KEGG   Mycoplasmopsis fermentans JER: MFE_08330
Entry
MFE_08330         CDS       T01325                                 
Symbol
hsdR2
Name
(GenBank) type I site-specific deoxyribonuclease (type I restriction-modification enzyme, R subunit)
  KO
K01153  type I restriction enzyme, R subunit [EC:3.1.21.3]
Organism
mfr  Mycoplasmopsis fermentans JER
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mfr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:mfr02048]
    MFE_08330 (hsdR2)
Enzymes [BR:mfr01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.3  type I site-specific deoxyribonuclease
     MFE_08330 (hsdR2)
Prokaryotic defense system [BR:mfr02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type I R-M system
   MFE_08330 (hsdR2)
SSDB
Motif
Pfam: SWI2_SNF2 ResIII HSDR_N T1R_D3-like DUF6687
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADN69394
LinkDB
Position
920328..923423
AA seq 1031 aa
MEFNEDTRVKLPATIHFLKLGYNYQTVRSPEINRDNNIFEERFHRAIEKINKKKFAKEEI
NELISDISRKIKNKDLGKEFYNRLISTDYPIKLIDFENIENNDFAIVNELTFRSNANSNY
DSFRPDITILVNGMPLAFLEVKVKNNKNGIQAEFIRMWEDRLKVDEYRKFFNMLQIVSFT
NNMDYEEFNDAEASLLKQGSFYTTPNGKDNTTFSAFREDEPNYHANYSFEEIDNDKIKEI
LIDNNIKTSHVDSDWFQTNLSDTTPCNRFITSIFDKERFLYFIKYGMMYLSQIKEIKNET
LNKVEQLPINQKHIMRYPQFFATRAIIKRFKRTNKNGIIWHTQGSGKTALSAFATKVIKD
YWSKKKINARFFFIVDRLDLMRQASAEFANRGFNVVNVDSKEAFAKELNETIDRNNNGIG
TICVVNIHKFMDSSKMPEAKNDYNIRTQRIFFIDEAHRSYTMHGEFYKNLMTCDRDGIYI
AMTGTPLLTKRERSNLKFGDYIHKYFYDKSIADGYTLRIKKEQIKTEARATIIRNLNIEI
EKLESRIIYESDDYVKSVSQYIEKDFIDFRFICRNDLTIGGMIVCRSNDQAKKIHEWFKK
NSKLTTGLVLSDTDNPLQDNINKNNQKTFKESNYPDILVVHYMLTTGYDVKRLKKMYLLR
GPKAQNLLQTISRVNRPYRSPNGQEYQYGYIVDFIDIEKEYNNTIDAYRKEIEEEYDFEE
EDTSLSGLIIDKTDIKKRYDVLKSDLEKFVNNYNLETFVDKINNFDKDTLQKIKKILVNI
KNCSIEFKLSQADEYSKLINDYEINVFIKEVQKKINFLNLRSDPIDTIQLIDNKEVVQII
YDFLLKNITVLDLGKFDKENKMELIKQKFMKMQKEIKENKNTRDVKFMNLNALIKKLLDK
LAVEELTYEEVEDELDLIYNSTKKINEENKEISKDFGNSLAFVTTMNIVLAETKLDRSIL
KNFLLMVYDELKGNISDEILIKQGKNGFIDSTKSKITTRLIKKNLYKQIKDNYDYILNEL
YFNLLNYKETL
NT seq 3096 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaatttaatgaagatacaagagtaaaattaccagcaacgattcactttttaaaactt
ggttacaattatcaaactgttagaagcccagaaattaatagagacaataacatttttgaa
gaaagatttcatagagcaattgaaaaaataaataagaaaaaatttgctaaagaagaaata
aatgaattgatctctgatataagcagaaaaatcaaaaataaggatttaggaaaagaattt
tataatcgattaatttcgaccgattaccctataaaactgatagattttgaaaatattgag
aacaatgattttgcaattgttaatgaattaacttttagaagtaacgctaattctaattat
gattcatttagaccagatattacaattttagttaatggtatgccattagcatttttagaa
gtaaaagttaaaaacaacaaaaatggtattcaagcagaatttattagaatgtgagaagat
agattaaaagttgatgaatacagaaaattttttaatatgttgcaaattgtttcatttaca
