Methanocaldococcus sp. FS406-22: MFS40622_0254
Help
Entry
MFS40622_0254 CDS
T01175
Name
(GenBank) legume lectin beta domain protein
Organism
mfs
Methanocaldococcus sp. FS406-22
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Bact_lectin
Beta_helix
Lectin_leg-like
SdrD_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADC68950
UniProt:
D3S7E0
LinkDB
All DBs
Position
complement(245236..253941)
Genome browser
AA seq
2901 aa
AA seq
DB search
MIFNLKNISIFVLAILLVSNVSLGLNISTINESLDSNNMDVAFNKSLPSSIDALNYNLTK
NESVGKDNNVTINITNVTNEEENECYLNVIVNGYKVIVETNGKVFGFANGTPLKFVKIDS
SKYVISPVILNTPMEIYTKFDGNKILHKTVILNYTKPEKENEETKKKELHYLNVSFDNFK
LIVKTNGKPYAKYLDVNIKVKTKKIKKYEYLVYPLILNKTIIIYAKFKNETLNKTVFLNY
TCENENLTNKTILTRDVYFPSEKIVVKTNFKPNTAYIITPDNKIIRLKVHKKGKFYVLST
KLKKNVILGNYSVVIDGIKKTFAVDYYKINAKLINNRFIVGNVSYYVKEPKFLTLIIYPN
KKEIDVPLINGTFDIPLDYLVNKLNISKPEKIKKIVLICGNAEEKIKIKLKNKEKLKKLI
SYDPVNKEVVIKIEGNKKDVEKILKEYKKGKYYISKIMDINNHTTIEIRVKADEEILKDY
GLPVDVIKTTETIKKISNNKIRVEVNNKLDGIWYRFSCKIPKGYRVKEIVGDDGRIIKNN
ISINRLTGEVVGEVRWYIENNTLYFYDDPIYGYDISLIPPAPNNSIAVELSYDGQDNGGC
GQISAIVFPYSEGDNISTIETYDHAGRTGDYDYANNIDADAGSKIAIKYTSGIRTRQYGN
GGDYYETASFYLSEINRTDVPLNTVPNGVLESVIITNMYAPWTNNELNITQKVIIRGNNK
WFATIYYIKNPTTKTYTNLKFFQGMDWNFRGSYQKDNAYYNNANDVVYGYDSDAPSGDIQ
YGGFKSILPSYEHDVNPYWRMWDDIKYDNLNNYSSYNGDAGVALAWTKSSLKPGEIWVVP
IIWGLGYNFTDMMNEINMGLSQLYDTGVKTINYPNNGDVFNPNLQPIIYVNSTIALYGLV
DAYNLNVSINVTQINGTYTYTNSTLINLSVPYEEEKTISFPINISNMPYGAYNITIKTNL
PNDQNTSNDEKSIIIYISPFSIEPEYQEKTGNAGEEIFYNITLYNFGSGERFDINITNST
KGWTTCIYNNSTLIAEDTNGDGIWDYISPNYDLNANNLPDIYVPHGELNLTVSKVIPPTT
PLGEIDLTTLKFVNTNNPSIYDIASFQTSTPFPPSVQKTFYLHGDSSRTLNTSIPTEIDN
YTTITGNSLASWTQIPRFADDFTVVGNISILLYMSDPDVLGGFETHKIVVSLIATNGVNS
ITLGSDTEDLNLYSTTRPYTFNIPLNSIVTIPKDYYLILRVENLQSTNSINIYHDSTYVS
NITLNTTTYVEVQNIYADKDVYIPGDTATVFVNITDPIGSYDIKGANIAVYYPNGTLYIN
DSMNLQEVDANTPSLWKLFNYSFKVPVSGNYNITITGIESNGVIYKKDYVLCVGYEIQGY
VKEDFGTLGVEDSSDKGVYDVNVSLFEDSNNNGVLDKNDKMINSTTTDVFGYYKFLVYNT
SKTYFVAVNSKTISPTRGYNQGYNINDVWAEETYQTLYAPINTSQWIANGNATVSTNKLL
LTPDDYNQVGSVWYYEPVNLSEDFVIEYYAYLGDNPDGADGVTFTLQPNGLSEWGGAGGG
LGYAGITPSVAVEIDTWLNDFDYPATTDHIAIDVDGIVNHTYNNITFLTPNPYDLGNVED
GTEHKVKIVWNATTKQLTVYFDGSQVLTWNKDITQILGTTAYFGFTGGTGGAKNLQYIKP
TYAKNGNSYIIKPTYSIVSMFGGRNPGKSDDWNTGDYEHYCTVDLNNYHGENITFGFSFD
VITNTNPVGQGSFAQFIKNANAIVGEDKAYFKIPKTELHGKYYVIYTNNNSIVDNLTVIN
GSTQVDGDVLLSGSQWIANGDSYINNSENLTLIITPDDYNQVGSVWYYEPVNLSEDFVIE
YYAYLGDNPDGADGVTFTLQPNGLSEWGGAGGGLGYAGITPSVAVEIDTWLNDFDYPATT
DHIAIDVDGIVNHTYNNITFLTPNPYDLGNVEDGTEHKVKIVWNATTKQLTVYFDGSQVL
