Marivirga harenae: Q3Y49_01075
Help
Entry
Q3Y49_01075 CDS
T09240
Name
(GenBank) cadherin domain-containing protein
Organism
mhaa
Marivirga harenae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Cadherin_CELSR2_9th
Cadherin_FAT4_N
Ig_BT4661_1st
CHU_C
Big_9
PKD
DUF7154
PKD_4
Bact_surface_Ig-like
Ig_7
Ig_3
Lectin_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKV12426
LinkDB
All DBs
Position
complement(235381..242124)
Genome browser
AA seq
2247 aa
AA seq
DB search
MKNKLLLTIILFLTWVGAQAHSGGVWIANDGCGHWYAIVFHYHNNSSGGSVSGSAKAGLY
IDYDQDGVFNVNGQTYAYTNAAGFTTSDGDFQRFTDWINLSDKSMSANAFANNAATQTEV
LNWLNANKNFGKNYSLTVAIDAGNYSSTWYEALVAPIKPLSPGVYKTSTSTSSMVETPVG
YTNPFNLNYTPTNFTGTLTTQSTCGETLQIEASLTQTCVEEYGLVYSLTNQLPSVGDADA
TKQVLWNGVATDFTNEALDYTVNVDAADEFKDHYLRTYYLQNVSGTYFYVYSPLITAMPL
DPDLDCDGDGISNGQELDTSDTNKDTDGDEIPDYRDQDSNNDGTSDSEDTGAPDCDEDGV
KDFQDLNNDPGIQSQPSNASACDLSNATFSVTATGGGLSYQWQVNEGSGFVDLVNDNTYS
NASSSTLNISAATLGMDGFLYRCVINSSSCNTSSTSENASLTINFVSAPVSTDVTYNLDE
TAAALSTHITGQNLTYYDAENGGTGVVHEITPSTNNVGVSEYWVSQTVDGCESARSKVTV
TVEFPYALGGSASAKSSLYALNSKVDESVTITGSGDITDPKVYVNTGYQTGDKLQSGIDL
PSGISANFDANSGSLNFTGTASAAVWQEIFRNVMFSSSSSNMDDRTIAFILENSISLKVN
GKDHYYQYISGSKTWAQAKTAAEAMTFLGLPGYLATVTSQNENDFIENKLASDGWIAGSD
DHNFINAAVGSTLYASQASAEGKWYWVSGPEKGVAISNGNASPVAVGDAFINWNPGEPNN
SSGEHYMQLYSTQNGKWNDLPGGYSLNGFVVEYGGYEDEESPSILHSRVFSFDQDADISI
TVNDIDENSTAGTVLDQLHVSGIDEDMNITFALTSGEGDTDNNLFSIVDGELVSSSSFDY
ESKSSLSIKVKASDELGGSFEKVLVISVNNLNDNAPIIAANQSFDIDENSAENTVVGTVS
VSDADGSTTYENWSITAGNTNEAFQIDANTGKISVKTTDLDYEAVGAYNLTVTVQDGANT
SSAVDLTIEINNLNDNAPVIVANQSFNIDENSAQNTVVGTVAVSDADGATTYENWTITAG
NTNEAFQIDANTGEISVKTTDLDYEAVGAYILTVTVQDGANTSSAVDLTIDINNLNDNAP
VIAANQSFNIDENNAQNTVVGTVAVSDADGATTYENWTITAGNTNEAFQIDTNTGEISVK
TTDLDYEAVGAYTLTLTVQDGANTSSAVDLTIDINNLNDNAPVIAANQSFNIDENSAQNT
VVGTVAVSDADGSTTYENWTITSGNTNEAFQIDANTGEISVQTTDLDYEAVAAYTLTVSV
EDGVNTAAAVDLTIGINNLNDNAPVIAANQSFDIDENSVQHTVVGAVAVSDADGTTTYEN
WSITAGNTNEAFQIDANTGELSVKTTDLDYEAVGAYTLTVTVQDGANTSEAVELTLDVNN
QNDNTPIISANQSFDIDENSAQNTVVGSVSVSDADGTTTYENWIITAGNTNEAFQIDAST
GEISVKTTDLDYEAVGNYALTLTVQDGANTSAAVELSIDINNLNDNAPIIASNQSFDIDE
NSAQNTVVGSVSVSDADGTTTYENWIITAGNTNEAFQIDASTGEISVKTTDLDYEAVGNY
TLTLTVQDGANTSAAVELSIDINNLNDNAPIIAANQSFDIDENSAENTVVGSVSVNDADG
STTYEKWTITAGNTNEAFQIDTNTGELSVKATDLDYEAVGSYTLTLTVQDGANTSAAGNV
LVKINNLNDNAPVITANQSFSINENSVENSLVGTVKATDADGTQQQFTWNLISEENEKAF
AIDANNGIIKVLNSSLLDAERKTQFVAEVIASDGVHQFSSEITINVLNINDNEPGIAENQ
SFTIEENLSDETNIGQIVASDADAASVLGNWEILSGNTDDAFELDPNTGVLSVNNSAALD
