KEGG   Candidatus Malacoplasma girerdii: MGM1_5230
Entry
MGM1_5230         CDS       T03441                                 
Name
(GenBank) putative metallo-beta-lactamase family protein
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mgj  Candidatus Malacoplasma girerdii
Pathway
mgj03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mgj00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    MGM1_5230
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mgj03019]
    MGM1_5230
Messenger RNA biogenesis [BR:mgj03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     MGM1_5230
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_C RNase_J_b_CASP Enkurin
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIV03883
UniProt: A0A097STG0
LinkDB
Position
complement(538354..540114)
AA seq 586 aa
MAKINFIGFGGLNEKDLPCYAVSVDGNIFLFDCGLSTPINAQLGVRKIIPDFNWIIENSH
RVKGLFIGTPKYMSFAAIQYLIKHLPQLPIYTSEVGAAIIDNYFNYLQNSIREKIIRPNL
RILMPMITRKIAGISVTPFYVSNYMPKSLGFVISTSDGAIIFIDDFMISSNRNSAFEDQL
FQINRITKGKNLTLIVGVGNIDINKGFTNPSHRTYDFFNDVIANNTEGRTLIACHDHDLY
TMMTIASVCAQRKKPFIVYSGNTNKTFQFLLRQGYMNNKNLITLPHTEMQRNNDCVVVIS
GIPQRLIKKISDVTSGEDPILKINPTDTFVYATRTLNGYEKAEAEMFDAVVRSNANRIVK
LPKEIILATASVEDHKFLIDLLRPKYAIPINGLYMNFIQYRDAVSKSFINRNNVIVLGNG
EQIEFVNGELTKNRRTIKQTLQFVNSAGTVDAGSISIYEREQMANNGVVVVNLLIDRKNK
QIIDKNYECIGVINNTDYNQEALEKIYEICTGSINDYLSKNLTDDVNTYNATKELRFFIK
KIFSRSMDKAFQKTPLVLSTLLFKKKKEENINKLSSLEADENNEDE
NT seq 1761 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggccaaaataaattttatcggttttggaggtctaaacgaaaaagatttaccatgctat
gcagttagtgttgatgggaacatttttttgtttgactgtgggttatcaacgccaattaat
gcccaattaggtgtaagaaaaattattccagactttaattgaattattgaaaatagccac
cgtgttaaaggtttgttcattggaacaccaaaatacatgtcgtttgcggcaattcaatat
ttaattaagcatttacctcaattaccgatttatacaagtgaagtaggggcagcaatcatt
gacaactactttaactatttacaaaattcaatacgtgaaaaaattatccgtccgaattta
cgcattttaatgccaatgattacacgtaaaattgctggaatatcagttacacctttttat
gtatcaaactatatgccaaaatcattaggttttgtcatttcaacttcagatggagcaatt
atttttattgatgactttatgattagtagtaatcgtaatagtgcttttgaagatcaattg
tttcaaattaaccgtattactaaaggaaagaatctaacattaatagttggtgtaggtaac
attgatattaataaaggttttaccaatccttcacaccgtacttatgatttctttaatgat
gttattgcaaataatactgaaggaagaacattaattgcatgccacgaccatgatttatac
acaatgatgactattgctagtgtctgcgcacaaagaaaaaaaccgttcattgtttattca
ggaaatacaaataaaacattccaattcttgttaagacaaggatatatgaataacaaaaac
ttaattacgctaccacacacagaaatgcaacgcaataatgattgtgttgttgttattagt
ggaattccacaacgtttaattaaaaaaattagtgatgtaacttcaggtgaagatccaata
ttaaaaattaacccaaccgatacgtttgtttatgctactagaacattaaatggatatgaa
aaagctgaagcagaaatgtttgacgctgtagtgagaagcaacgccaatcgaatagttaaa
ttgccaaaagaaattattttggcaactgcaagtgttgaagaccacaaatttttaattgac
ttattgcgacctaaatatgcaattcctattaacggactatacatgaactttattcaatat
cgtgatgcagttagcaaatcatttattaaccgcaataacgttattgttttaggaaatgga
gaacaaattgaatttgttaatggtgaattaactaaaaatcgccgaacaattaaacaaaca
ttacaatttgttaattctgcaggaacagttgatgctggttcaatttcaatttacgaacga
gaacaaatggcaaataatggagttgttgttgtcaatttattaattgatcgtaaaaataaa
caaatcattgataaaaactacgaatgtattggtgtaattaacaataccgattataatcaa
gaagcattagaaaaaatttatgaaatttgcactggtagtattaatgattatttatctaaa
aatctaactgatgatgtaaatacgtataatgccaccaaagaattaagattttttattaaa
aaaatcttcagtcgttcaatggataaagcatttcaaaaaacaccattagttttaagtaca
ttgttatttaaaaagaagaaggaagaaaatattaataaattatcttctttagaagctgat
gagaataatgaggatgaataa

DBGET integrated database retrieval system