KEGG   Mesoplasma florum W37: mflW37_2960
Entry
mflW37_2960       CDS       T02878                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III polC-type
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mfw  Mesoplasma florum W37
Pathway
mfw03030  DNA replication
mfw03430  Mismatch repair
mfw03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mfw00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    mflW37_2960
   03430 Mismatch repair
    mflW37_2960
   03440 Homologous recombination
    mflW37_2960
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mfw03032]
    mflW37_2960
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mfw03400]
    mflW37_2960
Enzymes [BR:mfw01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     mflW37_2960
DNA replication proteins [BR:mfw03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     mflW37_2960
DNA repair and recombination proteins [BR:mfw03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     mflW37_2960
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T PHP DNA_pol3_finger DNA_pol3_a_NII DNA_pol3_a_NI HHH_6 RNase_H_2 tRNA_anti-codon Rv2179c-like DEDDh_C DUF3310
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGY41363
LinkDB
Position
1:336169..340650
AA seq 1493 aa
MSDNKVLELFQKLKINLNEGELSYFEHSEIEKATISSLKSKLRLSLKIKNFLPIRVLSEI
HEKCVGSEEIKIKLILNVQNQRIDKELICEYIEFIKNFKSQNKTIIWNFIEAEGFEYDAD
ENLIKFVVDSNELKNQLTTELEYCLAKLKQFGFKELSYDIQVEDKTEEYIKQSLIIEQQT
KEQYKQFAPEPTEKSQNMIISKQKSQKWNQSLDKPSYDSFEYIEEDAQNIVLHGKVMSID
IRDSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGKEDERTIMDPLTEEELSSDRIEEIKNKRIAK
GDWIAVKGKTSYSQFDKEQNFIIEKIGKISRSEAMVKDDSEQKRVELHLHTKMSAMDGVS
SIQDYLQMVDKWNWKAIAITDHINVQTFPDAYNELKKINKNKAEEDKLKLIYGLEMNMIE
KEDYWIVKNPKGQKIRESKMVVFDLETTGLSPEFNEIIEFGAVVFDPVTGKTTKYDYLFK
PKQPLKQFTIDLTNITPEMLEDKKNIDDDFDKIYELIKDSILVAHNANFDFNFLNSLSKR
LGYGELQNTVIDTLTLSRLVRPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFF
KIIAELKLTTPIIYDADLIKLEPENDKDNINLLRSRGAHVNVLAKNQQGLKDIFKLVSIS
HTDNFFNSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFETARIGTDEKLEEIIPFYDYIEI
QPLSVYKNLINDNQLEEHELIDVIKKIIRLAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYIN
AKGLGGSRHPLFSFRNKNKLIDYPDQYLRTTNEMLKEFAWLSEPALVQEMVITNTNKIAE
MIDSNIIVIKDGLFTPNIENVDTLLKDKCYETAHAMYGDVLPEIVESRLEKELTSIIKHG
FAVVYWISHLLVERSNNDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFN
TPIEIKCGYDLPEQNCPKCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHN
FTKEMFGENNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKAFYEETGVLEEDMPRKIEIERQAKLVEGVK
RTTGQHPGGIIILPKEFEIEDFSPVNFPADDASSSWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVD
PTALRMLGDLTGVNPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFV
RSMLRETKPKTFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKNNTANISTVIGCRDDIMVYLMGQ
GIDATTSFKIMESVRKGQGLRKEWKEIMLAHNVPEWYIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMA
YRIAWYKIYYPAEYYATFLTNRADAFDLKTFLGGYNGVREKLMELESRKNKKDKMTTKEL
ALMPVLEIGLEMFSRGIKMANLNFEKSLADKYIIEKDEITGEATLYPPFLVIDSLGDAVA
DSIIKARSERPLTSVKDLTMRTTITQTQMKIFEQLNVLDTLAQDEQLEFDFFN
NT seq 4482 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcagacaataaggtattagaattatttcaaaaattgaagatcaatttaaatgaaggc
gaactttcatattttgaacattctgaaattgaaaaagctacaataagctctttaaaatca
aaacttagattgtcattaaaaattaaaaactttttacctataagagtattaagtgaaatt
catgaaaaatgtgtcggatcagaagaaataaaaataaaactaattttaaatgtgcaaaac
caaagaatagataaagaattaatttgtgagtatattgaatttattaaaaattttaaatct
caaaataaaacaattatctgaaactttattgaagctgaaggatttgaatatgatgcagat
gaaaatttaattaaatttgttgttgattctaatgaattgaaaaaccaattaacaactgaa
ttggaatattgtttagctaaattaaaacaatttggttttaaagaacttagttatgatatt
caagttgaagataaaacagaagaatatataaaacaatctttaataattgaacaacaaact
aaagaacaatataaacaatttgcccctgaaccaacagaaaaatctcaaaatatgattatt
tcaaaacaaaagtctcagaagtgaaatcaatctttagataaaccaagttatgattcattt
gaatacattgaagaagatgctcaaaatattgtcttacatggtaaagtgatgagcattgat
