Candidatus Malacoplasma girerdii: MGM1_4790
Help
Entry
MGM1_4790 CDS
T03441
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mgj
Candidatus Malacoplasma girerdii
Pathway
mgj03030
DNA replication
mgj03430
Mismatch repair
mgj03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mgj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MGM1_4790 (polC)
03430 Mismatch repair
MGM1_4790 (polC)
03440 Homologous recombination
MGM1_4790 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mgj03032
]
MGM1_4790 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mgj03400
]
MGM1_4790 (polC)
Enzymes [BR:
mgj01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MGM1_4790 (polC)
DNA replication proteins [BR:
mgj03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MGM1_4790 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mgj03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MGM1_4790 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
RNase_H_2
HHH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIV03844
UniProt:
A0A097STD0
LinkDB
All DBs
Position
complement(491759..496126)
Genome browser
AA seq
1455 aa
AA seq
DB search
MSDLGIEFLLTSEVITEDEYKTIGDSITTELGENKNTNTYFLNISVKRILPVNIYKKIYS
LAIKDKDNNFDIYFKGKVKDFTAQDLFDYFKFYLESKKIDTEVFKSILDAKSFSSSNGNI
SILYYTNAELTSLKSIKTDLIYFLMEACFDFNELHFKLDNNRQNTDLRKKQTTEAIAQAK
LRVKKTDFAMNATREANKIDANKINKIETIYINEVDRVFFEGQIFSEPTRIITKNGYIIY
RFDVTDFSSAISCTAFINPKEGNYSSKYLKKQTSSLNQAYLDDFHLNDWVRVDGYSKTDK
YSNNEVTCSINKIEKLKKAPSQFVYLDEEINKRSEVLMHTKMSAFDGIASVEEIVDKVKQ
HGWKGIGIADRYNVHNYPTIYNNTKNTDLKILYGVELNVLNKNNLIVKNETDLDLNQATY
VIFDIETTGLYNEFDDLIEFAGYKVRDGQIIDKEIFLVKTKQTIKPHLLDKVNITNEMLD
NEGINVTEALKRIQNFVKDTVLVAHNGIAFDYRFINKKLVANGFLPLSNSIIDTLQLSRA
INEKILHHRLGVVAKLFNIEYNEADAHRAEYDTNVLYQLFNVFIKRLNDLKITNLKQLAA
YTSKILFERQFSDNFVITYVKDQKGFKPLYKIVSDSNTKNLFTTPRVFIDDLINEREHFI
LMNHPTESDLFDNALNGLDTELETCINFYDYILVASDKNIAHLINNQNISVDDARKAIKR
IVLTAKKLNKKVIATSDAYYLNPWEEIARRVYVNSKLLGGKNHRFYSYGGNNDFLPNGNL
RTTKDLIKEFSFLNDDALIKEIVITNPNELFNSIDCNLKPIKTSLYPPIIDNVEEKIAKY
VQDRLKELYGDKIHPIIQSALDKEIDAVFKYKYSIIYWVSHLLVKKSLDDGYLVGSRGSV
GSSILAYLLNITEVNPLPPHYICKKCKHIEFVENVDDGFDLKPKQCPNCGEIMFGDGHDI
PFETFMGFKGDKIPDIDLNFSGEYQHKAHQFIRDVFGADHVFRSGTISTVADKTAFGYVK
NYFESKNPNQIIPTAYINWIVKKCSNVKRTTGQHPGGIIVIPRDMEICDFTPYNYPADEP
SDWYTSHFTYDFLHDCLLKFDVLGHDDPTKLKILDKSTNVHPTTISFYDDKVLRLFTDIE
VMGIKATDVENEPTGALGLPEFGTDFVRQMLCEAKPRSFADLVRISGLSHGTNVWLQNSR
DLILESQLKLSEVISCRDDIMINLIKQYGVPDKVAFNVMESVRKGKGIKTNELEILKEHK
VKDWYINSCQKIAYLFPKAHATAYVINAWRMAWYKIYYPLHFYAAYFSINAQDFDLEAAI
WGKEKVLNKLKNLKSQINAKAKVSDVERHKIPVYEVMLEMFARGFKFANVDLKHSLPTYF
IVDKDQLIPPFLTIPGLGFKGAFMLHKGREYKPYISKEDLLNRAKVQTPVLKAMEDLGIT
NGLKEENQMSLFDDC
NT seq
4368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgatcttggaattgaatttttgttaactagcgaagtaataacagaagatgaatat
aaaacaataggtgatagcattaccactgaattgggtgaaaataaaaacacaaatacttat
tttttaaatatcagtgttaaaagaattctccctgttaacatttacaaaaagatttattca
ttagcaattaaggataaggataataattttgatatttattttaaaggtaaagttaaggat
tttaccgctcaagatttatttgattatttcaaattctatcttgaaagtaaaaaaattgat
acggaagtttttaagtcaattcttgatgcaaaatcatttagttcatctaatggtaatatt
tccattttatactataccaatgcggaattaactagtttgaaaagtatcaaaactgacttg
atttattttttaatggaagcgtgttttgattttaatgaactgcactttaagcttgataat
aaccgtcaaaataccgatttaagaaaaaaacaaacaacagaagcaattgcacaagcaaaa
ttacgtgttaaaaaaactgattttgcaatgaatgcaactcgtgaagcaaataaaattgat
gctaacaaaattaataagattgaaaccatttatattaacgaagtagaccgtgttttcttc
gaaggacaaatttttagtgaaccaactcgaataattactaaaaacggttatattatttat
cgttttgatgttactgatttttcgtcagcaatatcatgtactgcttttattaatccaaaa
gaagggaactattcaagcaagtatttaaaaaaacaaactagttcattaaatcaagcttat
ttagacgattttcatttaaatgattgggtacgtgttgatggctattctaaaacggataaa
