Methanosarcina flavescens: AOB57_010250
Help
Entry
AOB57_010250 CDS
T05666
Name
(GenBank) cell surface protein
Organism
mfz
Methanosarcina flavescens
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NosD
Beta_helix
Pect-lyase_RHGA_epim
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYK15514
UniProt:
A0A660HT93
LinkDB
All DBs
Position
2328778..2331390
Genome browser
AA seq
870 aa
AA seq
DB search
MKQVKETSRMIFIVALTLQLMTAGSAAAAMIYVGNSTDQVVNFTSIQAAVDAANPGDEII
VKPGIYEENIVITKNISIVSESGNFSDTIIRAADSSQDALCIWTNGVSIKGFSINGSESA
GIHFFGVIDCRVENNKLSNNSCGIDLYMISSRNTIDNNEISDCTTGISISGSWNNNLSNN
SISNCSNGVSLFDSPNNIIENNIISENIEGISLTGESNGNTLSNNNVVLNEELGIHIYEA
SGNLIYNNYFNNTLNVKSNAIWDTNIWNITRTEGINIAGGPYLGGNVWTRPDGVTYPQGV
RDADFDGILDSQYSIEGTQFTDYLPLKELKPVTLTVNNSTGQAADFTSIQAAIDNAFPGD
TVLISPGIYEENVDVYVTNLTLTSEPGSSGDTIVRAASALDDVFYVIADGVTIRGLNITG
PVDSPNAGIRLNGVKHCNIENNQISTYSDILNASIDNLNTSSENSSLILNNSSSETGFGI
LLDSSSTNILDNNTVSGDGTLILLRSSTENKLNNNSVSGSNYGILVDSSSNNTLNGNNLS
NNEVGAYLKTSSGNILNNSTVSNNTVSGIYLWDSVGNTLSNSTASRNNASIVLQNSSSNL
IDNNTVSSSNYGFWLYSSSNDNKLDGNTALNNRIGVHINASSGNVLTDNTALNSIRSGIS
LWDSVENTLINNAASGSDNSIFLHNSSKNTLVNNTVSNSSYGMWVAFSSNNNLSNNSASN
NTFGLYLKNSTANRLSDNWISSNSRLGIYMGFSRSNILSKNRIISNSEYGLYMLESGNSS
IYNNYFNNTNNTYLRGLNIGTNLNTTLVRSENILNGDYHGGNFWATPEGDGFSQTHTDKD
GDGICDVAYIVDKEFVDYLPLADPRTINQS
NT seq
2613 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcaagtaaaagaaacatccagaatgatttttatagtagctctcacgcttcagctg
atgaccgcaggaagtgcagcagctgctatgatttatgtaggtaacagtactgatcaggtt
gtaaacttcacttctatccaggctgcagtagatgctgcaaatccaggggatgagataatt
gtcaaacccggtatttacgaagagaatattgtaattaccaagaacatatccattgtctca
gaatccggaaatttctccgataccataatccgggcagctgatagttctcaggatgctctc
tgtatctggacaaacggcgtaagcattaaaggttttagtattaacggatccgaatctgct
gggattcactttttcggggttattgactgccgagttgagaacaataaactgtccaataac
agctgtggtatcgatctatacatgataagttcacgtaacacgattgataataatgaaatc
tcagactgcaccaccggcatcagcattagtggaagctggaacaataatttgagcaataac
tcaatctcaaactgcagtaacggtgtttcactttttgactcccctaacaatatcattgag
aataatataatctcagaaaatatagaaggcatttctctcacaggcgaatcaaacggcaat
accctgtctaataataatgtagttctcaatgaggaacttgggatacatatttacgaggct
tcgggcaatctgatttacaacaattattttaataacacactgaacgtaaaatccaatgcc
atttgggacacgaatatctggaacattaccagaaccgagggtattaacatagctggtggc
ccttacctgggaggtaacgtctggacaaggcctgatggggttacatatcctcagggagtc
cgggatgccgactttgatggaatccttgattcccagtacagcattgaaggtacccagttc
acagattatcttcctctcaaagaattaaagcctgtaacgcttactgtaaataacagtaca
gggcaggctgctgattttacctctattcaagctgcaatagacaatgcgttcccaggtgac
acagttcttatttccccgggaatctatgaagaaaacgttgatgtatacgtaacaaactta
acccttacttccgaacccggtagcagtggtgataccattgttagagcagccagcgctctg
gacgacgttttctatgttattgcagatggagtgacaattcgcgggctgaatataacagga
cccgtagattccccaaacgcaggcatccgtcttaatggagttaaacactgcaatattgaa
aataatcagatatctacctacagtgacatattaaatgcttccatagataacttaaatact
tccagtgagaacagttccctcattctcaataattcaagttcggaaacaggatttggaatt
ctcctcgactcttccagcaccaatatactggacaataatactgtgtccggggatggaacc
ttaattcttctccgcagttccacggagaataaacttaacaacaattcggtatccggaagc
aactacggtatcttggtagactcctccagcaataatactctgaacgggaataatctgtca
aacaatgaagtcggtgcctatctaaagacttctagcggaaatatccttaataacagtaca
gtatcaaacaacacagtttccggtatttatctatgggattctgttggaaacacattgagt
aattccacagcatcgagaaataatgcttctattgttctgcagaattccagttcaaatctg
attgataataacactgtatccagtagcaactacggtttctggctgtactcttccagcaac
gataataagctagatggcaacacagcattaaataacaggatcggtgtccatattaatgca
tcaagtggaaatgttcttacagacaacactgcattaaacagcattagatccggaattagt
ttatgggattcggttgaaaacacgctaattaacaatgcagcttcgggcagcgacaactcg
attttcctgcacaattccagcaaaaatacacttgtcaataatactgtatctaacagcagt
tacggaatgtgggttgctttttccagcaacaataacctgagtaataatagtgcatcgaat
aatacattcggtctctacttgaaaaattccactgccaatcgactgtcagataactggata
agctcaaattccagactcgggatctatatgggcttctcaaggagtaatattttgagcaaa
aacaggattatctccaactcggaatatggactttacatgttggaatccggaaacagctcg
atttataataattatttcaacaacacaaacaatacctatcttagaggcttaaacataggt
acgaacttgaacacaaccctggtacggtcagagaatatcctcaatggggattatcatggg
ggaaatttctgggctacaccagaaggagatggctttagccagactcacactgacaaagat
ggcgatggtatctgtgatgtagcttatattgtggataaagagttcgttgattatctgcct
cttgcagatcctcgtaccataaatcagtcctga
DBGET
integrated database retrieval system