ataagagattctaaagcaaataatcgtaaaatatattcaattggtttaacagataataat
tcatcaatcaaatgtatatattttggtaaagaagatgaaagaactattatggatccttta
accgaagaagaattatcatcagatagaattgaagaaattaaaaataagagaattgctaaa
ggtgattgaatagctgttaaaggtaaaacatcttattcacaatttgataaagaacaaaat
tttattattgaaaagataggaaaaatatctcgatcagaagctatggttaaagacgattca
gaacaaaaacgtgttgaattgcatcttcatactaaaatgagtgctatggatggtgtttca
tcaattcaagactatttacaaatggttgataaatgaaattgaaaagcaatcgcaattact
gatcatataaatgttcaaacttttcctgatgcatataatgaattaaaaaaaattaataaa
aataaagctgaagaagataaactaaaattaatttatggtcttgaaatgaatatgattgaa
aaagaggattattgaattgttaaaaatcctaaaggtcaaaaaataagagaatcaaaaatg
gttgtattcgacttagaaacaactggtttatcacctgagtttaatgaaatcattgaattt
ggtgctgtagtttttgatcctgtaactgggaaaacaaccaaatacgactatttatttaaa
ccaaaacaacctttaaaacaatttacaatagatcttacaaatataactcctgagatgtta
gaagataagaaaaatattgatgatgattttgataagatttatgaattaattaaagatagt
attttagttgctcataatgcaaactttgactttaactttttaaatagcttatctaaaaga
ttaggatatggtgaattacaaaatactgttattgatacattaacactttctagattagtt
agacctgctttaaaatctcataggttaggagcagtatgtaaaaaatttggtattttatac
gatgaacatgttgctcaccgtggagattatgatgcagatgttttaaacgatttattcttt
aaaataatagctgaattaaaattaacaacaccaatcatttatgatgctgacttaattaag
ttagaacctgaaaatgataaagataacattaacttattaagatctcgtggagctcatgtt
aatgtattagctaaaaatcagcaagggttaaaagacatatttaaattggtttcaatttct
catactgataacttttttaactctcctaaaatatttaaggaaaaattaaaagaatttaaa
gaaaaaaataatattttaattggagctggttgtgtaaactcagaagtttttgaaacagct
agaattggaacagatgaaaaactagaagaaatcattcctttttatgactatatagaaatt
caaccattaagtgtttataaaaacttaattaatgataatcagttagaagaacatgaacta
atagatgtaattaaaaaaataattagactagctaaaaaatataatgtaatgctagttgca
acaagtgatgctcactatacaagacctgaattgaaaaaaattcgtgatgtttatattaat
gcaaaaggacttggaggaagtagacacccattatttagttttagaaataaaaacaaatta
attgactaccctgatcaatacttaagaacaactaatgaaatgcttaaagaatttgcttga
ttaagtgaacctgctttagtgcaagaaatggttatcacaaatacaaataaaatagcagaa
atgattgattcaaatatcattgttatcaaagatggtttattcactccaaacattgaaaac
gtagatactttattaaaagataaatgttatgaaacagcacatgcaatgtatggtgatgtt
ttacctgaaatagttgaatcacgtttagaaaaagaattaacatcaattattaaacatggt
tttgctgttgtttattgaatttcacatttactagttgaaagatctaacaatgatggatat
cttgttggttcaagaggaagtgttggttcttcatttgtagcaactgcttcaaagattact
gaggttaatccattaaaagctcattatagatgtttaaactgtaaatattcagattttaat
actccaattgaaattaaatgtggatatgatttaccagaacaaaattgtccaaaatgtaat
gaaaaattaatcggtgatgggcatgatattccatttgaaacattcttaggatttgatgga
gataaagttccagatattgatttaaacttttctggagaataccaaccaattgctcataac
tttacaaaagagatgtttggtgaaaacaatgtatttagagccggaacaatttcaacagtt
gctgaaaaaactgcttttggatacgtaaaagcattttatgaagaaactggtgtattagaa
gaagatatgccaagaaaaattgaaattgaaagacaagctaagttagttgaaggggtaaaa
agaacaacaggacaacaccctggaggaattattatcttacctaaagaatttgaaattgaa
gatttctctcctgttaacttcccagctgatgatgcatcaagttcttgaaaaacaactcac
tttgatttccactcaattcatgataacttattaaaaatggatattctaggacacgttgac
ccaactgctttaagaatgcttggtgatttaactggagttaatccaatcaatattccaaca
aatgatccaaaagtatattcattatttagtaatctatctgctttaaatataaaaccagaa
caaattaatggagaaacaactggagctattggtttacctgagtttggaacaggatttgtt
agatcaatgttaagagaaacaaaacctaaaacatttgctgacttagtgcaaatttcagga
ctatcacatggtactgatgtttgattaggaaatgcaagagatttaattaaaaacaataca
gcaaatatttcaactgttattggttgtcgtgatgatattatggtttatttaatgggacaa
ggtattgatgctactacttcatttaaaataatggaatcagtgcgtaaaggacaaggttta
agaaaagaatgaaaagaaattatgctagcgcataatgttcctgaatgatatattgaatca
tgtttaaaaattaaatatatgttccctaaagcccatgctacagcttatgtattaatggct
tatcgaattgcttgatataaaatttattatcctgcagaatactatgcaacatttttaact
aatagagctgatgcttttgatttaaaaacatttttaggtggttataatggtgttagagaa
aaactaatggaattagaatcaagaaaaaacaaaaaagataaaatgacaacaaaagaatta
gctttaatgccagttctagaaattggattagaaatgtttagtcgtggaattaaaatggct
aatttaaactttgaaaaatctttagcagataaatatattattgaaaaagatgaaataact
ggagaagctacattatatcctccattcttagtaattgattcacttggagatgctgtggct
gattcaattattaaagctagaagtgaaagaccattaactagtgttaaagatctaacaatg
cgaacaacaattactcaaacacaaatgaaaatatttgaacaattaaatgtattagatact
ttagcacaagatgaacaattagaatttgacttttttaactaa

DBGET integrated database retrieval system