Candidatus Malacoplasma girerdii: MGM1_3690
Help
Entry
MGM1_3690 CDS
T03441
Name
(GenBank) ABC-type antimicrobial peptide transport system permease
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
mgj
Candidatus Malacoplasma girerdii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mgj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mgj02000
]
MGM1_3690
Transporters [BR:
mgj02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
MGM1_3690
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
OppC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIV03741
UniProt:
A0A097ST23
LinkDB
All DBs
Position
complement(362920..367812)
Genome browser
AA seq
1630 aa
AA seq
DB search
MWNLLKNAFRSLKKNKLSMVGLTFLVFLSTGIFTVLNSATTSINTEYHQISSEGNLHDIT
ISQVYDNGVAKYSNLVEKQQDDNVGSEFYSYLYEQNHLVKTNDGLIAPFFTARTSGNNYL
FRCYYLLDIDNIAKKTAIKEFFLDVINDPIEWNKYDRFLAPTIDIVTAKTNESTALYNYI
TTEQKAYGKNSNKTTDKSFNEIDKLIQSGGLSGSSTISDKLKDAADELYQISGTKDTPLD
QHLKSEYSNRLMFRDFNSLEISNSSDKIFYKGVNSSIDDQIDKLVNIDINNNTNGINWNN
FSVTDATFDILNYELNDHYDLGRTLSYLPSSICKYDIHYLEKVHLLKKANWPSQNQIKID
LDALPGNLSLDNKERQKYWVDNLKQLQKVLSDELAGNEEVFVKDYRITATWIFGDVPSNC
EIDNWTAYFTNVNPEFMEANHKLTAQVNDLKSDAQFNSYIQNHPKITELRTLFIDWMNTL
TYQEIQAFVDSYVSKHNNQTIAPGGNTNFIIIGSGITPDFIYPIVSITRTTPNPKSECIF
FTNNAGYNRVYDGFRGNKTEDYIVAKFTNDISNREQQKILDSINAWAKEEMILSPGIKAA
YFANDTSNVLNASAFRIAFIPSFINDINYVSYTLTLFIILLSLVICAIVINRYITINQSI
LGIMRANGLSKWVIAGSLLPFALIPSLVGAIAGVTLGFGLQWFVLKLLSNYWMLPTSILS
INIFSILIAFGICLLIFMGVIYLTSYWVLNKKTVDTMKTDSQDNPNIIAKAAKTLVSKFG
IITKFRVAVAFSSIWKLLVLVVMTSMTVSSLVFSTSINNKFEYAISKTNASRNYTYAIKL
ATPTTSGGQYIPTRFDYDVSKLEQNDLFLAYGASGFNQAGNDSRDNVYLQSSYYGNSNKK
VTFDLSEVVPWWVPIKEFNVTFNGIDQEQLKGIINVSGTRRDLNDVIDHEYYYSSLALNA
ANDLTHLIPPSKIDEYVAKYIPAITQTDSTGKSVYFSNLFIPFMGDAVGQAYDIFYLKNR
IMTNGTLNYVVGAFGQTSDPWDISSSLMPENVRTAAYKSSQEFFNYVGDALHNEQEKGST
KAILRERLIQGLGEDLSQVQNELVLNEKTGNYEVNDKTALGATFAVALNPEFIKLLTIAY
SFGPSAVMDYPITYNTVPIKDDDETYTYLDVNEISSNSNSTIMGVKANSEHLSQYVNLFD
TDGNNLINRITYTTTDLANKVDYPILVNAYAAHKYGLSEGSKITFKINNRADRIQHQIRV
DNNEIDPDYTDTATFTVKGIFTTYEGEEYFIDQDLANYLLRLKSHLNDANQTGENVQPNN
WYANEELSIGNNANIGYPHDKIGKNAKDGLINISNYQAIDHEQYQLTPYGFNGVFTKSNE
GGALLAKSMMLYASSGLYLSNDKFNSNVAFNTLKFGANTYMAAKAAGLLNTTLGQEITSL
YNTLIANPSDENQQALAAKANELAQLIVKYYGQQVYEALLTGANDKLSSNLVYTNISNTV
NKVTKVVIGVIAVMVIIIIALVTNMIINDSKKLAAILKSLGYSDNQNAATYLSIYIPVII
IGLLISIGISHLMVNVYNAVIFGGIGIWINATVKWYYYLGALGIVLIVFTIAGTNGVLTL
KRDKLIEMIK
NT seq
4893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgaaatctattaaagaacgcttttagatcgttaaagaaaaataagctaagtatggtt
