Marivirga harenae: Q3Y49_12960
Help
Entry
Q3Y49_12960 CDS
T09240
Name
(GenBank) M12 family metallo-peptidase
Organism
mhaa
Marivirga harenae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reprolysin_4
Reprolysin_2
Reprolysin_3
Reprolysin_5
fn3
Por_Secre_tail
P_proprotein
DUF4953
Peptidase_M66
ASH
Metallopep
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKV11120
LinkDB
All DBs
Position
complement(3015241..3019305)
Genome browser
AA seq
1354 aa
AA seq
DB search
MRLQRFLIFLIVFFTGFVSHAQNYNGQFWTESNARASARLISTEKQKIYKLAVDQLKAKL
NQNSKLNFSIPYPDGAFQEFKLEESPIMAPALAKKYPNIKTYSGRNPTTGETLRLDLSKK
GFHAMVYSTEGVFFIDPVQDQFNDYQIYYKKDLKRDPKKPRFEELEPIIADDVQFQRMQS
MVESGNVNQPSGTQLRTYRIAVAATGEYTEFHGGTVEDGLSAIVSTMNRVNSIYEKEIAV
RMVLVENNDEIIFTNSSTDPFTVDDVGILIDENQVVLDSIIGNQNYDLGHNFSTAAGGLA
GLGVVCRSNSKARGVTGINQPIGDPFDVDYVSHEIGHQFGAPHTFNGTVSSCGQNRSANS
AYEPGSGSTIMAYAGICGGDNIQNNSDPYFHTASLDFMNAYIQDNAGNNCADITETGNNL
PIVEAGQGGFTIPISTPFQLNGFATDPDGDQLNYAWEQFDLGPAGSPNLPQDNAPLFRSF
SPTLDSFRIFPQISDILNGTQTKGEILPDYARNLNFRLSVRDNQAIAAVDHDEISFSVTD
IAGPFIVDTISGDYSGLNIITVSWEVNNTNIAPVNAAFVDIYLSTDGGQTFSVKVLENTE
NDGSEPIELPNINTNQAKIKVVASNNIFFNISPDVFTITETTEPTFTLEAEIDSDQYCPE
DEITFTINITSILEYDESINLSVSDLADFEVSFDQNTLTPGESTILTITNTNQNTGEFNF
TLEANTVDKSKSKELSFNVVDFPTAPNITFPVEADNNINLSPTVMWEDSDLQADYLLEIA
LDNNFNEKVDSVEVVNAKEYKLQENLQRLTSYFVRVKAINNCGESDFSDVISFSTADIIC
DLYEGTDLPLSISSENVDTIQSIINIPYSGKVESIAISNLVGTHSYINDLSFILESPTGT
QITLLSNICDDQDNFNLSISDEGTSSELPCPPSDGETYQSEEALNTLNGEESEGEWKLIV
IDRFAADGGELQSWSLDLCLLDVVAPEILAPTNLTANENVTGTVELSWTDNSENETSFII
ERSTDNNSNFQEFADVDSNSSTYSDTDIVGQTQYFYRVKAVLDIFSSDYSNDINITTQLQ
VPPAPSTITASNLESGNVLIQWTDNTDLEEGYILERSQGDNTNYSNLAELEANSFDFVDE
TVEEESVYFYRVKGFNENGDGNYSSEVEIETLIGLPLAPTDLDFELLNDSTVRLNWADNA
QNESSYRVQRSDNGNDFISVAELEVDSKSYEEILNSGNYNYRVLARNTRGNSNFSNEVTV
EIDLENGVLSVRDEWKSKITLFPNPAQQIVNLKNESQYEIEKIQIRNSLGQKIRDVKFND
ATELEISIQDLNSGIYFIYLETIDNVLIKQLMVK
NT seq
4065 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggctacaacgatttttaatatttttaattgttttttttaccggctttgtttcgcat
gctcagaattataatgggcaattttggacggaaagtaatgctagagcttctgcaagatta
atttcgactgaaaaacaaaaaatttacaaattagctgttgaccagttaaaggcaaaatta
aatcaaaattcaaaattaaattttagcatcccctaccctgacggagcatttcaggaattc
aaattggaggaaagccctattatggcaccggctttagctaaaaaatatcccaacatcaaa
acctatagtgggagaaaccctacaactggtgaaactctacgattagacctaagcaaaaaa
ggatttcatgccatggtctattccactgaaggcgtattttttattgaccccgtccaagat
caattcaacgactaccaaatctattataaaaaagatttgaaaagagatcccaaaaagcca
agatttgaggaattagaacctatcattgcagatgatgttcaatttcaacgaatgcaatcc
atggttgaatctggtaatgtaaatcaaccttccggaacacaattaagaacctatagaata
gccgtggcagcaacgggcgaatacactgaatttcacggaggtactgtggaagatggtttg
tctgccatagtgagcactatgaacagggtcaacagcatttatgaaaaagaaattgcagta
agaatggtgttagtagaaaataatgatgaaattatttttacaaatagtagtacagaccct
tttacagttgatgatgtcgggatattaattgatgaaaatcaagtagtcctagacagtata
attggtaatcaaaattatgatttagggcataatttctcaactgctgctggtggactagca
ggattaggagtggtatgtagatcaaattcaaaagcaaggggagtaacaggtattaatcaa
cccattggtgatccctttgatgtggactatgtttcacacgaaattggtcatcaatttggg
gcgccacacacatttaatggaacagtcagttcttgcgggcagaaccgttccgctaattcc
gcatatgagccaggtagtggttccaccataatggcttatgctggtatttgtggtggcgat
