Miscanthus floridulus: 136532986
Help
Entry
136532986 CDS
T10264
Name
(RefSeq) calpain-type cysteine protease DEK1-like
KO
K25378
calpain-type cysteine protease DEK1 [EC:3.4.22.-]
Organism
mflo Miscanthus floridulus
Brite
Peptidases and inhibitors [BR:
mflo01002
]
Cysteine peptidases
Family C2: calpain family
136532986
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
136532986
NCBI-ProteinID:
XP_066381653
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(150627505..150646805)
Genome browser
AA seq
2160 aa
AA seq
DB search
MEEEGHHGVVLACSICGFLFAVLSPLSFWVLWAVNWRPWRLYSWIYARKWPTYVQGPQLS
TLCSLLTLFAWLVVISPIAVLLVWGSILIALLERNIIGLAVIMAGVALLLSFYSIMLWWR
TQWQSSKAVAYLLLLAVGLLCAYDFCAIYVTAGASASELNSPSGFFFGVSAISLAINMLF
ICKILFNVSGFDVDEYMRRSYKFAYSDCVEVAPVSCSPEPPDPSELYMTKSSRVLHLGLL
YISSLLVLVAYSILYGLTSKEARWLGALTSVAVVILDWNLGLCSFRFELLKSRMIVLFVA
GTSRAFLISFGVHYWYLGHCISYAFVASVLLSAAVSSWLSISNPSVARIDALRSTVIKLR
EGFRRKGQNSSSNSSEGCGSSLKRSSGSVEAGQNGNATDSMYRSNSQSDGVNWSSIPFDR
SNSCQEGRSSDKNIDSARASLAHRSNSCLSAVQDSETAVVSIDRHGDPTTSLVCSSGGLE
SHGCEPSGSATTSGNQQLLDLNLAVIFQDRLNDPRISSMLKKNGGLGDVELANLLQDKGL
DPNFSYMLKDKVMDPRILALLQRSSLDADREHQDDVDVTATDSDRLDTTIANQISLSEEL
RRSGLEKWLNISRLIFHHLAGSPIRAFIVFTVMFIIETATVAIYRPETIKVINATHEQFE
FGFSILLLSPVVCSIMAFIWSLRAEEMMMTSKPRKYGFIAWLLSTCVGLFLSFLSKSSVI
LGLSLTVPLMVACLSFAVPIWMCNGYRFWIPGREFDTRENVSQAPGKKERALFVISIAVF
TASVIGLGAIVSAKPLDALGYKGWDADKNSFYSPYATSMYLGWALSSTIAVITTGLIPIV
AWFATYRFSPSSAICVGLFATVLVSFCGASYWGVVNSREDGVPLKADFLAALLPLLCIPA
FFSLFTGLYKWKDDDWKISRGVYLFVGMGMLLLFGAVAAVIVTIRPWTVGVACLVAILFL
VFVIGVIHYWTSNNFYLTRTQMLLVCSIAFLLALAAFLMVLFHGKPFVGASIGYFSFIFL
LTGRALTVLLSPPIVVYSPRVLPVYVYDAHADSAKNVSYAFLILYGIALATEVWGVIASL
IMSPPFVGAGVSAATLVIAFSFAVSRPCLTLKMMEDAVHFLSKDTVVQAMSRSANKTRNA
ISGTYSAPQRSASSAALLVGDPALTLDRAGNFVLPRADVMKLRDRLRNEEIAAGSFLCGV
KDCLVICPQSLSNVDYRRNMCAHARILALEEAIDTEWVYMWDKFGGYLLLLLGLTAKAEQ
IQDEVRLRLFLDSIGLSDLSAKEIKKWMPEDRRQFELIQESYIREKEMEEEALMQRREEE
GKGRERRRALLEREERKWKELEISLLSSIPNTGSRDAAAMAAAVRAVGGDSALEDSFARD
RVSSIANHIRKAQLARRAEQTGIPGTVCILDDEPRSTGRHCGELDLCLCQSQKVTLSIAV
MVQPVSGPVCLFGSEFQKKVCWEILVAGSEQGMEAGQVGLRLVTKGERMTTVAKEWNIGA
SSIADGRWHLVTVTLDADLGEATSFIDGVYDGYQNGLPLPTDNGIWEPGTDIWVGARPPT
DLDAFGRSDSEGSDSKMQIMDAFLWGRCLSEDEVTVLHTAMSPAEYGFFDLAPGDAWHGS
YSARVDDWESEDAYEVYDQGDVEWDGQYSSGRKRPVHDAVAIDIDSFARRPRKPRFETRD
EVNQRMLSVERAVRDALVAKGERNFTDQEFPPEDRSLFVDPMNPPLKLQVVSEWMRPSDI
AKEISISSQPCLFSGSVNSSDVCQGRLGDCWFLSAVAVLTEMSRISEVIITPEYNDEGIY