FETRSTYTLNVKVTDGELESNVAVIVIQITDLNDLAPIIENNISFSIAENEPIGTELGMI
RATDKDGNTELTNWTIISGNDQNAFSINENTGLLVVNNSGALDYEKVNQFTLGITVSDGI
NTSNVSEISVAIENVNDNAPSSLSLSNTQLHEADASGTEVGYFTTADADVIDNFTYQLVS
GEGDDDNDYFQIIDDELFTSKPLDFDYNSRLKIRVRTEDSGGNAFEANFSITVTANMEIE
LSIPTAFTPNGDGSNDTWEIDRMGNYPKSTIRIYNSDGIEVFKNTGYTQQWDGYYNGKLM
SIGNYYYIIQLNDSTGKVYKGSVMIIK
NT seq
6744 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaaattattacttacaattatcctatttcttacttgggtaggagcacaagcc
cactcaggtggggtatggatagccaatgatggatgtggtcattggtacgccattgtattt
cactatcataacaatagtagtggagggtctgtttctggctctgcaaaagctggactttat
attgactacgaccaggatggtgtattcaacgtgaatggacaaacatacgcctataccaat
gctgccggttttacgactagcgatggagactttcagagatttactgattggattaacctt
tctgataagtcaatgtcagctaatgcatttgcaaataatgcagctactcaaactgaggtg
ctaaattggctcaatgctaataaaaactttggaaaaaattactctttaactgtagccatt
gatgcgggaaactattctagtacatggtacgaagcattagtcgcaccaattaagccctta
tcgcctggagtttataaaacatcgacttcaacctcctcaatggtggaaactcctgttggt
tatactaacccatttaacttaaactatactcctactaatttcactggaactctaacaact
cagagcacctgtggagagactttacaaattgaagcaagtttaacacagacttgtgttgaa
gaatatggtttggtttattccttgactaaccaattaccttcagtaggggatgcagacgca
acaaaacaagtattatggaatggtgttgccactgattttaccaatgaggcacttgactat
accgtaaatgtagatgcagcagatgaatttaaagatcattacctaagaacatactattta
caaaatgtgtcgggtacttatttttatgtttattcacctttgattactgccatgcctttg
gatcccgacttagattgtgacggtgatggaatatcaaatggccaagagttagatacatct
gatactaataaagatactgatggtgatgaaatacctgattaccgagatcaagattccaat
aatgatgggacttccgatagtgaagatacaggagctcccgattgtgatgaggatggtgtt
aaggattttcaagatttaaataatgatccagggattcagtcacagccatccaatgcttct
gcgtgtgacctcagcaacgcaactttcagtgtaactgctacgggaggaggattatcctat
cagtggcaagtgaatgaagggtcgggttttgtggatttagtaaatgataacacttacagt
aatgcatcaagcagtacattgaatatctctgcggccaccttgggtatggatggcttcctc
tacagatgtgttattaattcttcttcatgtaatacttcttcaacttccgagaatgcaagc
ttaaccatcaattttgttagtgcgcctgtatcaacggatgtcacatataatcttgatgaa
acagctgccgctttaagcacacatattacaggtcaaaatttgacttactatgatgctgaa
aacggaggtactggtgttgttcatgaaataactccttctacaaataatgttggagttagc
gaatactgggtaagtcagactgttgatggatgtgaatccgcaaggtctaaagtaactgta
actgtggaatttccatatgcattaggaggttctgctagcgcaaaaagcagcttgtatgct
ctcaatagtaaagttgatgagtctgtcacaatcactggtagtggtgatataacagaccca
aaagtttatgttaacacgggctatcaaactggtgacaagctgcaatcaggaattgatttg
ccttcaggtatttcagctaactttgacgctaatagcggtagtttaaatttcaccggaact
gctagtgcagcagtttggcaagaaatatttagaaatgtgatgttctcttctagttcttca
aatatggatgacagaacaattgcatttattttagagaatagtatcagtctaaaagtaaat
ggcaaagatcactattatcaatatatatcaggtagcaaaacgtgggctcaggcaaagaca