ggattaactttccttgtttttctttctacaggaatctttaccgttttaaatagtgcaact
acaagtattaatactgaatatcatcaaatttcttcagaaggaaatttacatgatattact
attagccaagtttatgataatggagttgctaaatattccaatttagtagaaaagcaacaa
gatgataatgttggaagtgaattttattcttacttatatgaacaaaatcatttagttaaa
actaatgatggtttaatagctccgttttttacagcgagaacttcaggtaataattatctt
tttcgctgttattatttattagacattgataatatcgctaaaaaaacagcaattaaagag
ttttttcttgatgtcataaatgatcctattgaatgaaataaatatgatcgttttcttgct
ccaactattgatatagtaacagcaaaaacaaatgaatcaacagctttatacaattacatt
acaactgagcaaaaggcatatggtaaaaatagcaataaaacaacggataaatcttttaat
gaaattgataaactaattcaatccggtggtttgagtggttcaagtactattagtgataaa
ttgaaagatgcagctgatgaactttatcaaatatcagggactaaagatacaccacttgac
caacacttaaaaagtgaatatagtaatcgattaatgttccgtgattttaattcattagaa
atcagtaactcatcagacaaaattttttataaaggtgttaattcatcaatcgatgatcaa
attgataagttagttaacattgatattaataataacaccaacggcatcaattgaaacaat
ttttcagtaaccgatgctacttttgatattttaaattatgaattaaatgaccattatgat
ctaggtagaacattaagctatttaccaagcagtatatgtaaatatgatattcactatctt
gaaaaagttcatttattaaaaaaagccaattgaccaagtcaaaatcaaattaagattgat
ttggatgctttaccgggcaatttaagtttagataataaagaacgtcaaaaatattgagtt
gataatttaaaacaattgcaaaaagttttaagtgatgaacttgctggtaatgaagaagtt
tttgttaaagattaccgaattactgctacttgaatctttggtgatgttccaagtaactgc
gaaattgataattggacagcttatttcactaatgttaaccctgaatttatggaagctaac
cataaattgacagctcaagttaatgatttaaaatctgatgctcaatttaattcttatatt
caaaaccatccaaaaataactgaactaagaacgttatttattgattgaatgaatacatta
acttatcaagaaattcaggcttttgttgatagttatgttagtaaacacaataatcaaact
attgctcctggaggaaatactaattttattattattggcagcggaattacacctgatttt
atttatccaattgtaagtattactagaacaactcccaacccaaaaagtgaatgtattttc
tttactaataatgccggatataatcgggtgtatgatggatttagaggaaataaaaccgaa
gattatattgttgccaaatttactaacgatattagtaatcgagaacaacaaaagatcctt
gatagtattaacgcttgagcgaaagaagaaatgattctttctcctgggattaaagcagct
tattttgcaaatgacacaagtaatgtgttaaatgctagtgcctttagaattgcttttatt
ccaagttttattaatgatattaattatgtttcatatacactaaccttattcattattctc
ttaagtttagtgatttgtgcaattgtaattaatcgttatatcacaattaatcaatctatt
ttaggaattatgcgtgctaatggattaagtaagtgagttattgctggttcattacttccg
tttgccttaattccaagtctagttggagcaattgctggggtaacgcttggatttggatta
caatggtttgttttaaaacttttatctaattattgaatgttgccaacatcaatactgtca
attaatatctttagcattttaattgcctttggtatttgcttattaattttcatgggtgtt
atttacttaactagttattgagtattaaataaaaaaacagttgatacaatgaaaactgac
tcccaagataacccaaacattattgctaaagctgcaaaaacgcttgtaagtaagtttgga
attattactaaatttcgagtagctgttgcttttagttcaatttgaaagttattagttctt
gttgtaatgacatcaatgactgtatcttcacttgtgttttcaacaagtattaacaataaa
tttgaatatgcaattagtaaaacaaacgcttcacgtaattacacctatgcaataaagtta