TVRFCIQGEWVAVVVDDWIPCESPGKPAFATSRKQNELWVSILEKAYAKLHGSYEALEGG
LVQDALVDLTGGAGEEIDMRSPQAQLDLASGRLWSQLLHFKQEGFLLGAGSPSGSDAHIS
SSGIVQGHAYSILQVREVDGHKLIQIRNPWANEVEWNGPWSDSSPEWTERMKHKIMHVPQ
SKNGVFWMSWQDFQIHFRSIYVCRVYPPEMRYSVHGQWRGYNAGGCQDYDSWHQNPQYRL
RVTGRDALYPVHVFITLTQGVGFSRKTNGFRNYQSSHDSSMFYIGMRILKTQGCRAAYNI
YMHESAGGTDYVNSREISCELVLDPYPKGYTIVPTTIHPGEEAPFVLSVFSKASIKLEAV
NT seq
6483 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaggagggacaccacggagttgttttggcatgcagcatctgtgggttcctcttc
gctgtccttagccctctcagcttttgggttctatgggctgtgaattggaggccatggagg
ttatacagttggatatatgcaaggaaatggccaacatatgtgcaaggacctcaactaagc
acactttgcagccttttgactctttttgcatggcttgttgtcatttctcctatagcagtt
ctgctcgtgtggggaagcatccttattgctcttctggaaaggaacataattggtttagct
gttataatggcgggtgttgctttgcttctgtcattctactctataatgctctggtggaga
acacaatggcaaagctcaaaggctgttgcttaccttctcctcctggcagtaggcctacta
tgtgcctacgacttttgtgctatttatgtgacggctggtgctagtgcttccgagcttaat
tctccatcagggttcttcttcggggtgtctgcaatatcattggccatcaatatgcttttt
atatgtaaaatactgtttaatgtaagtggatttgatgttgatgaatatatgcggaggtcg
tacaagtttgcctattctgactgtgttgaagtggctcctgtttcatgctctcctgagcca
ccagatcctagtgagttatacatgacaaaatccagcagggtcttgcatttagggcttctc
tacattagctcgctgcttgtgcttgttgcctattccatcttgtacggtcttacatcaaaa
gaagctcgttggctgggtgctttaacttcagttgcagtggtgatccttgactggaatctg
ggcttgtgttcatttagatttgagcttcttaaaagtcggatgatagtgttatttgtggct
ggaacatcaagggctttccttatatccttcggagtgcattactggtaccttggccattgc
atcagttatgcttttgtagcatctgtgcttttatctgctgctgtctcttcctggctttct
atttcaaacccctcagttgcaaggatagacgctctaagaagtacagttataaagctgcga
gagggatttcgaagaaaaggacaaaatagttcttcaaattcatcagaaggctgtggctct
agtttgaagcgtagtagcggtagtgttgaagctggtcaaaatggtaatgcaacggattct
atgtacagaagcaactcacaaagcgatggtgtcaattggagcagtattccttttgatcga
tcaaacagttgtcaagaaggccggagctctgacaagaacatagatagtgcacgtgcaagc
ttagctcatcggagtaattcatgcctatctgctgtccaagactctgaaactgctgttgtt
tcaatagataggcatggagatcccactacttcacttgtttgttctagcggtggtttggaa
agtcatggctgtgagcctagtggatcagccaccacctcaggtaatcaacagttattggat
ttgaacctggcagtgatatttcaggacagattaaatgacccaaggatttcatctatgcta
aaaaagaacggtggacttggagatgtagaactagctaatcttcttcaggataaaggattg
gatccaaatttttcctacatgctgaaagacaaagttatggatccacggattttagctttg
ctacagaggagcagcttagatgcagatagagagcatcaagatgatgtagatgtcacagct
actgattcagatagattggataccactattgcaaaccagatctctctgtcagaagaacta
aggagaagcggtctagaaaaatggttgaacatttcaaggctaatattccatcatttagct
ggatccccaatacgtgcttttattgttttcacagtaatgttcataatagagactgctact
