Rasiella rasia: G5B37_06130
Help
Entry
G5B37_06130 CDS
T06461
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
mgel
Rasiella rasia
Pathway
mgel02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mgel00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
G5B37_06130
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Exotox-A_bind
Ig_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIE59149
UniProt:
A0A6G6GKR3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1368336..1374464)
Genome browser
AA seq
2042 aa
AA seq
DB search
MKKTYPTSFFASIILLFSFAAMNAQGPGSLFVDAGPDQALIPGSGGCTTITATFLETFDT
SGSTYAVNSIPYNPPFAFDGLANSIDISTDDVWSPVDTLPFDFCFFGNLEQDFQVGSNGV
IRFDVDAGDTTNGWAFSEDLPNNTNATLAEANVFTPVHDIHPGINPNNEIGYEVLGTFPN
RVLVVSYFEVAMFSGSCNSMEATHMAVFYEYSNVIEIYIRDKPTCTTWNDGNAAVGIQNN
AGDTAYVPPGRNTSDSPWTTNNEAWSFSPVGTETYVFEWLDDMGTVVSTDPVFNVCVPCG
TTTYTARVTYNNTCNGDVVVLEDDIEITFGNFSADLGPDVETCNTDPILLDANTGLTGLS
YEWFYNAVSQGPSTVDDNTFLVTAPNSGTYTVEVFDPGDPTCVVSDSVDINYYPQPIIEN
PADDLFQCDDGVNLGEFDLTVNNAVVLGTQNPAEFTFSYHNSQADADTGANPIMPDTAYP
IATPPLEVIYVRIQDLSGTCFATDEFNIEFSPVSAGPMTDILDLCDQDSDGMVTLNLVAL
KNAEALNGQNPSDYSVSYHPTQLDADNNTNPHPNPYDVTVSPETIFVRVENNNSPGGSCF
ATDSFIVEFFIAPALNMPTPYEICDELPNDGFAEFDLTTKDNEITGGNPDAVVTYYETLN
DAQNAMNVIATPTMYINIVQGFQTVYARAENINSPDCFNVVALDLKVNDSPPLTDPVTDY
IICDNDEDGLEEFDLTSKDGEIANILVNLTITYHTSQADAEAGVGAIATPGAYISGGEII
WARGENIAGCYTVVSFTLILDTIPLFVEVPEFRQCDNDGDGVESFDLNTQNATIVDGDLD
LSVTYHPTELDADDATNELMSPYVSGGEVIWVRVESNSRGCYGVFDMELIVVERPDIFEP
DPLTICDDNNDGFGEFTLTDADDQVVNGNPAGNLVVSYHETLVNAQNNVDPLASPYLNIV
PFNQTVYVRLSDTATGCYNVTTLDLIVLETPEISDPSPLEECDTDGDGVFVFNLTDAEPE
ILAGLTGGPYVVNYYEDPALTIAIANTTAYPNISNPQTLFVTVSDTGNSCLAETTLELIV
NLPPSLNEPMAYTLCDENDPPGEEMEVFDLTSRTAEITGGNIGIVVSFYESLADAQAGTN
AIATPEAYTNLTNPQNIYIRGENATTGCEQTGGVNGLVLELRVDNIPDVEDPTPLVVCDM
DNDGFAQFDLTSKDAEIAGGDPSVTVTYHETLLDAQDGVFALTSPYQNIVADMQTVYARA
VFSMAPNTNGCFDIVELDLIVLPSPTLPLEISPIIACESGGTAVFDLTEREVEILNGQDP
LSFTVSYYELLVDAQAGTNAIAIPTAYANTSNPQTIYVRVSDNTNLCAVTGSFEIEVREP
PMATQPIPFTKCDDLGEPNDGIASFDLTTKDVEIAGAGIGINVSYYLTPEDAQDATNAID
PATAYVNQDPVTGAAINPQTIYVRVDDVTTECEGFTSMTLRVVSNPEPVSPDAIEVCDIN
DPNDGVEVFDLTIREAQILNGENWTLEYYETFTDAVDQTNVIGTPGAYPNISNPQIVYVR
VTNGTIPEMCFEIVELELIVNPLPDASAVVTPLVLCQAPNTGFGLFNLTDKEGEILGGQD
PALFTVSYYESAADAAIMFNPITTPGSYTNLSNPQTIYVGIQNIETECYIAMQEFELRVD
DGATATTPAAPYAICDNTDPNDGIADFTLDDPTDPTSQAQLLRDEILGGQDPTLFLLTYH
ETLANAEGNIDPLGATYTNIVNPQVIYARVSNSANDCFAITEVILKVEQLPILALDEEYR
LCVDADGLPIEAEFGGPSPPVLDTGLSPEDYIFLWELNGAVLIGEVGPSIIATQEGVYVV
TVTERVTGCMQSYTTTVILSSPPTTFDVDVTTGAFAGEHAITATAQGLGTYQFQLDDGAF
QDEGMFNNVAPGSHTVTIQDINGCGSVTVPVGVVDYPRFMTPNLDGYHDTWNIIGIADAD
PTAKIYIFDRHGKLLKQISPTGEGWDGTFNGNPMPSSDYWFVVEYTEDETQKEFKGHFTL
KR
NT seq
6129 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagacttaccccacctcgttctttgcgtctattatactcttattttcatttgca
gctatgaatgcgcaaggcccaggttctttatttgttgatgctggacccgatcaagcttta
ataccagggtctggaggatgtacaacgattactgcaacatttcttgaaacgtttgacacc
tctggttctacgtatgccgtaaattcaattccttataatccgccctttgcctttgacggt
ttggcaaattcaatcgatatttctacagacgatgtttggtctccagtagatacattgcct
