Mucilaginibacter gossypii: DIU38_017755
Help
Entry
DIU38_017755 CDS
T06453
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
mgos
Mucilaginibacter gossypii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
CooC_C
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEM17830
LinkDB
All DBs
Position
complement(4133310..4136336)
Genome browser
AA seq
1008 aa
AA seq
DB search
MKFKQLLKRFILPLLSVFVFCYSTYAQTVSLKGKVTDEKGEPIVGASVKIKNTSAGSVTN
GSGVFSLNYTGQGTLMVTAIGFTSQEVKLTGQVQINVALAEDNKVLNEVVVTALGIKRDK
RILTYSSQEVKAESIAQSKEPNLVNALAGKVSGVQVTSSSGTPGSSARIVIRGATSFYGE
NGPLMVIDGVPVDNAETGNLNSGPGTNRIADIDPSIITSMNVLKGAAATALYGSKGANGV
VIITTKTGALNQKPLITFSSDFSFENPLLPQIQNKYSQGTNGIYYDGVNQKTSTSWGARM
DTLKINGQPAKVYNQSDLFFKTGHTYNNTVNIGGGGNNSTYLVSYSNFNQQGTVPTTKFL
RNTFFAKYSAQVLKNLTTTFQLNYSNSQNDRLPEGYALESPVWTIFTAPVSYNLQPYLNA
DGTQRLYRFSRNNPYWVLDNIKNHSGVNRFLPTFTADYKPFSWLTITERFGADVYAEMDR
YHESTQSVSNPNGRLVDQNLTYRQYNNDLLISANKQFGDFNVDVVLGNNLISTYNENTYA
NGVGLTVPGLYNMSSASTVNYSEGSSLQRKVGFYLQSNIEYKRFLLLSLTGRYDGNSVLS
IDHSFYPYGSAAGSFIFSEFFSPEFSKVMNLGKVRVSYGTVGNDGSIGAYSLLTPYNKAT
IRNLAFPYNQQAGFLISDVLGNPNLKNERINEFEAGFEAGFFNNRISLEASFYNKKTNGG
IIPTVALPPSTGYSATSVNSAVMRNKGIEVLLNVNPIKSRDFNWDFTLNFTRNRNKVLSI
YKDLSLINIGFTNVVIGQPYGVIYGTRYARNAAGKLLIDDSGLPYADDNQGIVGNINPNW
LGGINNNFRYKQFNFSFFFDIKRGGDIQNNVDGYGYFYGTPKVTENRGLRVVDGVNATTG
QPNTVAVNGQAYYQRANGVLESVIQDGSYVKLRNVSLGYTLKPSWLSKSPFKSATFSVTG
RNLWIHAPHFTGGDPEVSSFGSSNGSQGIYSFSTPTSKSVDFSLKVTL
NT seq
3027 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtttaaacaattactaaagaggttcattttgcctttactgagtgtgtttgtgttt
tgttacagcacctacgcgcaaacagtatcattaaaaggaaaggtaaccgacgagaagggc
gagcccatagttggcgcttccgttaaaataaaaaatacaagcgcaggttctgttaccaat
ggcagcggtgtgtttagcctcaactataccgggcagggtacacttatggtaaccgctatt
ggttttacatcgcaagaagttaagttaaccggtcaggtgcaaattaacgtggcgctggcc
gaggataacaaagtgctgaacgaggttgttgttaccgctttaggtataaaacgcgacaaa
aggatcttaacttacagctcacaggaggtaaaagccgaatcgattgcgcaatcaaaagag
cccaacctggtaaatgctcttgcgggtaaggtatcaggtgtgcaggtaacaagctcatca
ggtacgcctggcagctcggcgaggatcgtgatcaggggggcaacgtcattttatggtgaa
aatgggcccctaatggttattgacggggttcctgttgataacgctgaaacaggtaacctc
aattccgggccgggcacgaacaggatagctgatattgatccatctattattaccagtatg
aacgtattgaaaggtgcggcagctacagccttatatggttcaaagggtgccaatggtgtg
gttatcattaccacaaaaaccggcgccttaaatcaaaagccacttataactttttcttct
gatttttctttcgaaaacccattattgccacaaattcaaaataagtattcgcaaggtaca