gtggctatatatcgaccagagaccatcaaagtgataaatgcaacacatgaacagtttgaa
tttggtttctcgatactgcttctgtcaccagttgtctgctccattatggcattcatttgg
tctctgcgtgctgaagaaatgatgatgacatccaagccccggaagtatggtttcattgca
tggctactgagcacatgtgttggtttgtttctctctttcttaagcaagtcatcagttata
ttgggcttgtctctcacagtaccacttatggtggcttgcctctcatttgctgttcccata
tggatgtgtaatggttaccgtttctggattcctggaagggagtttgatactcgtgaaaat
gttagtcaagctccaggaaagaaagagcgggctctctttgttatcagcatagctgttttc
actgcatcagttattggccttggtgcaatagtgtcagcaaagcctttagacgctttaggc
tataaagggtgggatgctgataagaacagcttctattctccctatgcaacatcgatgtat
cttggatgggcgttgtcttcaacaattgctgtgattaccacggggttgatacctattgtt
gcttggtttgcaacgtaccggttttcaccttcatcagctatatgtgttggcctctttgca
actgttcttgtgtccttttgtggtgcatcctactggggagtggtaaattcacgagaggat
ggtgtgcctctgaaggctgatttcctggcagcattacttcccttgctttgcattcctgca
tttttctcgctgttcactgggctgtacaaatggaaggatgatgattggaagatttctcgt
ggcgtttacctctttgttggcatgggaatgttgctgttgtttggtgcagttgcagctgtt
attgtcacaatcaggccctggactgttggagttgcttgcctcgtagccattctgttcctt
gtatttgttattggggtcatccactactggacatctaacaacttctatctaactaggact
cagatgctgcttgtttgttccattgcttttctcctagccttggctgccttcctgatggtt
ttatttcacggaaagccttttgttggagcatctataggttatttctcatttatatttctt
ctcactggaagggctttgactgtccttctatcaccgccaattgtagtgtattcgccaaga
gtattgcctgtatatgtttatgatgctcatgcagactctgctaaaaatgttagctatgcc
tttcttattctgtacggaattgcattagcaactgaagtttggggtgttattgctagtcta
ataatgagtccaccatttgttggggctggcgtttctgctgctactcttgtaattgctttc
agttttgctgtttctcgaccatgcctgactcttaagatgatggaggatgcagttcatttt
ctcagcaaggatacagttgtgcaagcgatgtcacggtctgctaataaaactagaaatgct
atatctgggacttactcagcgcctcagaggtctgcaagctctgctgctcttttggttgga
gatcctgctcttacattggacagggctgggaactttgtgcttcctagggctgatgttatg
aagctgagagatcgtttgagaaatgaagaaattgctgcaggatctttcttatgtggagta
aaagattgtttagtaatttgcccccagtccctgtcaaacgtagattatcggaggaatatg
tgtgcccatgcacgtattttggctttggaagaagcaattgatacggaatgggtgtatatg
tgggataaatttggtggttatttacttctgttgcttggattgactgccaaagctgaacaa
atacaggatgaagtacgtctaagactctttttggatagcataggcctttccgatttgagt
gccaaagaaattaagaaatggatgcccgaagatcggaggcaatttgagcttattcaagaa
agttacataagggaaaaagaaatggaagaggaggctttgatgcaaaggcgagaggaagaa
gggaagggaagagaaaggaggagggcattgctggagagagaggaacgaaaatggaaggag
ctcgaaatatcattgctttcttccattcctaatactggaagcagggatgctgcagctatg
gcagcagctgtccgagctgttggaggtgattctgccctggaagattcttttgcaagagat
agggtctcttcaatagccaatcacatacgaaaggcacaattggctcggcgagcagaacag
