Mucilaginibacter ginsenosidivorax: FSB76_26315
Help
Entry
FSB76_26315 CDS
T06204
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
mgk
Mucilaginibacter ginsenosidivorax
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TIG
NHL
TEN_NHL
TIG_SUH
SGL
He_PIG
Vgb_lyase
Por_Secre_tail
SBBP
DUF3244
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEC79292
UniProt:
A0A5B8W8R7
LinkDB
All DBs
Position
complement(6320609..6325972)
Genome browser
AA seq
1787 aa
AA seq
DB search
MKVKNFRKCLTLLPCAIFACLNGYSQAPNITYTTPAPYKTGTAITPLSPQNSGKPVPAVS
YASVTPFAGGSLGWTDGSGTAAQFNNPAGVALDASGNLYIAENSGQRIRKATPAGIVSTI
AGTYRVAGSADGPGSSATFNSPYGVAVDAAGNIYISETAGRKIRKITPAGVVSTFAGSGT
KGVADGTGTAASFNVPEGLCFDKSGNLYVADIQNNNIRKITPAGVVSTFAGSTSGTPGAA
NGLGTTASFFGPTGIVADATGNLYVTDAGNHKIRKITAAGAVSDLVGDGTANWRDGTGTS
AALNDPYAIAIDELGNLYEAEYYFSLVRKITPAGVITTIAGNGIEGSASAVGNAATFNDV
KGMACDGHGNLYIGEGYNSDVRKMSIWGYSINPALPNGLTFDGTSGTISGTPLATSSLTV
YTITAYNAGGSSTATVGLSTVLPASAPTVTSLAPVLASAYSTINITGNNLLGATAVTVGG
VPAKSFTPVSPTSLNVTIPGAATSGTIKITTPYGSVTANGFTLLKAPKISYSQPPAYVTG
KASTTLSPANTGGEVPKTGYRYVSLLAGNPSGGSNDGTGKAAGFKYPYAGVCDLFGNLYV
ADITNGLIRKVTPDGVVTTFAGGGHYPNDGTGKTAGFYGPAGITIDAAGNLYVADGNDQL
IRKITPAGVVTTLAGSGRAGSKDGKGVYAWFSGPVEMGIDALWNLYCGEFSATSNLRKIT
TDGVVTTVDNSFNGVTGITTDDAGNLYIADQGHALVKKMTPAGSVSIFTGSGKTGKADGT
PASASFTGLSGLAADHFGNIYACETGNNQLRMIDPAGNVSTIAPLPKILDSYFYKPNGIC
ADGRGNIYIFNGDNTIRKMSLTGYSISPDLPAGLNFDASTGTISGTPTTASALTSYVITA
FNTSGNSTYTLKFAVTQGNLAIKSFKPASAAKGVTVTITGSNLGKVTGVRFGSIAAASFK
VVNDTTVTAVVGTGATGNVTLTTAADSTSKAGFTFAAPVSLSGFTPMTAARGATVKLSGS
NFTSATAVSFGGTAAASFKIVSDTLITAVVGTGATGAISVTSPGGSAILPGFKFIAAPVT
TSFSPLNAASGTTVTITGTGFTGATAVSFGGVAAASFSVTSDTGIKAVIGQGASGNIVIT
TPGGTSTFAGFKFISPTVVTAFTPLSASTGDKVTITGTGFGGVSAVSFGDIPAYSYTLNA
DNSITAVIGQGASGNIKVTTPGGTGTLGGFKYIPAPAITSFSPASATKGTSITIAGTNFT
GATSVSFGGVAAASYVVNSDNSITAVIGSAASGTVTVTTRAGTATVSGFTFIPVPAIISF
TPSSAATGDVVTITGSGFNGATAVSFGGAAAASFVVNADNSITAVVDKGATGSISVKTAG
GTAILTGFTYYAPPAIASFTPLTATNQSTVTITGTGFTGTTAVSFGGMPAASFTVVSATS
IKAVTGDGSSGAVSVTTPYGTGTKTGFNYVPQPLITAGGPTTFSSINGSVTLTASPANGY
TYQWFKDGTAIKGATGATYTAAQTGAYTVKITLNAVTRESDAIDVNAVFMLPVNNFQLTY
TSASCKGSANGSVNITAAQTLNYLATITGNGISNSYPFTTGTVINNLAAGTYNICITVSG
EPTYQQCFTAVITEPKDLSLYTSVGGSNQVTLNLDGGTVYTIKLNGLEYTTTQSQVTLPL
NTGSNRILVSTDRLCQGVIERVININNALVIYPNPFNNNLNLDIGKQAVKNATVTIYAIT
NGKVVYSNQYTNPSEMLHIDLSALKNGIYMLKLSADGSDNISKIIKQ
NT seq
5364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtcaaaaacttcaggaaatgcttaaccctactgccatgtgctatttttgcttgc
ctgaacggatatagccaggcgcctaatataacatatactaccccggcaccctataaaaca
ggaactgccatcacacctctttcgccccaaaatagtggtaaacccgttcctgctgtgagt
tacgcttcggttactccttttgctggcggaagcctgggctggacggacggcagcggtaca
