Mucilaginibacter gossypii: DIU38_013680
Help
Entry
DIU38_013680 CDS
T06453
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
mgos
Mucilaginibacter gossypii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mgos00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mgos02000
]
DIU38_013680
Transporters [BR:
mgos02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
DIU38_013680
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEM17080
LinkDB
All DBs
Position
complement(3216314..3219514)
Genome browser
AA seq
1066 aa
AA seq
DB search
MRGKLRIKKVVALFCTSLSFVLISLSGQAQSKLITGKITGSDNGLPLPGVTVKIKGSTQA
AGSKADGTYSITAGNNETLVFSFVGFLNQEVAINGRSVINVSLVPDNKTLTEVVVVGYGT
TKRKDLTGAISSINADQVGKVPVTSVDQALQGRAAGVQVTNNDGAPGSSVSVLIRGVGSL
ATNGNEPLYVVDGYPISGGLNNVNPNDIANIDVLKDASATAIYGVRAANGVVIITTKKGR
KDGGVQVSLDAYGSLQSKPKKYKVLNAQQWATLANEDHASEGNFTELPEWANPSALTSVD
WQDAIYRQGAKQSYNLGIRGGNEKIQSAFSAGYYDQKGIVLGSYFKRLNLGMNIDYTVSK
WLKSSTSAKYSRQDQNNPFGSGSLQQLTELIPTLDGGNKLTNQIKDKNGNYGFYNPINIY
TKSWNNPLYTIEKNDYKNLNNYLLASSSLEATIIDGLKIKTNAGLNVSDYSGYFFQPEDL
RWQEQYGLSGANQNSVYSQSANNTFEWLWENTISYDKTFGKHAINFVGGVSAQSNTYRYM
TGTGDKLINNALRDLAQVNDLVVTGSQYTTTFASQFGRLIYKYNDKYIVTGTVRRDGSSK
FANGHQYGVFPSGSVAWKAKEESFLKNVAWLSDLKFRGGYGEVGNQGSIPLFQYNALYSS
GGAATTGTNVGYPFGKNGSSGEVYQPGLAPTQPANPDLRWETDYQTDIGMDAAFLNGALT
FTVDYYNRRSKDFLLNLPVSSQTGFSQNLAQNVGEINNKGFEFAVNYNHTVNDFRYGLGL
TFTTVKNKLVSINKSLTFIDNLTTVTGLNGNGWGQFSETNIGQAVGEFFGYKSLGIFQSQ
AQINALNAAAATKFPSNPYYWKSVTQPGDRYYADTNGDGQVTPSDRTSLGSPIPKFYGGL
NLDFAYKAFDLNAYFYGSYGNKILNYQQRTLESFQAPGFVGVENVGYDYYVNHWTPSNPS
NRYARLTYNDDTSANNVPSSVYVEDGSYLRLRNLTLGYTLPSDVTKKLTLSKVRIYFSTQ
NLFTITGYKGLDPEIGTANGSATASGIDAGNYPSSKFYTLGLNVTF
NT seq
3201 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaggaaaactacgtatcaaaaaagttgtggctttattctgtacaagtttatcattt
gtgttgataagcctgtcggggcaagcccaaagtaaattgattaccggtaagatcaccggt
tcggacaacggactacctttgccgggtgttaccgttaagataaaagggagcacgcaggct
gcgggttcaaaggccgatggtacctactcaataaccgccggtaacaatgaaacacttgtt
tttagctttgttggcttcttaaaccaggaagttgccataaacggcagatcggttatcaac
gtatcgctggtgcccgataataaaacccttactgaggttgttgttgtgggttatggtacc
actaagcgtaaagatttaacgggggctattagttcaatcaacgccgatcaggtaggtaaa
gtgcctgtgaccagcgttgaccaggctttgcaaggcagggcagcgggtgtacaggttact
aataatgatggcgcacccggtagtagtgtgagtgtattgatcaggggggtaggtagtttg
gctacaaatggtaatgagcctctatatgtggttgatggttacccgatcagcggaggctta
aataacgttaatcctaatgatatagctaatattgatgtgttgaaagatgcttcggcaaca
gctatttatggtgttagggcagcaaacggcgttgttatcattactacaaaaaaaggccgg
aaggatggtggggtgcaggtatcgttagatgcctatggttcattgcaatcaaaaccaaaa
