KEGG   Mycoplasmopsis fermentans M64: MfeM64YM_1066
Entry
MfeM64YM_1066     CDS       T01402                                 
Symbol
recD
Name
(GenBank) Exodeoxyribonuclease V, alpha subunit
  KO
K03581  exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mfm  Mycoplasmopsis fermentans M64
Pathway
mfm03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mfm00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    MfeM64YM_1066 (recD)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mfm03400]
    MfeM64YM_1066 (recD)
Enzymes [BR:mfm01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     MfeM64YM_1066 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:mfm03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     MfeM64YM_1066 (recD)
SSDB
Motif
Pfam: AAA_19 AAA_30 UvrD_C_2 Viral_helicase1 SH3_13 UvrD-helicase AAA_11 PIF1 AAA_22 AAA SLFN-g3_helicase HHH_RecD2 nSTAND2 PhoH AAA_12 cobW AAA_5 AAA_14 NPHP3_N Transcrip_act AAA_16
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADV35061
UniProt: A0AB32XDI1
LinkDB
Position
complement(1116173..1118413)
AA seq 746 aa
MQAKTTIKVKGTIKKIRKGLAQKWILFEFKSQENQLFVVYARISSDDFLQVGYLYEMELS
GPNKYNNYILEGYNMIEATKEDLKVMLKNHIRGFKEEDHNILKENLGENYLDVIKDTPKE
ERKIFYEFIKPPLLKKIEAFIEEVLNMGKDERFFITNNIYNFYIKLKQKLPLADGESYLD
FFDKNKENHEDPYLILYIELGLSFDSVDNFASLIGYSKDCETRYYAIVYKSIYDFGIQVN
DTYYNLSDLHKNWLEFTNELILNNKLSISKLAIDNIFINSINKLIEMQKLYYAEKEVPTI
ALSFIKEQEDFIFEKLITIKNKINKTIPQIEDDTLTAKQLDALNIALNEPISIISGFPGT
GKTYLISNIYESLIAQKVYKKGEIEILTPTGRAAINIKNKSNNLPAKTIHNYLKIDKEDE
DVVYNNDCDKTKVVIIDEFSMVNLKIFYQLLSHLSKLEKLIIVGDKDQLPCIGPGNLMHD
LCNWDFIPKTLLIENQRAESDEICEHFLSIIDSKVKEVEIGSTNTIQMKEINSVALLNEL
SYLYQTYNPEYNSEKMVTLIPLHDGQVGAKTVNKWLQKEKLNNYTYKLPKFKQSKDNYIQ
SWEGTKFYLFDNVIQLINDYEKNVFNGEIGIIKEIIDDKIVSVEYPQGGNKFKTVNYVKS
EIAINLSLAYALTVHKFQGSEAPHVVIPVFKDYSRMLNKKLLYTAVSRAKEKLFILGDLA
LYAKKTKTEDYSKIKTYLFDLIKEQN
NT seq 2241 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaagcaaaaacaacaataaaagtaaaaggaacaataaaaaaaataagaaaaggattg
gctcaaaagtgaattctttttgaatttaaatctcaagaaaaccaattatttgttgtctat
gctcgaattagttccgatgactttttacaagttggttatttatatgaaatggaattaagt
gggcctaataaatataataattacatacttgaaggctacaatatgattgaagcaacaaaa
gaagatttaaaagttatgttgaagaatcatattagaggttttaaagaagaagatcataat
attttaaaagaaaatttaggtgaaaattatttagatgttattaaagatacacctaaagaa
gaaagaaaaatattttacgaatttattaaaccccctttgcttaaaaaaatagaagctttt
attgaagaagttctaaacatgggtaaagatgaaagattttttataaccaataatatttac
aatttttatattaaattgaagcaaaaattacctcttgcagatggcgaatcatatttagat
ttttttgataaaaacaaagaaaatcatgaagatccttatcttattttgtatattgaatta
ggattaagctttgactcagtagacaattttgcaagcttaataggatattcaaaagattgc
gaaactagatattatgcaatagtttataaatctatttatgattttggaattcaagttaat
gatacatattacaatttgtctgatttacataaaaattgacttgaatttacaaatgagtta
atactaaataataagttatcaatttcaaagcttgctattgataatatatttattaattct
ataaacaaactaattgaaatgcaaaaattatattatgcagaaaaagaagttccaactata
gcacttagttttattaaagaacaagaagactttatttttgaaaaattaataactataaaa
aataagataaataaaactattccgcaaatagaagatgatacattaactgctaaacaactt
gatgctttaaacattgcactaaatgaaccgataagcataatttcaggattccctggcact
ggcaaaacatatttaattagtaatatttatgagtcattaattgcccaaaaagtctataaa
aaaggtgaaatagaaattttgacccccactggtagagctgcaattaatattaaaaataag
agtaataatttgcctgcaaaaacgattcacaactatttaaaaattgataaagaagatgaa
gacgttgtttataacaatgattgtgacaaaacgaaagttgtaattattgacgagttttca
atggttaatttaaagattttttatcaacttttaagtcatttatccaagcttgaaaagctc
attattgttggagataaagatcagcttccatgtattggacctggcaatttaatgcacgac
ttatgtaattgagattttattcctaaaactcttttaattgaaaatcaaagagctgaaagt
gatgaaatttgcgaacactttttaagtattattgattcaaaagttaaagaagttgaaata
ggaagtacaaacacaattcaaatgaaagaaataaactcagttgcattattaaacgaatta
tcatacttatatcaaacttataatccagaatacaattctgaaaaaatggtaaccttgatt
ccacttcatgatggtcaagttggagccaaaacagttaataaatgattgcaaaaagaaaaa
ctaaataattacacatataagttgcctaaatttaaacaaagtaaagacaactatatccaa
tcttgagaaggtacaaaattctatttatttgacaatgttatccaattaataaatgattat
gaaaaaaatgtttttaatggtgagatcggaataataaaagaaataatagatgacaaaatt
gttagtgttgaatatccacaaggtggaaataaatttaaaacagttaattatgtaaaatca
gaaatagcaattaatttatctttagcatatgctttaactgttcataaatttcaaggttca
gaagcgccacatgttgtaattccggtttttaaagattattcaagaatgcttaataaaaaa
cttttatatacagcagtttcaagagctaaagaaaaattatttattttaggcgacttagct
ttatacgctaaaaaaacaaaaactgaagattatagtaaaataaaaacatatttatttgat
ttaattaaggaacaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system