Mycoplasmoides genitalium M2321: CM9_00420
Help
Entry
CM9_00420 CDS
T02209
Name
(GenBank) excinuclease ABC subunit B
KO
K03702
excinuclease ABC subunit B
Organism
mgc
Mycoplasmoides genitalium M2321
Pathway
mgc03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mgc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
CM9_00420
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mgc03400
]
CM9_00420
DNA repair and recombination proteins [BR:
mgc03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
CM9_00420
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
Supressor
CM9_00420
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UvrB_inter
UvrB_3rd
Helicase_C
UvrB
UVR
ResIII
DEAD
AAA_30
AAA_22
AAA_19
AAA_7
AAA
P-loop_SecA
partial_CstF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFQ02889
LinkDB
All DBs
Position
96911..98881
Genome browser
AA seq
656 aa
AA seq
DB search
MKNQTKSNSLFQLSTNYIPTGDQPEAIKKLSEFKTKQQVLLGATGTGKTFTIANVIQNSQ
LPTVVIAHNKTLAGQLFNELKQLFPKNAVEYFISYFDFYQPEAYLPSKGIYIEKSATVNE
AIKRLRVSTLHSLSTRKDVIVVGSVASIYPTSSPSDFVKYCLWFVVGKDYDLKTIKDRLV
SLNYVVNKQQLTPGKFRFQGDVLEVFPGYSDAFAIRISFFDTKVEQICQIDPLTNKILNQ
LFEIKIGPADEYVVNQSDLDIAIKNIKQELQERVNYFNKQNLVERAQRLATITNHDLNDL
KAWGFCSGVENYARHLELRMANSTPYSIFDYFKGDWLLVIDESHQTLPQLNGMYNTDLSR
KQSLIDYGFRLPSALDNRPLSFAELQQKMQKVIYVSATPRDKEISLSQNNVIEQLVRPTY
LVDPIIVVKPKDNQVEDLIEEIINQRQNNTRTFVTVLTIKMAENLTEYLKERKIKVAYIH
KDIKALERLLLINDLRRGEYECLVGINLLREGLDVPEVALVCIFDADIPGLPRDERSLIQ
IIGRAARNEHGRVVMYANHVTEQMQKAIDETKRRRTVQMEYNKLHNKTPKTVVKPLTFVQ
PIKLKAKSNAEKNAALIKQLTKEMKKAAANQNYELAIEIRDSIFELEKEIGSKIKV
NT seq
1971 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatcaaaccaagagtaatagtttatttcaactttccactaactatatacctact
ggtgatcaacctgaagcaattaagaaattatcagaatttaaaactaagcagcaggtttta
ttgggggccacaggcacaggtaaaacctttacaattgctaatgtaattcaaaacagccaa
ctcccaacagttgttattgctcataacaaaaccctagcaggtcaactcttcaatgaatta
aagcaactgtttcctaaaaatgcagttgaatattttatctcttactttgatttttatcaa
cctgaagcttacttacccagtaaagggatctacattgaaaaaagtgctacagtcaatgaa
gcgattaaacgcttaagagtctcaacactgcattcactttcaacaagaaaagatgttatt
gtagtaggttctgttgctagtatttatcccacctcatctcccagtgattttgttaagtat
tgcttgtggtttgtggttggcaaagattatgatttgaaaaccattaaagataggttagtt
agtcttaactatgttgttaataaacaacaattaaccccaggaaaatttcgcttccagggt
gatgttttggaagtatttcctggttacagtgatgcttttgcgatcagaatctcttttttt
gatactaaagtagaacaaatttgtcaaattgacccactaacaaataagattttaaaccaa
ctctttgagattaagataggtcctgctgatgaatatgttgtaaaccaatctgatcttgat
atagcaattaaaaatattaaacaagaacttcaggaacgagttaattatttcaataagcaa
aatcttgttgaaagagcacaacgtttagccaccattactaaccatgatctcaatgatctg
aaggcttggggattttgtagtggagttgaaaactatgctagacacttagagttgaggatg
gctaactcaaccccttacagtatctttgattattttaagggggattggttattggttatt
gatgaatcacaccaaactttaccgcaacttaatgggatgtataacactgatctttcaaga
aaacaaagcttaattgattatggttttcgactcccctctgcacttgataacagaccgctc
tcatttgctgaattacaacaaaaaatgcaaaaagttatttatgtttcagcaactccaaga
gataaagagattagtttaagtcagaataatgtcattgaacagttagttagaccaacctac
ttggttgatcctattatcgttgttaaaccaaaagataaccaggtggaggatctcattgaa
gagattatcaaccaacgccaaaacaacacaagaacatttgttactgttttaactattaag
atggctgaaaacctcactgaatacttaaaggaacgcaaaattaaagttgcctatatccat
aaggacattaaagcattggaacgtttattgttaattaatgacctgagaagaggtgaatat
gagtgtttagttgggattaaccttttaagagaagggttagatgtccctgaagttgcttta
gtttgtatctttgatgcagatatcccaggactacctagggatgagagaagtttaatccag
attattggacgtgctgctagaaatgaacatggtcgagttgttatgtatgctaaccatgtt
actgaacagatgcaaaaagccattgatgaaaccaaaagaagaagaactgttcaaatggaa
tataacaagctacataataagacaccaaaaacagttgttaaaccccttacctttgttcaa
ccaatcaaattaaaagctaagagtaatgcagaaaaaaatgctgcattaatcaaacaatta
accaaagaaatgaagaaagcagcagctaatcaaaattatgaacttgccattgagattaga
gattccatatttgaattggaaaaagaaattggtagtaaaattaaagtatag
DBGET
integrated database retrieval system