gcagcacaattcaacaatcccgcaggcgttgcacttgatgcttcgggcaatttatatatt
gccgaaaatagcggccagcgcattcgcaaggccacacctgccggcatagtaagcacaatt
gccggtacctatagggtggcgggctctgccgacggccccggctcgtcggcaacctttaac
agcccatatggcgtagctgttgatgcagcaggcaatatctatatttcggagacagcaggg
cgcaagatcaggaaaataacgcctgcaggcgtagtaagcacctttgccggcagcggcaca
aaaggggttgctgatggcaccggcactgcagcaagttttaacgttcccgaggggctttgt
tttgacaaaagcggcaatttgtacgttgcagatattcaaaacaataatatcagaaaaata
acgcccgccggcgtagttagcacctttgcgggcagcaccagcggcactcccggagctgcc
aatggccttggcacaacagcctctttttttggccccacaggtattgtggctgatgccaca
ggaaatctgtatgttacagatgccggcaaccacaagataaggaaaattacagcagccggt
gcggtaagtgatttagttggcgacggtacagccaactggcgcgatggaacgggcacatct
gcagcccttaacgacccttatgccattgccattgatgaacttggaaatttgtatgaagcc
gaatattattttagcctggtacgcaaaattacgccggcgggagttatcaccactatagct
ggcaacggaattgagggctcggccagtgctgttggcaatgcagccacattcaatgatgtt
aagggcatggcatgtgatggccatggcaatctttatattggagaaggctataatagcgat
gtacgtaagatgagtatctggggctatagcatcaaccctgccctacccaatggtttaaca
ttcgatggtacatcgggtactatcagcggtacgccattggcaacttcgtcgcttactgtt
tatacaataacggcttataatgcagggggcagcagtactgcaacagtcggcctgtccacc
gttttaccggcctcggcgccaacggttacttcattggcacccgtattggcaagcgcatac
tcaactataaatattacaggcaacaacctgttgggcgctactgcggttaccgttggtggt
gtgcccgcaaaatctttcactccggtatcgcccacaagccttaatgtaactattcctggc
gcggcaacatcgggtactatcaaaatcaccacgccttacggcagcgtaacagctaatggc
tttacactgcttaaagctcctaaaatttcctatagccagccgccagcttatgttaccggc
aaagcaagtactaccctgtcacctgccaatacaggcggtgaagtacccaaaacaggttac
agatacgttagtctgctggccggcaacccttcgggcggatcaaacgacggcacgggtaaa
gccgccggttttaaatacccctatgcaggcgtatgtgacctatttggaaatctttacgtt
gccgacattaccaacggcctcatcagaaaagttactcctgatggcgtggttacaaccttt
gcagggggtggccactatcctaacgacggcaccggaaaaacagccgggttttatggcccg
gcgggtattactattgacgctgcaggcaacctgtatgtggccgacggtaatgaccagctg
atcaggaaaattactccggcgggcgttgttaccacacttgcaggcagcgggcgcgcgggc
tccaaagatggtaaaggggtttatgcctggttttccggccccgtagaaatgggtattgat
gccctttggaatttatattgcggggagttttcggcaacaagcaatctcagaaaaataact
acggatggcgttgttactactgttgataacagctttaatggtgtaacaggcataacaaca
gacgatgccggtaatttatatatagccgatcagggacatgctttagttaaaaaaatgacc
ccggcgggctctgtaagcatctttacaggcagcggaaaaactggaaaagccgatggtacc
cctgcatcagcaagctttaccggcctgagtggcctggcagccgatcattttggaaacatt
tatgcatgcgaaacaggcaataatcagctcaggatgattgaccctgccggaaatgtatcc
accattgcacccttacccaaaatacttgattcttatttttataagccaaatggtatttgt
gccgatggcagaggcaacatttatattttcaatggcgataatacaatccgcaaaatgtcg
ctcacaggctactccatcagtcccgacttacccgcaggcttgaatttcgatgcatcaaca
ggcaccatcagcggtacgccaacaacggcaagtgcgctaacaagctatgttattacagct
tttaataccagcggcaacagcacttatacgcttaaattcgctgtaactcagggcaacctc
gctataaaatcattcaaacccgcatcggcagcaaaaggtgttaccgttaccataaccggc