TWNKDITQILGTTAYFGFTGGTGGAKNLQYIKPTYAKNGNELLNLDAISKNPVINNLAYN
TTISNINFENVSVAILGNESGLNYLKITNVSVFGNILKAGIELLDYNWNMQEYPAYMTNI
HINSSDAYGIEMLNRIWLIFEDSLIEMHNGIGVYWANWAGGYGNLTMENISIKECNHGIY
FYKNGNIASIINSKIENSAYEGIYIIDSNNISILNTSIINNSIGIFSNNSSISVENSTVF
NNRFEGIYVENSNITTYNLSVSNNSIGIYIKGFGNNKISLSRIFYNNYGVEVVNSSKILM
NSSEIFNNSIDGIAVFNGDNLTITNNRIYNNNYSFLSYGNLTNVFIYNTSFENSTNKSLD
IEVPSNSVLNNLTILDSKILNSGEYGLYVYSLGDSSNLNISGNFINASFRDGILIFGVND
IEILNNNITNNGLIGGDPAGAGIKVIGYNTANVTIENNNCSNNGGNGIDVEDYYGNYLRN
VTIENNYLSNNGIEANAGNALFIGGRVENVLVKNNIMQYSDAQAILIQEPNGWATWAWIG
TNITIDNNTIQYNGLTVEAGNVTAGITIGAYGNYNQDDGYIIIKNNKIINNNLCPNPSYG
GKVGGIEIYGLNESWINLEFNITNNIIANNSAYGISVAASKDINIVNNTIYNNEKGITLP
TYDSAPHNIIISKNSIYNNSMLGIDLNDDNVTLNDGLINPNEANYGIDYPIITYAELVGD
NLTIRGYIGNGTGSSNFANAIVEIFLVKNSTGGDNLIGNNISSDGTTLDDTYGEGWIYLG
SLIADSNGFFNGTLNVSGKGVDYDSILTATATINGYGTSEFGRNYLLIKKFFNITGSITM
LPNGYNITIKSYNTTRDVYVYWYKPNDIGVINISGDYNENGTNGNTYWFKFNIINANEVK
KISITTNTTTIEGLIIGIDPK
NT seq
8706 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatattcaatttaaagaatatttcaatatttgtattagctattttattggtttcaaat
gtaagtttaggattaaatatttctacaataaatgaaagtttagattcaaataatatggat
gtggcattcaacaaaagcctaccctcttctatagacgcattaaactataacttaactaag
aatgaaagtgtaggaaaagacaacaatgtaacgataaatataacaaatgtaactaatgaa
gaagaaaatgagtgttatttaaatgttattgttaatggttataaagttatagtagaaact
aacggaaaggtttttgggtttgcaaatggaactcctctaaaatttgttaaaatagatagt
agcaaatatgtgatttctccagtaatcttaaacactccaatggaaatttacacaaaattt
gatggtaacaaaatattgcataaaacagttattttaaattacacaaaaccagaaaaagaa
aatgaagaaacgaaaaaaaaggaattgcactatttaaatgtatcatttgataattttaag
ctgattgttaaaacaaacggaaaaccttatgctaaatatttagatgtcaatataaaagtt
aaaactaaaaaaattaaaaaatatgaatatttagtttatcctctaattttaaacaaaaca
attatcatttatgcaaaattcaaaaatgaaacattgaataaaacagtatttttaaactat
acttgtgaaaatgaaaatctaacaaacaaaacaatattaacgagagatgtttattttcca
tcagaaaaaatagttgtaaaaacaaactttaaaccaaatactgcatatataataactccc
gataataaaataatacgattaaaagttcataaaaaagggaagttttatgttttatccaca
aaactaaaaaagaatgttatattaggaaattattcagttgtaattgatggaattaaaaaa
acttttgctgttgattattataaaattaacgctaaattgataaacaatagatttatcgtt
ggaaatgtctcttactatgttaaagaaccaaagtttttaaccctcattatttatccaaat
aaaaaagagattgatgttccattgattaatggaacatttgatattcctttagattatttg
gttaataagttaaatatatcaaaacctgaaaaaattaaaaaaatagttttaatatgtgga
aatgcagaagaaaaaataaaaatcaaacttaaaaataaagaaaaactaaaaaaattaatt
tcttatgatcccgttaataaagaggtagttattaaaattgaaggaaataaaaaagatgtt
gaaaaaattttaaaggaatataaaaaagggaaatactacatttcaaaaataatggacatt
aataaccatacaacaatagagattagggttaaagcagatgaagaaattttaaaagattat