aacggcatttactatgatggtgtaaatcaaaaaacaagtacatcatggggggcgcgtatg
gataccctgaaaattaacgggcaacccgcaaaagtttacaatcagtctgacctgtttttt
aaaaccggccacacttataataataccgttaacatcggcggtggcggtaacaattctacc
tacctggtttcatactctaattttaaccagcagggtacagtgccaacaactaaatttttg
cgcaatactttcttcgctaaatacagtgcgcaagtgctcaaaaacctgactactacattt
cagctaaattactccaattcacaaaatgacaggttgccggaaggttatgcgctcgaaagt
cctgtttggacaatttttacagcaccggtatcatacaatctgcagccttatttaaatgcc
gatggcacccagaggctgtatcgtttctcgcgtaataatccatattgggttttagataac
atcaaaaatcactctggtgttaacaggtttttaccaacctttactgccgattataaaccc
ttttcatggctaaccatcaccgaaaggtttggtgccgatgtttatgctgaaatggacagg
taccatgaatcaacccaatcggtgtcaaatcccaatggccgactggttgatcagaacctt
acttaccgccagtacaataatgatttattgattagtgccaataagcaatttggtgatttt
aatgtagatgttgtattgggtaataacctgatctccacctataatgaaaatacttacgcc
aatggtgttggtttgactgtacctggtttgtataatatgtcttccgcatcaacagttaat
tatagtgaaggctcatcattgcagcgaaaagttggtttctacctgcaatcaaatatcgaa
tataaacgcttcctgctattgtcattaaccgggcggtacgatggtaactctgtactttca
atagaccacagcttttatccatatggttctgctgccggtagcttcatattctcggagttt
tttagccccgaattttcaaaggtcatgaatctgggcaaggtaagggtttcatatggtacc
gttggtaacgatggcagcattggtgcctatagcttgttaaccccatataacaaagcaact
atccggaacctcgctttcccttataaccagcaggctggtttcttaatcagcgatgtactg
ggcaatcctaatcttaaaaacgagcgtatcaacgagtttgaagcagggtttgaggcgggt
ttctttaataacaggatcagtcttgaggcttcattctacaataaaaaaacaaatggtggt
atcatacctactgtggcgcttccgccctcaacggggtattctgcaacaagtgtaaactct
gcagtaatgcgtaacaagggtatcgaagtattgttaaatgtaaacccaataaaaagccgt
gactttaactgggactttactttaaattttacacgtaacaggaataaggtattatctatt
tataaagacctgtcattgattaacattggctttaccaatgtcgttattgggcagccttac
ggcgtgatatatggtacccgttatgctcgtaacgccgctggtaagttattgattgatgat
tcggggcttccatatgccgatgataaccagggtatagtgggtaacattaaccctaactgg
cttggcggtatcaacaacaacttcaggtacaaacaatttaacttcagtttcttctttgat
atcaaacgcggcggcgacatccaaaacaatgttgacggctacggctatttctatggtacg
ccaaaagttaccgaaaaccgcggtttaagagtggttgatggtgtaaatgcaactaccgga
caaccaaacacagtagcagttaacggtcaggcgtattatcagcgcgcaaacggagtgctg
gagtctgttattcaggacggcagctatgttaaactgcgtaatgtgagtttaggttacact
ttaaaaccatcatggttaagtaaaagccctttcaaatcggcaacatttagtgtaacgggc
cgcaacctttggatccatgcaccgcactttaccggcggcgacccggaagttagctcattt
ggttcatcaaatggttcacaggggatctattcattctcaaccccaacctcaaaatcagtt
gattttagcttgaaagttaccctataa
DBGET
integrated database retrieval system