tttgatttttgtttcttcggaaatttggagcaagattttcaagtaggctcaaatggagta
attcgctttgatgttgatgctggtgatacaactaatggttgggcttttagtgaagattta
ccaaacaatacaaatgcaacactagccgaagcaaatgtatttacacccgtacacgatatt
caccctggtattaatccaaataatgaaattggatacgaagttttaggaaccttccctaac
cgagttcttgtggtttcttattttgaagttgccatgttttcaggatcttgtaattcaatg
gaagcaacacacatggctgtgttttatgaatactctaacgtaatcgaaatttacataaga
gataagccaacttgtacaacgtggaatgacggaaatgctgcggtgggtattcaaaataat
gcaggtgatacagcctatgtaccccctggaagaaatacaagtgattctccatggaccact
aataatgaagcctggagtttcagtccagttggtacagagacttatgtgtttgaatggcta
gacgacatgggaaccgtagtgagtacagacccagtgtttaatgtatgcgttccttgtgga
actacaacctacacagcacgtgtaacttataacaatacttgtaatggggacgtagttgta
ctcgaagatgatattgaaattaccttcggaaatttttcagcagatttaggtcccgacgta
gaaacctgtaatacagatccaattttgttagatgcgaatactgggttaacagggctttct
tatgagtggttttataatgccgtttctcaaggaccatctactgtcgatgataatacattt
ttagtaactgctcctaattctggaacttatactgttgaagtatttgatccaggagatcca
acctgtgttgtgtcagatagtgtagacattaactattatccacagcctattattgaaaat
cctgcagatgatttgtttcagtgtgatgatggtgtaaatttaggtgagttcgaccttaca
gtaaacaatgcagtagttttaggaacacaaaatccagccgagtttaccttttcttaccat
aatagtcaggcagacgccgataccggggcaaacccaattatgccagatactgcataccca
attgcaacacctcctttagaagtaatctatgttagaattcaagatttgtcaggtacgtgt
tttgcgacagacgaatttaatattgaattctcgccagttagtgcaggaccaatgacagat
attcttgatttgtgtgatcaggattcagatggtatggtgactttaaacctagttgcacta
aaaaatgcggaagcattaaacggacaaaacccatcagattattcagtgagttatcaccca
acacaattagatgccgataacaatacaaacccacatccaaatccatatgatgtaaccgta
tcgccagaaactatttttgttcgagttgaaaataataatagcccaggcggatcatgtttt
gctaccgatagttttattgttgaattttttattgctccggctttgaatatgcctacaccg
tatgaaatttgcgacgagttaccgaatgatggttttgcagaatttgacctgacaacaaaa
gataatgaaatcacaggtggaaaccctgacgcggtcgttacatactacgaaactttgaat
gacgcgcagaacgcaatgaacgtgattgcaacgcctactatgtatattaatatagtgcaa
ggatttcaaacagtatatgcaagagcagaaaatataaatagtccagattgtttcaatgtt
gttgctttagacttaaaagtcaacgacagtccacctcttacagatccggtcactgattat
attatttgcgacaatgacgaggatggtttagaggaatttgatttaacgagcaaggatggt
gagatagcgaacattttggttaatttaacaattacgtatcacacgagtcaggcagatgct
gaggctggtgttggagctattgctacacctggggcttatataagtggtggtgagataatt
tgggcgcgtggagagaatatagctggatgttatacggttgttagttttacattgatatta
gacacgattccgttgtttgttgaggttcctgagtttaggcagtgtgacaatgatggagat
ggtgttgagagtttcgatttaaatactcagaatgctacgattgtcgatggtgatttagat
ttaagtgttacgtatcatcctaccgagttagatgcagacgatgctactaatgagttaatg
agtccttatgtgagtggaggcgaggttatctgggtacgtgtagagagtaatagtcgtggt
tgttatggtgtatttgacatggagcttatcgttgtggagcgtcctgatatttttgagcca
gatcctcttacaatttgtgatgacaacaacgatggttttggggagtttactttgacagat
gcagatgatcaggttgtcaatggtaatccggcgggtaatttggtagttagctatcatgag
acgttggtcaatgctcagaacaatgtagatcctttagcgagtccttatttgaatatagtt
ccttttaaccagacggtgtatgttcgtttgagcgatactgctacgggatgttataatgtt
acaacgttagatcttatagttttagagacccctgagatatcagatccttcaccattagag
gagtgtgataccgatggagatggtgtttttgtatttaaccttactgatgctgagccagag
attttggcgggtctaacgggaggtccttatgtggtgaactattatgaagacccagccctt
accattgcgatagctaatactacggcatatccaaacattagtaatcctcagactttgttt
gtgacagtaagtgatacaggcaatagctgtttggcagagacaactttagaacttattgta