gcagcggaagctatgacattcttaggattgccaggatacttagcgacagtcacttcgcaa
aatgaaaatgactttattgaaaataaattagctagtgatgggtggattgcaggatcagat
gaccacaatttcataaatgctgcagttggttccacattgtatgcaagtcaagctagtgca
gaagggaaatggtattgggtgagtggaccagaaaagggagtagctatttcaaacggcaac
gcttcaccagtagcagtaggggatgcttttattaattggaatccaggggaaccaaataat
tcatcgggcgaacactatatgcaattatattccacgcaaaatggaaagtggaatgatctg
cctggtggatatagccttaatggctttgtggtagaatatggaggatacgaagatgaagag
tcgccaagtatcctgcatagcagagttttttcatttgaccaagatgcagatatttctatt
actgtaaatgacattgatgaaaatagtacagctggtacagtcttagatcaattacatgtt
tccggaatcgatgaggacatgaatattactttcgcattgaccagtggcgagggtgatact
gacaataatctattttcaatagttgatggcgaattagttagcagcagcagcttcgactat
gaaagcaaatcaagtttaagcataaaagtaaaagcttcagatgaacttggaggcagtttt
gaaaaagtattagttatttcggtcaataatcttaatgataatgcaccaataatagctgct
aatcagtcatttgatattgatgagaatagtgcagaaaacacggtagtaggaactgtttca
gtaagcgatgcagacggcagcactacttatgaaaactggagcatcacggcagggaataca
aacgaagccttccaaattgatgcgaatacaggaaagatttcagtaaaaaccactgatttg
gattatgaagcagtaggtgcttataacttaactgtaacagttcaagatggagcgaacact
tcttcagctgttgatttaactattgaaatcaacaacttgaacgacaatgctccagtaatt
gtagcaaatcaatcatttaatattgatgagaatagtgctcaaaatacggtagtgggtaca
gttgcagtaagcgatgcagacggagccactacttatgaaaattggaccatcacggcaggg
aatacaaacgaagccttccaaattgatgccaataccggggaaatctcagtaaagactaca
gacttggattatgaagcagtaggtgcttatatcttaactgtaacagttcaagatggagcg
aacacttcttctgcggttgatttgacaattgatatcaataatttaaatgacaatgctcca
gtaattgcagcaaatcaatcatttaatattgatgagaacaatgctcaaaatacggtagtg
ggtacagttgcagtaagcgatgcagacggagcaactacttacgagaattggactattacg
gctggaaatacgaacgaagccttccaaattgataccaataccggagaaatctcagtaaag
actacagacttggattatgaagcagtaggtgcttataccttaactttgacagttcaggat
ggagcgaacacttcttctgcggttgatttgacaattgacatcaataatttaaatgacaat
gctccagtaattgcagcaaatcaatcatttaatattgatgagaatagtgctcaaaatacg
gtagtgggtacagttgcagtaagcgatgcagatggcagcactacttatgaaaactggacg
atcacatcaggcaatacgaacgaagccttccagattgatgccaatacaggcgagatttca
gtacaaactactgatttggattatgaagcagtagctgcttatactttaacagtatcagtt
gaagacggagtaaatactgcagcagcagtggatttgacaattgggatcaataacctgaat
gataatgcaccggtaatcgctgctaatcagtcattcgatattgatgagaacagtgttcag
catacagtagtaggtgctgttgcggtaagcgatgcagatggcacgactacttatgaaaac
tggtcgattacagctggaaatacaaacgaagccttccagattgatgccaataccggtgag
ctatccgtaaaaactactgacttggattatgaagcagtgggagcttatactttgacggta
acagttcaagatggagcaaatacttctgaagcagtagaattgacccttgatgtgaacaat
caaaatgacaataccccgataatctctgctaatcagtcattcgatatagatgaaaatagt