aacattcaaaataatagtgatccatattttcatacggccagcttagatttcatgaatgcg
tatattcaagataatgcggggaataattgtgccgacattacggagacaggcaacaacctt
ccgatagtagaagctggccaaggtggttttacaatccctattagtacacctttccagcta
aatgggttcgctacagatcctgatggcgatcagttaaattacgcttgggagcaatttgat
ttgggacctgccggttctccgaatttacctcaagataatgcaccattattcagatccttt
tcacctactcttgacagttttagaatctttccacaaatatcggatatccttaatggtaca
cagaccaagggtgaaatattaccggattatgcaaggaatcttaactttagacttagcgta
cgtgataatcaagcaatagcggctgtggatcatgatgaaattagttttagtgtaacagat
atagccggcccgttcattgttgataccatttctggggactacagtggactcaatattatc
acagtaagctgggaagtgaataataccaatatagctccggtaaatgcagcatttgtggat
atatacctctccactgatggaggacaaacattttctgtaaaagtgttggaaaatacagaa
aatgatggctcagaacctattgaattaccaaatatcaataccaatcaggcaaaaataaaa
gtggtcgcctccaataatattttctttaacattagcccggacgtttttaccattacagaa
accaccgagccaacctttactttggaagctgaaattgacagtgatcaatattgccctgag
gatgaaattacatttaccatcaatataacttctattttagaatatgatgaaagcattaat
ttatcagtaagtgacttagcagattttgaggttagtttcgatcaaaatacacttacccct
ggggaaagcactatcttaacaatcaccaataccaaccaaaatacaggagaatttaatttc
acactggaagccaatacggtggacaaatcaaaaagtaaagaattgagctttaatgtagtt
gatttcccgacagcaccaaatattacttttcctgtggaagcggacaacaatatcaattta
agcccaactgtaatgtgggaagacagtgatttgcaggctgactacttattagaaatcgct
ttagataataattttaatgaaaaagtagattctgtagaggttgttaatgcaaaagaatat
aaactacaagagaacctgcaaagactcacaagctattttgtgcgtgtaaaggcaattaat
aattgtggggaaagtgatttttctgatgttatttccttttcaactgcagatattatttgt
gatttatacgaaggaacggatttgcctttatcaatttcatctgaaaatgtagatacaatt
caatctattataaatattccatactcaggaaaagttgaatctattgccataagcaattta
gtaggtacgcattcctatattaatgatttaagtttcatattagaaagccctactggtact
caaatcactttactctccaatatttgcgatgatcaggataattttaacctatccattagt
gatgagggaacatcatcagaattaccttgtcctccaagcgatggggaaacctatcaatct
gaagaagccctcaataccttaaatggagaagaatcagaaggagaatggaaattaatagtt
attgatcgttttgcagcggatggtggagaattgcagtcatggtcacttgatctgtgctta
ctggatgttgtagctcctgaaattctagcacccactaatttaaccgcgaatgaaaatgta
acaggaactgtggaactctcttggacagataattctgaaaatgagactagttttattatt
gaaagatcgacagacaacaattcaaattttcaggaatttgctgatgtagactccaatagc
tcaacatattctgataccgatatagtaggacaaacccaatatttttatagagtgaaggct
gtattggatatattttcatcggattattcgaatgacatcaatattactacccaattgcaa
gtacctcctgccccctctacaataactgcctctaatttagaaagtggtaatgttttgatt
caatggacagataatactgatttagaagaaggttatatattggaaagatcgcagggtgat
aacactaactatagtaatttagcagaattagaagcaaattcctttgattttgtagacgaa
acagttgaagaagaaagtgtatatttctacagagtaaagggatttaatgagaacggagac
ggcaattattccagcgaagtagaaattgaaactttgattggattgccgcttgccccaacc
gatctagactttgagttattgaatgatagtacggtaaggctcaactgggctgacaatgct
caaaatgaaagttcttacagggtacaaagatctgataatggaaatgattttatttctgtg
gctgaattggaagttgacagtaaaagttatgaagaaatattaaattctggcaactataat
tatagggtattggctagaaatacgaggggaaattctaacttcagtaatgaggttacagtt
gaaatagatctagaaaatggtgttcttagtgttcgagatgaatggaaatcaaaaattact
ttatttcccaatcctgcccagcaaattgttaatctcaaaaatgagagtcaatatgaaatt
gaaaaaattcagattagaaatagcttaggccagaaaataagagatgttaaatttaatgat
gcaacggaactagagatttctattcaagatttgaatagtgggatttatttcatttatctg
gagaccattgataatgtccttattaaacagttgatggtcaaatag
DBGET
integrated database retrieval system