aaccttccaccatcgctcaatgagcctatggcctatacgttatgtgatgagaatgatcct
cctggagaggagatggaggtttttgatcttaccagtcgtacagcagagatcacaggcggt
aatataggtattgtggttagtttctatgagagtttggccgatgcacaggcaggcacaaat
gccattgcgacaccagaggcatataccaatttaaccaatccacaaaacatttatattcga
ggagagaacgctaccacgggttgtgaacaaacaggtggtgtaaacgggttggttcttgag
ttacgtgtagataacattcctgatgtagaagatccaacacctttggttgtttgtgatatg
gataatgatggttttgctcagtttgatcttaccagtaaagatgcagagattgcaggaggt
gatcctagtgtaactgttacctaccatgaaacacttttagatgctcaggatggggtgttt
gcccttacgagtccgtatcaaaacattgtagccgacatgcagacggtatacgcgcgtgct
gttttctctatggctcctaataccaatggttgttttgatattgttgagttagaccttatt
gtacttccttctccaaccttgcctttggagatatcgccaattattgcttgtgaatcaggt
ggtactgcggtgttcgatttaacagagcgagaagtagaaattttaaatggtcaagatccg
ttgagttttacggttagttattatgaattactagtagatgcacaggcgggtactaatgct
attgctatacctacggcatatgctaatactagcaacccacagactatttatgttcgtgtt
tcagataacacgaatctatgtgctgtcacgggtagttttgagatagaggttcgtgagcca
cctatggccacacagcctattccgtttactaagtgtgatgatctaggtgagcctaatgat
ggtattgctagtttcgatttaacgaccaaagatgttgagattgctggtgctggtattggt
attaatgtaagttactaccttacacctgaagatgctcaggatgcgaccaatgctattgat
ccagctacggcgtatgtaaaccaagatccagttacaggagctgctattaacccgcagacg
atttatgtacgtgtagacgatgttactacagaatgtgaaggctttacaagcatgaccctt
cgtgtggtgtctaatccagaacctgtttcgccagatgctattgaggtttgtgatattaat
gatccaaacgatggggtagaggtattcgatttaaccatacgcgaggctcagattctcaat
ggtgagaattggactttagagtattatgagacctttaccgatgctgtagatcagaccaat
gttattggtacccctggggcatatcctaatataagtaatcctcagattgtttatgtacgt
gttaccaatggtaccattcctgagatgtgctttgagattgtagaattagaacttattgtg
aatccattaccagatgctagcgcagtggtaacgccattggttttatgtcaggcacctaac
actggatttgggttgtttaaccttaccgataaggaaggtgagatactcgggggtcaagat
ccagcgcttttcacggttagttattatgagagtgctgcagatgcggccattatgtttaat
ccaattacaacccctggttcgtatacaaaccttagcaatccacagactatctatgtaggg
atacagaatatagagacggagtgttatattgctatgcaagagtttgagttacgtgtagat
gatggagctacggcaacaacacctgcagcgccatacgctatttgtgataatacagaccct
aatgatggtatagccgactttaccttagacgatccaacagaccctacttcacaggctcag
ttgttgcgtgatgagatactcgggggtcaagatccgacgttatttttacttacctatcat
gagactcttgctaatgcagaagggaacatagatccattaggagctacgtatactaatatt
gtaaatccacaagtgatttatgctcgtgtgagtaatagcgccaacgattgttttgcgatt
actgaagttattctgaaagtggagcaattaccaattttggcattagatgaggagtatagg
ttgtgtgtagatgccgatgggttaccgatcgaggctgaatttggaggtccttcaccaccg
gttttagatacagggttatcaccagaggattatattttcttgtgggagttaaatggagcg
gtacttattggagaagtaggtccttcaattatagcgacacaagagggtgtttatgtggtc
actgttaccgagcgtgttacaggctgtatgcagagttataccactacggtgatattgagt
tcacctccaacgacatttgatgtagatgttaccacgggtgcctttgcaggagagcatgcg
ataactgctactgcccaaggtttagggacgtatcagttccagttagatgatggagccttc
caagatgaagggatgtttaacaatgtggctcctggaagtcatacggttaccatacaagat
ataaatggttgtgggagtgtgacggtaccggtaggtgttgtggattatcctaggtttatg
actcctaatttagacggataccatgacacgtggaatatcattggtattgcagatgcagac
cctacggcaaaaatttatatatttgaccgccacggaaaactgcttaagcagattagtcca
acaggagaaggatgggatggaacctttaacggaaatcctatgccttctagcgattactgg
ttcgtggtagaatatacagaagacgaaacccaaaaggagtttaaaggacacttcacttta
aaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system