Mycoplasmoides gallisepticum NY01_2001.047-5-1P: HFMG01NYA_1975
Help
Entry
HFMG01NYA_1975 CDS
T02202
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mgt
Mycoplasmoides gallisepticum NY01_2001.047-5-1P
Pathway
mgt03030
DNA replication
mgt03430
Mismatch repair
mgt03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mgt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
03430 Mismatch repair
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
03440 Homologous recombination
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mgt03032
]
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mgt03400
]
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
Enzymes [BR:
mgt01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
mgt03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mgt03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
HFMG01NYA_1975 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFP78143
LinkDB
All DBs
Position
332299..335370
Genome browser
AA seq
1023 aa
AA seq
DB search
MFVNLNTRSYYSLLSTNLSVSEIIDFAVKNNQTHVCLTDLNVLYGAVEFYNLAKKNHLIP
IIGLEIFDHSTNSELVLIAKNNSGYLNLIKISSFASSNLEFDLFKYLDENLFVIVKSGHF
KWDHVNCLKKKELAFNFVNCYDLEKKVGLNVINAVSMKQAGKRSKFQIDELYNSQLVLAS
PFLSTEKAKKQFSQKQLDRLNDLVQQCSGWDLDNLTKNSIIKYHTPKGFDGDQYLVELCQ
TRFNDLLNKRLIRASDQKRLNYELAIIKKLNFSDYFLFVYDFINHAKQQGIVIGPGRGSA
AGSFISYLLNITTINPISYGLIFERFLNPQRKSMPDIDVDIMDSRREEVVDYLFNKYSKD
NVAHIITFQRIKVKNAIRDVCRVLDLKTSETDEVINFVSYDEISDWEKNQNATALKKVLN
CNECDLDQKKCKRSGAVSCYVISKIFDLAQTIFNVPRQTGLHAAGVVCGNDALTQTIPLQ
YLNNRSVSQFSMEYLEQFGLMKIDLLGLKTLTIIDEINSLVKLNYDRDFDINNIPLNNKN
TFNLLKKGYTKGVFQLESLGMQNVLKKVLPESIEDISIISALYRPGPQDNIDEYVKRRFS
NTEFNYLSEDLIEILKPTHGIIIYQEQVINTAMVVANFDAAQADSFRRAISKKDEALLLK
DKKAFIEQAIKNRYSEQKALEIFEYLHKFADYGFNHSHSLSYAFLAYQMAYLKANYPKEF
YLILLKNNVDSKVKLTDYFIEIIERNIGIIKPNINLSDWSFSLSADHQKIILGFNMINGL
GNENANKIVQARNNKQFEGFIDCLINLAKNGITKSLFDKLVNVGVFDQFKLELSKKAMSA
LVKSYFDQNVGFKNDDDLISYEEKKALVQSSLFFLTKEQPELFLNLSKDELIAENELADS
LLKVSFEAIKKKVYKPNIFKKEIAFLEKQIKDLKTVKQLKGALQKEVCSILVQIKKVELK
NKIWRFTIFDGAYEINAKVRDKKLSDYLTNFINQETKLIVRLDHDLFRGHDSYTILDVVD
IFK
NT seq
3072 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgtcaatttaaatactcgatcttactactctttattaagcactaatctaagcgtt
agtgagattattgactttgctgtcaaaaataatcaaacccacgtttgcttaactgattta
aatgttttatacggagcagttgagttttataacttagctaaaaaaaatcatctaatccca
atcatcggattagagatttttgatcatagcactaattctgaactagttttaattgcaaaa
aataattctggttatcttaatctaattaagattagtagttttgcttctagtaatcttgag
tttgatctttttaaatatttagatgagaatctttttgtcattgttaaatcaggtcatttt
aagtgggaccatgttaattgtcttaagaaaaaagaactagcttttaactttgttaattgt
tatgacttagagaaaaaagttgggctaaatgtgatcaatgcagttagcatgaaacaagct
ggcaaaagatctaaatttcagatcgatgagttatataattcccaacttgttttagctagt
