
AA seq
DB search
MVGEKERHPKDTTIIYYSKPSERTGCCSPSPSKAQERSHARMLSQTTLDSELNAEYEESG
NSYDYFKLVKAQRTTQSEPEQLGHPEKVIAYLQQIQRAKLIQPFGCLLALDEKSFNIIAF
SENAPEMLMANSHAVPTVDDDAPKIKIGTNVQSIFSSRSVAALHKALKFDDVSLLNPIIV
QCKTSGKQMYAIVHRSTGSLVVDLEPVKHTEFPSIATGTTQSYKHATKAISKIQSLPGGS
MQILCNTVVKEVFDLTGYDRAMAYKFHEDDHGEVIAEITKPGLEPYLGLHYPATDVPQAA
RVLFMKSKVRIICDCRANSVKIIEAKGLPFDINLSGSTLRAPHSCHLEYMENMNSIASLV
MAVVINENREDDDVKPEEPPKGLKSRRLWGLLVCHHESPRYIPFPVRYACEFLAEVFAVH
VNNEFLLEKQIREKSILDVQTMLSDMLFHEASPLSIIFGSPNIMDLVKCDGAALLHGDKV
WRLGMAPTEPQIHDIASWLSKVHRDSTGLCTDSLVDAGYSGAASLGDRICGMAMAKIAPN
DIVFWFRSHTAADIKWGGAKHDPFDQDDNRRMHPRLSFMAFLEVVKMKCLPWNDYEMDAI
CSLQLILGDRMNGATKPTGAAGFDNLHIHDIKLDYGLAELQTVTKEMSRLMETASVPIFA
VDANGLVNGWNLKLVELTGLTVQETVGRNILTLVEQSSFQVVQKMLYLALEGKEEKDVRF
EVKTHSSRVDDGPVILVANACSSRDISGHVIGVFFVAQDMTVHKLAMDKFTRVDGDYKTI
IHNPNPLIPPIFGADQFGWCFEWNAAMTKLTGFHRDEVLDKMLVGEVFDSSNGSCLLKNH
DSVVRLCVIINSALAGEQTDKATFGFYNRNGKYIECILSAYGKENTDGIFDGVFCFIHVP
SQELQHALHVKQASEQTTLRRMKAFSYMRYAINNPLSGLLHTTEALKSTGLNEEQMRHPN
VADRCHRQLDKILADIDHDNITDESFCFELEMVEFVLQDVVEGAVSQVLTACQDKDIGVL
VNQSEGFMKEKLYGDGIRLQQILSDILFVSVKFSTVGGSVEISCNLTKNNIGKSLDLELR
IKHKGLDVPGEILSGTYKDDIKDMSGEGLSLVVSRYLLKLMNGGIHYVRKVGTSTFILTA
ELASARSVIGQ
NT seq
3456 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaggagagaaggagcgacatccaaaagacacgactataatatattactcaaagcct
agtgagaggaccggttgttgttctcccagtcctagcaaggcccaggagaggtcgcatgca
aggatgctatcacaaacaacccttgattctgaacttaatgcagaatatgaagaatcgggt
aattcctatgactacttcaagttggttaaagcacagcggaccacccaaagtgaacctgaa
caactagggcatccagagaaggtcatagcgtacttgcagcagattcagagagccaagtta
atccaaccgtttggttgcttgttggcccttgatgagaagagcttcaatattattgcattc
agtgagaatgcacctgaaatgctgatggcaaacagtcatgcagtaccaactgttgatgac
gatgctccaaagataaagattggcaccaatgttcagtccattttctctagccgtagtgtc
gccgccctgcataaggcactcaaatttgatgatgtttcattgctgaatcctattatagtt
caatgcaagacctcaggcaagcaaatgtatgccattgtccataggtctaccggttctctg
gtggtagatttggagcctgtgaagcatactgaattcccttccatagccactgggactaca
cagtcttacaagcatgctaccaaggcaatctctaagattcagtcactaccaggaggaagc
atgcagatcctatgcaatactgtggttaaggaagtgtttgaccttaccggttatgatagg
gccatggcttacaagttccatgaagatgaccatggtgaggtcattgcggagatcacaaaa
cctggtcttgagccttatcttggtctacactatccggccactgatgttcctcaagctgcc
agggttcttttcatgaagagcaaagtacggataatttgtgattgtcgagcaaattctgtg
aagataatagaagctaaaggactcccctttgatataaatctgtctggctcaactcttaga
gctccacacagttgtcaccttgagtatatggagaacatgaactcaattgcatcacttgtc
atggctgtagtaataaatgagaatagagaggatgatgatgtcaagcctgaagaacctcca