ggactaccagtagatgttataaaaactactgaaactataaagaaaataagtaataataaa
attagggttgaagttaataacaaattagatggtatttggtatagatttagctgtaagatt
ccaaaaggttatagggttaaagaaattgtaggagatgatggtagaataataaaaaataat
atttcaataaacagattaactggagaagttgttggagaagtaagatggtatattgaaaac
aacacactatacttctatgacgacccaatttatggatatgatatatctttaattccacca
gctccaaataattcaatcgctgttgaattgtcttatgatgggcaagataatggtggatgt
gggcaaatatctgcaattgtatttccatacagtgaaggagataacatatcaacaattgaa
acatacgaccatgcagggagaactggagattacgattatgcaaataatattgatgccgat
gcaggttctaagatagcaataaaatatacaagcggaatacgaacaaggcagtatggaaat
ggtggagactattatgaaactgcatcgttttacttatctgagataaatagaacagacgtt
cctttaaatactgttccaaatggagttttagaaagcgtgattataacgaatatgtatgct
ccatggactaacaatgagttaaatattactcaaaaagtaatcattagaggaaataataag
tggtttgctaccatatactacataaaaaacccaacaacaaaaacatacacaaatttaaag
ttctttcaggggatggattggaatttcagaggaagttatcagaaggacaatgcatattac
aacaatgccaacgatgttgtatatgggtatgactctgacgctccgtcgggagatatacaa
tatggtggttttaaatcaattcttccaagttatgagcatgatgttaatccttattggcgt
atgtgggacgatatcaaatatgataatttaaataactattcgtcatataatggggacgcg
ggagttgcattagcatggactaagagctcattaaaaccaggagaaatttgggtagttcca
ataatttggggattaggatataattttactgacatgatgaatgaaataaacatgggatta
agtcaattatacgatactggggttaaaactataaactatccaaataatggggatgtattt
aatccaaatcttcaaccaataatatatgtaaattcaacaatagctttgtatgggttggta
gatgcatacaatttaaatgtttcaattaatgtgactcaaattaatgggacttacacttat
acaaactcaactctaataaacctatcagtcccttatgaagaggaaaaaaccatatctttc
ccaataaatatctcaaacatgccttatggagcttacaatataacaataaaaacaaatctt
ccaaatgaccaaaatacatcaaatgatgaaaaaagcattataatttatatttctccattc
tcaatagaaccagaatatcaagaaaaaactggaaatgctggtgaggaaatattctacaat
ataactctatataactttggctctggagaaagatttgatataaatataacaaactcaaca
aagggctggacaacatgcatatataataactccactctaatagctgaagataccaatgga
gatggaatttgggactatataagtccaaactatgatttaaatgcaaataatttgccagat
atttatgtaccacatggagaattaaatttaacagtttcaaaggtaattccacctacaact
ccattaggagagattgatttaacaactttgaaatttgttaatacaaataatccatcgata
tatgatattgcatcattccaaacatcaacaccattccctccatcagttcaaaaaactttc
tacttgcatggagattcttcaagaactttaaacacatctattcctacagagatagataat
tatacaacaattactggaaattcattagcttcatggacacagattccaagatttgcagac
gactttactgttgttggtaatatatccatcttactgtatatgagcgacccagatgttttg
ggaggatttgaaactcataaaatagtagtttcactaatagccactaatggagttaattca
attactttaggaagtgatacagaagatttaaacctatatagcacaacacgtccatacact
ttcaatattcctttaaattcaatagttacaataccaaaggattactacttaattttaaga
gtggaaaaccttcaatcaacaaattcaataaacatctatcatgattccacttatgtatca
aacataacgctaaatacaacaacctacgtagaagttcagaatatatacgctgacaaagat
gtttatattcctggagacactgctacagtatttgtaaacattacagacccaattggaagc