ccttttttaagtacagaaaaagctaaaaaacaattttcacaaaaacaactagatagatta
aatgatttagttcagcagtgttcaggttgagatcttgataatctaaccaaaaattcaatc
attaaatatcacacccctaaagggtttgatggcgatcaatatttagttgaactgtgtcaa
actagatttaatgacttattaaacaaaagattaattagagctagtgaccaaaaacgttta
aactacgaactagcaatcattaaaaaacttaattttagtgattacttcttgtttgtttat
gattttattaatcatgctaaacaacaagggatcgtgatcggtccagggagaggttcagct
gctggatcgtttatctcttatcttttaaatatcaccacgattaatccaattagttatgga
ttaatctttgaacgtttcttaaacccccaaagaaaaagcatgcctgatatcgatgttgat
atcatggattcacgacgtgaagaagttgtagattacttatttaataagtattctaaagat
aatgttgcccacattattacgtttcaaagaattaaggttaaaaatgcgatcagagacgtt
tgccgggttttagatttaaaaactagtgaaacagatgaagtaattaattttgtttcatat
gatgagatatctgattgagaaaaaaaccaaaatgcgacagcacttaagaaagtgcttaat
tgcaatgagtgtgatttagatcaaaaaaagtgtaaacgttcaggagctgttagttgttat
gtgattagcaagatctttgatttagcccaaacgatctttaatgttccaagacagaccgga
ttacatgctgctggtgttgtttgtggtaatgatgcactaacccaaacgatcccattgcaa
tatttaaataaccgttccgtttcgcaattctcaatggaatatctcgaacagtttggtttg
atgaagattgatctgttagggttaaaaaccttaacaatcattgatgagattaatagttta
gtcaaactaaactatgatcgtgattttgatatcaataatatcccactaaataataagaac
acctttaacttattaaaaaaagggtatacgaaaggagtgttccaattagaatctttaggg
atgcaaaatgtcttaaaaaaggttctaccagaatcaattgaagatatctcaattatctca
gcactataccgaccaggtccccaagataatattgatgaatatgtcaaaagacgattctca
aacactgaatttaattacttaagtgaagatttaattgagatcttaaaaccaacacatggg
atcatcatttatcaagaacaagtgattaacacagcaatggtggtagcaaattttgatgct
gcacaagctgattcttttcgtagagcaatctctaaaaaggatgaagccttattattaaaa
gataagaaggcttttattgaacaagcgatcaaaaatcgctattcagaacaaaaagcgtta
gagatctttgaatacttacataagtttgctgattatggttttaaccattctcactcctta
tcttatgcgttcttagcttatcagatggcctatctgaaagctaattatcccaaagagttt
tatctgatcttattaaaaaacaacgttgattctaaggtaaaactcactgattatttcatt
gagattattgaacgcaatattgggatcattaaaccaaatattaatctttcagattgatcg
tttagtttaagtgctgatcatcaaaagatcattctagggtttaatatgattaatggtcta
ggtaatgaaaatgccaacaagatcgtacaagcaagaaataacaaacagtttgaaggtttc
attgattgtttaatcaatttagcaaaaaatgggattactaaaagtttatttgataagtta
gttaacgttggtgtttttgatcaatttaaattagagttatctaagaaagcgatgagtgct
ttagttaaatcgtattttgatcagaacgttgggtttaaaaacgatgatgatctaatctca
tatgaagagaaaaaagcgcttgttcaatctagcttattctttttaactaaagaacaacct
gaactgtttttaaatctttctaaagatgagcttatagctgaaaacgagttagctgattca
ttactaaaagtttcatttgaagcgatcaagaaaaaagtttataaaccaaatatctttaaa
aaagagattgcttttttagaaaaacagattaaagatttaaaaacagtgaaacaactaaaa
ggtgcactacaaaaagaagtgtgtagtatcttagtgcaaatcaaaaaagttgaactgaaa
aacaagatctgaagattcactatctttgatggtgcatatgagattaatgctaaagtaaga
gataaaaaattaagtgattatctaaccaacttcattaatcaagaaacaaaattgatcgtg
cgtttagaccatgacctatttagaggccatgattcttacaccattttagatgtagtagat
atttttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
