KEGG   Candidatus Malacoplasma girerdii: MGM1_4280
Entry
MGM1_4280         CDS       T03441                                 
Symbol
gidA
Name
(GenBank) tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA
  KO
K03495  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme
Organism
mgj  Candidatus Malacoplasma girerdii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mgj00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:mgj03016]
    MGM1_4280 (gidA)
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:mgj03036]
    MGM1_4280 (gidA)
Transfer RNA biogenesis [BR:mgj03016]
 Eukaryotic type
  tRNA modification factors
   Other tRNA modification factors
    MGM1_4280 (gidA)
 Prokaryotic type
    MGM1_4280 (gidA)
Chromosome and associated proteins [BR:mgj03036]
 Prokaryotic type
  Chromosome partitioning proteins
   Other chromosome partitioning proteins
    MGM1_4280 (gidA)
SSDB
Motif
Pfam: GIDA GIDA_C GIDA_C_1st Pyr_redox_2 FAD_binding_2 FAD_oxidored Pyr_redox_3 HI0933_like DAO 3HCDH_N Pyr_redox DUF4464 AlaDh_PNT_C NAD_binding_8
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIV03794
UniProt: A0A097ST78
LinkDB
Position
437514..439352
AA seq 612 aa
MEKNLFNVIVIGAGHAGIEAAFAAANKGHKTALFTISKKAVAQAPCNPSIGGPAKGIVTR
EIDALGGMQAQAADACMIQIKILNSSKGPGVWALRAQIDKDLYHQYFLKLINETKNLSLI
EAEVTELIVEKNVVKGIKANDVIYLAKTVIITTGTYLKSTIHIGDEKKDSGPLNFPQAKF
LSNQLKELGFELIRLKTGTPPRIEINSFNKDAAEIQLGNSEPLHFSFYTNQHLKLEDQVP
CYLTYTNEKTHQIIRANLNKSAMYSGHIKGVGPRYCPSIEDKIVRFSNKPRHQIFIEPVG
LKSNLLYLQGLSTSLPKSVQLDLVHSIKGLEKAEIIQYAYAIEYDAVNPVQLWPSLESKL
IKNLYFAGQINGTSGYEEAAGQGLIAGINASLNIENKKPLILKRNEAYIGVMIDDIVTKG
VKDPYRLLTSRAEHRLYLRNDNADDRLMPYGYQVGLLKESKYEEYLKRKQLFNEVIEYLK
KTTLKNFSSLNKIYNSHSLLALAKQPQINLKDILIHSPYNNLDDELIQKISIAIKYEGYI
KHEQNNLDKFSKYLSFDISCINDYSGLINLPLEAREKLNKVKPLTLAQASNISGININDL
MIIKYYVENMKE
NT seq 1839 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaagaatctttttaacgttattgtaataggtgcaggtcacgctggaattgaagcg
gcttttgctgctgcaaataaaggccataagactgcattgtttactattagcaaaaaagct
gttgcccaagcaccatgcaatccttccattggtgggcctgccaaaggcattgtaacacgt
gaaattgatgcattgggaggaatgcaagcacaagctgctgatgcatgtatgatccaaatt
aaaatactcaatagttctaagggcccgggtgtatgagctttaagagcacaaattgataag
gatctatatcaccaatattttcttaaattaattaatgaaacaaaaaatttaagcctaatt
gaagccgaagttactgaattaattgttgaaaaaaatgttgtgaaaggaattaaagctaat
gatgttatttatttagctaaaaccgtgataatcaccacaggaacttatttaaaatcaact
attcatattggtgatgagaagaaagatagtggtccacttaatttcccccaagctaaattt
ttatcaaaccaattaaaagaattaggttttgaattaattcgccttaaaacaggaactcca
ccacgaattgaaattaattcatttaataaagatgcagctgaaattcaattaggaaatagt
gaaccactacattttagtttctatactaaccagcatttaaaactagaagatcaagttccg
tgttacttaacttatacgaatgaaaaaacacaccaaattattcgagctaatttgaataaa
agtgcaatgtattcaggacatattaagggggttggtccacgttattgtccaagtattgaa
gataaaattgtgcgttttagtaataaacctcgacaccaaatatttattgaaccagttgga
ttaaaatcaaatttactatacttacaaggattatcaacatctttgccaaaaagtgtgcaa
ttagatttagtgcacagcatcaaaggattagaaaaagctgaaattattcaatatgcttac
gcaattgaatatgatgcagttaatccggtccaattatgaccgtctcttgaatcaaagttg
attaaaaatttatattttgcaggtcaaattaatggcacgagtggttatgaagaggcggct
ggtcaaggtttaattgctggaattaatgcctcacttaatattgaaaataaaaaaccacta
attttaaagcgcaatgaagcatatattggcgtaatgattgatgatattgttactaaagga
gtaaaagacccttatcgtttattaactagccgggcagaacatcgactttacttacgcaac
gataatgctgatgatcgtttaatgccttatggctatcaagttggcttattaaaagaaagc
aaatacgaagaatatttaaaacgaaaacaattatttaacgaagtgattgaatatttaaag
aaaacaacactcaaaaattttagttcattaaataaaatatataactctcatagtttgcta
gcgttagctaaacaaccacaaattaatttaaaagatattctaattcattcaccatataat
aatttagatgatgaattaattcaaaagatttccattgcgattaaatatgaaggttatatc
aaacatgagcaaaataatttagataagtttagtaaatatttatcatttgatatttcatgc
attaatgattacagtggattaattaatttaccgcttgaagctcgtgaaaagctaaataaa
gttaaacctttaacattagcccaagctagtaatattagtggaattaatattaatgatctt
atgatcattaaatattatgtagaaaacatgaaagaatag

DBGET integrated database retrieval system