Marivirga harenae: Q3Y49_02160
Help
Entry
Q3Y49_02160 CDS
T09240
Name
(GenBank) choice-of-anchor D domain-containing protein
Organism
mhaa
Marivirga harenae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
HL_N-beta
FG-GAP_2
Por_Secre_tail
ASH
Cep192_D4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKV12637
LinkDB
All DBs
Position
complement(490975..496332)
Genome browser
AA seq
1785 aa
AA seq
DB search
MKSFLTLKIITCFIFFTCLNFHTQAQWSQKGADIDGGVAGDRSGEAISFSADGNTLAIGA
MRNDAGGDNSGTVRVYTWNGSSWVQKGANIDGEAAGDGSGGSVSLSSDGNTIAIGANANS
ASGQYAGHVRVYSWNGSSWVQKGADMDGEATYDNSGLAISLSSDGNILAVGATGNDGNGI
GAGHVRVYVWNGSSWVQKGTDIDGEAAGDMSGKSVFLSSDGNVVAIGAYRNDGAGDNAGH
VRVFSWDGSSWSQRGSDIDGEAAGDESGTSVSLSNDGNTLAIGAPKNEVGNNTTGHVRVY
NWNGSSWNQRGVDIDGEANNDNAGGSVSLSSDGNTVAIGAWSNSGNGTASGHVRVYSWNG
SSWYQRGLDIDGEAALDNSGKSISLSSDGNSIAIGAHLNDDGGDIAGHVRVYKAIPDIDI
KQGSTDIAVATEYDFGDVYVSASSSDITFTIENSGIADLNLVGTIGSFIILEGGNADQFS
IAQTNVTATISANSSNSFTIKFSPTSEGVKTAAIKITSNDPDEGIYTINLKATGVKQNQN
ITFEALANKTYGDANFNLNATGGASGNAVTYSSSDATVATVTGKTVTIVGAGTTEITASQ
AGNVNYNAASDVVQTLTVEKADQIITFEALASKTYGDANFDLNAIGGASGSPVTYSSSDA
SVATVSGNTVTIVGAGTTEITASQAGNDDYNAVDAVQTLTVTKADQSVTFEALASKIYGD
ANFDLNATGGASGNPVTYSSSDASVATVSGNTVTIVGAGTTEITASQTGNDDYNAADAVQ
TLTVTKADQSVIFESLASKIYGDVNFDLTATGGASGNAVTYSSSDASVATVSGNTVTIVG
AGTTEITASQAGNDDYNAADAVQTLTVAKANQSVIFESLASKIYGDANFDLTATGGASGN
AVTYSSSDASVATVIGNTVTIVGAGTTEITASQAGNDDYNAADAVQTLTVAKANQSVTFE
ALASKTSGDANYDLTATASSGLAVTYTSSDASVATVSGNTVTIVGVGTTEITASQVGDDN
YNAASDVVQTLTVEKGDQSISFESLASKTYGDANFDLNATGGASGNAVTYSSSDASVATV
VGNTVTIVGAGTTEITASQAGNDDYNAANAVQTLTVVKANQSVIFEALASKIYGDANFDL
TAIGGASGSPVTYSSSDASVATVSGNTVTIVGAGTTEITASQAGNNNYNAADAVQTLTVE
KGDQSVTFEALASKTSGEANYDLTATASSGLAVTYTSSDASVATVSGNTVTIVGVGTTEI
TASQVGDNNYNAASDVVQTLTVEKGDQSISFNAIAIKKYGDTNFDLSATASSGLAVTYTS
SDESIATVSGNTVTIVGVGRTEITASQVGNDNYNAASDVVQTLTVEKGDQSISFESLASK
TYGDANFDLNATGGASGNAVTYSSSDASVATVVGNTVTIVGAGTTEITASQAGNDDYNAA
SVVIQTLTVEKGDQIITFEALASKIYGDANFDLTAIGGASGSPVTYSSSDASVATVSGNT
VTIVGAGSTEITASQAGNDNYNAASVVIQTLTVEKGDQSISFEALASKTYGDANFDLNAT
GGASGSPVTYSSSDASVATVVGNTVTIIGAGTTEITASQAGNDDYSAAAAVQTLTVTKAD
QSITFEAIANQFFEVETLTLSATASSGLGVEYTVTSGPATVEANLITLTGLGLVTIEARQ
AGNINYFAAEEVSQSFEVVAVTAISQAEFSSLRLYPNPSSDILKLKNIDRAVQKIIVFNA
KGQRIHQIENPKQEEQLMVKNWKTGIYMVVVRTANGQQETKFIKK
NT seq
5358 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagctttctcactttaaaaattatcacatgttttattttttttacatgcttaaac
tttcatacccaagctcaatggagccaaaaaggagctgatattgatgggggagtagcgggt
gatcgatcaggtgaagccatttctttttctgctgatggtaatactttagctattggtgca
atgagaaatgatgcaggaggcgataactcaggaacggttcgtgtatatacttggaatggg
agttcttgggttcagaaaggagctaatattgatggtgaggcagctggtgatggatcaggc