aagtataaagttcttaacgcgcagcaatgggcaaccctggccaatgaagatcacgcatct
gaaggcaattttacagaattgcctgaatgggcaaatccttcggcattaaccagtgttgac
tggcaggatgcaatttatcgccagggggcaaaacagagctacaaccttggtatacgcgga
ggcaacgaaaaaattcaatctgccttttcagctggttattatgaccaaaaggggattgtt
ttaggttcatattttaagaggttaaacctggggatgaatattgattataccgtaagtaaa
tggcttaaatcatctaccagtgctaagtattcaaggcaggatcaaaataatccatttggt
tcaggatcattgcagcaattaaccgagcttatccctacgcttgatggtggtaataagtta
accaaccagataaaagacaaaaatgggaactatggtttttataacccgatcaatatttat
acaaaaagctggaacaatccattatatactattgaaaaaaacgattataaaaacctaaat
aattaccttttggcaagtagctcattagaggctactattatagacgggcttaagatcaaa
accaatgcgggcctaaacgtaagcgactattcgggttacttctttcaaccggaagacctt
cgctggcaggagcaatatggtttaagcggcgctaaccaaaattctgtttattcgcaaagc
gccaataacacttttgagtggttatgggaaaataccatatcgtatgataaaaccttcgga
aagcatgctattaactttgttggtggtgtttcagctcaatcaaatacctaccgatatatg
acaggtactggagataaattgatcaataatgcccttcgggatctggcgcaggttaacgat
cttgttgttacaggcagccagtatacaacaacttttgcttcacaatttggacggttaatc
tataaatacaatgacaaatatattgtaacaggtaccgttaggcgtgatggttcgtcgaaa
tttgctaacgggcatcaatatggtgtattcccttcgggttccgtagcctggaaagctaaa
gaagaatcattcctgaaaaacgttgcatggctgtctgatctgaagttcagaggcgggtat
ggcgaagttggtaatcagggctctattccattatttcaatataatgccttatattcatca
ggtggtgcagctactaccggcacaaacgtgggctatccatttggtaaaaatggttcgtca
ggagaggtctatcaacccggtttggcaccaacacaacctgccaaccccgacctcagatgg
gaaactgattaccaaactgacattggtatggatgctgccttcctgaatggcgcgcttact
tttacagttgattactataacaggagatcaaaagactttttgttaaacctccctgtatcg
tcacaaactggctttagccaaaacctggcccaaaatgttggtgaaatcaataacaaaggt
tttgaatttgctgtaaactataaccatacggtaaatgatttcagatatggtttgggttta
acctttaccacggttaagaataagttggttagcattaacaaaagcctgacctttatcgat
aaccttaccacggttaccggtcttaacggtaatggctggggccaattcagcgaaaccaat
atcgggcaggccgtaggtgagttttttggttataaatcgctggggatttttcagtcgcag
gcgcaaattaatgctttaaacgccgcggctgcaactaaattcccaagtaacccatactac
tggaaaagcgttacccaacccggagaccgttactatgcggacactaatggcgacggacaa
gttaccccttcggataggacaagcctcggtagtccgatccctaaattttatggtggttta
aacctcgattttgcttataaggcatttgatcttaacgcatacttctatggctcttacgga
aataaaatcctgaattatcagcaaaggacccttgaaagctttcaggcccccggctttgtt
ggtgttgaaaacgtaggttacgattattatgttaatcactggaccccgagtaatccatca
aatcgttacgcaaggcttacatataatgatgataccagtgcaaataatgtaccatcaagt
gtgtatgttgaagatggtagctatctccgtttaaggaaccttaccctgggttatacatta
ccgtctgacgtcaccaaaaagttgaccttatcaaaagtgaggatttacttttctacccag
aatttatttactataaccgggtataaaggtctggatcctgaaattggaacagctaatgga
agtgcaacagcatctggtattgatgcgggtaattacccttcatctaagttttatacactt
ggtttaaatgtaactttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