tatgacataaaaggggcaaatatagctgtttattatccaaacggcaccctatatattaat
gattctatgaatctgcaagaggtcgatgcaaacactccatcactttggaaattatttaat
tactcatttaaagttccagtctctggaaactacaatatcacaataacaggaatagaatct
aatggagttatctataaaaaagattatgttttatgtgtgggttatgagattcaaggatat
gttaaagaggattttggaacattaggggttgaagacagttcagataaaggagtttatgat
gtgaatgtttctctatttgaagatagcaacaacaacggtgttcttgataaaaacgataaa
atgataaactctacaacaacagatgtatttggatattacaagtttttggtctataacaca
tcaaaaacttactttgtagcagtaaattcaaagactatttctccaacaagaggatataac
caaggatacaacataaatgatgtttgggcagaagaaacatatcaaacattatatgctcca
ataaatacatcacaatggattgcaaatgggaatgcaactgtatcaacaaacaaactccta
ctaactcctgatgattataatcaggtgggtagtgtttggtattatgagccggttaatttg
tcggaggattttgttattgagtattatgcttatttgggggataatccagatggtgcggat
ggtgtaactttcacattgcaaccgaatgggttaagtgaatggggtggggctggaggaggt
ttgggatatgcaggaataactccgagtgtggcagttgagatagacacttggcttaatgac
tttgactacccagcaactaccgaccacattgccatagacgttgatggaatcgttaatcac
acatacaacaacataacattcctaaccccaaacccttacgacttaggaaatgtagaggat
gggacagaacataaagttaaaattgtatggaatgccacaacaaaacaattaaccgtatac
tttgacggaagccaagtattaacctggaacaaagacataacacaaatacttggaaccacc
gcatacttcggattcacaggaggaacaggaggagcaaaaaacctacaatacatcaaacca
acatacgcaaaaaacgggaattcctacataataaagccaacctatagtattgtctcaatg
tttggtggaagaaatcctggcaaaagtgatgattggaatactggagattatgagcattac
tgcacagttgatttaaataactatcatggagagaatataacctttggatttagctttgac
gtcataaccaacacaaatcctgtagggcaaggaagtttcgctcagtttataaaaaatgct
aatgctattgttggtgaagataaagcctactttaaaattccaaagacagaactacatgga
aaatattacgtaatatatacaaacaataacagcattgtggataatttaactgtaatcaat
ggaagcacacaggtagatggagatgtattgttatctggatcgcagtggattgctaatggg
gactcatacataaacaactctgaaaatttaactttaattataactcctgatgattataat
caggtgggtagtgtttggtattatgagccggttaatttgtcggaggattttgttattgag
tattatgcttatttgggggataatccagatggtgcggatggtgtaactttcacattgcaa
ccgaatgggttaagtgaatggggtggggctggaggaggtttaggatatgcaggaataact
ccgagtgtggcagttgagatagacacttggcttaatgactttgactacccagcaactacc
gaccacattgccatagacgttgatggaatcgttaatcacacatacaacaacataacattc
ctaaccccaaacccttacgacttaggaaatgtagaggatgggacagaacataaagttaaa
attgtatggaatgccacaacaaaacaattaaccgtatactttgacggaagccaagtatta
acctggaacaaagacataacacaaatacttggaaccaccgcatacttcggattcacagga
ggaacaggaggagcaaaaaacctacaatacatcaaaccaacatacgcaaaaaacgggaat
gaattgctaaatttagatgcaatttctaaaaatcctgtaataaataatttagcatataat
acaacgatatcaaacatcaattttgaaaatgtatctgtagcaatcctcggaaacgaaagt
ggattgaactacttaaaaattacgaatgttagtgtctttggaaacattctaaaagcaggt
attgagttgctcgactataattggaatatgcaggagtatccagcctatatgactaatata