ggatctgtttctctttcctctgatggcaataccattgcaataggtgcaaatgcaaatagt
gcatcaggacaatacgcaggtcacgtgcgagtgtatagctggaatggaagttcatgggtt
caaaaaggagctgatatggatggggaggcaacttacgataattcaggcctagctatttct
ctttcttctgatggcaatattctcgctgtcggtgcaactggaaatgatggtaacggcatt
ggtgcaggtcatgtacgtgtatatgtttggaatgggagttcatgggttcaaaaaggaact
gatatcgatggagaagcagctggcgatatgtcaggcaaatctgtttttctttcttctgat
ggtaatgtggtggctattggcgcatatagaaatgatggagcaggagataatgcaggtcat
gtacgcgtgtttagttgggatgggagttcctggagccaaagaggatctgatattgatggt
gaagcagctggtgatgaatcagggacatctgtatctctttctaatgatggcaatactttg
gccattggtgcacctaaaaatgaagtaggaaataatactactggtcatgtgcgtgtatat
aattggaatggaagttcctggaaccaaagaggagttgatattgatggagaagctaataat
gataacgcgggcggatctgtttctctttcttctgatggtaatacagttgctattggtgca
tggtcaaattctggaaatggtactgcttccggccatgttcgcgtatatagctggaatgga
agttcttggtaccaaagaggcctcgatattgatggtgaagcagcattagacaattcaggt
aaatctatttctctttcttcagatggtaatagcatagcaattggtgcacatctaaatgat
gacgggggagatattgcaggtcatgttcgtgtgtataaagcgattcccgatattgatatt
aagcagggcagtacagatattgcggttgcaactgaatatgacttcggagatgtctatgta
agtgcgtcttcttccgatattacctttaccattgaaaatagtggaatagcagatttgaat
cttgtagggacaattggttcttttataatcctggaaggtggaaatgctgatcaattttca
atagcacaaacaaatgttaccgctactatttcagcaaacagtagtaacagctttaccatt
aaattttctccaactagcgaaggggtgaaaaccgctgcaattaaaattactagtaatgac
ccagatgaaggaatttataccataaaccttaaggctacgggagtaaaacaaaatcaaaat
attactttcgaagcattagctaataaaacatacggtgatgctaactttaatctaaacgcc
acaggaggtgcatcaggtaatgcggttacttactcaagctcagatgctacagttgcaact
gtaacaggtaaaacagtcactatcgtaggtgctggtactacggagatcactgcttcccaa
gccgggaacgttaattataatgcagcttctgatgtagtacagacccttacagttgaaaaa
gcggatcaaattattactttcgaagcattagctagtaaaacatacggtgatgccaacttt
gatttaaacgcaataggaggtgcatcaggaagtccagtcacgtattcaagctcagatgct
tcggttgcaacggtttcaggtaatacggtcactatcgtaggtgctggtactacggagatc
acggcatctcaagctggaaatgatgattataatgctgttgacgcagtgcaaaccctgacc
gtaacaaaagcggatcaaagtgttactttcgaagccttagctagtaaaatatacggtgat
gccaattttgatttaaacgcaacaggaggtgcatcaggtaatccggtcacttattcaagc
tcagatgcttcagttgccactgtttcaggcaatacggtcactatcgtaggtgctggtact
acggagatcacagcatctcaaactggaaacgatgattataatgctgctgacgcagtacaa
accctgaccgtaacaaaagcggatcaaagcgttattttcgaatccttagctagtaaaata
tacggtgatgtcaattttgatttaaccgcaacaggcggtgcatcaggtaatgcggtcact
tattcaagctcagatgcttcggttgccactgtttcaggcaatacggtcactatcgtaggt
gctggtactacggagatcacggcatctcaagccggaaacgatgattataatgctgctgac
gcagtacaaaccctgacagtagcaaaagcgaatcaaagcgttattttcgaatccttagct
agtaaaatatacggggatgccaattttgatttaaccgcaacaggcggtgcttcaggtaat
gcggtcacttattcaagttcagatgcttcggttgcaactgtgataggcaatacagtcact
atcgtaggtgctggtactacggagatcacggcatctcaagccggaaacgatgattataat
gctgctgacgcagtacaaaccctgacagtagcaaaagcgaatcaaagcgttactttcgaa