gctcaaaatacagtagtaggttctgtttcggtaagtgatgcagacggcacgactacttac
gaaaactggatcatcacagcaggtaacactaacgaagccttccagattgatgcaagtact
ggagaaatctcagtaaagactactgacttggattatgaagcagtgggtaattacgctttg
acgctaacagttcaagatggagcgaatacatcagcagcagttgaattatcaattgacatc
aataatttgaatgataatgcaccgataatcgcatctaatcaatcattcgatatagatgaa
aatagtgctcaaaatacagtagtaggttctgtttcggtaagcgatgcagacggcacgact
acttacgaaaactggatcatcacagcgggtaacaccaacgaagccttccagattgatgca
agtactggagaaatctcagtaaagactactgacttggattatgaagcagtgggtaattac
actttgacgctaacagttcaagatggagcgaatacatcagcagcagttgaattatcaatt
gacatcaataatttgaatgataatgcaccgataatcgcagcaaatcagtcattcgatatt
gatgaaaacagtgctgagaatacggtagtaggatcagtttctgtaaacgatgcagacggt
agtactacttatgagaaatggacgattacagctggcaatacgaatgaggctttccagatt
gataccaataccggtgagctatcagtaaaagctactgacttggattatgaagcagtaggt
tcttatactttgaccttaacagttcaagatggagcgaacacttcagcagcaggaaatgta
ctagttaaaatcaataacttgaatgataatgcaccagtaatcacagcgaatcaaagcttt
agcataaatgaaaattcagtagaaaatagcttagtgggtactgtaaaagccacagatgcg
gatggtacccaacaacaatttacatggaatctaattagtgaagaaaatgaaaaggctttt
gctattgatgcaaacaatggaattatcaaagtattgaattcttctttgcttgatgcagag
agaaagactcaatttgtagcagaggtaatcgctagtgatggtgttcatcaattcagttct
gaaataaccatcaatgttttaaatatcaatgacaacgaacctggaattgctgaaaatcaa
agcttcacaattgaagagaatttatctgatgagactaatataggtcaaatagtggcttca
gatgcagacgcggcatccgtacttgggaattgggaaattttgagcggcaatactgatgat
gcattcgaattagatccaaacacgggggttttgagtgtaaataatagtgctgcattggat
tttgaaactagaagtacttacacattaaatgtgaaagtaaccgatggtgaactagaaagt
aatgtagcagtaattgttattcaaataacagatttgaatgatttagcacctataattgaa
aataatataagtttctctattgcagaaaatgagccaataggaactgagttaggaatgatt
agagctactgataaggatggtaatactgaactgaccaattggacaataatttcaggtaac
gatcaaaatgcatttagcataaatgagaatactggtttgcttgtagttaataattccggt
gcgctagattatgaaaaagtaaatcagttcactttaggaattactgtttcggatggaata
aatactagtaatgtaagcgagattagtgttgcaattgaaaatgtcaatgataatgcacca
tcatcattaagtttaagcaatactcaactacatgaagcagacgcaagcggaacagaagta
gggtatttcaccactgctgatgcagatgtaattgataattttacctatcaactggtgagc
ggagaaggggatgatgataatgattattttcaaataattgatgatgaattattcacaagt
aaaccattggatttcgattataatagcaggctgaaaatacgagtaagaacagaagatagt
ggtggcaatgcatttgaagctaatttcagcatcaccgtgacggctaatatggaaatcgaa
ctaagtattccaacggctttcacacccaatggcgatggaagcaatgatacttgggaaatc
gatagaatgggcaattatcctaagagtactattagaatttataatagtgatggaattgag
gtgttcaaaaatactggatacacccaacagtgggatggctactataatggaaaattaatg
tctattggtaattattactacatcattcaacttaatgatagcactggtaaggtttataag
ggcagtgtaatgatcattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system