Megamonas funiformis: GXM21_08205
Help
Entry
GXM21_08205 CDS
T06475
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
mfun
Megamonas funiformis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mfun00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mfun02000
]
GXM21_08205
Transporters [BR:
mfun02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GXM21_08205
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIB60374
LinkDB
All DBs
Position
complement(1614610..1616631)
Genome browser
AA seq
673 aa
AA seq
DB search
MRLSTKKQQTLLTLSVLLGLSSPVYAQDIQNNDVIVTPDVVVTATRTQEEVKAVPQTVEV
ITKEDIEQLGATDVYSALRLAANVDVTSAGMAGHNVMIRGMSTNHTLILIDGKRFAGEDT
SATQNVYALGRLSLSNIERIEIVRGSASAQYGSDALGGVINIITKKSKEPSVMVGLSTGS
EAINNYYHIDFGKQGNFSSTFDMRFSDVRKNMQAGDEGSNYYGPIQDFNFAGTWDLGNDK
EIDLTLGYYNEHTKADYADKYTSTGVFQTSKDKKEWYDYRRYDYSLGYSGKTDNSDYMIR
TFYSRLDKENNLYNYRNNFPGPMENILGSMYPKYDWDKSTYTLWGIEGKNTVQLSDNHLL
TFGGEYRQNKVEGTRLSDGGDNVHQVSQSGNGIVSNKYYSDKEINTWAGYIQDEWQVNDK
LLVIPSMRYDHDSSFGGEVTPKIGATYFISDNSRIKANWGKGFKAPTISELYMAMHRAMG
GQTVNVYGNPDLKPEKSTSWDISFEAEKDNNFGKLTYFNNDVKNLITTKQIGSSYYDQRY
INVDEAEIDGVEMEIGRNLDDKWTIKATSNWLDATDKVSGDRLDNRARNMTTLQLLYDDH
DDWGYSAILWQQWTNKYHYDDNDYNFNTTNFVLNKKFGEGNRVYAGVDNIFDKKISDIGL
DGMIWRLGAEWTF
NT seq
2022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagattatctacaaaaaaacaacaaactttattgactttatcagtgttattaggttta
tcaagtccagtatatgcacaagatatacaaaataatgacgtgatagttacaccagatgta
gtagttacagcgacacgaactcaagaggaagtaaaagctgtaccgcaaactgtagaagta
attactaaagaagatattgaacaattaggagcaacagatgtttattctgcacttcgtttg
gcagctaatgtagatgtaacttcagcaggtatggcaggtcataatgtgatgattcgtgga
atgagtacaaatcatactttaattttaatagatggtaaaagatttgctggagaagataca
agtgccacacaaaacgtttatgccttaggtcgcttgagtctgtcaaatattgaacgtatt
gaaattgtgcgtggcagtgcttcagcacaatatggttcagatgctttaggtggagtaatt
aatatcatcactaaaaaatcaaaagagccatcagttatggtaggtctttctacaggatca
gaagctataaataattattatcatatagattttggtaaacagggaaatttcagttctact
tttgatatgcgttttagtgatgtacgcaagaatatgcaagccggagacgaaggcagtaat
tattatggccctattcaagattttaattttgctggaacatgggatttaggcaatgataaa
gaaattgatttgacgcttggctattataatgaacatacaaaagcagattatgctgataaa
tatacatcaacaggtgtttttcaaactagtaaggataaaaaagaatggtatgattataga
agatatgattatagcttaggctatagtggcaaaactgataatagtgattatatgattagg
actttttatagtagattggataaagaaaataatttatataattatcgcaataattttcca
ggaccaatggaaaatattttgggttcaatgtatccaaaatatgattgggataaatccact
tatacgctttggggcatagaaggtaaaaatactgtgcaattaagtgataatcatcttttg
acatttggtggcgaatatcgtcaaaataaagtcgaaggtactcgtttgagtgatggaggt
gataatgtacatcaagtaagtcaatcaggaaatggaatagtgagtaataaatattattca
gataaagaaataaatacatgggcaggatatatccaagatgaatggcaagtgaatgataaa
ttattagtaattccatctatgcgttatgaccatgatagttcttttggtggggaagttaca
ccaaaaataggtgcgacatattttatcagtgataatagtcgcattaaagctaattggggt
aaaggcttcaaagctccaactattagtgaattatatatggcaatgcatcgtgcaatgggt
gggcaaactgtcaatgtttatggcaatccagatttaaaaccagaaaaatctacttcatgg
gatatcagttttgaagctgaaaaagataataattttggtaaattaacatatttcaataat
gatgttaaaaatttaatcactacaaaacaaataggtagtagttattatgatcagagatat
ataaatgtagatgaagctgaaattgatggtgtggaaatggaaattggtcgcaatttagac
gataaatggacaataaaagcaacaagtaactggcttgatgcaacagataaagtgagtggt
gatcgtttagataatagagcaagaaatatgactacattgcaattattatatgatgatcat
gatgattggggatatagtgcgattttatggcaacaatggactaataaataccattatgat
gataatgattataattttaatacaactaattttgtactcaataaaaaatttggtgaagga
aatagagtttatgcaggtgtagataatatttttgataaaaaaattagtgatattggttta
gatggtatgatttggcgtttgggtgcagaatggactttctaa
DBGET
integrated database retrieval system