gccttagctagtaaaacatccggtgatgccaattatgatttaactgcaacagcaagctca
ggtttagctgtaacttatacaagctcagatgcttcggtcgctactgtttcaggcaatacg
gtcactatcgtaggtgtcggaactacagagattactgcatctcaagtcggagacgataat
tataatgctgcttcggatgtagtacagacccttacagtggaaaaaggggatcaaagcatt
agtttcgaatccttagctagtaaaacatatggtgatgccaactttgatttaaacgccaca
ggaggtgcatcaggtaatgcggttacttattcaagctcagatgcttcggttgcaactgtt
gtaggtaatacggtcactatcgtaggtgctggtactacggagatcacggcatctcaagcc
ggaaacgatgattataatgctgctaacgcagtgcaaaccctgacagtagtaaaagcgaat
caaagcgttattttcgaagccttagctagtaaaatatacggtgatgccaattttgattta
accgcaataggaggtgcatcaggaagtccagtcacgtattcaagctcagatgcttcggtt
gccactgtttcaggcaatacggtaactatagtaggtgctggtactacagagatcacggca
tctcaagccggaaataataattataatgctgctgacgcagtacaaacccttacagtggaa
aaaggggatcaaagcgttactttcgaagccttagctagtaaaacatctggtgaagccaat
tatgatttaactgcaacagcaagctcaggtttagcagtaacttatacaagctcagatgct
tcggtcgccactgtttcaggcaatacggtcactatcgtaggtgtcggaactacagagatt
actgcatctcaagtcggagacaataattataatgctgcttctgatgtagtacagaccctc
acagtggaaaaaggggatcaaagcattagtttcaatgcaatagctatcaaaaaatatggt
gatactaattttgatttaagtgcaacggcaagctcaggtttagctgtaacttatacaagt
tcagatgaatctattgcaactgtttcaggtaatacggtcactatcgtaggtgttggtcgt
acagagattactgcatctcaagtcgggaacgataattataatgctgcttcggatgtagtg
cagacccttacagtggaaaaaggggatcaaagcattagtttcgaatccttagctagtaaa
acatatggtgatgccaactttgatttaaacgcaacaggaggtgcatcaggtaatgcggtt
acttattcaagctcagatgcttcggttgcaactgttgtaggtaatacggtcactatcgta
ggtgctggtactacggagatcacggcatctcaagctggaaacgatgattataatgctgct
tcggttgtaatacagacccttacagtggaaaaaggggatcaaattattactttcgaagcc
ttagctagtaaaatatacggtgatgccaattttgatttaaccgcaataggaggtgcatca
ggaagtccagtcacgtattcaagctctgatgcttcggttgcaacggtttcaggcaatacg
gtaactatagtaggtgctggttctacagagatcacggcatctcaagccggaaatgataat
tataatgctgcttcggttgtaatacagacccttacagtggaaaaaggggatcaaagcatt
agtttcgaagccttagctagtaaaacatacggtgatgccaactttgatttaaacgccaca
ggaggtgcatcaggaagtccggtcacgtattcaagctcagatgcttcggttgcaactgtt
gtaggtaatacggtaactatcataggtgctggtactacggagatcacggcatctcaagct
ggaaatgatgattatagtgctgctgccgcagtacaaaccctgactgtaacaaaagcggat
caaagcattacttttgaagcaatagctaatcaattcttcgaagtggaaactcttacttta
tcagccacagcctcttcaggcttgggggttgaatatactgttacttcgggaccagcaact
gtagaagcgaatttaattactttaacaggcttaggattggttacaattgaggcaaggcaa
gcagggaacataaattattttgctgcggaagaggtaagtcagtcttttgaggtggttgcc
gttacagcaatatcgcaagctgaatttagctcacttcggttataccctaacccctcttcg
gatatcctgaagttgaaaaatatcgacagagctgtgcaaaaaattattgtatttaatgca
aagggtcaacgtatccatcagatagaaaatcctaaacaagaagaacaattgatggtcaag
aactggaaaactggaatttatatggtcgtagtacgtactgcaaatggccagcaagaaacc
aaattcattaaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system