KEGG   Mycoplasmoides gallisepticum WI01_2001.043-13-2P: HFMG01WIA_0592
Entry
HFMG01WIA_0592    CDS       T02204                                 
Name
(GenBank) putative hydrolase
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mgw  Mycoplasmoides gallisepticum WI01_2001.043-13-2P
Pathway
mgw03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mgw00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    HFMG01WIA_0592
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mgw03019]
    HFMG01WIA_0592
Messenger RNA biogenesis [BR:mgw03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     HFMG01WIA_0592
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP RNase_J_C RMMBL DUF4763
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFP78773
UniProt: J3VGN4
LinkDB
Position
95672..97453
AA seq 593 aa
MCAFFVFIDIFILIINNMAKINFFTLGGQDEQGKNCSVLEVNDDIYLFNAGSLVPINSLL
GVEQLIPDYSYIVNHKKKVKGLFIGYPSQSNLGSLLYLLKSLKPQTLTVYTSLIGKTIIE
SIMDKQRNFEPYKKHVNIVVLNPLKEFKINDSVSVIPFRVFSSIPYSYGFCLSTQDGMIV
YIDDFILVNDKNKTFSSDLMDLRMLITNKKVLLLIVGAGQVGKHISNTSPNHRSKQAIEK
FMNDCKGRSIIACYDDNVYAMFTAATIARKQQRPFIVYSQASINLFNTIIKKNMFNSRDL
QTMPISEMNNVKDAIIVVANTPHNLYNQLAKIATGEDKRLKLDSEDRFILLTPKIAGFES
YEAKILDEIARCDVIYKRLNSEVLPIKASNEDHKFLVNLLRPQYAVPIQGLYKEFVKYLE
VVNQTGNFKEHQKPILLYNGEILSFVNGKLTNKHEELHLNSKCIDTAGVQDVKSMILSER
FQMGCNGVVVLAMYFSTKKMEFLDAIDIQTYGVSDEAVKLNEAIQKCKTQIKTMQITFIT
DIKDRIEKNMKKRITMNDYTQFKKTIRKLVGKIFEKSLFKNAAVITSVVELEN
NT seq 1782 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtgtgccttttttgtttttattgatatattcatattaattattaacaatatggctaaa
attaattttttcacgctaggcggacaggacgaacagggaaagaactgttctgttctagaa
gtcaatgatgatatctatttatttaatgcagggagtttggtaccaatcaacagtctatta
ggtgttgaacaactaatccctgattattcatatatcgtcaatcataaaaagaaggttaaa
ggtttatttatcggttatccttcacaatcaaacttaggttcattactttatttattaaaa
tcattaaaaccccaaacattaactgtttatacttcattaatcggtaaaacgattattgaa
agtattatggacaaacaacgcaactttgagccatataaaaaacatgtcaatatcgttgtt
ctaaacccattaaaagagtttaagatcaatgacagtgttagtgtcattccgtttagggta
ttttcatcaatcccttatagttatggtttttgtttatcaactcaagatgggatgatcgtt
tatatcgatgatttcatcttggttaatgataagaacaagacattcagttcagatctaatg
gatctgagaatgttaattactaataaaaaggttctattattaattgttggtgctggacaa
gtgggtaaacatattagtaataccagtcccaaccaccgctcaaagcaagcaattgaaaag
ttcatgaacgattgcaaagggcgaagtattattgcttgttatgacgataatgtttatgcg
atgtttacggcagctacgattgctagaaaacaacaaagaccatttatcgtttatagtcaa
gcatcaattaacttatttaatacgattattaagaagaatatgtttaattctcgagatttg
caaacgatgccaatcagcgagatgaacaacgttaaagatgcgattattgtcgtagctaac
actccgcacaatttatacaaccagttagcaaagattgctactggtgaagataaacgctta
aaactagattcagaagatcgttttatcttattaacccctaagattgcagggtttgagagt
tatgaagctaagatcttagatgagattgcgcgttgtgatgtgatctataagcggcttaat
tctgaagttttaccaattaaagcttcaaatgaagatcataagtttttagttaacttacta
agaccacaatatgcagtaccaatccaaggtttatataaagagtttgtaaaataccttgaa
gtggttaaccaaactggtaatttcaaagagcaccaaaaaccaatcttactttataatggt
gagatcttaagttttgttaatgggaaattaacaaataaacatgaagaattacatttaaat
tcaaagtgtattgatactgctggtgtacaagatgttaaatcgatgatcttatctgagcga
ttccaaatgggttgtaatggtgttgttgttttagcgatgtatttctcaaccaaaaagatg
gaattcttagatgcaattgatatccaaacttatggtgttagtgatgaagcagttaaatta
aacgaagcgatccaaaaatgtaaaacgcaaattaaaacgatgcaaattacgttcatcaca
gatatcaaagatcgaatcgaaaagaatatgaaaaaacggattacgatgaacgattacacc
caattcaaaaagacgataagaaaattggtaggtaagatctttgaaaagagcttatttaag
aatgcagcggtaataactagtgttgttgaattagaaaactaa

DBGET integrated database retrieval system