actggtattccaggcactgtatgcatacttgatgatgaaccgaggagtactggtcgtcat
tgtggagaacttgacctgtgcctctgtcaaagtcaaaaggttactttgtctattgctgtc
atggttcaacctgtatctggtccagtgtgtctttttggaagtgaattccaaaagaaggtt
tgctgggaaatcttagtggcaggatcagaacagggaatggaagctggacaggttggtctt
cgattagtgactaagggtgaaaggatgactactgttgctaaagagtggaatattggtgcg
tctagtattgcagatggcaggtggcatcttgtcactgtaactttagatgctgacctaggt
gaagcaacttctttcattgatggagtttatgatggatatcagaatgggttgccgttgcca
acagataatggtatttgggaacctgggactgatatttgggttggtgctaggccacccaca
gacttagatgcctttggtaggtcagatagtgaaggttctgactcaaagatgcagatcatg
gatgcttttctatggggaagatgtctcagtgaagatgaggttactgtgttacatactgcc
atgtctcctgctgagtatggattttttgaccttgcacctggcgatgcttggcatggaagt
tattctgcaagggtggatgactgggaaagtgaagatgcttatgaggtttatgatcaaggg
gatgtcgaatgggatggacagtactcaagtggtaggaaacgtccggtacatgatgctgta
gctattgacattgactcctttgctaggagaccaagaaaaccaaggtttgagacacgtgat
gaagtcaaccagcgtatgctttctgttgaaagggctgtcagggatgctcttgtcgcgaaa
ggagagagaaacttcactgatcaagagttccctccagaggatcgttctttatttgtagat
ccaatgaatccacctctgaaactgcaggttgtttctgaatggatgaggccttctgacata
gcaaaggagatatcgatcagttctcagccttgcttgttttcgggttctgtgaattcctca
gatgtgtgtcagggtcggttgggagactgttggttcctaagtgcagtcgcagttttaact
gagatgtctcgtatatcagaagttataatcactcctgagtacaacgatgaagggatttac
acagtcagattctgcattcagggtgagtgggtagccgtggttgttgatgattggatcccg
tgtgagtctccggggaaaccagcattcgctactagtagaaagcaaaatgagctttgggta
tccattcttgagaaggcttatgcaaaacttcatggctcttatgaggcattggaaggtggg
cttgttcaagatgctctagtggatctcacaggtggggctggtgaagagattgatatgcga
agtcctcaagcacaacttgatctggctagtggaagattgtggtcccagttgttgcatttc
aaacaagaaggttttcttcttggtgctggaagtccttctggatctgatgctcacatctca
tcaagtggcattgttcagggacatgcgtactcaattttgcaggtaagagaagttgatggc
cacaagctcatccaaatcagaaatccatgggcaaatgaagttgaatggaatggaccatgg
tcagactcttcaccagagtggaccgaacgaatgaagcataagatcatgcatgttccacag
tcgaagaatggggtattctggatgtcttggcaagattttcagattcactttcggtcaata
tatgtttgccgtgtttatccacctgagatgcgttattctgtccatgggcaatggcgtggc
tacaatgcaggtggttgccaagattatgactcatggcatcaaaatccacagtatcgactt
agagtaacaggacgtgatgcactataccctgttcatgtttttattacccttactcagggt
gttggtttctctagaaagacgaatggtttccgtaactaccaatctagtcatgattcttca
atgttttacattggaatgaggatactcaagacacagggctgtcgtgctgcttacaatatc
tacatgcatgaatcagctggtggaacagattacgttaactcaagagagatatcatgtgaa
ctggtcttggatccttatcccaaagggtacacgattgtgccaactaccatccatcctggg
gaggaagcaccttttgttttgtcagttttttcaaaagcatcaatcaaactagaggctgtt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