aacaatatggattatgaagaatttaatgatgctgaggcttcactactaaaacaaggctct
ttctatacaacaccaaatggaaaagacaatactactttttcagcttttagagaagatgaa
cctaactaccatgctaactactcttttgaggaaatagacaatgacaaaataaaagaaatt
ttaattgataataatattaaaacttcacatgttgatagtgattgattccaaacaaattta
tcagatacaactccttgcaaccgttttataacttcaatttttgacaaagaaagatttcta
tacttcattaaatatggaatgatgtatcttagccaaataaaagaaattaaaaatgaaact
ttaaataaagttgaacaattgccaattaatcaaaaacacattatgagatatcctcaattt
ttcgctacaagagcaattatcaaaagattcaaacgaactaataaaaatggaattatttga
catactcaaggttcaggcaaaacagcactaagtgcttttgctacaaaagtaattaaagat
tattgaagtaaaaagaaaataaatgcaagattcttctttatagttgatagattagactta
atgagacaagcttctgcagaatttgccaatagaggtttcaatgttgttaatgttgattca
aaagaagcattcgctaaagaattaaatgagacaatcgatagaaataataatggtattggc
acaatttgtgttgtaaacattcataaatttatggatagttcaaaaatgccagaagctaaa
aatgattacaacataagaactcaaagaattttctttattgatgaagctcacagaagttat
acaatgcatggtgaattttacaaaaaccttatgacttgtgatagagatggaatttacatt
gcaatgactggtacacctttattaactaaaagagaaagatcaaatttaaaatttggagac
tacattcataaatacttttatgataaatcaatagctgatggttatactttgagaattaaa
aaagaacaaattaaaactgaagctagagctacaattattagaaacttaaatattgaaatt
gaaaaattagaatcaagaattatttatgaatcagatgattatgttaaaagcgttagccaa
tatatagaaaaagactttattgattttagatttatttgcagaaatgatttaacaattggt
ggaatgattgtctgtcgttcaaatgaccaagcgaaaaaaattcatgaatgatttaaaaag
aattctaaattaactactggccttgttttatcagacactgataatccattgcaagacaac
ataaataaaaataatcaaaaaacctttaaagaaagtaattatccagatattttagttgtt
cactatatgcttacaactggatatgatgttaaaagacttaagaagatgtatttattaaga
ggacctaaagctcaaaatcttttgcaaactatttcacgtgttaatagaccctatcgtagt
cctaatggccaagaatatcaatatggatatatagttgattttattgatattgaaaaagaa
tacaacaatactattgatgcttatcgtaaagaaatagaagaagaatacgattttgaagaa
gaagacacttccctttctggtttaattattgataaaacagatatcaaaaaaagatatgat
gttttaaaaagtgatcttgaaaaatttgttaataattacaatttagaaacctttgttgac
aaaattaacaattttgacaaagatactttacaaaagatcaaaaagattcttgttaatatt
aaaaactgttcaattgaattcaaattatcacaagctgatgaatattcaaaactcattaac
gattatgaaatcaatgtgtttattaaagaagtacaaaagaaaattaattttttaaacttg
cgttcagatcctattgatacaattcaattaatagataacaaagaagttgttcaaatcatt
tatgattttcttttaaaaaatattactgttttagatttaggtaaatttgataaagaaaat
aaaatggaacttattaaacaaaagtttatgaaaatgcaaaaagaaattaaagaaaacaaa
aatacaagagatgttaaatttatgaatcttaatgcattgattaagaaattacttgataaa
ttagctgttgaggaattgacttacgaagaagtagaagatgaattagatttaatttacaat
tcaactaaaaaaataaatgaagaaaataaagaaatatctaaagactttggaaatagtttg
gcttttgtcacaacaatgaatattgttttagcagaaactaaattagatcgttcaatttta
aagaactttttattaatggtttatgatgaattaaaaggcaacatttctgacgaaatcctc
attaaacaaggcaaaaatggatttattgactcaacaaaatctaaaataacaactagatta
attaagaagaatttatataaacaaattaaagataattacgattatattttgaacgaatta
tactttaatctgcttaattacaaggaaacactttaa

DBGET integrated database retrieval system