gcaacaccgactacaagtggaggacaatacattccaactcgttttgattatgatgttagt
aaattagaacaaaatgatttatttttagcttatggagcatcaggttttaatcaagcagga
aatgacagccgtgataatgtttatttgcaaagttcatattatggaaatagcaataaaaaa
gttacttttgatttaagtgaagtagttccgtgatgagtgcctattaaagaatttaatgtt
acttttaatggaattgatcaagaacaattaaaaggaattattaatgttagtggaacccga
cgtgatttaaatgatgttattgatcatgaatattattattcatcattagctttaaatgcc
gcaaatgatttaacacatttaattccgccaagcaaaattgatgaatacgttgctaaatat
attccagcaattacacaaactgattcaactggtaaaagtgtttatttttctaatctattt
attccatttatgggtgatgctgttgggcaagcgtatgacattttttacttaaagaatcgg
ataatgactaacggaacacttaattatgttgttggtgcttttggacaaacatctgatcca
tgagatattagtagtagtttaatgcctgaaaatgtgcgaacagctgcatataaatcatca
caagaattttttaattatgttggtgatgctttgcacaatgaacaagaaaaaggatcaacg
aaagcaatcttaagagaacgtttaattcaaggtttaggggaagatctgtcacaagtgcaa
aatgaacttgtcttaaatgaaaaaactggtaattatgaagtaaatgataagacagcacta
ggagctacctttgctgttgctttaaatccagagttcattaaattactaacgattgcgtat
agttttggtccaagcgcagtgatggattacccaatcacctataacactgtgccaattaaa
gatgatgatgaaacttacacttatttagacgtaaatgaaataagttcaaatagtaatagc
acaattatgggggtaaaagctaatagtgaacatctatctcaatatgttaacttatttgat
acagacggtaataatttaattaatcgtatcacatatactactactgacttagccaacaaa
gttgattatccgattttagttaatgcttatgcagcacataaatatggattaagtgaaggc
agtaaaatcacttttaaaatcaataatcgtgccgatcgaattcaacatcaaattcgtgtt
gataataatgaaattgatcctgattacacagatacagcgacatttactgttaaaggaata
tttacaacttatgaaggtgaagaatattttattgatcaagatttagctaattacttacta
agacttaaatcacacttgaatgatgctaatcaaaccggtgaaaatgtgcaacctaataac
tgatatgctaacgaagaattaagtattggcaataatgctaatattggatatccacatgat
aagataggtaaaaatgctaaagatggattaattaatattagtaactatcaagcaattgat
catgaacaatatcaattaacaccatatggatttaatggtgtatttactaagagtaatgaa
ggcggggctttgttagcaaaatctatgatgctatatgcatcaagtggtttgtatttatca
aatgacaaatttaatagcaatgttgcatttaatactttaaagtttggtgctaacacatat
atggctgcaaaagctgcaggattattaaatactaccttaggtcaagaaattactagttta
tacaatacactaattgctaatccatctgatgaaaatcagcaagctttagcagctaaagct
aatgagttagcacaattaattgttaagtattatggacaacaagtttatgaagcactattg
actggcgcaaatgataaattatcaagcaatttagtttacaccaatattagcaatacagtt
aataaagtcactaaagttgtaattggtgttatcgctgttatggttattatcattattgct
ttagtaaccaacatgataattaacgattcaaaaaaacttgcagctattttaaagtcattg
ggttatagtgataatcaaaatgcggctacttatttatcaatttatataccagtaattatt
attggtttgctaatatcaatcggaatatcacatctaatggttaatgtatataatgcagtt
atttttggtggaattggtatttgaattaatgcaactgttaaatgatattactatctagga
gcattaggaattgtcttaattgtctttacgattgcaggaactaatggtgttttgacctta
aaacgtgataaattaatagaaatgattaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