catataaattcttcagatgcgtatggaattgaaatgctaaataggatatggttaatattt
gaagattcattgatagagatgcacaatggtattggagtatattgggcaaattgggctgga
ggttatggaaacttaacaatggaaaatataagtataaaggagtgtaatcatggaatttac
ttctacaaaaatggaaatattgcaagcataattaactcaaaaattgaaaactctgcatat
gaagggatttacataatagattccaataacatatcaatactaaatacttccataattaac
aactctattggaatattttcgaataactcctccattagtgtggaaaattcaacagtattt
aataatagatttgaaggaatttatgtagagaattcaaatataacaacatataatttgagt
gtatcaaataacagcattggaatttatattaaaggttttgggaacaataagataagtttg
tcgagaatattttataacaactatggtgttgaagtagttaattcctctaagatattaatg
aactcatcagaaatattcaataactcaatcgatggaattgcagtatttaatggagataat
ttaacaataacaaataacagaatttataacaacaattactctttcttatcatacggaaat
ctcactaatgttttcatctacaacacttcatttgaaaactcaacaaataaaagtttagat
attgaagtgccttcaaattcagtattaaataacttaacaatattggattcaaaaatattg
aatagtggagagtatggcttatatgtctattcattaggagatagctctaatttaaatatt
tcaggcaatttcataaatgcttcatttagagatggaattttaatatttggagttaatgat
atagagattttaaataacaacattaccaataatggattaatcggaggagacccagcagga
gcaggaattaaagttattggctacaacactgctaatgtaactatagaaaacaacaactgt
tcaaacaatggaggaaatgggattgatgtagaagattattatggaaattatttgagaaat
gtaacaattgaaaataactatttatcaaacaatggaattgaggcaaatgctggaaacgcc
ctctttattggaggaagagtagagaatgttttagttaaaaacaatattatgcagtacagt
gatgctcaggcaattttaattcaagaaccaaatggatgggcaacatgggcatggattggg
acgaatataacaatagataataacacaattcaatacaacggtttaacggttgaggcagga
aatgtaacggcaggaataactattggagcttatggaaactacaaccaagatgatggttac
ataataattaaaaataacaaaataataaacaacaatctctgcccaaacccaagttatggt
ggaaaagttggaggaattgagatttatggattaaatgagagttggattaacttagagttc
aatataaccaacaatataatagcaaataattctgcctatggaatctcagtagcagcaagt
aaagacatcaatatagttaataacacaatatacaacaatgaaaagggaataacccttcca
acttatgattctgctcctcataacataataatatctaagaattcaatttacaacaactcc
atgttgggaattgacttaaatgatgataatgtaacattaaatgatggtctaattaatcca
aatgaggcaaattatggtattgattatccaataattacttatgctgaattagttggggat
aacttaacaattaggggatacattggaaatggaacgggtagttcaaactttgcaaatgca
atagttgagattttcttagttaaaaattcaactggtggagacaacttaataggaaataat
atttcttcagacggaacaacattagacgacacctatggagaaggatggatttatttagga
agtttaatagctgatagtaatggctttttcaatggaaccttaaatgtctctggaaaaggt
gttgattatgactctatattaactgcaacagctacaataaatggttatggaacttctgaa
tttgggagaaactacctcttaattaaaaagtttttcaatataactggaagtataacaatg
cttccaaacggctacaatataacaataaagtcgtacaacacaacaagagatgtttatgtt
tattggtataagccaaatgatattggagttataaacatttcaggagattataacgaaaat
ggaacaaatggaaacacatactggttcaagtttaatataataaatgcaaatgaagtaaaa
aagatttcaataacaactaatacaacgacaattgaaggccttattataggcatagaccca
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