tatagcaataatgaagtaacttgctcaattaataaaattgaaaaattaaaaaaagctcca
agtcagtttgtttatcttgacgaagaaataaacaaacgttctgaagttttaatgcatacc
aaaatgtcagcctttgatggaattgcttctgtagaagaaattgttgataaagttaaacaa
catggctgaaaagggattggtattgctgatcgatataatgttcataactatccaacaatt
tacaataacacaaagaacactgacttaaaaatattgtatggagtggaattaaatgttttg
aataaaaacaatttaattgtcaagaatgaaactgatctagatttaaatcaagcaacttat
gttattttcgatattgaaactacaggtctatataatgaatttgatgatttaattgaattt
gctgggtataaagttcgtgatggtcaaattattgataaagaaatatttttagttaagaca
aagcaaacaatcaaacctcatttattagataaagttaacattactaatgaaatgcttgat
aatgaaggaataaatgttactgaagctttaaaaagaattcaaaattttgttaaagatact
gttttagtagcacataatgggattgccttcgactaccgttttattaataaaaaattagtg
gccaatggttttttgcctctttctaattcaattattgatactctccaactttccagagca
attaatgaaaaaatactgcaccatcggcttggggttgtagctaaattatttaacattgag
tataacgaagcagatgctcaccgtgctgaatatgatacaaatgtactgtaccaattattc
aacgtttttataaaacgattaaatgatttaaaaattactaacttaaaacaattagcagca
tatacttctaaaattttatttgaacgacaatttagtgataattttgttattacttatgtt
aaggatcaaaaaggttttaaaccattgtataaaattgtcagcgattctaatactaaaaat
ttatttactacaccacgtgtttttattgatgatctaattaatgaacgtgaacacttcatt
ttaatgaatcatcctaccgaatctgatttatttgacaatgcattaaatggtttagacacc
gaacttgagacatgcattaatttttatgactatattcttgttgcgagtgataaaaacatt
gctcatttaatcaataaccaaaatattagtgtagatgatgcacgtaaggctattaagcga
attgtcttaacagccaaaaaattaaataaaaaagttattgcaacaagcgatgcatattat
ctaaatccatgagaagaaatagcacgaagagtatatgtcaattctaagttactgggcgga
aagaaccaccgtttttattcatatggtggaaataatgattttcttccaaacggcaattta
agaacaactaaagatttaattaaagaatttagttttttaaatgatgatgctttaattaaa
gaaattgttattaccaatcctaatgagttatttaattctattgattgtaaccttaaacca
attaaaacttctttatacccgccgattattgacaatgttgaagaaaaaattgctaagtat
gtacaagatagattgaaagaattatacggagataaaattcaccctattattcaatctgct
cttgataaagaaattgatgctgtatttaaatacaaatattcaattatttattgagtaagt
catttattagttaaaaagtcattagatgatggttatttagttggttcaagaggttcagtt
ggatcgtcaattcttgcttatttattaaacattactgaagttaatccactacctccacat
tacatttgcaaaaaatgtaaacatattgaatttgttgaaaatgtagatgatggatttgat
ttaaagccaaaacaatgcccaaattgtggtgagattatgtttggtgatggtcatgatatt
ccgtttgaaacatttatgggttttaaaggagataaaattccagatattgatttaaatttt
agtggtgaatatcaacataaagcccatcaatttattcgagatgtatttggagctgatcat
gtattccgtagtggaacaattagtacggttgcagataaaactgcttttggatatgtaaaa
aattattttgaatcaaagaatccaaatcaaattatcccaactgcttacattaactgaatt
gttaaaaaatgtagtaacgttaaaagaacaacaggacaacaccctggaggaatcatcgtt
attcctcgtgatatggaaatatgtgattttactccatataattatccggctgatgaacca
agtgattgatacactagtcactttacatatgattttctgcacgattgtttattaaaattt
gatgtgctgggacacgatgatccaacaaaacttaaaattctagataagagcactaatgtc
cacccaactacaattagtttttatgatgataaagtattaagactctttactgatattgaa
gtgatgggaattaaagcaactgatgttgaaaatgaacctacaggtgcacttggcttacct
gaatttggaactgattttgttcgtcaaatgttgtgtgaagctaaaccgcgttcatttgct
gatttagtacgaatttctggattaagtcatggaacgaatgtttgattacaaaactcacgt
gatttaattcttgaatcacaattaaaattaagtgaagttatttcatgtcgtgatgatatt
atgatcaatttaattaaacaatatggtgtacccgataaagttgcatttaatgttatggaa
tctgtacgtaaaggtaagggaattaagactaatgaactagaaattttaaaagaacataaa
gttaaagattgatatattaattcatgccaaaaaattgcttatttatttccaaaagctcat
gctacagcatatgttattaatgcctgaagaatggcatgatataagatttattatccattg
catttttatgcagcgtattttagtattaatgctcaagattttgatcttgaagcagccatt
tgaggcaaagaaaaagttcttaataaattgaagaatttaaagagccaaatcaatgccaaa
gcaaaagttagtgatgttgaacgtcataaaattccagtttacgaagtgatgctagaaatg
tttgctcgtggctttaagtttgctaatgtagatttaaagcactctttaccaacatatttt
attgttgataaagatcaactcataccgccatttttaactattcctggattaggttttaaa
ggtgcttttatgctgcacaaaggacgtgaatataaaccttatatctctaaagaagattta
ttaaatcgcgctaaagttcaaacacctgtattaaaagcaatggaagatttaggaatcact
aatggtttaaaagaagagaatcaaatgagtttatttgatgattgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