tcaaacctgggcaaagttaccggtgtccgcttcggcagcattgccgcagcatcatttaaa
gtggttaatgataccacggttacggcggtggtaggtaccggggcaacaggaaatgtaacc
ttaactaccgctgcagatagcaccagcaaagcaggatttacctttgcagcacctgtttcg
ttatcgggatttacgcccatgacggcagcacggggcgcaacggttaaacttagcggcagc
aattttacaagcgctaccgctgtaagttttggcggcaccgccgcagcatcatttaaaatt
gtgtcagataccttaattaccgcggtggtgggtaccggcgccactggggcaataagcgtt
acctcgcccggcggctccgcaatactcccaggattcaaatttattgctgcgcctgtaaca
acatcgttttcgccattaaatgcggcttccggcacaacggtaaccattaccggtactggc
tttacaggcgctactgccgtgagttttggcggcgttgctgcagcatcattttcagttact
tcggatacgggcataaaagctgttatcgggcaaggcgcaagtggtaatattgtgataaca
acccctggaggaacatcaacctttgccgggttcaaatttatttccccaacggtagtaacc
gcatttacgccattgagtgcaagcaccggcgataaagttaccatcaccggtaccggcttc
ggcggggtttcggcagtaagtttcggcgatataccagcctattcttatacactaaatgct
gataatagcattacggctgttatagggcagggtgcaagcggcaatattaaggtaactacg
cccggaggtacaggcacgcttggcggattcaaatatatcccggcaccggctattacgtca
ttttcacctgcaagcgctactaaaggtacaagcataaccattgccggaacaaacttcacc
ggggcaacctccgtaagtttcggtggtgttgctgctgcctcatatgtagtaaattccgat
aacagcattaccgccgttatcggctctgctgcaagcggcacagttaccgtaacaaccagg
gccggcacggctacagtttcgggcttcacatttatcccggttccggctattatctcattt
acgccgtcatcggcagcaacaggagatgtggtgaccattacaggcagtggctttaacggg
gcaactgcggtgagctttggcggagcggcggcggcttcctttgttgttaatgccgacaat
agcattacggctgttgtagacaagggtgcaaccggcagtatcagcgtaaaaacggcaggc
ggtacagcgattttaacagggttcacttattatgcgccacctgctattgcctcattcacg
ccgcttacagcaaccaatcaaagcactgtgactattaccggtaccggctttacaggtaca
acagctgtaagctttggcggtatgcctgccgcctcttttacggtagtatcggcaacaagc
atcaaagcagtaaccggggacggctcttcaggcgcagtatcggttactacaccttacgga
actggtacaaaaaccggctttaactacgttccccaacctctcataacggctggcggccca
acaacgttcagtagtataaatggcagcgttactttaacagccagcccggctaacggctat
acttaccaatggtttaaggacggaactgccattaaaggcgcaacaggtgcaacttataca
gcagcacaaacgggggcatatacggtaaaaataacactaaacgccgtcacccgcgagtcg
gatgctattgatgtgaacgctgtgtttatgttgccggtaaataattttcagcttacttat
accagtgcgagttgcaaaggttcggcaaatggatcggtaaatattacagcggcgcaaaca
ttaaactacttagctacaataaccggtaacggcataagtaacagttatccgttcactacc
ggcacagttattaataaccttgcagcaggcacatataatatttgtattacagtatctggc
gagcccacctatcagcaatgttttaccgcggttatcaccgagcccaaagatttatcgtta
tacaccagcgtaggtggctccaaccaggttacgctaaacctcgatggcggaactgtgtac
acaataaagcttaacggcctcgaatatacaaccacacaaagccaggttaccttgccgtta
aacaccggcagcaaccgtattttggtaagtaccgacaggctgtgccagggagtaattgaa
agagtcattaacatcaacaatgcgttggtcatttatccaaacccttttaacaacaacctt
aaccttgatattggtaaacaagccgtaaaaaacgcaactgtaaccatatacgctataacc
aatggaaaagtggtttacagtaatcaatacacaaacccgtccgaaatgcttcacatcgat
ctttcggctttaaaaaacggcatttatatgcttaaactgtcagcagatggttcagataac
atctcgaaaataataaagcaatga
DBGET
integrated database retrieval system