aaaggactcaagagtaggagactatggggtctccttgtttgccaccatgagagccctaga
tatatcccctttccagtgcggtacgcctgtgagttcctggcagaagtatttgctgtccat
gtgaacaatgaatttctattggagaagcagatacgagagaaaagcatacttgatgtacag
acaatgctctctgatatgttgttccatgaagcatctcccctgagcatcatatttgggagt
ccaaatatcatggaccttgttaaatgtgatggtgctgctcttttgcatggtgacaaagtg
tggcggctaggcatggctccaacggagcctcagatacatgatatcgcctcatggctatca
aaggttcatagggattccaccggtttgtgtaccgatagccttgttgatgctggatattca
ggagcagcttcccttggtgacaggatttgtggaatggcaatggctaagattgccccaaat
gatattgttttctggtttaggtcacatacagctgctgatatcaaatggggtggtgcaaag
catgatccatttgaccaggatgacaacagaagaatgcaccctaggttgtccttcatggca
ttcctcgaggttgtcaagatgaaatgcctgccgtggaatgactatgagatggatgctatc
tgctcattgcagctcatacttggagataggatgaatggtgcaacaaaaccaactggggca
gctggtttcgataacctgcacattcatgatatcaagcttgattatgggcttgctgaattg
cagacagtgacaaaagaaatgtctcgtctgatggaaacagcatctgttccaatatttgca
gttgatgcaaatgggttggtcaatggatggaaccttaagttagtggagctgacaggattg
acagtgcaggagactgtaggaaggaacatacttaccctggtagagcaatcatctttccaa
gttgtacagaaaatgctatacttggctctggaaggcaaagaagagaaggatgttcgattt
gaagtcaaaacccacagttcaagggtagatgatgggccggttatcttggttgcaaatgct
tgttctagccgtgacatttctggccatgtgattggggtgttctttgtggcccaagatatg
actgttcataagctggccatggacaaatttactcgagttgacggagactacaagacaatc
attcacaacccgaacccactcattcctcctatatttggtgctgaccagtttgggtggtgc
ttcgagtggaatgccgccatgactaagcttactgggttccacagagatgaggtgctcgat
aagatgcttgttggtgaagtctttgacagtagcaatggctcctgtcttttgaagaaccat
gattcagttgtacgcctttgcgtcattatcaacagtgcactggctggtgaacaaacagat
aaggctacatttggcttctacaaccgaaatgggaagtacattgaatgtattttgtcagct
tatggaaaagaaaacacagatggcatctttgatggagtgttctgcttcatacatgttcct
agccaggagctgcaacatgcactacatgtgaagcaagcctcggagcagacgaccttaaga
cggatgaaggctttctcctacatgagatatgccatcaacaatcctctctcaggtttgctt
cacaccacagaagcattgaagagcacaggtttgaatgaagagcagatgagacaccccaat
gttgcagatcgttgtcaccgccagctcgacaagatacttgctgacattgatcatgataac
ataactgacgagtcgttttgctttgagctggagatggttgaatttgtattgcaagatgtg
gtagagggtgctgtaagtcaagtattgacagcttgccaggacaaagacattggagtcctt
gtaaaccagtcagagggatttatgaaggaaaaactttatggtgatggaattcgactccaa
cagattctctctgacattctatttgtttcagtgaagttctctacagttgggggctctgtt
gagatttcctgcaacctgaccaagaacaacattggcaaaagccttgacctagaacttagg
atcaaacacaagggattagatgtccctggggaaatcttgtcaggaacttacaaggatgac
atcaaagatatgtcaggggagggtttgagccttgtagtttcaagataccttttgaagctt
atgaatggtggcattcattatgtaaggaaagttggcacgtcaactttcatcctcacggct
gaacttgcttctgctcgttcagtcattggacaatga
DBGET
integrated database retrieval system