Marinomonas foliarum: JSY38_11600
Help
Entry
JSY38_11600 CDS
T07165
Name
(GenBank) PAS-domain containing protein
Organism
mfoi
Marinomonas foliarum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_8
HAMP
PAS_4
PAS
PPP1R21_C
DUF6183
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QRV22720
LinkDB
All DBs
Position
2506577..2509105
Genome browser
AA seq
842 aa
AA seq
DB search
MRFTSIRQKASLSILAISLVAFFMVGIGWQSMRVSEASLSEFESETLPEISTSLTLAEGV
AQLAAIAPYTAGSGRPFQLQTESERIHRRILELRGVADSLTDSVFQQDIDKRLDDLQTTL
EELVALVREELYLREDSLAQQFRIRQLPLNDDAASVTNQQGLVWLLQLLESPSLVPESIL
ESLKLSEQNEQVASIADDLLMAHRRLNQIQERKNYLLIAIRAKSEQLSKHVSDFVGGLQK
KVSRQRQEVSTFVARGQNWIIGISVFLLLGLTRLYWYSQRMTKDLGVVTNDMEQLSLGRV
DSKHTGIRRNDEIGTLADTFEVFRRDALRRLEVTAELSEQKRLLETIFDNMNDGLSVFSS
KGTLIAWNSGYQKLFDLSDDDLSVGMSIDEVQSLINQGQHKNLNLENQQVHMEEVNVSRH
LRFQSFERHFDSGKIIEFRSKPMPEGGFVTLYTDLTERKSVESQLRQAQKMEMLGQLTGG
VAHDFNNLLAAIMGNLQMLSDSRPQTEDQARYIERALVVSEKSSNLVQRLLAFSRRQQLF
PVSIGIDDLIEGMLDLVEYSVGSHIVVESDLQCPDVVSLIDPSQLENALLNLSLNSASAM
PGGGRLAFSTKLCTLPDSDVPAIRIRVEDSGDGIDDEVIGRIFEPFFTTKPVGKGSGLGL
SMIYGFVKQSGGEIKVTSEKGKWTRVCLFLPQQITSPDLILDSGKASEEKDINRDVIVLP
ELSLVWLVEDDEEVCRVMREQLAKMGFMVQTFECAEAVVNALNKAIVPDAIVSDVNLAGT
MSGVELAHSLNSDLSGFTGPILLMSGLPKDELKQKYQLKDDDLFISKPFTIKELSQIFQI
ER
NT seq
2529 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgttttaccagtattcgtcaaaaagcctccttgtctattttagcgattagcttggtg
gcgttttttatggtggggattggttggcaatccatgcgcgtcagtgaagcttctttatca
gaatttgagtcagaaaccctacctgaaatctctacctctttaacgctagccgaaggcgtt
gcgcaattggccgcgatagcaccttataccgcaggttctgggcgtccttttcagttacaa
actgaatccgagcgcattcatcgtcgtattcttgagctgcgcggagttgctgacagtttg
acggattctgtctttcaacaggatatcgataaacgattggatgatctgcaaaccaccctt
gaagagcttgttgccttggtgcgtgaagagttgtatctgcgagaagacagcttggcgcaa
cagtttcggattcgtcagttgccgctaaatgatgatgccgctagtgtgactaatcagcaa
ggtttggtatggctactgcaattactagaatcgccgagtttggtgccagaaagcatcttg
gaaagcttaaaactttcagaacaaaacgagcaagtggcgagtattgctgatgatttgcta
atggcgcatcgacgtttgaatcaaatacaagagcgcaaaaattatttgctgattgcaatt
cgagctaagtcggaacaattgagtaagcatgtcagtgatttcgttggtggtttgcaaaag
aaagtgagccgtcaacgtcaggaggtatcgacctttgtagcccgtggtcagaactggatt
atcggtatatcggtatttcttttgttgggtttgacgcgtctgtattggtacagccagcgg
atgaccaaagatttaggcgttgttaccaacgacatggagcaactgtctttggggcgtgta
gattcaaagcatacaggcattcgtcgtaacgatgaaattggtaccttggccgataccttt
gaggtatttcgccgtgatgctttaaggcgtttggaagtcacagccgaattgtcggaacaa
aaacgcttgctcgaaaccattttcgataatatgaacgatggcctgagtgtgttttcctca
aaaggtaccttgattgcttggaactcgggttatcagaaattgtttgatttatcggacgat
gacttgagtgtcggcatgtcaattgatgaagtgcaaagcttgattaatcaagggcaacat
aaaaatcttaatttagaaaaccagcaagttcacatggaagaagtgaacgtttctcgtcat
ttacgttttcaaagcttcgaacgccattttgactcaggaaaaatcatcgaatttcgttct
aagccaatgcctgaaggtggttttgttaccttatatacggatttaactgagcgaaaaagc
gttgaaagtcagttacgtcaggcacaaaaaatggagatgctagggcagcttacaggtggc
gttgcccatgattttaataatctcttagcggcgattatgggcaatttacaaatgctgtct
gactctcgcccacaaaccgaagatcaagcaagatacatagaacgtgctttggtcgtttct
gagaaaagcagcaacttggtacagcgcttattggcctttagtcgtcgtcagcagcttttc
cctgtgtcgattgggattgatgatttaattgaaggcatgctcgatctagttgagtacagt
gttggttcacatattgttgttgaaagcgacctgcaatgtcctgatgtggtgagtttgatt
gatccctctcagctagaaaatgccttgttgaatttgtccttaaatagcgccagcgctatg
ccgggtggtgggcgtttggccttttcaaccaagctgtgcactttacctgacagcgacgtg
ccagccattcgtattcgagtagaagactcgggtgacggtattgatgatgaagtaattggt
cgaatatttgaacctttcttcacgactaagcctgtcggcaaaggcagtggtttggggttg
agcatgatctatggctttgttaaacaaagtggtggtgaaatcaaagtcacctccgaaaaa
ggtaaatggacccgagtttgtctttttttgccccaacaaattacatcgcccgatttgatc
ttagatagtggcaaagcgtctgaagaaaaagatatcaatcgagacgtgatagtcttgccc
gaattgagtttggtgtggctggtagaagacgacgaagaagtatgtcgagtcatgcgtgaa
caattagcaaaaatgggctttatggtgcaaacctttgaatgcgccgaagcggtggtgaat
gccttgaataaagccattgtgccagatgctatagtgtcggatgttaacttagctggaacc
atgagcggtgttgagcttgcacacagtctgaattctgatttgtctggttttaccgggcca
atattgctgatgtctggcttgccaaaagacgaattaaaacaaaaatatcaattaaaagac
gatgatttatttatttcaaaaccttttactatcaaagagttgagccaaatatttcaaatt
gagcgttga
DBGET
integrated database retrieval system